Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,930,409 | T→A | 6.3% | T188T (ACA→ACT) ‡ | cheZ ← | protein phosphatase CheZ |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,930,409 | 0 | T | A | 6.3% | 228.7 / 4.5 | 79 | T188T (ACA→ACT) ‡ | cheZ | protein phosphatase CheZ |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (35/39); new base A (3/2); total (38/41) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.67e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.81e-01 |
CGGACCTTCACCCCGAGTCGGATGTTTTTCTCGATCTTTTTCTGCACGCAATTGATCGTGGTCATGTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCG > NC_002947/4930265‑4930557 | cGGACCTTCACCCCGAGTCGGATGTTTTTCTCGATCTTTTTCTGCACGCAATTGATCGTGGTCATGTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAgt < 6:338893/145‑1 (MQ=255) cGGACCTTCACCCCGAGTCGGATGTTTTTCTCGATCTTTTTCTGCACGCAATTGATCGTGGTCATGTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTgtgg < 4:130529/149‑1 (MQ=255) aCCCCGAGTCGGATGTTTTTCTCGATCTTTTTCTGCACGCAATTGATCGTGGTCATGTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACgcgc < 7:31783/148‑1 (MQ=255) ccccGAGTCGGATGTTTTTCTCGATCTTTTTCTGCACGCAATTGATCGTGGTCATGTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCtt > 5:167506/1‑149 (MQ=255) ccccGAGTCGGATGTTTTTCTCGATCTTTTTCTGCACGCAATTGATCGTGGTCATGTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCtt < 1:96853/149‑1 (MQ=255) ccccGAGTCGGATGTTTTTCTCGATCTTTTTCTGCACGCAATTGATCGTGGTCATGTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCtt > 3:274293/1‑149 (MQ=255) ccccGAGTCGGATGTTTTTCTCGATCTTTTTCTGCACGCAATTGATCGTGGTCATGTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCtt > 7:15458/1‑149 (MQ=255) cccGAGTCGGATGTTTTTCTCGATCTTTTTCTGCACGCAATTGATCGTGGTCATGTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCtt > 2:6627/1‑148 (MQ=255) cccGAGTCGGATGTTTTTCTCGATCTTTTTCTGCACGCAATTGATCGTGGTCATGTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCtt > 7:19467/1‑148 (MQ=255) cccGAGTCGGATGTTTTTCTCGATCTTTTTCTGCACGCAATTGATCGTGGTCATGTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCtt > 1:53303/1‑148 (MQ=255) cccGAGTCGGATGTTTTTCTCGATCTTTTTCTGCACGCAATTGATCGTGGTCATGTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCtt > 5:124835/1‑148 (MQ=255) gATGTTTTTCTCGATCTTTTTCTGCACGGAATTGATCGTGGTCATGTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTgg > 1:214546/1‑149 (MQ=255) tGTTTTTCTCGATCTTTTTCTGCACGCAATTGATCGTGGTCATGTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGcc < 4:272916/149‑1 (MQ=255) tttttCTCGATCTTTTTCTGCACGCAATTGATCGTGGTCATGTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCg < 6:167506/148‑1 (MQ=255) ctcGATCTTTTTCTGCACGCAATTGATCGTGGTCATGTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAg < 2:95790/148‑1 (MQ=255) gATCTTTTTCTGCACGCAATTGATGGTGGTCATGTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTcc > 8:173806/1‑149 (MQ=255) gATCTTTTTCTGCACGCAATTGATCGTGGTCATGTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGa > 2:193839/1‑129 (MQ=255) gATCTTTTTCTGCACGCAATTGATCGTGGTCATGTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGa < 1:193839/129‑1 (MQ=255) gATCTTTTTCTGCACGCAATTGATCGTGGTCATGTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTc < 5:278321/148‑1 (MQ=255) tCTTTTTCTGCACGCAATTGATCGTGGTCATGTTTTATACCGGCAAAGTGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCt > 7:94892/1‑148 (MQ=255) tttCTGCACGCAATTGATCGTTATCATCTTTTATACCGGCAAAGCTGTCGAACTGGCTGGACATCAGCACCAGATTGAGCAGGTTGCTTTCAACCTCGGTCACGAGTGTGGTGACGCGCTTGATCAACTGGCCGATCAGGTGCTGATAg > 4:226275/1‑149 (MQ=255) tttCTGCACGCAATTGATCGTGGTCATGTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGAt < 6:124835/147‑1 (MQ=255) cACGCAATTGATCGTGGTCATGTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTgg < 5:35530/149‑1 (MQ=255) gCAATTGATCGTGGTCATGTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGc > 7:345203/1‑148 (MQ=255) cAATTGATCGTGGTCATGTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCATGTCCTGATAGTCCTGGGCCa < 4:234434/149‑1 (MQ=255) aaTTGATCGTGGTCATGTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAg > 4:368354/1‑149 (MQ=255) aTCGTGGTCATGTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGt > 8:349285/1‑134 (MQ=255) aTCGTGGTCATGTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGt < 7:349285/134‑1 (MQ=255) tCGTGGTCATGTTTTATACCTGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTTGCCGGTCAGGTCCTGATATTCCTGGGCCAGCAAAAt < 3:226275/149‑1 (MQ=255) cGTGGTCATGTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACTAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATg > 8:100976/1‑149 (MQ=255) tGGTCATGTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTc > 2:297360/1‑149 (MQ=255) tGGTCATGTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTc < 2:214546/149‑1 (MQ=255) tCATGTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGtt < 8:924/149‑1 (MQ=255) cATGTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGtt > 4:85904/1‑148 (MQ=255) aTGTTTTATACCGGCAAAGCGTTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAgt < 4:235894/82‑1 (MQ=255) aTGTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAgt > 3:235894/1‑82 (MQ=255) aTGTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGTTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTg < 7:173806/148‑1 (MQ=255) aTGTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTg < 3:44724/148‑1 (MQ=255) aTGTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGa < 8:15458/149‑1 (MQ=255) aTGTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCACTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGtt > 2:141936/1‑147 (MQ=255) gTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAg < 8:345203/148‑1 (MQ=255) ttttATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGt > 6:306501/1‑149 (MQ=255) ttttATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGt > 6:166061/1‑149 (MQ=255) tataCCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGcc > 3:155152/1‑149 (MQ=255) ataCCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGcc < 2:53303/148‑1 (MQ=255) ggCAAAGTGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGaaa < 8:94892/149‑1 (MQ=255) gCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGc < 1:6627/149‑1 (MQ=255) aCCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTAcc < 1:297360/149‑1 (MQ=255) ctggctggCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATATTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCt > 1:344684/1‑149 (MQ=255) ggctggcCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCg > 1:172561/1‑149 (MQ=255) gctggcCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCGCCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCg < 4:274293/148‑1 (MQ=255) tggcCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGgcg > 5:250915/1‑149 (MQ=255) gcCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCt < 3:85904/149‑1 (MQ=255) cATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCt < 3:41456/147‑1 (MQ=255) cATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCt > 4:41456/1‑147 (MQ=255) aTCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCAGCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAATCCTTGCGGTTACCCTCGGCGCtgtg < 1:141936/149‑1 (MQ=255) gCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATg > 1:283781/1‑101 (MQ=255) gCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATg < 2:283781/101‑1 (MQ=255) cACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCa < 4:155152/149‑1 (MQ=255) cAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCtgt > 4:278672/1‑140 (MQ=255) cAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCtgt < 3:278672/140‑1 (MQ=255) aGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTc < 8:19467/149‑1 (MQ=255) gCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTc > 6:18966/1‑148 (MQ=255) gTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAgg < 5:229700/58‑1 (MQ=255) gTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAgg > 6:229700/1‑58 (MQ=255) gCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGc < 6:250915/148‑1 (MQ=255) cTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCt < 5:166061/148‑1 (MQ=255) tCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGa < 2:172561/148‑1 (MQ=255) gcgcgTCACCACACTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACt > 7:248605/5‑129 (MQ=255) gcgcgTCACCACACTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACt < 8:248605/125‑1 (MQ=255) gcgTCACCACACTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCGTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACACTCGGCGCTGTGCGTCAGTAAGCTGTCGACTCGGTTGCGCAGATCa > 8:342907/3‑149 (MQ=255) gcgTCACCACACTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATc < 1:94985/146‑1 (MQ=255) gcgTCACCACACTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATc > 2:94985/3‑148 (MQ=255) ggTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCAc > 7:297753/1‑149 (MQ=255) gTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGc > 1:71195/1‑135 (MQ=255) gTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGc < 2:71195/135‑1 (MQ=255) gTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCAc > 8:55796/1‑148 (MQ=255) gTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACg < 7:100976/149‑1 (MQ=255) ccAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGgcg < 2:260240/104‑1 (MQ=255) ccAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGgcg > 1:260240/1‑104 (MQ=255) cAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAg < 2:327621/72‑1 (MQ=255) cAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAg > 1:327621/1‑72 (MQ=255) tgtgGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCg < 5:18966/149‑1 (MQ=255) | CGGACCTTCACCCCGAGTCGGATGTTTTTCTCGATCTTTTTCTGCACGCAATTGATCGTGGTCATGTTTTATACCGGCAAAGCGGTCGACCTGGCTGGCCATCAGCACCAGCTTGAGCAGGTTGCTTTCCACCTCGGTCACCAGTGTGGTGACGCGCTTGATCACCTGGCCGGTCAGGTCCTGATAGTCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCG > NC_002947/4930265‑4930557 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |