| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,863,421 | C→G | 5.3% | E818Q (GAG→CAG) | smc ← | chromosome partition protein Smc |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,863,421 | 0 | C | G | 5.3% | 249.2 / 3.0 | 76 | E818Q (GAG→CAG) | smc | chromosome partition protein Smc |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (36/36); new base G (2/2); total (38/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.11e-01 | |||||||||||
CGCATTTCCTCGTCGACGCTCATGCGCCGCTCCAGCAGCTCCTCCAGCTTCAGACGCAGTTCTTCCTGCGGGGCTTCACCCTCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑GCGTGGTCCTTGTGCTGGCGGGCTTCCTGACGCACCCGGTCAAGGCTTTCGCGCAAGGTATCGCGGCGGGCCATCAACTGTT > NC_002947/4863273‑4863567 | cgcATTTCCTCGTCGACGCTCATGCGCCGCTCCAGCAGCTCCTCCAGCTTCAGACGCAGTTCTTCCTGCGGGGCTTCACCCTCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTc < 8:198491/149‑1 (MQ=255) tttCCTCGTCGACGCTCATGCGCCGCTCCAGCAGCTCCTCCAGCTTCAGACGCAGTTCTTCCTGCGGGGCTTCACCATCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAgc > 4:178817/1‑149 (MQ=255) tcgtcgACGCTCATGCGCCGCTCCAGCAGCTCCTCCAGCTTCAGACGCAGTTCTTCCTGCGGGGCTTCACCCTCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTcc < 7:133244/141‑1 (MQ=255) tcgtcgACGCTCATGCGCCGCTCCAGCAGCTCCTCCAGCTTCAGACGCAGTTCTTCCTGCGGGGCTTCACCCTCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCtt > 8:211702/1‑148 (MQ=255) tcgtcgACGCTCATGCGCCGCTCCAGCAGCTCCTCCAGCTTCAGACGCAGTTCTTCCTGCGGGGCTTCACCCTCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGAGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTcc > 8:133244/1‑141 (MQ=255) tcgtcgACGCTCATGCGCCGCTCCAGCAGCTCCTCCAGCTTCAGACGCAGTTCTTCCTGCGGGGCTTAACCCTCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTg > 8:206126/1‑149 (MQ=255) aCGCTCATGCGCCGCTCCAGCAGCTCCTCCAGCTTCAGACGCAGTTCTTCCTGCGGGGCTTCACCCTCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGt < 8:49110/149‑1 (MQ=255) aTGCGCCGCTCCAGCAGCTCCTCCAGCTTCAGACGCAGTTCTTCCTGCGGGGCTTCACCCTCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTagag < 1:250607/147‑1 (MQ=255) aTGCGCCGCTCCAGCAGCTCCTCCAGCTTCAGACGCAGTTCTTCCTGCGGGGCTTCACCCTCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTACCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTc > 2:301000/1‑149 (MQ=255) cgccgcTCCAGCAGCTCCTCCAGCTTCAGACGCAGTTCTTCCTGCGGGGCTTCACCCTCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTg < 8:244720/149‑1 (MQ=255) gccgcTCCAGCAGCTCCTCCAGCTTCAGACGCAGTTCTTCCTGCGGGGCTTCACCCTCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGc > 3:250052/1‑149 (MQ=255) gccgcTCCAGCAGCTCCTCCAGCTTCAGACGCAGTTCTTCCTGCGGGGCTTCACCCTCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGc > 5:147048/1‑149 (MQ=255) ccgcTCCAGCAGCTCCTCCAGCTTCAGACGCAGTTCTTCCTGCGGGGCTTCACCCTCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCt < 5:206171/149‑1 (MQ=255) ccgcTCCAGCAGCTCCTCCAGCTTCAGACGCAGTTCTTCCTGCGGGGCTTCACCCTCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTACCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCt < 1:301000/149‑1 (MQ=255) ccAGCAGCTCCTCCAGCTTCAGACGCAGTTCTTCCTGCGGGGCTTCACCCTCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCt < 2:230979/144‑1 (MQ=255) ccAGCAGCTCCTCCAGCTTCAGACGCAGTTCTTCCTGCGGGGCTTCACCCTCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCt > 1:230979/1‑144 (MQ=255) cagcagCTCCTCCAGCTTCAGACGCAGTTCTTCCTGCGGGGCTTCACCCTCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGc < 6:154551/147‑1 (MQ=255) gcTCCTCCAGCTTCAGACGCAGTTCTTCCTGCGGGGCTTCACCCTCCTCCAGGATCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGc < 1:310713/149‑1 (MQ=255) ctccAGCTTCAGACGCAGTTCTTCCTGCGGGGCTTCACCCTCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGAc < 3:178817/148‑1 (MQ=255) cTTCAGACGCAGTTCTTCCTGCGGGGCTTCACCCTCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAgc > 5:378318/1‑106 (MQ=255) cTTCAGACGCAGTTCTTCCTGCGGGGCTTCACCCTCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAgc < 6:378318/106‑1 (MQ=255) tCAGACGCAGTTCTTCCTGCGGGGCTTCACCCTCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACg > 6:138391/1‑148 (MQ=255) cAGACGCAGTTCTTCCTGCGGGGCTTCACCCTCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGc < 5:138391/148‑1 (MQ=255) cAGACGCAGTTCTTCCTGCGGGGCTTCACCCTCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCa > 3:5829/1‑149 (MQ=255) aGACGCAGTTCTTCCTGCGGGGCTTCACCCTCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCAc > 3:54073/1‑149 (MQ=255) aCGCAGTTCTTCCTGCGGGGCTTCACCCTCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGCCCCCACACCCACCg > 2:355074/1‑149 (MQ=255) gCAGTTCTTCCTGCGGGGCTTCACCCTCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGcc < 4:54073/149‑1 (MQ=255) cAGTTCTTCCTGCGGGGCTTCACCCTCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCa < 6:304737/149‑1 (MQ=255) aGTTCTTCCTGCGGGGCTTCACCCTCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAg > 8:242652/1‑149 (MQ=255) cttcCTGCGGGGCTTCACCCTCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTg < 6:147048/148‑1 (MQ=255) ccTGCGGGGCTTCACCCTCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGt < 7:39477/147‑1 (MQ=255) cTGCGGGGCTTCACCCTCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGCCCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑g > 5:290396/1‑149 (MQ=255) tGCGGGGCTTCACCCTCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑Gc > 6:329214/1‑149 (MQ=255) gCTTCACCCTCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑GCGTGGTc < 5:329214/149‑1 (MQ=255) ttCACCCTCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCAGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCCCCCCCAGCGGGTGA‑GCGTGGTCCt > 6:49691/1‑149 (MQ=255) tCACCCTCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑GCGTGGTCCtt > 4:334430/1‑149 (MQ=255) cACCCTCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑GCGTGGTCCtt < 3:75825/148‑1 (MQ=255) aCCCTCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑GCGTGGTCCTtgt < 7:242652/149‑1 (MQ=255) cctcctCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGt > 4:97899/1‑93 (MQ=255) cctcctCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGt < 3:97899/93‑1 (MQ=255) cctcctCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑Gc < 7:5942/136‑1 (MQ=255) cctcctCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCAGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑Gc > 8:5942/1‑136 (MQ=255) ctccAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCATCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑GCGTGGTCCTTGTGCTGGc < 7:206126/149‑1 (MQ=255) ctccAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑GCGTGGTCCTTGTGCTGGc < 7:211702/149‑1 (MQ=255) ctccAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑GCGTGGTCCTTGTGCTGGc > 3:222932/1‑149 (MQ=255) ggCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGc > 7:118951/1‑85 (MQ=255) ggCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGc < 8:118951/85‑1 (MQ=255) ggCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑GCGTGGTCCTTGTGCTGGCGGGCTTCCTGa < 5:221260/149‑1 (MQ=255) gCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑GCGTGGTCCTTGTGCTGGCGGGCTTCCTGAc < 4:5829/149‑1 (MQ=255) cTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑GCGTGGTCCTTGTGCTGGCGGGCTTCCTGACg < 3:147725/149‑1 (MQ=255) tCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGCCCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑GCGTGGTCCTTGTGCTGGCGGGCTTCCTGACGc > 2:322976/1‑149 (MQ=255) tCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑GCGTGGTCCTTGTGCTGGCGGGCTTCCTGACg > 5:165308/1‑148 (MQ=255) gttgttCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTGTCTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑GCGTGGTCCTTGTGCTGGCGGGCTTCCTGACGCAc > 1:259472/1‑149 (MQ=255) ttCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑GCGTGGTCCTTGTGCTGGCGGGCTTCCTGACGCACCCGGt > 7:134922/1‑149 (MQ=255) tCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACCCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCAGGTGA‑GCGTGGTCCTTGTGCAGCCGGGCTTCCAGACGCACCCGGt > 4:123774/1‑148 (MQ=255) tGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑GCGTGGTCCTTGTGCTGGCGGGCTTCCTGACGCACCCGGTCAAg > 1:191658/1‑149 (MQ=255) gTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑GCGTGGTCCTTGTGCTGGCGGGCTTCCTGACGCACCCGGTCAAGGCtt > 5:46172/1‑149 (MQ=255) cGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑GCGTGGTCCTTGTGCTGGCGGGCTTCCTGACGCACCCGGTCAAGGCTTTc < 1:355074/148‑1 (MQ=255) ggTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCCGCTGGTGA‑GCGTGGTCCTTGTGCTGGCGGGCTTCCTGAAGCACCCGGTCAAGGCTTTcgc > 4:178037/1‑149 (MQ=255) tCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑GCGTGGTCCTTGTGCTGGCGGGCTTCCTGACGCACCCGGTCAAGGCTTTcgcg > 4:363321/1‑148 (MQ=255) aGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGACGCGTGGTCCTTGTGCTGGCGGGCTTc < 1:4554/120‑1 (MQ=255) aGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑GCGTGGTCCTTGTGCTGGCGGGCTTc > 2:4554/1‑119 (MQ=255) aGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑GCGTGGTCCTTGTGCTGGCGGGCTTCCTGACGCACCCGGTCAAGGCTTTCGCGCaa < 6:165308/149‑1 (MQ=255) ggCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑GCGTGGTCCTTGTGCTGGCGGGCTTCCTGACGCACCCGGTCAAGGCTTTCGCGCAAg < 4:222932/149‑1 (MQ=255) gcAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑GCGTGGTCCTTGTGCTGGCGGGCTTCCTGa < 5:151307/117‑1 (MQ=255) gcAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑GCGTGGTCCTTGTGCTGGCGGGCTTCCTGa > 6:151307/1‑117 (MQ=255) cTTTCTG‑CGCCAGAGGATCTAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑GCGTGGTCCTTGTGCTGGCGGGCTTCCTGACGCACCCGGTCAAGGCTTTCGCGCAAGGTATCgcgg < 8:336338/149‑1 (MQ=255) ctg‑ctCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑GCGTGGTCCTTGTGCTGGCGGGCTTCCTGACGCACCCGGTCAAGGCTTTCGCGCAAGGTATCGCGGCggg > 1:331286/1‑149 (MQ=255) ctg‑ctCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGGGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑GCGTGGTCCTTGTGCTGGCGGGCTTCCTGACGCACCCGGTCAAGGCTTTCGCGCAAGGTATCGCGGCggg < 8:134922/149‑1 (MQ=255) tg‑ctCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCATGTGA‑GCGTGGTCCTTGTGCTGGCGGGCTTACTGACGCACCCGGTCAAGGCTTTCGCGCAAGGTATCGCGGCGGGc > 2:49757/1‑149 (MQ=255) ccgccAGGCGCTGGAGCGTCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑GCGTGGTCCTTGTGCTGGCGGGCTTCCTGACGCACCCGGTCAAGGCTTTc < 1:96613/124‑1 (MQ=255) ccgccAGGCGCTGGAGCGTCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑GCGTGGTCCTTGTGCTGGCGGGCTTCCTGACGCACCCGGTCAAGGCTTTc > 2:96613/4‑127 (MQ=255) ccAGGCGCTGGAGCGTCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑GCGTGGTCCTTGTGCTGGCGGGCTTCCTGACGCACCCGGTCAAGGCTTTCGCGCaa < 1:230650/130‑1 (MQ=255) ccAGGCGCTGGAGCGTCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑GCGTGGTCCTTGTGCTGGCGGGCTTCCTGACGCACCCGGTCAAGGCTTTCGCGCaa > 2:230650/1‑130 (MQ=255) ccAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑GCGTGGTCCTTGTGCTGGCGGGCTTCCTGACGCACCCGGTCAAGGCTTTCGCGCAAGGTATCGCGGCGGGCCAt > 5:128358/1‑148 (MQ=255) cAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑GCGTGGTCCTTGTGCTGGCGGGCTTCCTGACGCACCCGGTCAAGGCTTTCGCGCAAGGTATCGCGGCGGGCCATc < 6:128358/148‑1 (MQ=255) cAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGAGA‑GCGTGGTCCTTGTGCTGGCGGGCTTCCTGACGCACCCGGTCAAGGCTTTCGCGCAAGGTATCGCGGCGGGCCATc > 3:212628/1‑148 (MQ=255) aGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑GCGTGGTCCTTGTGCTGGCGGGCTTCCTGACGCACCCGGTCAAGGCTTTCGCGCAAGGTATCGCGGCGGGCCATCaa < 1:261606/149‑1 (MQ=255) cTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑GCGTGGTCCTTGTGCTGGCGGGCTTCCTGACGCACCCGGTCAAGGCTTTCGCGCAAGGTATCGCGGCGGGCCATCAACTGtt < 4:250052/149‑1 (MQ=255) | CGCATTTCCTCGTCGACGCTCATGCGCCGCTCCAGCAGCTCCTCCAGCTTCAGACGCAGTTCTTCCTGCGGGGCTTCACCCTCCTCCAGGTTCAGGCTCAGTTGTTCCTGGCGTTCGGTCAGGCGCGCAGCTTGCTG‑CTCCAGACGCTCCAGCGCCTGGCGGGTAGAGTCGTGCTGGGCACGCAGCGACCCCAGACGCACCGCCAGCTGGTGA‑GCGTGGTCCTTGTGCTGGCGGGCTTCCTGACGCACCCGGTCAAGGCTTTCGCGCAAGGTATCGCGGCGGGCCATCAACTGTT > NC_002947/4863273‑4863567 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |