Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,936,919 | A→T | 9.2% | intergenic (‑330/‑88) | flhA ← / → PP_4345 | flagellar export pore protein/GntR family transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,936,919 | 0 | A | T | 9.2% | 180.0 / 8.0 | 65 | intergenic (‑330/‑88) | flhA/PP_4345 | flagellar export pore protein/GntR family transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (28/31); new base T (4/2); total (32/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.27e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.05e-01 |
CAATGGCCAAAGGCTTAAGCTCTTGGAAAGCCACAGAGAGGGTGGCGCCACGACAAAAAAAATCTGAGCGACTTGATCATGCAAAAGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTACATCGCTAGACCCGGAGAACATGGTGGCGAACTCTCTCGATAGCTTTATCGTTCCTGACAAACATCGCCATAAAACCG > NC_002947/4936779‑4937061 | cAATGGCCAAAGGCTTAAGCTCTTGGAAAGCCACAGAGAGGGTGGCGCCACGACAAAAAAAATCTGAGCGACTTGATCATGCAAAAGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGcc > 6:29543/1‑148 (MQ=255) aaTGGCCAAAGGCTTAAGCTCTTGGAAAGCCACAGAGAGGGTGGCGCCACGACAAAAAAAATCTGAGCGACTTGATCATGCAAAAGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCGATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCa > 4:19937/1‑148 (MQ=255) aTGGCCAAAGGCTTAAGCTCTTGGAAAGCCACAGAGAGGGTGGCGCCACGACAAAAAAAATCTGAGCGACTTGATCATGCAAAAGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGATGTTCATGccttt < 2:294432/149‑4 (MQ=255) aTGGCCAAAGGCTTAAGCTCTTGGAAAGCCACAGAGAGGGTGGCGCCACGACAAAAAAAATCTGAGCGACTTGATCATGCAAAAGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAAc < 6:90851/149‑1 (MQ=255) aTGGCCAAAGGCTTAAGCTCTTGGAAAGCCACAGAGAGGGTGGCGCCACGACAAAAAAAATCTGAGCGACTTGATCATGCAAAAGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAAc > 4:307406/1‑149 (MQ=255) ccAAAGGCTTAAGCTCTTGGAAAGCCACAGAGAGGGTGGCGCCACGACAAAAAAAATCTGAGCGACTTGATCATGCAAAAGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCt < 5:279994/149‑1 (MQ=255) gatatgCTTACGCTGTTGGATATCCATAGAGTGGGTGGCTCCAGGACAAAAAAAATCTGAGCGACTTTTTCATGCAAAAGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTc < 8:313920/144‑1 (MQ=255) cAAAGTCTTAAGGTCTTGGATAGCCACAGAGAGGGTGTCGCCACGACAAAAAAAATCTGAGCGACTTGATCATGCAAAAGCTGAGGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGGCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGc < 8:42505/140‑1 (MQ=255) cAAAGGCTTAAGCTCTTGGAAAGCCACAGAGAGGGTGGCGCCACGACAAAAAAAATCTGAGCGACTTGATCATGCAAAAGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTc > 7:163587/1‑149 (MQ=255) cAAAGGCTTAAGCTCTTGGAAAGCCACAGAGAGCGTGGCGCCACGACAAAAAAAATCTGAGCGACTTCATCATGCAAAAGAACACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAACGCATGAACAACATGc > 7:42505/1‑140 (MQ=255) aGGCTTAAGCTCTTGGAAAGCCACAGAGAGGGTGGCGCCACGACAAAAAAAATCTGAGCGACTTGATCATGCAAAAGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGAt < 8:35275/149‑1 (MQ=255) ggCTTAAGCTCTTGGAAAGCCACAGATAGGGTGGCGCCACGACAAAAATAATCTGAGCGACTTGATCATGCAAAAGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATg < 3:34604/149‑1 (MQ=255) aaGCTCTTGGAAAGCCACAGAGAGGGTGGCGCCACGACAAAAAAAATCTGAGCGACTTGATCATGCAAAAGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTa < 3:307406/147‑1 (MQ=255) aaGCTCTTGGAAAGCCACAGAGAGGGTGGCGCCACGACAAAAAAAATCTGAGCGACTTGATCATGCAAAAGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGc > 7:361069/1‑149 (MQ=255) gCTCTTGGAAAGCCACAGAGAGGGTGGCGCCACGACAAAAAAAATCTGAGCGACTTGATCATGCAAAAGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGctc > 7:229209/1‑149 (MQ=255) ttGGAAAGCCACAGAGAGGGTGGCGCCACGACAAAAAAAATCTGAGCGACTTGATCATGCAAAAGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTa < 2:270457/147‑1 (MQ=255) ggAAAGCCACAGAGAGGGTGGCGCCACGACAAAAAAAATCTGAGCGACTTGATCATGCAAAAGCTCACGCTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑Gt < 1:119054/147‑1 (MQ=255) ccACAGAGAGGGTGGCGCCACGACAAAAAAAATCTGAGCGACTTGATCATGCAAAAGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCtgt > 5:179888/1‑149 (MQ=255) cacaGAGAGGGTGGCGCCACGACAAAAAAAATCTGAGCGACTTGATCATGCAAAAGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCGATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCtgtg < 3:19937/149‑1 (MQ=255) agagagGGTGGCGCCACGACAAAAAAAATCTGAGCGACTTGATCATGCAAAAGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATa > 1:275843/1‑149 (MQ=255) gcCACGACAAAAAAAATCTGAGCTACTTGATCATGCAAAAGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGa < 1:241390/135‑1 (MQ=255) gcCACGACAAAAAAAATCTGAGCGACTTGATCATGCAAAAGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGa > 2:241390/1‑135 (MQ=255) aaaaaaaTCTGAGCGACTTGATCATGCAAAAGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACt < 3:36609/149‑1 (MQ=255) aaaaaaTCTGAGCGACTTGATCATGCAAAAGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTa > 1:105557/1‑149 (MQ=255) tGAGCGACTTGATCATGCAAAAGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTACATCGc > 1:83380/1‑147 (MQ=255) cGACTTGATCATGCAAAAGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGa < 5:64066/134‑1 (MQ=255) cGACTTGATCATGCAAAAGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGa > 6:64066/1‑134 (MQ=255) cTTGATCATGCAAAAGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCtt < 2:325634/127‑1 (MQ=255) cTTGATCATGCAAAAGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCtt > 1:325634/1‑127 (MQ=255) cTTGATCATGCAAAAGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTACATCGCTAGACCCg > 5:384845/1‑148 (MQ=255) gATCATGCAAAAGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTACATCGCTAGACCCGgag > 1:317812/1‑148 (MQ=255) tGCAAAAGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTACATCGCTAGACCCGGAGAACAtg < 8:163587/149‑1 (MQ=255) tGCAAAAGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTACATCGCTAGACCCGGAGAACAtg > 6:104985/1‑149 (MQ=255) cAAAAGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTACATCGCTAGACCCGGAGAACAtggt > 4:106079/1‑149 (MQ=255) cAAAAGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTACATCGCTAGACCCGGAGAACAtgg < 2:83380/148‑1 (MQ=255) aaaaGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGTCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTACATCGCTAGACCCGGAGAACAtggtg < 4:118481/149‑1 (MQ=255) aaaaGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTACATCGCTAGACCCGGAGAACAtggtg < 5:29543/149‑1 (MQ=255) aaaaGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTACATCGCTAGACCCGGAGAACAtggtg > 3:118481/1‑149 (MQ=255) aaaGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTACATCGCTAGACCCGGAGAACAtggtgg < 1:251377/149‑1 (MQ=255) aGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTACATCGCTAGACCCGGAGAACATGGTGGCg < 2:105557/149‑1 (MQ=255) tCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTACATCGCTAGACCCGGAGAACATGGTGGCGAAc > 1:21176/1‑149 (MQ=255) ggTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTACATCGCTAGACCCGGAGAACATGGTGGCGAActctc < 5:104985/149‑1 (MQ=255) tttCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTACATCGCTAGATCCGGAGAACATGGTGGCGAACtctctc < 8:361069/149‑1 (MQ=255) tttCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTACATCGCTAGACCCGGAGAACATGGTGGCGAACtctctc < 2:275843/149‑1 (MQ=255) tATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTAGGGTAGGAGTCTGTGATATGATACCCCAGCGATTTTGACAACATAGCTAGCCCAGTAGAACATGGTGGCGaaatatc > 1:117644/1‑143 (MQ=255) aTGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTACATCGCTAGAccc > 7:5994/1‑119 (MQ=255) aTGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTACATCGCTAGAccc < 8:5994/119‑1 (MQ=255) tGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTACATCGCTAGACCCGGAGAACATGGTGGCGAACTCTCTCGAt < 2:21176/146‑1 (MQ=255) gTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTACATCGCTAGACCCGgag > 6:190950/1‑115 (MQ=255) gTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTACATCGCTAGACCCGgag < 5:190950/115‑1 (MQ=255) gagagCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTACATCGCTAGACCCGGAGAACATGGTGGCGAACTCTCTCGATAGCTTTATCGTTc < 8:229209/149‑1 (MQ=255) agagCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTACATCGCTAGACCCGGAGAACATGGTGGCGAACTCTCTCGATAGCTTTATCGTTcc < 6:384845/149‑1 (MQ=255) aTGACTACTCAAGGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTACATCGCTAGACCCGGAGAAGATGGTGGCGAACTCTCTCGATAGCTTTATCGTTCCTGACaa > 1:315790/1‑148 (MQ=255) ctactCAAAGGCATGAACACCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTACATCGCTAGACCCGGAGAACATGGTGGCGAACTCTCTCGATAGCTTTATCGTTCCTGACAAACATc > 3:144005/1‑149 (MQ=255) gttggCATGATGTTCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTACATCGCTAGACCCGGAGAACATGGTGGCGAACTCTCTCGATAGCTTTATCGTTCCTGACAAACATCGCCAt > 8:177669/4‑148 (MQ=255) aaaGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTACATCGCTAGACCCGGAGAACATGGTGGCGAACTCTCTCGATAGCTTTATCGTTCCTGACAAACATCGCCAt > 1:183014/1‑148 (MQ=255) ttggCATGATGTTCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTACATCGc < 2:203007/80‑1 (MQ=255) ttggCATGATGTTCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTACATCGc > 1:203007/3‑82 (MQ=255) ttggCATGATGTTCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTACATCGCTAGACCCGGAGAACATGGTGGCGAACTCTCTCGATAGCTTTATCGTTCCTGACAAACATCGCCATa > 7:266967/3‑148 (MQ=255) ttggCATGATGTTCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTACATCGCTAGACCCGGAGAACATGGTGGCGAACTCTCTCGATAGCTTTATCGTTCCTGACAAACATCGCCATa > 3:151568/3‑148 (MQ=255) ggCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTACATCGCTAGACCCGGAGAACATGGTGGCGAACTCTCTCGATAGCTTTATCGTTCCTGACAAACATCGCCATaaaa > 7:64299/1‑149 (MQ=255) ggCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTACATCGCTAGACCCGGAGAACATGGTGGCGAACTCTCTCGATAGCTTTATCGTTCCTGACAAACATCGCCATaaaa < 2:183014/149‑1 (MQ=255) aTGAACACCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTACATCGCTAGACCCGGAGAACATGGTGGCGAACTCTCTCGATAGCTTTATCGTTCCTGACAAACATCGCCATAAAACcg < 4:144005/149‑1 (MQ=255) aCATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTACATCGCTAGACCCGGAGAACATGGTGGCGAACTCTCTCGa < 7:277266/107‑1 (MQ=255) aCATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTACATCGCTAGACCCGGAGAACATGGTGGCGAACTCTCTCGa > 8:277266/1‑107 (MQ=255) | CAATGGCCAAAGGCTTAAGCTCTTGGAAAGCCACAGAGAGGGTGGCGCCACGACAAAAAAAATCTGAGCGACTTGATCATGCAAAAGCTCACGGTTTCTATGCGGATGTAGAGAGCCAATGACTACTCAAAGGCATGAACATCATGCCAACTGCTCGATGGTAGCTCTA‑‑GT‑‑GAGTCTGTGATA‑CCTTCGCCAGCGCTTTTGACTACATCGCTAGACCCGGAGAACATGGTGGCGAACTCTCTCGATAGCTTTATCGTTCCTGACAAACATCGCCATAAAACCG > NC_002947/4936779‑4937061 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |