| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,244,358 | G→C | 7.4% | S221R (AGC→AGG) | aruH ← | arginine‑‑pyruvate transaminase AruH |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,244,358 | 0 | G | C | 7.4% | 206.2 / 6.9 | 68 | S221R (AGC→AGG) | aruH | arginine‑‑pyruvate transaminase AruH |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (32/31); new base C (3/2); total (35/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.09e-01 | |||||||||||
CGTAGAGCATGCACAGGGCGAGGTTTTCCAGATGCGTGGCCAGTGCTGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGCCTCCCAGGTGGCGCGCGGCAGGCTCGCCCCTGAAGGGTTGTGCGGGCTG > NC_002947/4244216‑4244505 | cGTAGAGCATGCACAGGGCGAGGTTTTCCAGATGCGTGGCCAGTGCTGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCg < 7:321079/149‑1 (MQ=255) tAGAGCATGCACAGGGCGAGGTTTTCCAGATGCGTGGCCAGTGCTGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCggg < 4:130046/149‑1 (MQ=255) gagCATGCACAGGGCGAGGTTTTCCAGATGCGTGGCCAGTGCTGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGCCTG‑CCgggca < 4:325717/149‑3 (MQ=255) aTGCACAGGGCGAGGTTTTCCAGATGCGTGGCCAGTGCTGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGa > 1:169547/1‑148 (MQ=255) aTGCACAGGGCGAGGTTTTCCAGATGCGTGGCCAGTGCTGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGAc < 7:49997/149‑1 (MQ=255) acaGGGCGAGGTTTTCCAGATGCGTGGCCAGTGCTGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATg > 6:219808/1‑148 (MQ=255) acaGGGCGAGGTTTTCCAGATGCGTGGCCAGTGCTGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGc > 1:212953/1‑149 (MQ=255) caGGGCGAGGTTTTCCAGATGCGTGGCCAGTGCTGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCt > 1:64279/1‑149 (MQ=255) aGGGCGAGGTTTTCCAGATGCGTGGCCAGTGCTGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTc < 8:192269/149‑1 (MQ=255) ggCGAGGTTTTCCAGATGCGTGGCCAGTGCTGTCGAGCAGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑ACGGGGCTGACATGCTCGc > 2:316543/1‑149 (MQ=255) ggTTTTCCAGATGCGTGGCCAGTGCTGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGAGAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCa < 5:150018/149‑1 (MQ=255) gTTTTCCAGATTCTTGTCCAGTGCTTTCGAGGCGACCACCCACGAGATTCGCCTGCCGTTCATGGCATGCTATTTGTACAGGGTGTTCATCGTTTGAGTGCGCTCGGCCTTGAGCTGCAGGATG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCATTCa < 8:264412/148‑1 (MQ=255) cAGATGCGTGGCCAGTGCTGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACAt < 8:13524/131‑1 (MQ=255) tGGCCAGTGCTGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTg < 3:302027/149‑1 (MQ=255) gCCAGTGCTGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAgg < 8:65197/105‑1 (MQ=255) gCCAGTGCTGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAgg > 7:65197/1‑105 (MQ=255) caggtcTGTCGAGCCGACCACCCCCCCCCTGCGCCAGCCGGTCCTGCCATGCGATCTGGACAGGCTGTTCCACGTTGCAGTCCCCTCGGCCCTGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCATCATACACCAGCTCGCTGTAGa < 4:6785/144‑1 (MQ=255) tGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCAAGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCg > 8:128899/1‑148 (MQ=255) gTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTa > 7:278857/1‑140 (MQ=255) gTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTa < 8:278857/140‑1 (MQ=255) tCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCa < 2:169547/149‑1 (MQ=255) gAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCaga < 5:219808/149‑1 (MQ=255) gAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCa > 7:257246/1‑147 (MQ=255) gAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGCCTG‑CCgggcatgg < 8:317489/106‑6 (MQ=255) gAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGCCTG‑CCgggcatgg > 7:317489/1‑101 (MQ=255) gACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGAt > 6:173691/1‑147 (MQ=255) gACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGAt > 6:168138/1‑147 (MQ=255) ccacccacCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑cc < 8:68253/91‑1 (MQ=255) ccacccacCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑cc > 7:68253/1‑91 (MQ=255) acccacccCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCca < 8:293197/149‑1 (MQ=255) cccacccCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCca > 6:190711/1‑148 (MQ=255) ccacccCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCca > 6:341771/1‑147 (MQ=255) ccacccCATGCGCCAGCCGGACATCGCAAGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCACTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACAAGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTAAGAGATCAGCcac > 4:352237/1‑148 (MQ=255) aTGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATg < 6:125387/149‑1 (MQ=255) gcCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTg < 4:19419/113‑1 (MQ=255) gcCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTg < 4:14346/113‑1 (MQ=255) gcCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTg > 3:19419/1‑113 (MQ=255) gcCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTg > 3:14346/1‑113 (MQ=255) ccAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTc > 1:171388/1‑96 (MQ=255) ccAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTc < 2:171388/96‑1 (MQ=255) aGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACg > 4:99478/1‑149 (MQ=255) ggTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGca > 5:189238/1‑147 (MQ=255) tCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCAt < 8:163908/135‑1 (MQ=255) tCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCAt > 7:163908/1‑135 (MQ=255) tCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGt < 5:173691/149‑1 (MQ=255) tCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGt < 5:168138/149‑1 (MQ=255) gACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGAc > 3:165231/1‑92 (MQ=255) gACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGAc < 4:165231/92‑1 (MQ=255) gACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATc > 2:314943/1‑105 (MQ=255) gACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATc < 1:314943/105‑1 (MQ=255) gCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCa < 2:202365/101‑1 (MQ=255) gCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCa > 1:202365/1‑101 (MQ=255) gCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGCCTCCCAGGTgg > 8:111495/1‑149 (MQ=255) tGTTCAACGTTTCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTGTCTCGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGCCTCCCAGGTGgc < 1:316543/149‑1 (MQ=255) ttCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGCCTCCCAGGTGgcgcg > 3:285236/1‑149 (MQ=255) aaCGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGCCTCCCAGGTGGCGCGCgg > 4:50012/1‑149 (MQ=255) cGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGCCTCCCAGGTGGCGCGCGGCa < 5:190711/149‑1 (MQ=255) ttGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGCCTCCCAGGTGGCGCGCGGCAgg > 5:116202/1‑149 (MQ=255) cAGTGCGCTCGGCCAAGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGCCTCCCAGGTGGCGCGCGGCAGGCTc < 7:128899/149‑1 (MQ=255) gcTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGCCTCCCAGGTGGCGCGCGGCAGGCTCGCCCCt > 3:26090/1‑149 (MQ=255) cTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGCCTCCCAGGTGGCGCGCGGCAGGCTCGCCCCTg < 2:64279/149‑1 (MQ=255) ggCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGCCTCCCAGGTGGCGCGCGGCAGGCTCGCCCCTGaa < 5:341771/148‑1 (MQ=255) ggCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGCCTCCCAGGTGGCGCGCGGCAGGCTCGCCCCTGAAg < 6:280298/149‑1 (MQ=255) ccATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGCCTCCCAGGTGGCGCGCGGCAGGCTCGCCCCTGAAggg > 1:56415/1‑149 (MQ=255) gCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGCCTCCCAGGTGGCGCGCGGCAGGCTCGCCCCTGAAGGGTtgt > 6:55161/1‑149 (MQ=255) ccccGGCAGCCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGCCTCCCAGGTGGCGCGCGGCAGGCTCGCCCCTGAAGGGTtgt > 6:350376/2‑149 (MQ=255) ccccGGCAGCCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGCCTCCCAGGTGGCGCGCGGCAGGCTCGCCCCTGAAGGGTtgt > 8:253090/2‑149 (MQ=255) ccGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGCCTCCCAGGTGGCGCGCGGCAGGCTCGCCCCTGAAGGGTTGTGc > 1:370326/1‑149 (MQ=255) aGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGCCTCCCAGGTGgcgc < 5:263051/115‑1 (MQ=255) aGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGCCTCCCAGGTGgcgc > 6:263051/1‑115 (MQ=255) ggCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGCCTCCCAGGTGGCGCGCGGCAGGCTCGCCCCTGAAGGGTTGTGCGGGCTg < 3:99478/149‑1 (MQ=255) | CGTAGAGCATGCACAGGGCGAGGTTTTCCAGATGCGTGGCCAGTGCTGTCGAGCCGACCACCCACCCCATGCGCCAGCCGGTCATGGCATGCGATTTGGACAGGCTGTTCAACGTTGCAGTGCGCTCGGCCATGCCCGGCAGGCTG‑CCGGGGCTGACATGCTCGCCTTCATACAGCAGCTCGCTGTAGACCTCGTCAGAGATCAGCCACAGATCATGGGCAACGCACAGTTCGGCCAGCGCCTCCCAGGTGGCGCGCGGCAGGCTCGCCCCTGAAGGGTTGTGCGGGCTG > NC_002947/4244216‑4244505 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |