| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,106,210 | G→C | 6.8% | N254K (AAC→AAG) | PP_3613 ← | L‑sorbosone dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,106,210 | 0 | G | C | 6.8% | 233.0 / 6.6 | 73 | N254K (AAC→AAG) | PP_3613 | L‑sorbosone dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/32); new base C (2/3); total (37/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.70e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.37e-01 | |||||||||||
CCAGTAGCTGTAAGGCCAACCATAGAAGCCGCCTTCACGTACCGAAGTGAGGTAGTCTGGCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCAT > NC_002947/4106066‑4106352 | ccAGTAGCTGTAAGGCCAACCATAGAAGCCGCCTTCACGTACCGAAGTGAGGTAGTCTGGCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTAc > 6:350018/1‑149 (MQ=255)ccAGTAGCTGTAAGGCCAACCATAGAAGCCGCCTTCACGTACCGAAGTGAGGTAGTCTGGCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTAc < 2:320492/149‑1 (MQ=255) aGTAGCTGTAAGGCCAACCATAGAAGCCGCCTTCACGTACCGAAGTGAGGTAGTCTGGCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACg > 8:301288/1‑148 (MQ=255) aGTAGCTGTAAGGCCAACCATAGAAGCCGCCTTCACGTACCGAAGTGAGGTAGTCTGGCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACg > 3:181400/1‑148 (MQ=255) tGTAAGGCCAACCATAGAAGCCGCCTTCACGTACCGAAGTGAGGTAGTCTGGCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCg > 4:247855/1‑149 (MQ=255) tAAGGCCAACCATAGAAGCCGCCTTCACGTACCGAAGTGAGGTAGTCTGGCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCgg < 5:350018/148‑1 (MQ=255) tAAGGCCAACCATAGAAGCCGCCTTCACGTACCGAAGTGAGGTAGTCTGGCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCg < 3:164231/147‑1 (MQ=255) aGGCCAACCATAGAAGCCGCCTTCACGTACCGAAGTGAGGTAGTCTGGCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCACCGGCTTGCGTAACCCgacgg < 2:197856/149‑5 (MQ=255) ccAACCATAGAAGCCGCCTTCACGTACCGAAGTGAGGTAGTCTGGCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCTATGCCACCGGCTTGCGTAACCCGACGGCAt > 7:87410/1‑149 (MQ=255) cAACCATAGAAGCCGCCTTCACGTACCGAAGTGAGGTAGTCTGGCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCa > 1:13497/1‑147 (MQ=255) aCCATAGAAGCCGCCTTCACGTACCGAAGTGAGGTAGTCTGGCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAgg < 7:43791/149‑1 (MQ=255) ccATAGAAGCCGCCTTCACGTACCGAAGTGAGGTAGTCTGGCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCTATGCCACCGGCTTGCGTAACCCGACGGCAttgac < 8:87410/149‑5 (MQ=38) ccATAGAAGCCGCCTTCACGTACCGAAGTGAGGTAGTCTGGCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAggg > 1:281761/1‑149 (MQ=255) ccATAGAAGCCGCCTTCACGTACCGAAGTGAGGTAGTCTGGCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAggg > 4:309010/1‑149 (MQ=255) acATAGAAGACGCCTTCACGTACCGAAGTGAGGTAGTCTGGCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGAGGCTTGATGGTCAATTCAGTCTGGTTACGCAAGCCGGTGGCATattg > 1:286528/2‑146 (MQ=255) cATAGAAGCCGCCTTCACGTACCGAAGTGAGGTAGTCTGGCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCACCGGCTTGCGTAACCCGACGGCAttg < 6:306912/146‑3 (MQ=255) cATAGAAGCCGCCTTCACGTACCGAAGTGAGGTAGTCTGGCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCACCGGCTTGCGTAACCCGACGGCAttg > 5:306912/1‑144 (MQ=255) tAGAAGCCGCCTTCACGTACCGAAGTGAGGTAGTCTGGCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGc > 4:302112/1‑129 (MQ=255) tAGAAGCCGCCTTCACGTACCGAAGTGAGGTAGTCTGGCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGc > 4:296949/1‑129 (MQ=255) tAGAAGCCGCCTTCACGTACCGAAGTGAGGTAGTCTGGCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCg < 2:281761/149‑1 (MQ=255) tAGAAGCCGCCTTCACGTACCGAAGTGAGGGAGTCTGGAACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGAACACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGTTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCg < 2:286528/149‑1 (MQ=255) gAAGCCGCCTTCACGTACCGAAGTGAGGTAGTCTGGCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCgg < 6:367667/148‑1 (MQ=255) gAAGCCGCCTTCACGTACCGAAGTGAGGTAGTCTGGCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGgt < 3:247855/149‑1 (MQ=255) aaGCCGCCTTCACGTACCGAAGTGAGGTAGTCTGGCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGgt > 5:57905/1‑148 (MQ=255) aaGCCGCCTTCACGTACCGAAGTGAGGTAGTCTGGCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGgt < 6:57905/148‑1 (MQ=255) gccgccTTCACGTACCGAAGTGAGGTAGTCTGGCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGtgtg > 2:371782/1‑149 (MQ=255) gccTTCACGTACCGAAGTGAGGTAGTCTGGCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTgcgc > 5:64680/1‑149 (MQ=255) cACGTACCGAAGTGAGGTAGTCTGGCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGt < 1:41025/148‑1 (MQ=255) aCGTACCGAAGTGAGGTAGTCTGGCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGtct > 7:217876/1‑149 (MQ=255) gAAGTGAGGTAGTCTGGCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACACCTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGGCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATc < 7:301288/149‑1 (MQ=255) aGGTAGTCTGGCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTg < 8:202309/111‑1 (MQ=255) ggTAGTCTGGCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGc > 7:361239/1‑149 (MQ=255) gTAGTCTGGCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTgc < 2:112184/126‑1 (MQ=255) gTAGTCTGGCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTgc > 1:112184/1‑126 (MQ=255) tgcTGGCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTGGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATTCCGGCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCTGGGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAg < 8:361239/146‑1 (MQ=255) gTCTGGCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGa > 3:24146/1‑149 (MQ=255) gCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATg > 3:344886/1‑149 (MQ=255) gCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATg > 6:368113/1‑149 (MQ=255) aCCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGc < 2:13497/149‑1 (MQ=255) gTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCcgat < 7:163047/149‑1 (MQ=255) tCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCcgatc < 3:309010/149‑1 (MQ=255) ccAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTcc < 4:24146/149‑1 (MQ=255) tCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCcgcg > 8:8413/1‑149 (MQ=255) tCGTTGACAACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCAAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCcgcg > 6:72511/1‑149 (MQ=255) cGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGc < 8:149801/110‑1 (MQ=255) cGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGc > 7:149801/1‑110 (MQ=255) gTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCt > 5:287546/1‑149 (MQ=255) accaccGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCgg < 5:368113/148‑1 (MQ=255) tCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGtt > 4:60121/1‑148 (MQ=255) acaACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATgg > 6:151578/1‑105 (MQ=255) acaACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATgg < 5:151578/105‑1 (MQ=255) caACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGAtctc < 2:264625/117‑1 (MQ=255) caACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGAtctc > 1:264625/1‑117 (MQ=255) caACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGt > 8:159160/1‑149 (MQ=255) aaCTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGtt > 5:350629/1‑149 (MQ=255) cccGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGa < 8:217876/147‑1 (MQ=255) tgagCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGGGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATAccc < 6:283300/146‑1 (MQ=255) cTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCcaca > 7:269530/1‑148 (MQ=255) tGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATa > 2:87824/1‑149 (MQ=255) gATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATa < 8:269530/147‑1 (MQ=255) gATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATAc < 4:344886/148‑1 (MQ=255) gATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGAGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCcgatc > 3:563/1‑90 (MQ=255) gATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGAGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCcgatc < 4:563/90‑1 (MQ=255) tCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACaagaag > 4:332226/1‑149 (MQ=255) tCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACaagaag > 3:93698/1‑149 (MQ=255) aaTGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGc < 6:350629/148‑1 (MQ=255) aTGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCg > 2:334592/1‑107 (MQ=255) aTGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCg < 1:334592/107‑1 (MQ=255) aTGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGa < 7:8413/149‑1 (MQ=255) aTGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGa < 7:159160/149‑1 (MQ=255) aTGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGa < 1:371782/149‑1 (MQ=255) aTGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGa < 5:72511/149‑1 (MQ=255) cGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGATCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCAt > 4:249954/1‑149 (MQ=255) | CCAGTAGCTGTAAGGCCAACCATAGAAGCCGCCTTCACGTACCGAAGTGAGGTAGTCTGGCACCAGGTCGGGGCCCAGCTCATCCCGCTCGTTGACCACCGTCCACAACTGCCCGGTCTGCGGCTGGATGGTCAATGCCGTCGGGTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCAT > NC_002947/4106066‑4106352 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |