| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,543,597 | G→A | 8.7% | G11E (GGG→GAG) | rnz → | ribonuclease Z |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,543,597 | 0 | G | A | 8.7% | 223.4 / 9.1 | 80 | G11E (GGG→GAG) | rnz | ribonuclease Z |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (36/37); new base A (3/4); total (39/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.95e-01 | |||||||||||
CAAGCTCATCTGGCGACAGGATAACTAGCGGGCGGTCGACGGCGGGTGGCAATCCGGCTAAGGTGTGCGCCCCGTATCACCTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTGGTCGATTGCGGCGAAGGCACCCAGCACCGCCTGCTGCACACCCCGCTTTCGATCCGCGACCTGCGCGCGATCTTCAT > NC_002947/4543451‑4543744 | cAAGCTCATCTGGCGACAGGATAACTAGCGGGCGGTCGACGGCGGGTGGCAATCCGGCTAAGGTGTGCGCCCCGTATCACCTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCgggg > 4:149490/1‑149 (MQ=255) aaGCTCATCTGGCGACAGGATAACTAGCGGGCGGTCGACGGCGGGTGGCAATCCGGCTAAGGTGTGCGCCCCGTATCACCTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGt > 1:114094/1‑149 (MQ=255) cTCATCTGGCGACAGGATAACTAGCGGGCGGTCGACGGCGGGTGGCAATCCGGCTAAGGTGTGCGCCCCGTATCACCTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCCCGGCGGAGGTGcc < 3:31614/149‑1 (MQ=255) aTCTGGCGACAGGATAACTAGCGGGCGGTCGACGGCGGGTGGCAATCCGGCTAAGGTGTGCGCCCCGTATCACCTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCccac > 6:262597/1‑149 (MQ=255) aTCTGGCGACAGGATAACTAGCGGGCGGTCGACGGCGGGTGGCAATCCGGCTAAGGTGTGCGCCCCGTATCACCTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCCCGGCGGAGGTGccaa < 5:234494/148‑3 (MQ=255) ggCGACAGGATAACTAGCGGGCGGTCGAGGGCGGGTGGCAATCCGGCTAAGGTGTGCGCCCCGTATCACCTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAg > 1:212113/1‑149 (MQ=255) gCGACAGGATAACTAGCGGGCGGTCGACGGCGGGTGGCAATCCGGCTAAGGTGTGCGCCCCGTATCACCTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAgg < 7:165810/149‑1 (MQ=255) cGACAGGATAACTAGCGGGCGGTCGACGGCGGGTGGCAATCCGGCTAAGGTGTGCGCCCCGTATCACCTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGc < 2:212113/149‑1 (MQ=255) cAGGATAACTAGCGGGCGGTCGACGGCGGGTGGCAATCCGGCTAAGGTGTGCGCCCCGTATCACCTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACg > 7:260799/1‑149 (MQ=255) gATAACTAGCGGGCGGTCGACGGCGGGTGGCAATCCGGCTAAGGTGTGCGCCCCGTATCACCTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCaa > 5:182514/1‑149 (MQ=255) aaCTAGCGGGCGGTCGACGGCGGGTGGCAATCCGGCTAAGGTGTGCGCCCCGTATCACCTTCGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGt < 8:310213/149‑1 (MQ=255) aCTAGCGGGCGGTCGACGGCGGGTGGCAATCCGGCTAAGGTGTGCGCCCCGTATCACCTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTc < 4:141780/149‑1 (MQ=255) tAGCGGGCGGTCGACGGCGGGTGGCAATCCGGCTAAGGTGTGCGCCCCGTATCACCTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAg > 4:315144/1‑149 (MQ=255) tAGCGGGCGGTCGACGGCGGGTGGCAATCCGGCTAAGGTGTGCGCCCCGTATCACCTTGGCCGCTTCAGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAg > 3:227054/1‑149 (MQ=255) ggcggTCGACGGCGGGTGGCAATCCGGCTAAGGTGTGCGCCCCGTATCACCTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCca > 8:99024/1‑149 (MQ=255) ggTCGACGGCGGGTGGCAATCCGGCTAAGGTGTGCGCCCCGTATCACCTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGTCCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAg > 1:189844/1‑149 (MQ=255) ggTCGACGGCGGGTGGCAATCCGGCTAAGGTGTGCGCCCCGTATCACCTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAg > 1:42798/1‑149 (MQ=255) ggTCGACGGCGGGTGGCAATCCGGCTAAGGTGTGCGCCCCGTATCACCTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAg < 7:59425/149‑1 (MQ=255) gACGGCGGGTGGCAATCCGGCTAAGGTGTGCGCCCCGTATCACCTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGt < 7:99024/149‑1 (MQ=255) ggTGGCAATCCGGCTAAGGTGTGCGCCCCGTATCACCTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGaa < 2:114094/149‑1 (MQ=255) ggTGGCAATCCGGCTAAGGTGTGCGCCCCGTATCACCTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGaa < 2:42798/149‑1 (MQ=255) aaTCCGGCTAAGGTGTGCGCCCCGTATCACCTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGc > 5:42235/1‑149 (MQ=255) aTCCGGCTAAGGTGTGCGCCCCGTATCACCTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCg > 4:76777/1‑149 (MQ=255) cGGCTAAGGTGTGCGCCCCGTATCACCTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGaa < 5:86391/139‑1 (MQ=255) cGGCTAAGGTGTGCGCCCCGTATCACCTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGaa > 6:86391/1‑139 (MQ=255) ggCAAAGGTGTGCGCCCCGTATCACCTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAg > 3:33315/1‑149 (MQ=255) tAAGGTGTGCGCCCCGTATCACCTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAgc > 8:23075/1‑117 (MQ=255) tAAGGTGTGCGCCCCGTATCACCTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAgc < 7:23075/117‑1 (MQ=255) aaGGTGTGCGCCCCGTATCACCTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAg < 4:80793/101‑1 (MQ=255) aaGGTGTGCGCCCCGTATCACCTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAg > 3:80793/1‑101 (MQ=255) ggTGTGCGCCCCGTATCACCTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTg < 3:76777/149‑1 (MQ=255) tgCGCCCCGTATCACCTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTAt < 3:149490/149‑1 (MQ=255) gcgcCCCGTATCACCTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATc < 4:33315/149‑1 (MQ=255) cgcCCCGTATCACCTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCt < 4:108946/149‑1 (MQ=255) cgcCCCGTATCACCTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCt < 1:514/149‑1 (MQ=255) ccGTATCACCTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTGGTc < 6:42235/149‑1 (MQ=255) tATCACCTTGGCCGCTTCAGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTGGTCGAt < 4:227054/149‑1 (MQ=255) tCACCTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTGGTCGAtt < 8:260799/148‑1 (MQ=255) aCCTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCCCCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTGGTCGATTgcg > 3:15272/1‑149 (MQ=255) ccTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCTGCCACTGGTATCTGGTCGATTgcgg > 2:120071/1‑149 (MQ=255) gCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTGGTCGATTGCGGCGAAg < 3:315144/149‑1 (MQ=255) ccGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTGGTCGATTGCGGCGAAgg > 1:358085/1‑149 (MQ=255) cTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTGGTCGATTGCGGCGAAGGCAc < 3:124417/149‑1 (MQ=255) ggCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTa < 4:123659/120‑1 (MQ=255) ggCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTa > 3:123659/1‑120 (MQ=255) gCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTGGTCGATTGCGGCGAAGGCACCCAGCa < 5:262597/149‑1 (MQ=255) cTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTGGTCGATTGCGGCGAAGGCAcc < 2:36076/142‑1 (MQ=255) cTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTGGTCGATTGCGGCGAAGGCAcc > 1:36076/1‑142 (MQ=255) tGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAAt > 6:119592/1‑72 (MQ=255) tGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTAt < 2:318186/117‑1 (MQ=255) tGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTAt > 1:318186/1‑117 (MQ=255) tGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTGGTCGATTGCGGCGAAGGCACCCAGCACCg > 5:248225/1‑149 (MQ=255) gAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTGGTCGATTGCGGCGAAGGCACCCAGCACCGc > 5:244464/1‑149 (MQ=255) aCAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGATGCCAGCGGCAGCCACTGGt < 4:338814/111‑1 (MQ=255) aCAGGAGCCTGACCATCGACCTGCACTTCCTTGGCACCTCCCCCTGCCTGCCCACCAACGCACGCAATGACAGCGCCACAGCCGTGATCCAAGCCAGCGGCAGCCACtcga > 3:338814/1‑108 (MQ=255) aGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTGGTCGATTGCGGCGAAGGCCCCCAGCACCGCctgct > 6:268039/1‑149 (MQ=255) cATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTGGTCGATTGCGGCGAAGGCACCCAGCACCGCCTGCTGCACACCCCGc > 7:347427/1‑149 (MQ=255) gACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTGGTCGATTGCGGCGAAGGCACCCAGCACCGCCTGCTGCACACCCCGCTTTc < 6:244464/149‑1 (MQ=255) ccTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTGGTCGATTGCGGCGAAGGCACCCAGCACCGCCTGCTGCACACCCCGCTTTCGa > 3:340316/1‑149 (MQ=255) ctgctgTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGATGCCAGCGGCTGCCACTGGTATCTGGTCGATTGCGGCGAAGGCACCCAGCACCGCCTGCTGCACACCCCGCTTTCGAt < 1:120071/149‑1 (MQ=255) ctgctgTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTGGTCGATTGCGGCGAAGGCACCCAGCACCGcc < 1:236945/127‑1 (MQ=255) ctgctgTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTGGTCGATTGCGGCGAAGGCACCCAGCACCGcc > 2:236945/1‑127 (MQ=255) gctgTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTg < 4:364275/94‑1 (MQ=255) gctgTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTg > 3:364275/1‑94 (MQ=255) ctgTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGGCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTGGTCGATTGCGGCGAAGGCACCCAGCACCGCCTGCTGCACACCCCGCTTTCGATc < 6:182514/147‑1 (MQ=255) ttggtgggCACCCCGGCGGAGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTGGTCGATTGCGGCGAAGGCACCCAGCACCGCctgct > 2:111125/7‑125 (MQ=255) ttggtgggCACCCCGGCGGAGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTGGTCGATTGCGGCGAAGGCACCCAGCACCGCctgct < 1:111125/119‑1 (MQ=255) ggtgggCACCCCGGCGGAGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTGGTCGATTGCGGCGAAGGCACCCAGCACCGCCTGCTGCACACCCCGCTTTCGATCCGCGAcc > 3:107661/5‑149 (MQ=255) gtgggCACCCCGGCGGAGGTGCCAACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTGGTCGATTGCGGCGAAGGCACCCAGCACCGCCTGCTGCACACCCCGCTTTCGATCcgc < 1:194399/141‑1 (MQ=255) gtgggCACCCCGGCGGAGGTGCCAACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTGGTCGATTGCGGCGAAGGCACCCAGCACCGCCTGCTGCACACCCCGCTTTCGATCcgc > 2:194399/4‑144 (MQ=255) ttGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGTCACGCTATGTCTGCGCCACAGCCGTGATCGTAGAGATCGGCAGCAACTGGTATGTGGTCGATTGCGGCTaa < 2:15891/101‑1 (MQ=255) ttGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTGGTCGATTGCGGCGaa > 1:15891/1‑101 (MQ=255) ggCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTGGTAGATTGCGGCGAAGGCACCCATCACCGCCTGCTGCACACCCCGCTTTCGATCCGCGACCTgc < 2:358085/148‑1 (MQ=255) cTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTGGTCGATTGCGGCGAAGGCACCCAGCACCGCCTGCTGCACACCCCGCTTTCGATCCGCGACCTgcgcg > 7:294696/1‑146 (MQ=255) cTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTGGTCGATTGCGGCGAAGGCACCCAGCACCGCCTGCTGCACACCCCGCTTTCGATCCGCGACCTgcgcg < 8:294696/146‑1 (MQ=255) cTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTGGTCGATTGCGGCGAAGGCACCCAGCACCGCCTGCTGCACACCCCGCTTTCGATCCGCGACCTGCGCGCGa > 7:12384/1‑149 (MQ=255) tCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTGGTCGATTGCGGCGAAGGCACCCAGCACCGCCTGCTGCACACCCCGCTTTCGATcc > 6:49682/1‑133 (MQ=255) tCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTGGTCGATTGCGGCGAAGGCACCCAGCACCGCCTGCTGCACACCCCGCTTTCGATcc < 5:49682/133‑1 (MQ=255) ccgccgGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTGGTCGATTGCGGCGAAGGCACCCAGCACCGCctgc > 3:269918/1‑111 (MQ=255) ccgccgGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTGGTCGATTGCGGCGAAGGCACCCAGCACCGCctgc < 4:269918/111‑1 (MQ=255) gccgGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTGGTCGATTGCGGCGAAGGCACCCAGCACCGCCTGCTGCACACCCCGCTTTCGATCCGCGACCTGCGCGCGATCtt < 8:347427/149‑1 (MQ=255) ggggTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTGGTCGATTGCGGCGAAGGCACCCAGCACCGCCTGCTGCACACCCCGCTTTCGATCCGCGACCTGCGCGCGATCTtcat < 4:340316/149‑1 (MQ=255) | CAAGCTCATCTGGCGACAGGATAACTAGCGGGCGGTCGACGGCGGGTGGCAATCCGGCTAAGGTGTGCGCCCCGTATCACCTTGGCCGCTTCTGGCCTGAAACAGGAGCCTGAGCATGGACCTGCTGTTCCTTGGCACCTCCGCCGGGGTGCCCACCAAGGCACGCAATGTCAGCGCCACAGCCGTGATCGAAGCCAGCGGCAGCCACTGGTATCTGGTCGATTGCGGCGAAGGCACCCAGCACCGCCTGCTGCACACCCCGCTTTCGATCCGCGACCTGCGCGCGATCTTCAT > NC_002947/4543451‑4543744 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |