| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,840,005 | A→T | 6.9% | Y124F (TAC→TTC) | ccoN‑II → | cbb3‑type cytochrome c oxidase subunit 1 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,840,005 | 0 | A | T | 6.9% | 200.6 / 2.6 | 67 | Y124F (TAC→TTC) | ccoN‑II | cbb3‑type cytochrome c oxidase subunit 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (36/26); new base T (2/3); total (38/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.45e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 | |||||||||||
TTCGGCACCAGCTACTACGTGGTGCAGCGCACCTGCCAGACCCGGCTGATCTCCGACAGCATGGCCGCCTTCACCTTCTGGGGT‑TGGCAAGCCGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTG > NC_002947/4839857‑4840144 | ttCGGCACCAGCTACTACGTGGTGCAGCGCACCTTCCAGACCCGGCTGATCTCCGACAGCATGGCCGCCTTCACCTTCTGGGGT‑TGGCAAGCCGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATa < 7:317333/149‑1 (MQ=255) gtcACCAGCTACTACGTGGTGCAGCGCACCTGCCAGTCCCGGCTGATCTCCGACAGCATGGCCGCCTTCACCTTCTGGGGT‑TGGCAAGCCGTGATGGG‑CGGCGCGCTGATCACCCTGGCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATTCGc < 4:82815/147‑1 (MQ=255) ggCACCAGCTACTACGTGGTGCAGCGCACCTGCCAGACCCGGCTGATCTCCGACAGCATGGCCGCCTTCACCTTCTGGGGT‑TGGCAAGCCGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGc > 2:324843/1‑149 (MQ=255) gCACCAGCTACTACGTGGTGCAGCGCACCTGCCAGACCCGGCTGATCTCCGACAGCATGGCCGCCTTCACCTTCTGGGGT‑TGGCAAGCCGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGcc > 5:105120/1‑149 (MQ=255) cACCAGCTACTACGTGGTGCAGCGCACCTGCCAGACCCGGCTGATCTCCGACAGCATGGCCGCCTTCACCTTCTGGGGT‑TGGCAAGCCGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGcc > 2:328519/1‑148 (MQ=255) cACCAGATACTACGTGGTGCAGCGCACCTGCCAGACCCGGCTGATCTCCGACAGCATCGCCGCCTTCACCTTCTGCGGT‑TGGCAAGCCGTGATCGT‑CGGCGCGATGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGcc > 5:378319/1‑148 (MQ=255) aCCAGCTACTACGTGGTGCAGCGCACCTGCCAGACCCGGCTGATCTCCGACAGCATGGCCGCCTTCACCTTCTGGGGT‑TGGCAAGCCGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGcc > 7:53534/1‑147 (MQ=255) tgCAGCGCACCTGCCAGACCCGGCTGATCTCCGACAGCATGGCCGCCTTCACCTTCTGGGGT‑TGGCAAGCCGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTg < 1:324843/149‑1 (MQ=255) aGCGCACCTGCCAGACCCGGCTGATCTCCGACAGCATGGCCGCCTTCACCTTCTGGGGTAGGGCAAGCCGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATAACCCTGCCGATGGGCTACCCCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGc > 1:299264/1‑149 (MQ=255) gCCAGACCCGGCTGATCTCCGACAGCATGGCCGCCTTCACCTTCTGGGGT‑TGGCAAGCCGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCctgctg < 4:219500/149‑1 (MQ=255) cAGACCCGGCTGATCTCCGACAGCATGGCCGCCTTCACCTTCTGGGGT‑TGGCAAGCCGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGc < 1:214383/149‑1 (MQ=255) gCTGATCTCCGACAGCATGGCCGCCTTCACCTTCTGGGGT‑TGGCAAGCCGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCt > 7:205403/1‑149 (MQ=255) gCTGATCTCCGACAGCATGGCCGCCTTCACCTTCTGGGGT‑TGGCAAGCCGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCt < 1:51446/149‑1 (MQ=255) tGATATCCGACAGCATGGCCGCCTTCACATTCTGGGGT‑TGGCAAGCCGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATAAGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTgg > 3:293232/1‑149 (MQ=255) aTCTCCGACAGCATGGCCGCCTTCACCTTCTGGGGT‑TGGCAAGCCGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTggg < 1:328519/148‑1 (MQ=255) aTCTCCGACAGCATGGCCGCCTTCACCTTCTGGGGT‑TGGCAAGCCGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTgg < 8:205403/147‑1 (MQ=255) ctcCGACAGAATGGCCGCCTTCACCTTCTGGGGT‑TGGCAAGCCGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCCATCGGCTAAACCACAACCAAGGAATACGCCGAGCTGGC‑GTGGCCGCTGGCGCTCATGCTGGCCATCGTCTGGGtt > 7:196762/1‑148 (MQ=255) tcCGACAGCATGGCCGCCTTCACCTTCTGGGGT‑TGGCAAGCCGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑c > 3:242970/1‑149 (MQ=255) aCAGCATGGCCGCCTTCACCTTCTGGGGT‑TGGCAAGCCGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTAc > 3:73495/1‑149 (MQ=255) aGCATGGCCGCCTTCACCTTCTGGGGT‑TGGCAAGCCGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACgg > 7:86943/1‑149 (MQ=255) aTGGCCGCCTTCACCTTCTGGGGT‑TGGCAAGCCGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑c < 6:59633/140‑1 (MQ=255) aTGGCCGCCTTCACCTTCTGGGGT‑TGGCAAGCCGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑c > 5:59633/1‑140 (MQ=255) gccgccTTCACCTTCTGGGGT‑TGGCAAGCCGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACGGGCTGgt > 7:361941/1‑149 (MQ=255) cACCTTCTGGGGT‑TGGCAAGCCGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACGGGCTGGTGttcttc < 2:299264/148‑1 (MQ=255) cACCTTCTGGGGT‑TGGCAAGCCGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACGGGCTGGTGttcttc < 4:242970/148‑1 (MQ=255) aCCTTCTGGGGT‑TGGCAAGCCGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACGGGCTGGTGTTCTTCg < 6:105120/148‑1 (MQ=255) ttCTGGGGT‑TGGCAAGCCGTGATCGTGCGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCa > 1:196166/1‑149 (MQ=255) cTGGGGT‑TGGCAAGCCGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCa < 2:196166/146‑1 (MQ=255) gggT‑TGGCAAGCCGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTa < 4:253013/146‑1 (MQ=255) t‑tGGCAAGCCGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACGGGCTg > 4:24180/1‑127 (MQ=255) ggCAAGCCGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCaaa > 4:329649/1‑149 (MQ=255) ggCAAGCCGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCaaa > 4:8624/1‑149 (MQ=255) gCAAGCCGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACGGGCTg > 4:192642/1‑124 (MQ=255) gCAAGCCGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACGGGCTg < 3:192642/124‑1 (MQ=255) gCAAGCCGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAAc < 8:53534/149‑1 (MQ=255) aGCCGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATTCGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGc > 2:20657/1‑148 (MQ=255) aGCCGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGc > 5:167301/1‑148 (MQ=255) aGCCGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACACTGCCGATGGGCTAAACCACCACCAAGGAATTAGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATAGTCTGGGTTA‑CCTACGGGATGGTGTTCTTCGGCACAATCGTCAAAccc > 2:264048/1‑146 (MQ=255) cGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATTCGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGa < 1:20657/149‑1 (MQ=255) cGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGa > 2:346503/1‑149 (MQ=255) gTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATTCGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTAGCCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGa < 1:264048/149‑1 (MQ=255) gTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACGGGATGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGa > 5:81807/1‑148 (MQ=255) tcgt‑cgGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAATGCAAGACCAAg < 3:8624/149‑1 (MQ=255) cgcTGATGAGCCTGGCGATGGGCTACACCACCACCACGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTTGCTATCCTGCTGGCCATCTGCTGGGTTA‑CCTACGGTCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTAt < 8:196762/149‑1 (MQ=255) gcTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATg < 8:86943/149‑1 (MQ=255) gATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCg > 3:31320/1‑149 (MQ=255) tCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCgg > 2:140951/1‑148 (MQ=255) cACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGc > 4:330996/1‑148 (MQ=255) cccTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAAc > 3:95654/1‑149 (MQ=255) ccTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGACGTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAAc > 1:269594/1‑149 (MQ=255) ccTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTc < 1:182791/142‑1 (MQ=255) ccTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTc > 2:182791/1‑142 (MQ=255) cTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATAGGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTg < 4:73495/149‑1 (MQ=255) tGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATg > 6:338468/1‑138 (MQ=255) 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caccaccacCAATGAATACGCCTAGCTGGA‑GTGGCCGAGGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGt < 8:151681/149‑1 (MQ=255) caccaccacCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGt < 4:293232/149‑1 (MQ=255) caccaccacCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGt > 8:147096/1‑149 (MQ=255) ccaccaccaAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTc < 1:140951/149‑1 (MQ=255) caccaccaAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCa > 8:323402/1‑149 (MQ=255) ccaccaAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATc < 8:79573/149‑1 (MQ=255) ccaAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTg < 8:361941/149‑1 (MQ=255) gAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATc < 5:61323/45‑1 (MQ=255) gAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATc > 6:61323/1‑45 (MQ=255) | TTCGGCACCAGCTACTACGTGGTGCAGCGCACCTGCCAGACCCGGCTGATCTCCGACAGCATGGCCGCCTTCACCTTCTGGGGT‑TGGCAAGCCGTGATCGT‑CGGCGCGCTGATCACCCTGCCGATGGGCTACACCACCACCAAGGAATACGCCGAGCTGGA‑GTGGCCGCTGGCGATCCTGCTGGCCATCGTCTGGGTTA‑CCTACGGGCTGGTGTTCTTCGGCACTATCGTCAAACGCAAGACCAAGCACATCTATGTCGGCAACTGGTTCTACGGTGCGTTCATCGTG > NC_002947/4839857‑4840144 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |