| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,525,998 | A→C | 6.0% | Q310P (CAG→CCG) | mnmA → | tRNA 2‑thiouridine(34) synthase MnmA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,525,998 | 0 | A | C | 6.0% | 257.2 / 4.2 | 80 | Q310P (CAG→CCG) | mnmA | tRNA 2‑thiouridine(34) synthase MnmA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (36/39); new base C (3/2); total (39/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.71e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GAGCCGTGGTACGTGCTGCACAAGGACCTGGCCCGCAACGTGCTGGTGGTCGGCCAGGGCAACGAGCACCCATGGCTGTTCTCCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCGTGTTCGACGAGCCTCAGCGCGCCGTGACGCCGGGCCAGTCGGTGGTGTTCTACGACGGCGAAGTGTGCCTG > NC_002947/4525853‑4526146 | gtgCCGTGGTACGTGCTGCACAAGGACCTGGCCCGCAACGTGCTGGT‑GTCGGCCAGGGCAACGAGCACCCATGGCTGTTCTCCCGCGCCCTGCTCGGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGtt < 1:98619/147‑1 (MQ=255)gAGCCGTGGTACGTGCTGCACAAGGACCTGGCCCGCAACGTGCTGGTGGTCGGCCAGGGCAACGAGCACCCATGGCTGTTCTCCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGtt < 8:335243/149‑1 (MQ=255) aGCCGTGGTACGTGCTGCACAAGGACCTGGCCCGCAACGTGCTGGTGGTCGGCCAGGGCAACGAGCACCCATGGCTGTTCTCCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTg < 7:203235/149‑1 (MQ=255) gCCGTGGTACGTGCTGCACAAGGACCTGGCCCGCAACGTGCTGGTGGTCGGCCAGGGCAACGAGCACCCATGGCTGTTCTCCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGa < 1:47407/149‑1 (MQ=255) gTGGTACGTGCTGCACAAGGACCTGGCCCGCAACGTGCTGGTGGTCGGCCAGGGCAACGAGCACCCATGGCTGTTCTCCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTg > 7:302047/1‑149 (MQ=255) gTACGTGCTGCACAAGGACCTGGCCCGCAACGTGCTGGTGGTCGGCCAGGGCAACGAGCACCCATGGCTGTTCTCCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGcc > 5:146820/1‑148 (MQ=255) cGTGCTGCACAAGGACCTGGCCCGCAACGTGCTGGTGGTCGGCCAGGGCAACGAGCACCCATGGCTGTTCTCCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGTCAACTGCCGTGGGCTGCCGAgg < 1:272458/149‑1 (MQ=255) cGTGCTGCACAAGGACCTGGCCCGCAACGTGCTGGTGGTCGGCCAGGGCAACGAGCACCCATGGCTGTTCTCCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGGCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAg < 4:215244/148‑1 (MQ=255) tgctgcACAAGGACCTGGCCCGCAACGTGCTGGTGGTCGGCCAGGGCAACGAGCACCCATGGCTGTTCTCCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTg > 2:310008/1‑149 (MQ=255) tgcagcACAAGGACCTGGCACGCAACGTGCTGGTGGTCGGCCAGGGCAACGAGCACCCATGGCTGTTCTCCCCCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTg > 2:219641/1‑149 (MQ=255) gcACAAGGACCTGGCCCGCAACGTGCTGGTGGTCGGCCAGGGCAACGAGCACCCATGGCTGTTCTCCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTTGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTgcgc > 5:338946/1‑148 (MQ=255) cacaAGGACCTGGCCCGCAACGTGCTGGTGGTCGGCCAGGGCAACGAGCACCCATGGCTGTTCTCCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTgcgc < 1:362861/147‑1 (MQ=255) acaAGGACCTGGCCCGCAACGTGCTGGTGGTCGGCCAGGGCAACGAGCACCCATGGCTGTTCTCCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTAc < 6:146820/149‑1 (MQ=255) caAGGACCTGGCCCGCAACGTGCTGGTGGTCGGCCAGGGCAACGAGCACCCATGGCTGTTCTCCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTTGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTAcc < 6:338946/149‑1 (MQ=255) gCCCGCAACGTGCTGGTGGTCGGCCAGGGCAACGAGCACCCATGGCTGTTCTCCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGc < 6:117750/147‑1 (MQ=255) cccGCAACGTGCTGGTGGTCGGCCAGGGCAACGAGCACCCATGGCTGTTCTCCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGAc < 8:223014/149‑1 (MQ=255) cAACGTGCTGGTGGTCGGCCAGGGCAACGAGCACCCATGGCTGTTCTCCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGc < 6:151431/149‑1 (MQ=255) aaCGTGCTGGTGGTCGGCCAGGGCAACGAGCACCCATGGCTGTTCTCCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCg < 1:310008/149‑1 (MQ=255) gtCGGCCAGGGCAACGAGCACCCATGGCTGTTCTCCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTgg > 6:166293/1‑148 (MQ=255) gCCAGGGCAACGAGCACCCATGGCTGTTCTCCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACg > 4:318428/1‑148 (MQ=255) cAGGGCAACGAGCACCCATGGCTGTTCTCCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCAc < 8:302047/149‑1 (MQ=255) gggCAACGAGCACCCATGGCTGTTCTCCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGTCAACTGCCGTGGGCTGCCGAgg < 1:199851/104‑1 (MQ=37) gggCAACGAGCACCCATGGCTGTTCTCCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGTCAACTGCCGTGGGCTGCCGAgg > 2:199851/1‑104 (MQ=37) cAACGAGCACCCATGGCTGTTCTCCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGc > 3:182696/1‑147 (MQ=255) gAGCACCCATGGCTGTTCTCCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCgg < 2:22697/149‑1 (MQ=255) cACCCATGGCTGTTCTCCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTa > 3:10938/1‑149 (MQ=255) cccATGGCTGTTCTCCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTAcc > 1:218872/1‑149 (MQ=255) ccATGGCTGTTCTCCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCa > 6:289932/1‑121 (MQ=255) ccATGGCTGTTCTCCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCa < 5:289932/121‑1 (MQ=255) ccATGGCTGTTCTCCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACcg > 2:99727/1‑149 (MQ=255) aTGGCTGTTCTCCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCAccc < 4:311708/122‑1 (MQ=255) aTGGCTGTTCTCCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCAccc > 3:311708/1‑122 (MQ=255) tGGCTGTTCTCCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCgcgc > 6:357875/1‑149 (MQ=255) ggCTGTTCTCCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGcc > 6:328706/1‑149 (MQ=255) gCTGTTCTCCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGc < 1:180158/139‑1 (MQ=255) gCTGTTCTCCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGc > 2:180158/1‑139 (MQ=255) cTGTTCTCCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCgt > 8:25435/1‑149 (MQ=255) tGTTCTCCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCgtg > 6:52548/1‑149 (MQ=255) ctcCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCAc > 6:59134/1‑123 (MQ=255) ctcCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCAc < 5:59134/123‑1 (MQ=255) ccGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCGTGTTcgac < 5:52548/148‑1 (MQ=255) ccGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCGTGTTcga < 2:218872/147‑1 (MQ=255) cgcCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCGTGTTCGACGAGc < 3:57875/149‑1 (MQ=255) cccTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCGTGTTcgac < 2:321353/143‑1 (MQ=255) cccTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCGTGTTcgac > 1:321353/1‑143 (MQ=255) cccTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCGTGTTCGACGAGCCt > 5:358723/1‑149 (MQ=255) ctgct‑gGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCGTGTTCGACGAGCCTCa > 6:179364/1‑149 (MQ=255) cTCGGAAATTTTATGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCACCCCACGGAAGTTTACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGAAGCACCCTGGAACGCCCCGCCAGCGGCTACAGCGCCGTGTTCTACGAGCCTCACCGAGCCg > 2:326256/1‑149 (MQ=255) aaTTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCGTGTTCGACGAGCCTCAGCGCGCCGTGACGc > 3:197562/1‑149 (MQ=255) aaTTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCGTGTTCGACGAGCCTCAGCGCGCCGTGACGc < 5:357875/149‑1 (MQ=255) ttttCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCGTGTTCGACGAGCCTCAGCGCGCCGTGACGCCg < 7:25435/149‑1 (MQ=255) ttCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCGTGTTCGACGAGCCTCAGCGCGCCGTGACGCCgg < 4:371008/148‑1 (MQ=255) cAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCGTGTTCGACGAGCCTCAGCGCGCCGTGACGCCGGGCCAGTCgg > 1:36778/1‑149 (MQ=255) aaCCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCGTGTTCGACGAGCCTCAGCGCGCCGTGACGCCGGGCCAGTCggt > 1:339068/1‑149 (MQ=255) aaCCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCGTGTTCGACGAGCCTCAGCGCGCCGTGACGCCGGGCCAGTCggt < 2:339068/149‑1 (MQ=255) aCCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCGAGACCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCCCGCCGTGTTCGCCGAGCCTCAGCGCGCCGTGCTAGCGGGCCAGTCggtg > 1:320733/1‑149 (MQ=255) cccGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCGTGTTCGACGAGCCTCAGCGCGCCGTGACGCCGGGCCAGTCggtgg > 7:362960/1‑149 (MQ=255) ccGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGaa < 6:109342/78‑1 (MQ=255) ccGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGaa > 5:109342/1‑78 (MQ=255) cGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCGTGTTCGACGAGCCTCAGCGCGCCGTGACGCGGGGCCAGTCGgtggtg < 5:179364/149‑1 (MQ=255) cGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCGTGTTCGACGAGCCTCAGCGCGCCGTGACGCCGGGCCAGTCGgtggtg < 1:99727/149‑1 (MQ=255) cGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCGTGTTCGACGAGCCTCAGCGCGCCGTGACGCCGGGCCAGTCGgtggtg < 4:197562/149‑1 (MQ=255) gTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACGGCGCCGTGTGCGACTAGCCTCACCGCGCCGTGACGCCGGGCCAGTCGGTGGTGtt < 1:219641/149‑1 (MQ=255) gTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCGTGTTCGACGAGCCTCAGCGCGCCGTGACGCCGGGCCAGTCGGTGGTGtt < 8:362960/149‑1 (MQ=255) gcaCCTTGGCAGTCAACTGCCGTGGGCTGCCGAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCGTGTTCGACGAGCCTCAGCGCGCCGTGACGCCGGGCCAGTCGGTGGTGTTc > 4:238261/3‑148 (MQ=38) aCCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCGTGTTCGACGAGCCTCAGCGCGCCGTGACGCCGGGCCAGTCGGTGGTGTTCTac > 7:245560/1‑149 (MQ=255) cttggCAGTCAACTGCCGTGGGCTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCGTGTTCGACGAGCCTCAGCGCGCCGTGACGCCGGGCCAGTCGGTGGTGTTCTacga > 8:323801/4‑149 (MQ=255) ctaggCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCCCCCTGGACCGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCGTGGTCGACGAGCCTCAGCGCGCCGTGACGCCGGGCCAGTCGGTGGTGTTCTacgc > 1:374554/4‑148 (MQ=255) cTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCGTGTTCGACGAGCCTCAGCGCGCCGTGACGCCGGGCCAGTCGGTGGTGTTCTacga < 4:10938/149‑1 (MQ=255) cGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCGTGTTCGACGAGCCTCAGCGCGCCGTGACGCCGGGCCAGTCGGTGGTGTTCTacgacg > 4:43464/1‑149 (MQ=255) ggCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCGTGTTCGACGAGCCTCAGCGCGCCGTGACGCCGGGCCAGTCGGTGGTGTTCTacgac < 5:166293/147‑1 (MQ=255) ggCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCGTGTTCGACGAGCCTCAGCGCGCCGTGACGCCGGGCCAGTCGGTGGTGTTCTACGACgg < 6:9383/149‑1 (MQ=255) gCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCGTGTTCGACGAGCCTCAGCGCGCCGTGACGCCGGGCCAGTCGGTGGTGTTCTACGACGGc < 5:328706/149‑1 (MQ=255) cAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGTGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCGTGTTCGACGAGCCTCAGCGCGCCGTGACGCCGGGCCAGTCggtg < 4:371832/133‑1 (MQ=255) cAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGTGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCGTGTTCGACGAGCCTCAGCGCGCCGTGACGCCGGGCCAGTCggtg > 3:371832/1‑133 (MQ=255) cAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCGTGTTCGACGAGCCTCAGCGCGCCGTGACGCCGGGCCAGTCGGTGGTGTTCTACGACGGc > 7:106881/1‑148 (MQ=255) gCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCGTGTTCGACGAGCCTCAGCGCGCCGTGACGCCGGGCCAGTCGGTGGTGTTCTACGACGGCGaa < 3:43464/149‑1 (MQ=255) cccACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCGTGTTCGACGAGCCTCAGCGCGCCGTGACGCCGGGCCAGTCGGTGGTGTTCTACGACGGCGAAg > 1:160946/1‑149 (MQ=255) cccACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCGTGTTCGACGAGCCTCAGCGCGCCGTGACGCCGGGCCAGTCGGTGGTGTTCTACGACGGCGAAg > 6:151916/1‑149 (MQ=255) ccACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCGTGTTCGACGAGCCTCAGCGCGCCGTGACGCCGGGCCAGTCGGTGGTGTTCTACGACGGCGAAgt < 6:358723/149‑1 (MQ=255) aGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCGTGTTCGACGAGCCTCAGCGCGCCGTGACGCCGGGCCAGTCGGTGGTGTTCTACGACGGCGAAGTGTGCCTg > 2:75051/1‑149 (MQ=255) | GAGCCGTGGTACGTGCTGCACAAGGACCTGGCCCGCAACGTGCTGGTGGTCGGCCAGGGCAACGAGCACCCATGGCTGTTCTCCCGCGCCCTGCT‑GGCCTCGGAAATTTTCTGGGTCAACCCGGTCGACCTCGGCAGCCCACGGCAGTTGACTGCCAAGGTGCGCTACCGCCAGAGCGACCAGCGATGCACCCTGGAACGCACCGCCAGCGGCTACCGCGCCGTGTTCGACGAGCCTCAGCGCGCCGTGACGCCGGGCCAGTCGGTGGTGTTCTACGACGGCGAAGTGTGCCTG > NC_002947/4525853‑4526146 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |