Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,781,591 | G→C | 5.8% | P1908R (CCC→CGC) | pvdJ ← | non‑ribosomal peptide synthetase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,781,591 | 0 | G | C | 5.8% | 259.3 / 4.3 | 86 | P1908R (CCC→CGC) | pvdJ | non‑ribosomal peptide synthetase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (42/39); new base C (2/3); total (44/42) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.73e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.37e-01 |
GAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCACGCCTGGATATCCACCAAAGGCAAGTGCTCGTGCTCGCGCAGGTTGAGGTTGTGGTCAAGCAGTGACTTGAGCCACGCCTTGGCCGT > NC_002947/4781446‑4781739 | gAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGgcg > 1:241990/1‑149 (MQ=255) gAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGgcg > 4:265611/1‑149 (MQ=255) aCAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCTAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGcgcg < 5:203458/149‑1 (MQ=255) aGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGtt > 6:129289/1‑149 (MQ=255) gTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTcgaac < 4:124717/148‑1 (MQ=255) cATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTcgaacacg < 8:97057/149‑1 (MQ=255) aTACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTcgaacacg < 2:32318/148‑1 (MQ=255) tACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTcgaacacgaa < 6:93613/149‑1 (MQ=255) gACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAg < 8:199161/149‑1 (MQ=255) aCAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAgg > 2:131448/1‑149 (MQ=255) cAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCg > 8:192575/1‑148 (MQ=255) aGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑aa > 5:38051/1‑149 (MQ=255) ccAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTcgaa < 6:162984/127‑1 (MQ=255) ccAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTcgaa > 5:162984/1‑127 (MQ=255) cAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAggg < 2:241990/149‑1 (MQ=255) ccTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGa > 1:713/1‑149 (MQ=255) cTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGCGCGCGTtctc > 2:188895/1‑117 (MQ=255) cTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGCGCGCGTtctc > 2:183017/1‑117 (MQ=255) cTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGCGCGCGTtctc < 1:183017/117‑1 (MQ=255) cTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGCGCGCGTtctc < 1:188895/117‑1 (MQ=255) aCCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGAcc < 4:153585/147‑1 (MQ=255) aCCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGCGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGc < 1:270971/149‑1 (MQ=255) gggTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGAATCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTAcc > 2:316339/1‑149 (MQ=255) caccaccacGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCt < 6:132775/149‑1 (MQ=255) caccacGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGc > 7:322086/1‑149 (MQ=255) aaccacGGTGAGCGTGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCACTGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGc < 8:334310/148‑1 (MQ=255) cacGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCTAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTcgaacacgaac < 7:156195/109‑1 (MQ=255) cacGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCg < 3:38350/139‑1 (MQ=255) cacGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCg > 4:38350/1‑139 (MQ=255) cacGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCAAGGGCGCGTTCTccaacacgaaa > 8:156195/1‑108 (MQ=255) aGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCACGCCTg < 7:192575/149‑1 (MQ=255) gTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGc < 5:204388/134‑1 (MQ=255) gTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGc > 6:204388/1‑134 (MQ=255) tgcgCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCACGCCTGGATATCCACCAAAGGCAAg < 4:14908/149‑1 (MQ=255) cgAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCACGCCTGGATATCCACCAAAGGCAAgtgct > 5:65659/1‑149 (MQ=255) gAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCACGCCTGGATATccac > 4:194782/1‑134 (MQ=255) gAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCACGCCTGGATATccac < 3:194782/134‑1 (MQ=255) gAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCACGCCTGGATATCCACCAAAGGCAAgtgctc > 5:159975/1‑149 (MQ=255) tCCCATCCTTGATCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCGAACGCTGGACTCCACGGGCGCTTTCTCGAACACGAACAGGCTGTAG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCAc < 4:49865/116‑1 (MQ=39) tCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCAc > 3:49865/1‑116 (MQ=255) tCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCAc > 3:124504/1‑116 (MQ=255) tCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCAc < 4:124504/116‑1 (MQ=255) tCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCACGCCTGGATATCCACCAAAGGCAAgtgctcgtgc > 4:355028/1‑149 (MQ=255) ccAGCCTTGAGCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCACGCCTGGATATCCACCAAAGGCAAgtgctcgtgc < 1:131448/147‑1 (MQ=255) ccAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTc < 6:66046/80‑1 (MQ=255) ccAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTc > 5:66046/1‑80 (MQ=255) ccAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGc < 6:92522/89‑1 (MQ=255) ccAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCACGCCt > 3:184046/1‑118 (MQ=255) ccAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCACGCCt < 4:184046/118‑1 (MQ=255) ccAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCACGCCTGGATATCCACCAAAGGCAAgtgctcgtgctc > 1:296312/1‑149 (MQ=255) ccAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCACGCCTGGATATCCACCAAAGGCAAgtgctcgtgctc > 2:371409/1‑149 (MQ=255) ccAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCACGCCTGGATATCCACCAAAGGCAAgtgctcgtgctc > 4:311855/1‑149 (MQ=255) ccAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCACGCCTGGATATCCACCAAAGGCAAgtgctcgtgctc > 6:234353/1‑149 (MQ=255) ccAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCACGCCTGGATATCCACCAAAGGCAAgtgctcgtgctc > 5:306687/1‑149 (MQ=255) ccAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCACGCCTGGATATCCACCAAAGGCAAgtgctcgtgctc > 3:45553/1‑149 (MQ=255) gACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCACGCCTGGATATCCACCAAAGGCAAGTGCTCGTGCTCGCGCagg < 3:311855/148‑1 (MQ=255) aCCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCACGCCTGGATATCCACCAAAGGCAAGTGCTCGTGCTCGCGCaggtt > 6:215863/1‑149 (MQ=255) aCCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCACGCCTGGATATCCACCAAAGGCAAGTGCTCGTGCTCGCGCaggtt < 6:159975/149‑1 (MQ=255) cTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCACGCCTGGATATCCACCAAAGGCAAgtgc > 8:186422/1‑130 (MQ=255) cTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCACGCCTGGATATCCACCAAAGGCAAgtgc < 7:186422/130‑1 (MQ=255) cTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCACGCCTGGATATCCACCAAAGGCAAGTGCTCGTGCTCGCGCaggtt > 1:355855/1‑147 (MQ=255) ttCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCACGCCTGGATATCCACCAAAGGCAAGTGCTCGTGCTCGCGCaggttgag > 5:126361/1‑149 (MQ=255) tCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCACGCCTGGATATCCACCAAAGGCAAGTGCTCGTGCTCGCGCaggttgagg > 5:328727/1‑149 (MQ=255) cATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCACGCCTGGATATCCACCAAAGGCAAGTGCTCGTGCTCGCGCaggttgaggt > 5:16273/1‑149 (MQ=255) tGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCACGCCTGGATATCCACCAAAGGCAAGTGCTCGTGCTCGCGCaggttgaggttg < 3:265611/149‑1 (MQ=255) gTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCACGCCTGGATATCCACCAAAGGCAAGTGCTCGTGCTCGCGCAGGTTGAGGTtgtg < 3:355028/149‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) gACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACAAGAACAGGATGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCACGCCTGGATATCCACCAAAGGCAAGTGCTCGTGCTCGCGCAGGTTGAGGTTGTGGTCAAGCAGTGACTTGAGCCAc < 6:292158/147‑1 (MQ=255) cACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCACGCCTGGATATCCACCAAAGGCAAGTGCTCGTGCTCGCGCAGGTTGAGGTTGTGGTCaa < 7:332898/125‑1 (MQ=255) cACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCACGCCTGGATATCCACCAAAGGCAAGTGCTCGTGCTCGCGCAGGTTGAGGTTGTGGTCaa > 8:332898/1‑125 (MQ=255) cACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCACGCCTGGATATCCACCAAAGGCAAGTGCTCGTGCTCGCGCAGGTTGAGGTTGTGGTCAAGCAGTGACTTGAGCCACGCCTTgg > 1:163790/1‑149 (MQ=255) cACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCACGCCTGGATATCCACCAAAGGCAAGTGCTCGTGCTCGCGCAGGTTGAGGTTGTGGTCAAGCAGTGACTTGAGCCACGCCTTgg > 5:354998/1‑149 (MQ=255) aCGGGCGCGTTCTCGAACAAGAACATGCTGTCGAAAACAGGGTCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCACGCCTGGATATCCACCAAAGGCAAGTGCTCGTGCTCGCGCAGGTTGAGGTTGTGGTCAAGCAGTGACTTGAGCCACGCCTTg < 1:316339/149‑1 (MQ=255) cGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCACGCCTGGATATCCACCAAAGGCAAGTGCTCGTGCTCGCGCAGGTTGAGGTTGTGGTCAAGCAGt < 6:126744/128‑1 (MQ=255) cGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCACGCCTGGATATCCACCAAAGGCAAGTGCTCGTGCTCGCGCAGGTTGAGGTTGTGGTCAAGCAGt > 5:126744/1‑128 (MQ=255) ggCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCACGCCTGGATATCCACCAAAGGCAAGTGCTCGTGCTCGCGCAGGTTGAGGTTGTGGTCAAGCAGTGACTTGAGCCACGCCTTGGCCGt < 8:322086/149‑1 (MQ=255) | GAACAGGCGTTGGTCATACGACAGGTGCAGGCCCAGCACCTCACCCGGGTACACCACCACGGTGAGCGGGTAGTTGGTGTGCGTGCGCGAACTCCCAGCCTTGACCTTCATGGTCGAAGCCTGGGCGCCAACGCTGGACTCCACGGGCGCGTTCTCGAACACGAACAGGCTGTCG‑‑AACAGGGCCTGACCGCTACCGACCTCGCTGCACGCCTGGATATCCACCAAAGGCAAGTGCTCGTGCTCGCGCAGGTTGAGGTTGTGGTCAAGCAGTGACTTGAGCCACGCCTTGGCCGT > NC_002947/4781446‑4781739 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |