Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,182,059 | G→T | 6.7% | intergenic (‑117/+37) | PP_4560 ← / ← csbD | ribonuclease BN/stress response protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,182,059 | 0 | G | T | 6.7% | 175.8 / 3.6 | 60 | intergenic (‑117/+37) | PP_4560/csbD | ribonuclease BN/stress response protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (28/28); new base T (2/2); total (30/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.44e-01 |
GGGGCAAGCCGCGCAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCTTGC > NC_002947/5181912‑5182205 | ggggCAAGCCGCGCAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTcgc < 6:217874/149‑1 (MQ=255) ggggCAAGCCGCGCAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTcgc < 2:260396/149‑1 (MQ=255) aaGCCGCGCAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCTCGGGt > 2:81234/1‑148 (MQ=255) aGCCGCGCAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTc < 1:233654/149‑1 (MQ=255) cgcAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCTCGGGTGAACCC‑g < 2:160428/149‑1 (MQ=255) gcAGGTCGGGGAAAATCATAGCGGCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTTGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTTCCTGCCTCTTCGCGGGTGCACCC‑ga < 2:241175/149‑1 (MQ=255) gTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑gag > 8:145922/1‑146 (MQ=255) gTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑Gagaag < 1:126021/149‑1 (MQ=255) gtggAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCTCTTGATCGTTACACATGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTTTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAgg < 2:288627/147‑1 (MQ=255) ggggAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAgg < 2:342832/149‑1 (MQ=255) gAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCGTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCTCGGGTGAACCC‑GCGAAGAGGCCg < 7:16253/149‑1 (MQ=39) tCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCAcc > 1:208905/1‑149 (MQ=255) gctcCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACAGTGCCCGAGCTGTGCTGCGCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCATAGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCtcaac > 4:131924/2‑148 (MQ=255) cTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCATCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGc > 2:11208/1‑130 (MQ=255) cTTTCGCCGCGTGATCGTTACAGAGGCAAGTCTAATAGACCGGGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCGCTTCGCGGGTTCCCCC‑GAGAAGAGGc < 1:11208/130‑1 (MQ=255) ttCGCCGTTTGTTCGTTACACAGGCATGTATAATCGCCGGTCCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGCCCTGGGTTCAAGAATTTCCTTACCAATAATGGCCGGCCTCTTCGGGGGTTCACCC‑TCTAATTGGCCGGCACCGCCtcaagtcaag < 2:208905/148‑1 (MQ=255) tCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCtcaagtcaag < 5:4378/147‑1 (MQ=255) gcTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGcttctt < 6:380528/149‑1 (MQ=255) tACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCTCCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATcc > 3:38121/1‑149 (MQ=255) acacAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGcttc > 4:163653/1‑136 (MQ=255) acacAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGcttc < 3:163653/136‑1 (MQ=255) actggCAAGTCTATTTCACGGTCGCCGATCTGTGCGGCTCCCGCCCGGTGTTTAATATATTTCTTACGAATACGTGGCGGCCCCTTCGGGCGTTCACCC‑TAGATTAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTc < 6:141350/146‑1 (MQ=255) aGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTca > 7:332577/1‑148 (MQ=255) aGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTca > 5:206372/1‑148 (MQ=255) aGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTca > 1:70220/1‑148 (MQ=255) gCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACAt > 2:85688/1‑149 (MQ=255) aaTAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCtt > 1:81244/1‑148 (MQ=255) cGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACctgct > 5:344391/1‑149 (MQ=255) cGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACctgag > 1:325927/1‑147 (MQ=255) gTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACctgctg < 1:85688/149‑1 (MQ=255) gTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACctgctg > 3:181943/1‑149 (MQ=255) cGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTccc > 7:242956/1‑133 (MQ=255) cGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTccc < 8:242956/133‑1 (MQ=255) gtgCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGTTTGAATATTTTGCTTACGAATATGTGCCGGCCTCTTCGCGGTTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGcgcctc < 2:325927/147‑1 (MQ=255) tgctgcTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCttt > 4:111903/1‑149 (MQ=255) ctgctCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGa < 6:206372/149‑1 (MQ=255) ctgctCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCGTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCttt > 1:285378/1‑147 (MQ=255) tCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGTTGCGCCTCGCCTTTGAGCTc > 1:317146/1‑149 (MQ=255) ccGGCGGTGGTTCAATAATTTCCTTACTAATAAGTGCCGGCCTCTTCGGGGGTTCCCCC‑GATAAGCGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTc < 8:11384/147‑1 (MQ=255) cGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTg < 2:81244/149‑1 (MQ=255) gTTTAATAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGTGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCgccttgc < 3:131924/149‑1 (MQ=255) ttGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCgccttgcc > 3:62970/1‑149 (MQ=255) gaagaaTTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTCGAGCTCCTGCgccttgcctt > 7:192956/1‑149 (MQ=255) aTTTGCTTCCGAATAAGTGCCGGCCTGTTCGCGGGTTCCCCC‑GAGATGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGc < 8:332577/148‑1 (MQ=255) tGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCg > 8:89585/1‑148 (MQ=255) ttACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGc > 2:236412/1‑149 (MQ=255) cGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCttt < 7:89585/149‑1 (MQ=255) gAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTg > 1:45076/1‑124 (MQ=255) gAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTg < 2:45076/123‑1 (MQ=255) gAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACAGTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCtttt > 1:157266/1‑149 (MQ=255) atttgTGCGGGCCTCTCGGCGTGTTCCCCC‑TAGACGTGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTc < 2:157266/144‑1 (MQ=255) aGTGCCGGCCTCTTCGCGGTTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGtt < 3:111903/148‑1 (MQ=255) gTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGt > 4:138126/1‑149 (MQ=255) gTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGt > 6:309365/1‑149 (MQ=255) gTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGt < 6:344391/149‑1 (MQ=255) gTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGt < 2:70220/149‑1 (MQ=255) gCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCg < 1:236412/149‑1 (MQ=255) ccGGCCTCTTGGCGGGTTCACCG‑GTGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCTTTGTCg < 1:13159/148‑1 (MQ=255) ctctTCTCGGGTGAACCC‑GCGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCgccttg > 6:116733/1‑116 (MQ=39) ttCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGt < 1:338825/138‑1 (MQ=255) ttCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGt > 2:338825/1‑138 (MQ=255) ttCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCTTg > 8:103669/1‑149 (MQ=255) cgcgGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCTTGc < 5:309365/148‑1 (MQ=255) | GGGGCAAGCCGCGCAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCC‑GAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCTTGC > NC_002947/5181912‑5182205 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |