| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,716,352 | G→T | 5.5% | S528I (AGT→ATT) | PP_4173 → | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,716,352 | 0 | G | T | 5.5% | 234.0 / 3.4 | 72 | S528I (AGT→ATT) | PP_4173 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (30/38); new base T (2/2); total (32/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.20e-01 | |||||||||||
GAAGGCCTGGGTTCGACCTTCACCCTGGAGATGCCGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCC‑CCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGATGGATTGCCGCCTGCCTCACCTGGACG > NC_002947/4716204‑4716486 | gAAGGCCTGGGTTCGACCTTCACCCTGGAGATGCCGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCC‑CCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAg > 7:133594/1‑149 (MQ=255)gAAGGCCTGGGTTCGACCTTCACCCTGGAGATGCCGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCC‑CCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAg > 5:18368/1‑149 (MQ=255) aaGGCCTGGGTTCGACCTTCACCCTGGAGATGCCGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCC‑CCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAgt < 3:108455/149‑1 (MQ=255) ggcTGGGTTCGACCTTCACCCTGGAGATGCCGTTGGCCCTTGCCATCCCTGCAC‑CCGTCCCGTTGACGCCGGCAAAGAATGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATGAGTTACTGATGTTGGAGGACAATGCGGTCAACCGgtgtgt < 3:158949/146‑1 (MQ=255) ggTTCGACCTTCACCCTGGAGATGCCGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCC‑CCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTgg > 5:28041/1‑148 (MQ=255) ggTTCGACCTTCACCCTGGAGATGCCGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCC‑CCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTgg > 5:22518/1‑148 (MQ=255) ctCGACCTTCACCCTGGAGATGCCGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCC‑CCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAg < 8:133594/148‑1 (MQ=255) aCCTTCACCCTGGAGATGCCGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCCGCCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCa > 1:263826/1‑149 (MQ=255) aCCTTCACCCTGGAGATGCCGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCC‑CCGTCCCGATTACGCCGCCAACGACTGTACCAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGCTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACAGGAGTGTCTTGGAAGCCAt > 7:311911/1‑149 (MQ=255) cccTGGAGATGCCGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCC‑CCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTgcg > 7:10473/1‑148 (MQ=255) ccTGGAGATGCCGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCC‑CCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACACTCCGGTTGACCGGATTGTc < 1:228976/130‑1 (MQ=255) ccTGGAGATGCCGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCC‑CCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACACTCCGGTTGACCGGATTGTc > 2:228976/1‑130 (MQ=255) aTGCCGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCC‑CCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACACTCCGGTTGACCGGATTGTcc > 8:342328/1‑123 (MQ=255) aTGCCGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCC‑CCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACACTCCGGTTGACCGGATTGTcc < 7:342328/124‑2 (MQ=255) aTGCCGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCC‑CCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTggg > 1:65204/1‑149 (MQ=255) aTGCCGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCC‑CCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTggg < 8:350741/149‑1 (MQ=255) tGCCGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCC‑CCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTgggg < 7:2804/149‑1 (MQ=255) tGCCGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCC‑CCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTgggg < 2:263826/149‑1 (MQ=255) ggcGTTGGCCCTTGGCAACCGTGCGC‑CCGTGCCGTTGACGGCGCCAACGACTGTACGATGGACGGTGCCGGACAATGTTCAGGTACTGCTGGTGGATGTCAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTgggg < 8:311911/146‑1 (MQ=255) cGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCC‑CCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTg < 8:138918/149‑1 (MQ=255) gTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCC‑CCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTgg < 8:160006/149‑1 (MQ=255) ggCCCTTGCCAACCCTGCCC‑CCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCa < 8:343107/148‑1 (MQ=255) gCCCTTGCCAACCCTGCCC‑CCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAg > 2:180383/1‑148 (MQ=255) ccTTGCCAACCCTGCCC‑CCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGc > 4:229708/1‑120 (MQ=255) ccTTGCCAACCCTGCCC‑CCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTAt > 8:131706/1‑149 (MQ=255) ccTTGCCAACCCTGCCC‑CCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTAt > 4:276779/1‑149 (MQ=255) cAACCCTGCCC‑CCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACgg < 4:58349/149‑1 (MQ=255) ccTGCCC‑CCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCag > 3:185436/1‑148 (MQ=255) ccTGCCC‑CCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCag > 4:312414/1‑148 (MQ=255) ccc‑ccGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGAt < 7:137866/149‑1 (MQ=255) cc‑ccGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATg < 7:314260/149‑1 (MQ=255) ccgtcccgtTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCa < 7:58622/105‑1 (MQ=255) ccgtcccgtTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCa > 8:58622/1‑105 (MQ=255) ccgtcccgtTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGACGTGGCAGCCATGCTGCGCAGCCTGCGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATgcc > 8:267891/1‑147 (MQ=255) gtcccgtTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCt < 1:180383/149‑1 (MQ=255) tcccgtTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCtt < 2:301178/149‑1 (MQ=255) ccgtTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTg > 1:292513/1‑148 (MQ=255) aCGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGt < 3:189006/149‑1 (MQ=255) aCGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGt < 6:18368/149‑1 (MQ=255) aCGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGt > 1:370293/1‑149 (MQ=255) ccgccAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGa < 2:292513/149‑1 (MQ=255) ccgccAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCATCGa < 3:276779/149‑1 (MQ=255) cgccAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGc < 1:128118/124‑1 (MQ=255) cgccAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGc > 2:128118/1‑124 (MQ=255) cgccAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAg > 2:246082/1‑149 (MQ=255) aaCGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTgg < 5:301754/149‑1 (MQ=255) tACGAACGACGGTGCCGGACAATGAGCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTcggccgg < 7:267891/149‑1 (MQ=255) gaacgaCTGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTc > 2:105495/1‑65 (MQ=255) gaacgaCGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTc < 1:105495/65‑1 (MQ=255) ggTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTGAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTtg < 6:28041/149‑1 (MQ=255) ggTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGGCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGATGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTtg < 6:22518/149‑1 (MQ=255) cGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGcc < 1:246082/149‑1 (MQ=255) cAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGc > 5:108255/1‑149 (MQ=255) aaTGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTcggcc > 8:197541/1‑127 (MQ=255) aaTGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTcggcc < 7:197541/127‑1 (MQ=255) tGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCa < 4:209497/129‑1 (MQ=255) tGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCa > 3:209497/1‑129 (MQ=255) tGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGa < 7:131706/149‑1 (MQ=255) tGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGa < 2:370293/149‑1 (MQ=255) tGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGa < 8:10473/149‑1 (MQ=255) tCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGAAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGGGCGGATg > 5:214936/1‑148 (MQ=255) ctgctgGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGTCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGATGGATTgcc < 2:65204/148‑1 (MQ=255) ctgctgGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGATGGATTgcc < 3:56219/148‑1 (MQ=255) tgctgGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGATGGATTgccgc > 2:80579/1‑149 (MQ=255) ggtggAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCAGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCAGGCAGCGCTTTGATGCCGTGCTGATGGATTGCCgcctgc > 2:239571/1‑149 (MQ=255) gtggAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGATGGATTGCCgcctgcc > 3:190483/1‑149 (MQ=255) gtggAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGATGGATTGCCgcctgcc > 5:74901/1‑149 (MQ=255) gaCAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGATGGATTGCCGCCTGCCTCACCt < 1:80579/149‑1 (MQ=255) gaCAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGATGGATTGCCGCCTGCCTCACCt < 3:312414/149‑1 (MQ=255) aaTCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGc < 2:136468/91‑1 (MQ=255) aTCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGa < 3:182229/123‑1 (MQ=255) aTCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGa > 4:182229/1‑123 (MQ=255) aTCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGATGGATTGCCGCCTGCCTCACCTGGAc < 4:185436/149‑1 (MQ=255) tCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGATGGATTGCCGCCTGCCTCACCTGGACg > 3:189805/1‑149 (MQ=255) gAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTtgctg > 3:182226/1‑101 (MQ=255) gAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTtgctg < 4:182226/101‑1 (MQ=255) | GAAGGCCTGGGTTCGACCTTCACCCTGGAGATGCCGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCC‑CCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCCATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGATGGATTGCCGCCTGCCTCACCTGGACG > NC_002947/4716204‑4716486 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |