| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,279,808 | C→A | 6.5% | A336A (GCC→GCA) | PP_3750 → | GntR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,279,808 | 0 | C | A | 6.5% | 247.1 / 5.8 | 77 | A336A (GCC→GCA) | PP_3750 | GntR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/38); new base A (3/2); total (37/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.67e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.71e-01 | |||||||||||
ACTGTGAGTTCCGCTACCACGGGCCAGCCTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCACCTGAACAAGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACAGCGCACGCCGCGAGC > NC_002947/4279669‑4279956 | actGTGAGTTCCGCTACCACGGGCCAGCCTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAg < 3:352084/149‑1 (MQ=255) ctGTGAGTTCCGCTACCACGGGCCAGCCTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAgg > 3:367798/1‑149 (MQ=255) tgtgAGTTCCGCTACCACGGGCCAGCCTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGc > 6:66473/1‑149 (MQ=255) gTTCCGCTACCACGGGCCAGCCTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCtt > 4:283033/1‑149 (MQ=255) cGCTACCACGGGCCAGCCTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGt < 1:21399/149‑1 (MQ=255) gCTACCACGGGCAAGCCTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGACTACGTCGGTACCTTCTCAAAGACCTTGCTGCACGAGCTGCGCCTGGGATATGACGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGACGCTTGCGTg > 4:363431/1‑149 (MQ=255) cTACCACGGGCCAGCCTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTgg < 1:341377/149‑1 (MQ=255) aCCACGGGCCAGCCTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGc > 4:7620/1‑148 (MQ=255) ccACGGGCCAGCCTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGcc < 6:384444/148‑1 (MQ=255) ccACGGGCCAGCCTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGc < 5:66473/147‑1 (MQ=255) cACGGGCCAGCCTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCa < 7:272241/131‑1 (MQ=255) cACGGGCCAGCCTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCa > 8:272241/1‑131 (MQ=255) cACGGGCCAGCCTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCAGTACGGCAg < 6:187312/132‑1 (MQ=255) cACGGGCCAGCCTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCAGTACGGCAg > 5:187312/1‑132 (MQ=255) aCGGGCCAGCCTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAg < 5:378229/149‑1 (MQ=255) cGGGCCAGCCTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGc < 4:367798/149‑1 (MQ=255) gCCTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCAcc > 5:231347/1‑145 (MQ=255) gCCTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCAcc < 6:231347/145‑1 (MQ=255) cgcgCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGc < 8:115622/149‑1 (MQ=255) gcTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGcaca < 2:272753/149‑1 (MQ=255) gCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGcc > 1:169064/1‑149 (MQ=255) cGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCAGTACGGCAGGcgg > 4:19076/1‑98 (MQ=255) cGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCAGTACGGCAGGcgg < 3:19076/100‑3 (MQ=255) ggCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAg < 2:225621/149‑1 (MQ=255) gCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCtt > 3:13358/1‑101 (MQ=255) gCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCtt < 4:13358/101‑1 (MQ=255) gCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGt > 1:350979/1‑149 (MQ=255) ggTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGc < 2:132915/124‑1 (MQ=255) ggTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGc > 1:132915/1‑124 (MQ=255) ggTCGCCTACGCCGGCACCTCCTCCACCACCTTGCGCCCCGAGCTGCGCCGGGCCTATGCGTTATACCCGCCTGCCGAACTGCAGGTTGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTgg < 1:109063/149‑1 (MQ=255) tCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGgcg > 7:156358/1‑149 (MQ=255) gCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGgcgc < 1:149321/148‑1 (MQ=255) cTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCt < 7:267563/149‑1 (MQ=255) tACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCtt > 6:345313/1‑149 (MQ=255) tCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTgg > 3:323044/1‑131 (MQ=255) tCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTgg < 4:323044/131‑1 (MQ=255) gggACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGc < 3:248754/91‑1 (MQ=255) gggACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGc > 4:248754/1‑91 (MQ=255) ggACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGc > 1:324023/1‑149 (MQ=255) gACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGc > 3:104260/1‑148 (MQ=255) ccTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCg > 4:246832/1‑147 (MQ=255) tcCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCtt > 3:312858/1‑138 (MQ=255) tcCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCtt < 4:312858/138‑1 (MQ=255) cAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGTGTGGCCAAGCAc < 2:16090/82‑1 (MQ=255) cAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGTGTGGCCAAGCAc > 1:16090/1‑82 (MQ=255) cAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCtt < 1:116980/136‑1 (MQ=255) cAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCtt > 2:116980/1‑136 (MQ=255) cAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCAc < 3:283033/148‑1 (MQ=255) aGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGgcgc > 4:74096/1‑126 (MQ=255) aGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGgcgc < 3:74096/126‑1 (MQ=255) aCCTTGTTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTCCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCACCTGaa > 5:327034/1‑149 (MQ=255) aCCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCACCTGaa < 2:324023/149‑1 (MQ=255) gctgcCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGgcgc < 6:93724/119‑1 (MQ=255) gctgcCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCACCTGAACAAg > 7:286015/1‑148 (MQ=255) cccGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCACCTGAACAAGcac < 2:191811/147‑1 (MQ=255) cGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCACCTGAACAAGCACATcc < 4:104260/149‑1 (MQ=255) agAGCTGCGCCTGCCCAATGCCGAATTACCTCCTGCCTTACTGCACGCCCCTTGAGTGGCCAAGCAACTTAGCGAATGGCACAGCCCTAACCTGCTCCAGTGGGCGCTGCCGCGCTTACTTGGAGAATGCCACCTGAACAAGCACATcc > 4:358293/2‑149 (MQ=255) gCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCACCTGAACAAGCACATccgcc < 5:345313/149‑1 (MQ=255) gggCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGaa < 8:139057/115‑1 (MQ=255) gggCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGaa > 7:139057/1‑115 (MQ=255) gggCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCACCTGAACAAGCACATCCGCCGCTGCCAc > 7:218128/1‑148 (MQ=255) gCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCACCTGAACAAGCACATCCGCCGCTGCCACGAg < 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cGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGgcgc < 2:372278/92‑1 (MQ=255) cGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGc > 2:151677/1‑109 (MQ=255) cGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGc < 1:151677/109‑1 (MQ=255) cGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCAACTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCACCTGAACAAGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACa < 3:7620/149‑1 (MQ=255) gTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCACCTGAACAAGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACAg > 5:388416/1‑149 (MQ=255) tACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCACCTGAACAAGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACa > 2:187730/1‑144 (MQ=255) tACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCACCTGAACAAGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACa < 1:187730/144‑1 (MQ=255) gcggCCTGCAGTACGGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCACCTGAACAAGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACAGCGCAc > 4:19384/4‑149 (MQ=255) aCCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCACCTGAACAAGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACAGCGCAc > 8:133617/1‑149 (MQ=255) cGTACTGCCGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACCGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCGCGGGAACGCGCCCCTCCGCCGCGGCCCCGAGGGCTGCAGCGCACGCCgcgcgc > 8:269196/1‑149 (MQ=255) cGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCACCTGAACAAGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACAGCGCACGCCGCGAgc < 3:246832/149‑1 (MQ=255) | ACTGTGAGTTCCGCTACCACGGGCCAGCCTCGGACGCGCTGCAGCGTCTGGACCGGCATGGGCTGGTCGCCTACGTCGGGACCTTCTCCAAGACCTTGCTGCCCGAGCTGCGCCTGGGCTATGCCGTATTACCGCCTGCCGTACTGCAGGCCGCTTGCGTGGCCAAGCACCTTAGCGACTGGCACAGCCCTACCCTGCTGCAGTGGGCGCTGGCGCGCTTCCTTGGCGAAGGCCACCTGAACAAGCACATCCGCCGCTGCCACGAGGTCTACAGCGCACGCCGCGAGC > NC_002947/4279669‑4279956 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |