| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,807,446 | A→T | 7.5% | F149Y (TTC→TAC) ‡ | PP_4234 ← | bifunctional aldehyde oxidase/xanthine dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,807,446 | 0 | A | T | 7.5% | 232.0 / 7.6 | 80 | F149Y (TTC→TAC) ‡ | PP_4234 | bifunctional aldehyde oxidase/xanthine dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/37); new base T (3/3); total (40/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.27e-01 | |||||||||||
GGAAGCTGCCATAAGGGTCGCGCTGGTACAGCGGCGCCTGGGCACCGTAACGGATCGCCTGCTGATTGAACTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGCAATGCCGTCCTGTTCGAGGTCGGCGGCGGTGACGATGCGGTCCGGCTGCAGGTCGCTGCCGAGCAGGCTGAGGTCATGGCCGGCATAA > NC_002947/4807303‑4807592 | ggAAGCTGCCATAAGGGTCGCGCTGGTACAGCGGCGCCTGGGCACCGTAACGGATCGCCTGCTGATTGAACTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATc > 5:381100/1‑149 (MQ=255) cTGCCATAAGGGTCGCGCTGGTACAGCGGCGCCTGGGCACCGTAACGGATCGCCTGCTGATTGAACTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGTTCATCGGcta < 7:341198/149‑3 (MQ=255) cTGCCATAAGGGTCGCGCTGGTACAGCGGCGCCTGGGCACCGTAACGGATCGCCTGCTGATTGAACTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCAc > 2:39827/1‑149 (MQ=255) ccATAAGGGTCGCGCTGGTACAGCGGCGCCTGGGCACCGTAACGGATCGCCTGCTGATTGAACTGCAGCTTGCACTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCtt > 7:307467/1‑149 (MQ=255) ggTCGCGCTGGTACAGCGGCGCCTGGGCACCGTAACGGATCGCCTGCTGATTGAACTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGggc < 5:317350/149‑1 (MQ=255) gcgcTGGTACAGCGGCGCCTGGGCACCGTAACGGATCGCCTGCTGATTGAACTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGggcggc < 1:124202/148‑1 (MQ=255) gcgcTGGTACAGCGGCGCCTGGGCACCGTAACGGATCGCCTGCTGATTGAACTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGgca < 4:98536/149‑1 (MQ=255) gcTGGTACAGCGGCGCCTGGGCACCGTAACGGATCGCCTGCTGATTGAACTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑Gcc < 8:262127/139‑1 (MQ=255) gcTGGTACAGCGGCGCCTGGGCACCGTAACGGATCGCCTGCTGATTGAACTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑Gcc > 7:262127/1‑139 (MQ=255) gcTGGTACAGCGGCGCCTGGGCACCGTAACGGATCGCCTGCTGATTGAACTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑Gcc < 2:136303/139‑1 (MQ=255) gcTGGTACAGCGGCGCCTGGGCACCGTAACGGATCGCCTGCTGATTGAACTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGagctccg > 1:136303/1‑143 (MQ=255) gcTGGTACAGCGGCGCCTGGGCACCGTAACGGATCGCCTGCTGATTGAACTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGACCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGggcggc < 5:131517/146‑1 (MQ=255) tGGTACAGCGGCGCCTGGGCACCGTAACGGATCGCCTGCTGATTGAACTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGcagcag > 7:25094/1‑149 (MQ=255) gTACAGCGGCGCCTGGGCACCGTAACGGATCGCCTGCTGATTGAACTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCagcagc < 2:124543/148‑1 (MQ=255) tACAGCGGCGCCTGGGCACCGTAACGGATCGCCTGCTGATTGAACTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCgg < 2:10757/149‑1 (MQ=255) aCAGCGGCGCCTGGGCACCGTAACGGATCGCCTGCTGATTGAACTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCggg > 4:158030/1‑149 (MQ=255) gcggcgCCTGGGCACCGTAACGGATCGCCTGCTGATTGAACTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCg < 2:210024/149‑1 (MQ=255) gcggcgCCTGGGCACCGTAACGGATCGCCTGCTGATTGAACTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCg > 7:92088/1‑149 (MQ=255) cggcgCCTGGGCACCGTAACGGATCGCCTGCTGATTGAACTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCgg < 2:252629/149‑1 (MQ=255) ggcgCCTGGGCACCGTAACGGATCGCCTGCTGATTGAACTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCggg < 5:302153/149‑1 (MQ=255) ggcgCCTGGGCACCGTAACGGATCGCCTGCTGATTGAACTGCAGCTTGCACTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCggg < 8:307467/149‑1 (MQ=255) ccTGGGCACCGTAACGGATCGCCTGCTGATTGAACTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCAcc < 6:63342/119‑1 (MQ=255) ccTGGGCACCGTAACGGATCGCCTGCTGATTGAACTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCAcc > 5:63342/1‑119 (MQ=255) atGGGCACCGTAACGGATCGCCTGCTGATTGAACTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGACGCGCTCGCAGTCATGCCAGAACAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAAt > 8:95945/2‑149 (MQ=255) aCCGTAACGGATCGCCTGCTGATTGAACTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCt < 8:297426/149‑1 (MQ=255) aCCGTAACGGATCGCCTGCTGATTGAACTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCt > 4:33258/1‑149 (MQ=255) cGTAACGGATCGCCTGCTGATTGAACTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGTTCATCGGcta < 8:36095/109‑3 (MQ=255) cGTAACGGATCGCCTGCTGATTGAACTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGTTCATCGGcta > 7:36095/1‑107 (MQ=255) cGTAACGGATCGCCTGCTGATTGAACTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATggg > 3:159638/1‑144 (MQ=255) cGTAACGGATCGCCTGCTGATTGAACTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATggg < 4:159638/144‑1 (MQ=255) cGTAACGGATCGCCTGCTGATTGAACTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCg > 5:206085/1‑149 (MQ=255) cGTAACGGATCGCCTGCTGATTGAACTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCg < 7:289302/149‑1 (MQ=255) cGTAACGGATCGCCTGCTGATTGAACTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGACAGATAAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCCGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCCGGTCGGGCGAATGGGCCTCg > 8:147871/1‑149 (MQ=255) gATCGCCTGCTGATTGAACTGCAGCTTGCCCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAgg > 3:295713/1‑149 (MQ=255) aTCGCCTGCTGATTGAACTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGc < 8:92088/149‑1 (MQ=255) ctgATTGAACTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGCAATGCCg < 2:348812/148‑1 (MQ=255) aTTGAACTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGCAATGCCGTc < 3:33258/147‑1 (MQ=255) aaCTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATc < 6:311377/81‑1 (MQ=255) aaCTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATc > 5:311377/1‑81 (MQ=255) aaCTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGCAATGCCATc > 4:17296/1‑143 (MQ=255) aaCTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGCAATGCCATc < 3:17296/143‑1 (MQ=255) cTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCggg < 2:301230/93‑1 (MQ=255) cTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGCAATGCCGTCCTGTTc > 1:247281/1‑147 (MQ=255) tGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGCAATGCCg < 6:312038/138‑1 (MQ=255) tGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGCAATGCCg > 5:312038/1‑138 (MQ=255) gCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGCAATGCCGTCCTGTTCGAgg > 6:290593/1‑149 (MQ=255) gctcTTGGCCTGTCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCATGATCGCCACCGTGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGCAATGCCGTCCTGTTCGAGGTcggc < 2:247281/144‑1 (MQ=255) gcTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGCAATGCCGTCCTGTTCGAGGTcggcggcg > 6:226047/1‑149 (MQ=255) gcTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGCAATGCCGTCCTGTTCGAGGTcggcgag > 1:328613/1‑146 (MQ=255) gcTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGGCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGCAATGCCGTCCTGTTCGAGGTcggc < 2:328613/145‑1 (MQ=255) ttGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCTGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGCAATGCCGTCCTGTTCGAGGTCGGCGGCGGt > 8:269132/1‑149 (MQ=255) ggCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAgg > 6:56958/1‑116 (MQ=255) gCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGCAATGCCGTCCTGTTCGAGGTCGGCGGCGGTGa < 1:69341/148‑1 (MQ=255) gCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGCAATGCCGTCCTGTTCGAGGTCGGCGGCGGTGAc > 3:114197/1‑149 (MQ=255) gCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGCAATGCCGTCCTGTTCGAGGTCGGCGGCGGTGACGATg < 3:158030/148‑1 (MQ=255) aGCGCTAGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGTGCCAGGCAATGCCGTCCTGTTCGAGGTCGCCGGAGGTGACGATGCGGTcc > 7:305892/1‑149 (MQ=255) cTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGCAATGCCGTCCTGTTCGAGGTCGGCGGCGGTGACGATGCGGTCCGGCt > 7:9055/1‑149 (MQ=255) aaGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCgg < 3:195587/47‑1 (MQ=255) aaGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCgg > 4:195587/1‑47 (MQ=255) gTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGCAATGCCGTCCTGTTCGAGGTCGGCGGCGGTGACGATGCGGTCCGGCTGCAGGt < 4:295713/149‑1 (MQ=255) tCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCTGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGCAATGCCGTCCTGTTCGAGGTCGGCGGCGGTGACGATGCGGTCCGGCTGCAGGTc < 6:381100/149‑1 (MQ=255) aTGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGCAATGCCGTCCTGTTCGAGGTCGGCGGCGGTGACGATGCGGTCCGGCTGCAGGTCg > 2:217136/1‑148 (MQ=255) aTGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGCAATGCCGTCCTGTTCGAGGTCGGCGGCGGTGACGATGCGGTCCGGCTGCAGGTCg < 1:217136/148‑1 (MQ=255) aTGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGCAATGCCGTCCTGTTCGAGGTCGGCGGCGGTGACGATGCGGTCCGGCTGCAGGTCGc > 4:54087/1‑149 (MQ=255) aTGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGCAATGCCGTCCTGTTCGAGGTCGGCGGCGGTGACGATGCGGTCCGGCTGCAGGTCGc > 5:242332/1‑149 (MQ=255) gCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTTGGCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGCAATGCCGTCCTGTTCGAGGTCGGCGGCGGTGACGATGCGGTCCGGCTGCAGGTCGCt > 1:83996/1‑149 (MQ=255) tCGCCACGGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGCAATGCCGTCCTGTTCGAGGTCGGCGGCGGTGACGATGCGGTCCGGCTGCAGGTCGCTGCCGAGCAGGCTg < 7:95945/149‑1 (MQ=255) ccACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGCAATGCCGTCCTGTTCGAGGTcggcggcg > 4:317236/1‑104 (MQ=255) ccACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGCAATGCCGTCCTGTTCGAGGTcggcggcg < 3:317236/104‑1 (MQ=255) cACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGc < 6:223312/55‑1 (MQ=255) cACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGc > 5:223312/1‑55 (MQ=255) ccGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGCAATGCCGTCCTGTTCGAGGTCGGCGGCGGTGACGATGCGGTCCGGCTGCAGGTCGCTGCCGAGCAGGCTGAGGTCa > 1:84655/1‑149 (MQ=255) cGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGCAATGCGGTCCTGTTCGAGGTCGGCGGCGGTGACGATGCGGTCCGGCTGCAGGTCGCTGCCGAGCAGGCTGAGGTCAt > 1:120334/1‑149 (MQ=255) gtgCCGATGTTCATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGCAATGCCGTCCTGTTCGAGGTCGGCGGCGGTGACGATGCGGTCCGGCTGCAGGTCGCTGCCGAGCAGGCTGAGGTCATGGcc > 5:57382/3‑149 (MQ=255) gCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCTGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGCAATGCCGTCCTGTTCGAGGTCGGCGGCGGTGACGATGCGGTCCGGCTGCAGGTCGCTGCCGAGCAGGCTGAGGTCATGGCCg < 7:269132/148‑1 (MQ=255) ccGATGTTCATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGCAATGCCGTCCTGTTCGAGGTCGGCGGCGGTGACGATGCGGTCCGGCTGCAGGTCGCTGCCGAGCAGGCTGAGGTCAt < 8:10294/142‑1 (MQ=255) ccGATGTTCATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGCAATGCCGTCCTGTTCGAGGTCGGCGGCGGTGACGATGCGGTCCGGCTGCAGGTCGCTGCCGAGCAGGCTGAGGTCAt > 7:10294/1‑142 (MQ=255) tGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGCAATGCCGTCCTGTTCGAGGTCGGCGGCGGTGACGATGCGGTCCGGCTGCAGGTCGCTGCCGAGCAGGCTGAGGTCATGGCCGGCATaa < 3:310329/149‑1 (MQ=255) gAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGCAATGCCGTCCTGTTCGAGGTCGGCGGCGGt < 2:336899/90‑1 (MQ=255) gAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGCAATGCCGTCCTGTTCGAGGTCGGCGGCGGt > 1:336899/1‑90 (MQ=255) | GGAAGCTGCCATAAGGGTCGCGCTGGTACAGCGGCGCCTGGGCACCGTAACGGATCGCCTGCTGATTGAACTGCAGCTTGCGCTTGGCCTGGCGGAAGCGCTCGAAGTCATGCCAGATCAGGATCGCCACCGGGTAGCCGATGAACATCGGCACCTT‑GCCGGGCGGCAGCAGCGGGTCGGGCGAATGGGCCTCGGGCCAGGCAATGCCGTCCTGTTCGAGGTCGGCGGCGGTGACGATGCGGTCCGGCTGCAGGTCGCTGCCGAGCAGGCTGAGGTCATGGCCGGCATAA > NC_002947/4807303‑4807592 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |