| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,980,807 | A→G | 6.0% | I382T (ATC→ACC) | flgE ← | flagellar hook protein FlgE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,980,807 | 0 | A | G | 6.0% | 192.2 / 2.1 | 66 | I382T (ATC→ACC) | flgE | flagellar hook protein FlgE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (27/35); new base G (2/2); total (29/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.54e-01 | |||||||||||
TCAGTGGAAATGGTCTTGGCATTGGCCTGGTAGTTGCTCTGCGCCTTGATCAGGTTTACCAGCTCGCCGGTCAGGTCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCGGCGTCAGGCCCTGCAGGTTGGCGAAGTTGGCAATCGCCACCTGGCCGATCACCTTGTCCTTGCCGTTGGTGAAGCTGGCAAACAGGTAGCCGTTCTG > NC_002947/4980666‑4980955 | tCAGTGGAAATGGTCTTGGCATTGGCCTGGTAGTTGCTCTGCGCCTTGATCAGGTTTACCAGCTCGCCGGTCAGGTCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCgg > 5:102179/1‑149 (MQ=255)tCAGTGGAAATGGTCTTGGCATTGGCCTGGTAGTTGCTCTGCGCCTTGATCAGGTTTACCAGCTCGCCGGTCAGGTCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCAGAACGCCGATCACCg < 1:358631/148‑1 (MQ=255) cAGTGGAAATGGTCTTGGCATTGGCCTGGTAGTTGCTCTGCGCCTTGATCAGGTTTACCAGCTCGCCGGTCAGGTCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCgg < 8:287835/148‑1 (MQ=255) tGGAAATGGTCTTGGCATTGGCCTGGTAGTTGCTCTGCGCCTTGATCAGGTTTACCAGCTCGCCGGTCAGGTCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACg > 2:188557/1‑149 (MQ=255) gAAATGGTCTTGGCATTGGCCTGGTAGTTGCTCTGCGCCTTGATCAGGTTTACCAGCTCGCCGGTCAGGTCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGc < 4:240674/148‑1 (MQ=255) aaaTGGTCTTGGCATTGGCCTGGTAGTTGCTCTGCGCCTTGATCAGGTTTACCAGCTCGCCGGTCAGGTCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGGTGATCGGcgctccg < 1:193202/149‑7 (MQ=255) gTCTTGGCATTGGCCTGGTAGTTGCTCTGCGCCTTGATCAGGTTTACCAGCTCGCCGGTCAGGTCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGATCGGCGCTCCGGACACCGGTAcc > 1:65073/1‑140 (MQ=255) gTCTTGGCATTGGCCTGGTAGTTGCTCTGCGCCTTGATCAGGTTTACCAGCTCGCCGGTCAGGTCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGATCGGCGCTCCGGACACCGGTAcc < 2:65073/141‑2 (MQ=255) cTTGGCATTGGCCTGGTAGTTGCTCTGCGCCTTGATCAGGTTTACCAGCTCGCCGGTCAGGTCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCa > 7:23620/1‑148 (MQ=255) gCATTGGCCTGGTAGTTGCTCTGCGCCTTGATCAGGTTTACCAGCTCGCCGGTCAGGTCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGa < 1:188557/149‑1 (MQ=255) ggCCTGGTAGTTGCTCTGCGCCTTGATCAGGTTTACCAGCTCGCCGGTCAGGTCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGActct < 2:353656/148‑1 (MQ=255) ccTGGTAGTTGCTCTGCGCCTTGATCAGGTTTACCAGCTCGCCGGTCAGGTCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTc < 7:11629/149‑1 (MQ=255) ccTGGTAGTTGCTCTGCGCCTTGATCAGGTTTACCAGCTCGCCGGTCAGGTCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTc < 3:233197/149‑1 (MQ=255) tAGTTGCTCTGCGCCTTGATCAGGTTTACCAGCTCGCCGGTCAGGTCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGtt < 8:206757/149‑1 (MQ=255) tAGTTGCTCTGCGCCTTGATCAGGTTTACCAGCTCGCCGGTCAGGTCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGtt < 6:30977/149‑1 (MQ=255) gTTGCTCTGCGCCTTGATAAGGTTTACCAGCTCGCCGGTCAGGTCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTgg > 6:33759/1‑149 (MQ=255) gCTCTGCGCCTTGATCAGGTTTACCAGCTCGCAGGTCAGGTCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCCCCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTAc > 8:317220/1‑149 (MQ=255) tctGCGCCTTGATCAGGTTTACCAGCTCGCCGGTCAGGTCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATa > 5:304830/1‑127 (MQ=255) tctGCGCCTTGATCAGGTTTACCAGCTCGCCGGTCAGGTCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATa < 6:304830/127‑1 (MQ=255) ctGCGCCTTGATCAGGTTTACCAGCTCGCCGGTCAGGTCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGc > 7:196594/1‑149 (MQ=255) cgcCTTGATCAGGTTTACCAGCTCGCCGGTCAGGGCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCaa < 8:164611/149‑1 (MQ=255) gcCTTGATCAGGTTTACCAGCTCGCCGGTCAGGTCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGa > 5:101097/1‑125 (MQ=255) gcCTTGATCAGGTTTACCAGCTCGCCGGTCAGGTCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGa < 6:101097/125‑1 (MQ=255) gcCTTGATCAGGTTTACCAGCTCGCCGGTCAGGTCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAAt > 6:143783/1‑149 (MQ=255) ccTTGATCAGGTTTACCAGCTCGCCGGTCAGGTCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATc < 1:314518/149‑1 (MQ=255) cTTGATCAGGTTTACCAGCTCGCCGGTCAGGTCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCg > 6:44692/1‑149 (MQ=255) ttGATCAGGTTTACCAGCTCGCCGGTCAGGTCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCgg > 1:14718/1‑149 (MQ=255) gATCAGGTTTACCAGCTCGCCGGTCCGGTCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCGGc < 8:196594/148‑1 (MQ=255) gATCAGGTTTACCAGCTCGCCGGTCAGGTCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCGGc < 7:317220/148‑1 (MQ=255) tCAGGTTTACCAGCTCGCCGGTCAGGGCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCGGCGTc < 1:105413/149‑1 (MQ=255) gTTTACCAGCTCGCCGGTCAGGTCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCGGCGTCAGGc > 8:358508/1‑149 (MQ=255) tttACCAGCTCGCCGGTCAGGTCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCGGCGTCAGGcc < 7:358508/149‑1 (MQ=255) ccAGCTCGCCGGTCAGGTCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCGGCGTCAGGCCCTg > 5:175521/1‑148 (MQ=255) cAGCTCGCCGGTCAGGTCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCGGCGTCAGGCCCTg > 6:299267/1‑147 (MQ=255) cAGCTCGCCGGTCAGGTCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCGGCGTCAGGCCCTg > 4:226208/1‑147 (MQ=255) cccGCCGGTCAGGGCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCAGCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATGACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCGGCGTCAGGCCCTGCAGGt < 7:306676/147‑1 (MQ=255) ggTCAGGTCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGa < 5:252488/90‑1 (MQ=255) ggTCAGGTCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGa > 6:252488/1‑90 (MQ=255) aCGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCGGCGTCAGGCCCTGCAGGTTGGCGAAGTTGGCAAt > 3:292959/1‑149 (MQ=255) gAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCGGCGTCAGGCCCTGCAGGTTGGCGAAGTTGGCAATCGCCAc < 5:33759/149‑1 (MQ=255) ctccAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGAc > 7:68446/1‑79 (MQ=255) ctccAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGAc < 8:68446/79‑1 (MQ=255) ctccAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCGGCGTCAGGCCCTGCAGGTTGGCGAAGTTGGCAATCGCCACCTGGc > 7:226074/1‑149 (MQ=255) tccAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCGGCGTCAGGCCCTGCAGGTTGGCGAAGTTGGCAATCGCCACCTGGcc > 8:125663/1‑149 (MQ=255) caccacCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCGGCGTCAGGCCCTGCAGGTTGGCGAAGTTGGCAATCGCCACCTGGCCGATCAcc < 5:44692/149‑1 (MQ=255) caccacCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCGGCGTCAGGCCCTGCAGGTTGGCGAAGTTGGCAATCGCCACCTGGCCGATCAcc < 2:315958/149‑1 (MQ=255) ccaccGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCGGCGTCAGGCCCTGCAGGTTGGCGAAGTTGGCAATCGCCACCTGGCCGTTCACCtt < 3:226208/149‑1 (MQ=255) accGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCGGCGTCAGGCCCTGCAGGTTGGCGAAGTTGGCAATCGCCACCTGGCCGATCACCTTGt < 6:149326/149‑1 (MQ=255) aaaTCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCGGCGTCAGGCCCTGCAGGTTGGCGAAGTTGGCAATCGCCACCTGGCCGATCACCTTGTcc < 4:362938/146‑1 (MQ=255) aaaTCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCGGCGTCAGGCCCTGCAGGTTGGCGAAGTTGGCAATCGCCACCTGGCCGATCACCTTGTcc > 3:362938/1‑146 (MQ=255) aTCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCGGCGTCAGGCCCTGCAGGTTGGCGAAGTTGGCAATCGCCACCTGGCCGATCACCTTGTCCTTGcc > 5:368333/1‑149 (MQ=255) tCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCGGCGTCAGGCCCTGCAGGTTGGCGAAGTTGGCAATCGCCACCTGGCCGAt < 3:147187/133‑1 (MQ=255) tCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCGGCGTCAGGCCCTGCAGGTTGGCGAAGTTGGCAATCGCCACCTGGCCGAt > 4:147187/1‑133 (MQ=255) gCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCGGCGTCAGGCCCTGCAGGTTGGCGAAGTTGGCAATCGCCACCTGGCCGATCACCTTGTCCTTGCCGTTg < 2:14718/148‑1 (MQ=255) gCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCGGCGTCAGGCCCTGCAGGTTGGCGAAGTTGGCAATCGCCACCTGGCCGATCACCTTGTCCTTGCCGTTg < 8:226074/148‑1 (MQ=255) gAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCGGCGTCAGGCCCTGCAGGTTGGCGAAGTTGGCAATCGCCACCTGGCCGATCACCTTGTCCTTGCCGTTGGTg > 7:65554/1‑148 (MQ=255) gggTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCGGCGTCAGGCCCTGCAGGTTGGCGAAGTTGGCAATCGCCACCTGGCCGATCACCTTGTCCTTGCCGTTGGTGAAg < 5:143783/149‑1 (MQ=255) cgtgccGGTGATCGGCGCTCCGGACACCGGTACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCGGCGTCAGGCCCTGCAGGTTGGCGAAGTTGGCAATCGCCACCTGGCCGATCACCTTGTCCTTGCCGTTGGTGAAGc > 1:133822/5‑149 (MQ=255) aCCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCGGCGTCAGGCCCTGCAGGTTGGCGAAGTTGGCAATCGCCACCTGGCCGATCACCTTGTCCTTGCCGTTGGTGAAGCTgg > 7:31204/1‑149 (MQ=255) ccGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCGGCGTCAGGCCCTGCAGGTTGGCGAAGTTGGCAATCGCCACCTGGCCGATCACCTTGTCCTTGCCGTTGGTGAAGCTGGc < 7:125663/149‑1 (MQ=255) cGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCGGCGTCAGGCCCTGCAGGTTGGCGAAGTTGGCAATCGCCACCTGGCCGATCACCTTGTCCTTGCCGTTGGt > 4:19189/1‑139 (MQ=255) cGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCGGCGTCAGGCCCTGCAGGTTGGCGAAGTTGGCAATCGCCACCTGGCCGATCACCTTGTCCTTGCCGTTGGt < 3:19189/139‑1 (MQ=255) ggTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCGGCGTCAGGCCCTGCAGGTTGGCGAAGTTGGCAATCGCCACCTGGCCGATCACCTTGTCCTTGCCGTTGGTGAAGCTGGCa > 6:147549/1‑148 (MQ=255) tgtCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCGGCGTCAGGCCCTGCAGGTTGGCGAAGTTGGCAATCGCCACCTGGCCGATCACCTTGTCCTTGCCGTTGGTGAAGCTGGCAAAc < 6:175521/149‑1 (MQ=255) tCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCGGCGTCAGGCCCTGCAGGTTGGCGAAGTTGGCAATCGCCACCTGGCCGATCACCTTGTCCTTGCCGTTGGTGAAGCTGGCAAACa < 8:23620/148‑1 (MQ=255) tCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCGGCGTCAGGCCCTGCAGGTTGGCGAAGTTGGCAATCGCCACCTGGCCGATCACCTTGTCCTTGCCGTTGGTGAAGCTGGCAAACAg < 4:292959/149‑1 (MQ=255) ctaTCTCCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTTGTACCGCCAATCGGCGTCAGGCCCTGCAGGTTGGCGAAGTTGGCAATCGCCACCTGGCCTATCACCTTGTCCTTGCCGTTGGTGAAGCTGGCAAACAGGTAGCCGtt < 3:205837/146‑1 (MQ=255) aTCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCGGCGTCAGGCCCTGCAGGTTGGCGAAGTTGGCAATCGCCACCTGGCCGATCACCTTGTCCTTGCCGTTGGTGAAGCTGGCAAACAGGTAGCCGTTCTg < 5:299267/149‑1 (MQ=255) | TCAGTGGAAATGGTCTTGGCATTGGCCTGGTAGTTGCTCTGCGCCTTGATCAGGTTTACCAGCTCGCCGGTCAGGTCGACGTTGGAGTCCTCCAGGGCACCACCGGAAATCTGGCCGAGGGTACCGGTGTCCGGAGCGCCGATCACCGGCACGCCCGAGGCATAGGACTCTTTCCAGTTGGTACCGCCAATCGGCGTCAGGCCCTGCAGGTTGGCGAAGTTGGCAATCGCCACCTGGCCGATCACCTTGTCCTTGCCGTTGGTGAAGCTGGCAAACAGGTAGCCGTTCTG > NC_002947/4980666‑4980955 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |