| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,931,200 | C→T | 5.7% | G57D (GGC→GAC) | cheY ← | two‑component system response regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,931,200 | 0 | C | T | 5.7% | 269.4 / 3.5 | 87 | G57D (GGC→GAC) | cheY | two‑component system response regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (43/39); new base T (2/3); total (45/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.69e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.44e-01 | |||||||||||
AACGGCTTGACCACATAACCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑CAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCTTGATGATCCGCCGCATCGTCGAAAAGT > NC_002947/4931053‑4931347 | aaCGGCTTGACCACATAACCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGcc < 6:109541/149‑1 (MQ=255)aaCGGCTTGACCACATAACCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTCTCGCGGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGCCATGcc > 7:127220/1‑149 (MQ=255) aCGGCTTGACCACATAACCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGATATGccc < 1:98055/149‑1 (MQ=255) ggCTTGACCACATAACCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCgg > 1:251084/1‑149 (MQ=255) ggCTTGACCACATAACCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATCATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCgg > 8:20496/1‑149 (MQ=255) gcctGACCACATAACCAATGACCCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGCTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGc < 8:127220/146‑1 (MQ=255) gCTTGACCACATAACCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGc < 2:213988/149‑1 (MQ=255) gACCACATAACCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGGCATGTCCGGCAtc < 8:321494/148‑2 (MQ=255) aCCACATAACCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGGCATGTCCGGCAtcg < 1:132794/148‑3 (MQ=255) aCCACATAACCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGt < 5:137725/148‑1 (MQ=255) ccACATAACCATTGACGCCATCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGTTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACTCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTc < 6:37465/149‑1 (MQ=255) acaTAACCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTc > 1:368842/1‑147 (MQ=255) aCCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCgg < 7:339010/149‑1 (MQ=255) cATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTc < 3:335141/149‑1 (MQ=255) aTTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTc < 1:325699/139‑1 (MQ=255) aTTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTc > 2:325699/1‑139 (MQ=255) aCGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTc < 7:188658/144‑1 (MQ=255) aCGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTc > 8:188658/1‑144 (MQ=255) aCGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCa < 7:20496/148‑1 (MQ=255) cAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAg > 3:363601/1‑149 (MQ=255) gCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTc > 8:94802/1‑149 (MQ=255) ggCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTa < 5:105525/147‑1 (MQ=255) ggCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTa < 8:151273/147‑1 (MQ=255) gCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTc < 8:219285/123‑1 (MQ=255) gCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTc > 7:219285/1‑123 (MQ=255) gCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGAcc > 4:116613/1‑149 (MQ=255) cTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCg > 6:164553/1‑149 (MQ=255) ttCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGc < 2:86149/112‑1 (MQ=255) ttCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGc > 1:86149/1‑112 (MQ=255) ttCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGt > 5:9688/1‑149 (MQ=255) aaTGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGtttt < 6:9688/149‑1 (MQ=255) aTGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTc < 3:214699/149‑1 (MQ=255) aTGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTc < 4:363601/149‑1 (MQ=255) gATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTc > 1:240532/1‑147 (MQ=255) 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gTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑CAGCATCg > 3:321295/1‑149 (MQ=255) gTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑CAGCATCg > 6:240348/1‑149 (MQ=255) gcgcTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑CAGCATCGGc > 4:363343/1‑148 (MQ=255) ggCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑CAGCATCGGCAACGc < 2:251084/147‑1 (MQ=255) gCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑CAGCATCGGCAACGCCg < 6:216146/148‑1 (MQ=255) gCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑CAGCATCAGCAACGCCgt < 1:143105/149‑1 (MQ=255) cTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑CAGCATCGGCAACGCCgtg < 2:368842/149‑1 (MQ=255) cTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑CAGCATCGGCAACGCCgtg < 3:363343/149‑1 (MQ=255) ttCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGCGTTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑CAGCATCGGCAACGCCgtg > 1:68251/1‑149 (MQ=255) tCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑CAGCATCGGCAACGCCgtggt > 6:70616/1‑149 (MQ=255) cAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCAc < 8:188306/103‑1 (MQ=255) cAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCAc > 7:188306/1‑103 (MQ=255) cAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑CAGCATCGGCAACGCCgtggtg > 8:308420/1‑149 (MQ=255) gCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑CAGCATCGGCAACGCCGTGGTGcc < 3:240336/149‑1 (MQ=255) gTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑CAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTc < 7:308420/149‑1 (MQ=255) tCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑CAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCa < 5:164553/149‑1 (MQ=255) aCCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑CAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATc > 7:337974/1‑149 (MQ=255) aCCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑CAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATc > 3:83661/1‑149 (MQ=255) cATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACTGTTTTC‑CAGCATCGGCAACTCCGTGGTGCCGTCATCgg > 6:348196/1‑149 (MQ=255) cATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑CAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCgg > 5:133661/1‑149 (MQ=255) aaGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑CAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTtc > 8:307127/1‑149 (MQ=255) 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cGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑CAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCTtga < 3:116613/148‑1 (MQ=255) gcagcaGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑CAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGTAACAGGTTCTtgat > 2:29563/1‑148 (MQ=255) cagcagGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑CAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCTtgatga < 5:240348/149‑1 (MQ=255) agGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑CAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACa < 8:205710/133‑1 (MQ=255) agGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑CAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACa > 7:205710/1‑133 (MQ=255) gaacaTGCCGGGCATGTCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑CAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCTTGATGATccgcc > 8:247657/5‑149 (MQ=255) gTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑CAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGTAACAGGTTCTTGATGATccgcc < 1:29563/149‑1 (MQ=255) gTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑CAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCTTGATGATccgcc > 1:268159/1‑149 (MQ=255) cGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑CAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCTTGATGATccgccg > 3:37465/1‑148 (MQ=255) cGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑CAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCTTGATGATccgccg > 1:377795/1‑148 (MQ=255) gATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑CAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCTTGATGATCCGCCGCa < 4:37465/149‑1 (MQ=255) tGCCGGGCATGTCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑CAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCTtgat < 3:329186/136‑1 (MQ=255) tGCCGGGCATGTCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑CAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCTtgat > 4:329186/1‑136 (MQ=255) cGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑CAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTg > 5:361143/1‑101 (MQ=255) cGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑CAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTg < 6:361143/101‑1 (MQ=255) aCATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑CAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCTTGATGATCCGCCGCATCGTCGa > 5:312035/1‑148 (MQ=255) aTGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑CAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCTTGATGATCCGCCGCATCGTCGaa > 6:251489/1‑147 (MQ=255) gCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑GAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCTTGATGATCCGCCGCATCGTCGAAAAgt > 2:365307/1‑149 (MQ=255) gCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑CAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCTTGATGATCCGCCGCATCGTCGAAAAgt > 5:344968/1‑149 (MQ=255) | AACGGCTTGACCACATAACCATTGACGCCAGCCTGGGCCGCTTCAATGATCTGGTCGCGCTTGGCTTCAGCGGTCACCATCAAGACCGGCATGCTTTTCAGC‑TTGTCGCTGGCACGCACTTTACGCAGCAGGTCGATGCCGGACATGCCCGGCATGTTCCAGTCGGTCACCAGGAAGTCGTAGTGACCGTTTTC‑CAGCATCGGCAACGCCGTGGTGCCGTCATCGGCTTCGTCGGTGTTGGTGAAACCCAGGTCACGCAACAGGTTCTTGATGATCCGCCGCATCGTCGAAAAGT > NC_002947/4931053‑4931347 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |