Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,951,546 | G→T | 6.1% | R243S (CGC→AGC) | fliK ← | flagellar hook‑length control protein FliK |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,951,546 | 0 | G | T | 6.1% | 210.1 / 3.3 | 66 | R243S (CGC→AGC) | fliK | flagellar hook‑length control protein FliK |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/28); new base T (2/2); total (36/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.22e-01 |
CCCGGTTGACCAGGCCCTCGGCCCAAGCGTTCTGGTTCATCGGCAATGGCTGATGCAGCGGGTTCGCAGTGGCCGGTACGGCGTTGGCGGTCTTGGCCGTGGCCGCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑ACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGACCAGATTCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCC > NC_002947/4951399‑4951691 | cccGGTTGACCAGGCCCTCGGCCCAAGCGTTCTGGTTCATCGGCAATGGCTGATGCAGCGGGTTCGCAGTGGCCGGTACGGCGTTGGCGGTCTTGGCCGTGGCCGCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCgg > 6:201515/1‑149 (MQ=255) ccGGTTGACCAGGCCCTCGGCCCAAGCGTTCTGGTTCATCGGCAATGGCTGATGCAGCGGGTTCGCAGTGGCCGGTACGGCGTTGGCGGTCTTGGCCGTGGCCGCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCggg > 7:150053/1‑149 (MQ=255) aCCAGGCCCTCGGCCCAAGCGTTCTGGTTCATCGGCAATGGCTGATGCAGCGGGTTCGCAGTGGCCGGTACGGCGTTGGCGGTCTTGGCCGTGGCCGCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCgct > 1:237315/1‑149 (MQ=255) cAGGCCCTCGGCCCAAGCGTTCTGGTTCATCGGCAATGGCTGATGCAGCGGGTTCGCAGTGGCCGGTACGGCGTTGGCGGTCTTGGCCGTGGCCGCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCgctgc > 3:224497/1‑149 (MQ=255) ccTCGGCCCAAGCGTTCTGGTTCATCGGCAATGGCTGATGCAGCGGGTTCGCAGTGGCCGGTACGGCGTTGGCGGTCTTGGCCGTGGCCGCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGgcg > 6:222063/1‑149 (MQ=255) ccTCGGCCCAAGCGTTCTGGTTAAACGGCAATGGCTGATGCAGCGGGTTCGCAGTGGCCGGTACGGCGTTGGCGGTATTGGCCGTGGCCGCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGgcg > 7:239243/1‑149 (MQ=255) tCGGCCCAAGCGTTCTGGTTCATCGGCAATGGCTGATGCAGCGGGTTCGCAGTGGCCGGTACGGCGTTGGCGGTCTTGGCCGTGGCCGCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGgtgt < 3:64511/136‑1 (MQ=255) tCGGCCCAAGCGTTCTGGTTCATCGGCAATGCCTGATGCAGCGGGTTCGCAGTGGCCGGTACGGCGTTGGCGGTCTTGGCCGTGGCCGCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGgtgt > 4:64511/1‑136 (MQ=255) gCCCAAGCGTTCTGGTTCATCGGCAATGGCTGATGCAGCGGGTTCGCAGTGGCCGGTACGGCGTTGGCGGTCTTGGCCGTGGCCGCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCtt < 5:62940/149‑1 (MQ=255) aGCGTTCTGGTTCATCGGCAATGGCTGATGCAGCGGGTTCGCAGTGGCCGGTACGGCGTTGGCGGTCTTGGCCGTGGCCGCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGgtg > 6:95332/1‑148 (MQ=255) gTTCATCGGCAATGGCTGATGCAGCGGGTTCGCAGTGGCCGGTACGGCGTTGGCGGTCTTGGCCGTGGCCGCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAgg < 6:35699/148‑1 (MQ=255) gTTCATCGGCAATGGCTGATGCAGCGGGTTCGCAGTGGCCGGTACGGCGTTGGCGGTCTTGGCCGTGGCCGCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGc > 6:239474/1‑149 (MQ=255) tCATCGGCAATGGCTGATGCAGCGGGTTCGCAGTGGCCGGTACGGCGTTGGCGGTCTTGGCCGTGGCCGCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGgt < 8:185809/136‑1 (MQ=255) tCATCGGCAATGGCTGATGCAGCGGGTTCGCAGTGGCCGGTACGGCGTTGGCGGTCTTGGCCGTGGCCGCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGgt > 7:185809/1‑136 (MQ=255) aTCGGCAATGGCTGATGCAGCGGGTTCGCAGTGGCCGGTACGGCGTTGGCGGTCTTGGCCGTGGCCGCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTc < 8:150053/149‑1 (MQ=255) tCGGCAATGGCTGATGCAGCGGGTTCGCAGTGGCCGGTACGGCGTTGGCGGTCTTGGCCGTGGCCGCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCt > 2:241414/1‑149 (MQ=255) ggCAATGGCTGATGCAGCGGGTTCGCAGTGGCCGGTACGGCGTTGGCGGTCTTGGCCGTGGCCGCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGGGTCTTTCAGGCCGTCTTc < 5:201515/149‑1 (MQ=255) gCAATGGCTGATGCAGCGGGTTCGCAGTGGCCGGTACGGCGTTGGCGGTCTTGGCCGTGGCCGCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTca < 8:240738/149‑1 (MQ=255) cAATGGCTGATGCAGCGGGTTCGCAGTGGCCGGTACGGCGTTGGCGGTCTTGGCCGTGGCCGCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGgt > 4:222221/1‑108 (MQ=255) 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gCAGTGGGCTGTACGGCGTTGGCGGTATTGGCGGTGGGCGCCTGTGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGc < 5:142271/148‑1 (MQ=255) cAGTGGCCGGTACGGCGTTGGCGGTCTTGGCCGTGGCCGCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTc < 7:203276/121‑1 (MQ=255) cAGTGGCCGGTACGGCGTTGGCGGTCTTGGCCGTGGCCGCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTc > 8:203276/1‑121 (MQ=255) gTGGCCGGTACGGCGTTGGCGGTCTTGGCCGTGGCCGCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑Acc < 5:239474/149‑1 (MQ=255) gCCGGTACGGCGTTGGCGGTCTTGGCCGTGGCCGCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGTGTGTCGCTGCTGGAGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑ACCGGa < 5:267695/149‑1 (MQ=255) gCCGGTACGGCGTTGGCGGTCTTGGCCGTGGCCGCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGGTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGGCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGACTTGCC‑‑ACCGGa > 8:325736/1‑149 (MQ=255) gTACGGCGTTGGCGGTCTTGGCCGTGGCCGCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑ACCGGATTCa < 4:224497/149‑1 (MQ=255) tACGGCGTTGGCGGTCTTGGCCGTGGCCGCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑ACCGGATTCAg < 1:241414/149‑1 (MQ=255) tACGGCGTTGGCGGTCTTGGCCGTGGCCGCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAAGCCTTGCC‑‑ACCGGATTCAg > 2:153528/1‑149 (MQ=255) gCGTTGGCGGTCTTGGCCGTGGCCGCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑ACCGGATTCAGCGCt > 1:339551/1‑149 (MQ=255) cGTTGGCGGTCTTGGCCGTGGCCGCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑ACCGGATTCAg > 6:312718/1‑144 (MQ=255) cGTTGGCGGTCTTGGCCGTGGCCGCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑ACCGGATTCAg < 5:312718/144‑1 (MQ=255) cGTTGGCGGTCTTGGCCGTGGCCGCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑ACCGGATTCAGCGCtt > 3:190090/1‑149 (MQ=255) cGTTCGCGGTCTTGGCCGTGGCCGCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCCAGCAAGGCACCAAAGGCCATGCC‑‑ACCGGATTCAGCGCtt > 6:71182/1‑149 (MQ=255) ccgtggccgCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑ACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATcc > 8:206241/1‑149 (MQ=255) ccgtggccgCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑ACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATc > 2:142914/1‑148 (MQ=255) gtggccgCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCTGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑ACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTc > 2:283399/1‑149 (MQ=255) gtggccgCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCTGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑ACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTc > 2:288153/1‑149 (MQ=255) ggccgCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑ACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTc < 8:175170/147‑1 (MQ=255) ggccgCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑ACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTc > 7:175170/1‑147 (MQ=255) gccgccTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑ACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGAc < 1:344314/149‑1 (MQ=255) gccgccTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑ACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGAc < 1:182110/149‑1 (MQ=255) ccgccTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑ACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGAc > 1:185035/1‑148 (MQ=255) cgccTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑ACCGGATTCAGCGCTTTCGcc < 1:207430/132‑1 (MQ=255) cgccTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑ACCGGATTCAGCGCTTTCGcc > 2:207430/1‑132 (MQ=255) cgccTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑ACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGAc > 4:138790/1‑147 (MQ=255) ggTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑ACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGACCAGATTc < 2:237315/148‑1 (MQ=255) aGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑ACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGACCAGATTCGCCaa < 5:222063/149‑1 (MQ=255) gCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGGTGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑ACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGACCAGATTCGCCAAgg > 1:22006/1‑149 (MQ=255) tGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑ACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGACCAGATTCGCCAAGGTa < 1:142914/149‑1 (MQ=255) gCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCACGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑ACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGACCAGATTCGCCAAGGTAtt > 3:9675/1‑149 (MQ=255) cAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑ACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGACCAGATTCGCCAAGGTAttaa > 5:53376/1‑147 (MQ=255) cAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑ACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGACCAGATTCGCCAAGGTATTGa < 5:95332/149‑1 (MQ=255) ggTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGATGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑ACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGACCAGATTCGCCAAGGTATTGACGgcc > 2:99315/1‑149 (MQ=255) ttGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑ACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGACCAGATTCGCCAAGGTATTGACGgccgc < 4:190090/149‑1 (MQ=255) cAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑ACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGACCAGATTCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGc > 1:286647/1‑149 (MQ=255) aaaTCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑ACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGACCAGATTCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGccc < 7:206241/149‑1 (MQ=255) aaTCATCGATGCTGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑ACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGACCAGATTCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCt < 1:288153/149‑1 (MQ=255) aaTCATCGATGCTGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑ACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGACCAGATTCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCt < 1:283399/149‑1 (MQ=255) aaTCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑ACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGACCAGATTCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCt > 3:173257/1‑149 (MQ=255) tcatcGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑ACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGACCAGATTCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTc < 7:21967/149‑1 (MQ=255) tcatcGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑ACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGACCAGATTCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTc < 2:22006/149‑1 (MQ=255) atcGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑ACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGACCAGATTCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCt > 7:63904/1‑149 (MQ=255) cGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCCTGAGCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGACCAGATTCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGccc > 1:307622/1‑149 (MQ=255) | CCCGGTTGACCAGGCCCTCGGCCCAAGCGTTCTGGTTCATCGGCAATGGCTGATGCAGCGGGTTCGCAGTGGCCGGTACGGCGTTGGCGGTCTTGGCCGTGGCCGCCTGGGTCAGGCTGGCCAGGCGGTTGGCAAAATCATCGATGCGGGTGTCGCTGCTGGCGCTCTTGGTGTCTTTCAGGCCGTCTTCAAGCAAGGCACCAAAGGCCTTGCC‑‑ACCGGATTCAGCGCTTTCGCCATCGGTATCCTCGACCAGATTCGCCAAGGTATTGACGGCCGCCTGCCCTTCCTCGCCC > NC_002947/4951399‑4951691 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |