| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,348,705 | A→G | 50.0% | intergenic (‑70/+404) | PP_3820 ← / ← galU | group II intron‑encoding maturase/UTP‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,348,705 | 0 | A | G | 50.0% | 11.9 / 125.4 | 88 | intergenic (‑70/+404) | PP_3820/galU | group II intron‑encoding maturase/UTP‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (19/25); new base G (23/21); total (42/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.22e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.13e-01 | |||||||||||
TCTGCATTACGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑ATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTTGTGCCACCT > NC_002947/4348590‑4348849 | tCTGCATTACGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑ATCCTGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGt < 1:17601/148‑1 (MQ=14) cTGCATTACGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑ATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTg < 6:255686/148‑1 (MQ=32) cATTACGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑GTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTg < 3:327188/145‑1 (MQ=17) cATTACGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑GTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTg > 4:327188/1‑145 (MQ=17) ttACGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑ATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGc < 3:42374/149‑1 (MQ=33) ttACGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑ATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGc > 2:170745/1‑149 (MQ=33) ttACGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑ATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGc < 5:185393/149‑1 (MQ=33) ttACGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑ATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGc < 4:43013/149‑1 (MQ=33) cGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑ATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTa < 1:209411/149‑1 (MQ=34) cGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑ATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTa > 6:197874/1‑149 (MQ=34) cGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑ATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTa < 4:258730/149‑1 (MQ=34) ttACCAACGAGCCGGCCACGCCTAATGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAA‑CGCCAATTACTACCGCTTCGGCCGCCTTCTGCACGCTCTATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACa < 1:77866/149‑1 (MQ=11) ttACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑ATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAg < 1:170745/149‑1 (MQ=34) ttACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑ATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAg < 1:261579/149‑1 (MQ=34) ccAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑GTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGAt < 2:351836/148‑1 (MQ=21) ccAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑GTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGAt < 3:92441/148‑1 (MQ=21) aaCGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑GTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGAtctc > 5:150574/1‑149 (MQ=21) aaCGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTCGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑GTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGAtctc > 1:267595/1‑149 (MQ=21) gagaCGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACTAGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑GTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTcc > 1:103587/1‑148 (MQ=255) gagaCGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑ATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCa < 4:39458/149‑1 (MQ=34) aCGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑ATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAggg < 6:206366/149‑1 (MQ=34) cGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑GTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGt < 6:7915/149‑1 (MQ=21) ggCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑ATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGt > 8:202578/1‑148 (MQ=34) cGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑GTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTcg > 5:182320/1‑149 (MQ=21) cGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑GTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTcg > 2:328624/1‑149 (MQ=21) ccTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCGACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑GTCCCGTCGACTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTcgcg > 5:268208/1‑149 (MQ=255) cTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑GTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTcgcgc < 7:9070/149‑1 (MQ=21) cTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑GTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTcgcgc > 8:9070/1‑149 (MQ=21) gcggcATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑GTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCa < 5:340666/130‑1 (MQ=25) gcggcATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑GTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCa > 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aaCCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑GTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCtt > 1:289160/1‑149 (MQ=21) aCCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑ATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTa < 7:202578/149‑1 (MQ=34) ccTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑GTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTAt > 4:149295/1‑149 (MQ=21) ccTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑ATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTAt < 2:56962/149‑1 (MQ=34) ccTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑ATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTAt < 1:138220/149‑1 (MQ=34) gTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑ATCCCGTCGCGTTTCGCCGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGcc > 6:206871/1‑149 (MQ=21) gTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑ATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTAt < 1:339301/146‑1 (MQ=34) gTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑ATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGcc > 2:197302/1‑149 (MQ=34) gTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑ATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGAGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTAt > 2:339301/1‑146 (MQ=21) ttCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑GTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGc < 1:328624/147‑1 (MQ=21) ttCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑GTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCt < 8:54836/149‑1 (MQ=21) ccTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑GTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGAGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGa > 7:156574/1‑149 (MQ=21) ccTTGGTGGCGCGGTTAAC‑AGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑ATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCT‑CCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCt < 2:320018/135‑1 (MQ=255) ggtggCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑GTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCt < 2:267595/148‑1 (MQ=21) ggtggCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑GTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCt < 2:339583/148‑1 (MQ=21) gtggCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑GTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTa < 7:233139/148‑1 (MQ=21) gcgGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑GTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTca > 3:305066/1‑148 (MQ=21) gcgGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑ATCCCGTCGCCTGTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTca > 3:50371/1‑148 (MQ=21) ggTTAAC‑CGCGACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑GTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACGTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTcacc < 6:268208/148‑2 (MQ=255) c‑cGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑ATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTcc > 6:231085/1‑149 (MQ=34) c‑cGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑ATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTcc > 3:274338/1‑149 (MQ=34) cGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTG‑GTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCg > 5:106162/1‑149 (MQ=21) cGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑ATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCCCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTcc > 2:118639/1‑148 (MQ=21) cACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑GTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGc < 8:156574/149‑1 (MQ=21) cACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑ATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTg > 1:201546/1‑148 (MQ=34) 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ttCTGCACGCTC‑ATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTtg > 8:58109/1‑149 (MQ=34) cTGCACGCTC‑GTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTTCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTtgt < 2:103587/148‑1 (MQ=21) cTGCACGCTC‑GTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTtgt < 3:149295/148‑1 (MQ=21) cTGCACGCTC‑ATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTtgtg > 7:234707/1‑149 (MQ=34) gCACGCTC‑GTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTTGTGc > 1:338172/1‑148 (MQ=21) cACGCTC‑GTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTcaca < 7:211082/110‑1 (MQ=25) cACGCTC‑GTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTcaca > 8:211082/1‑110 (MQ=25) cACGCTC‑ATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTTGTGCCa > 2:156905/1‑149 (MQ=34) aCGCTC‑ATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTAATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGAATTGGGCTTTGGCGATTTGTGCCAc > 1:299585/1‑149 (MQ=21) aCGCTC‑ATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCCCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTTGTGCCAc < 1:118639/149‑1 (MQ=21) gCTC‑ATCCCGTCGCGTTTCGACGCGAGGTAGCACAGTGGCAAGCGTAGAGATCTCCCAGCGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCATGTCGTATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTTGTGCCAc < 2:299585/147‑1 (MQ=11) cTC‑GTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTTGTGCCACCt > 8:233605/1‑148 (MQ=21) | TCTGCATTACGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAAC‑CGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTC‑ATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTTGTGCCACCT > NC_002947/4348590‑4348849 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |