Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,208,683 | T→C | 8.9% | D9G (GAC→GGC) ‡ | PP_4589 ← | D‑isomer specific 2‑hydroxyacid dehydrogenase family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,208,683 | 0 | T | C | 8.9% | 178.8 / 6.5 | 67 | D9G (GAC→GGC) ‡ | PP_4589 | D‑isomer specific 2‑hydroxyacid dehydrogenase family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (26/35); new base C (3/3); total (29/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.90e-01 |
TTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCTTTCGAGGTTCTCCAGCACCTTGGTG > NC_002947/5208535‑5208828 | ttGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGt > 2:64677/1‑149 (MQ=255) ggCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTc < 1:220076/148‑1 (MQ=255) gcgcAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCAt > 6:127654/1‑149 (MQ=255) gcagcaGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGc < 6:69298/149‑1 (MQ=255) gcagcaGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGc > 2:229391/1‑149 (MQ=255) gCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCa < 6:42107/148‑1 (MQ=255) ccAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAg > 5:28138/1‑148 (MQ=255) gCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGt > 6:132409/1‑148 (MQ=255) ggCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGa > 8:175391/1‑149 (MQ=255) ccAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACgg > 8:110696/1‑149 (MQ=255) ccACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTAcg < 4:291852/130‑1 (MQ=255) ccACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTAcg > 3:291852/1‑130 (MQ=255) ccACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTc > 3:77230/1‑149 (MQ=255) acacCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCGACTGTTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGCCGCCCCGCAAACCCGCGGCGTAACTCGCATGGTAATGCTCAGCGAGCAGTCCGCGCATGTTCAGACGGGGGCg > 1:84795/1‑149 (MQ=255) cacCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCT‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGtt < 1:229391/149‑1 (MQ=255) acCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGACCATGCTcga > 1:351510/1‑113 (MQ=255) acCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGACCATGCTcga < 2:351510/115‑3 (MQ=255) ccGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTgc < 6:271190/149‑1 (MQ=255) cGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTgcg < 2:230526/149‑1 (MQ=255) gggCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTgcgg < 1:225253/149‑1 (MQ=255) gggCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTgcgg < 1:64677/149‑1 (MQ=255) aCTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCgca < 2:306052/149‑1 (MQ=255) gCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCgcag > 3:161006/1‑147 (MQ=255) gCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGctct > 5:6645/1‑149 (MQ=255) ccTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCtt < 7:175391/149‑1 (MQ=255) cTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTc < 2:369267/149‑1 (MQ=255) cTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTc < 2:317695/149‑1 (MQ=255) gCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCggg > 8:29418/1‑149 (MQ=255) gCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCg < 4:102773/147‑1 (MQ=255) ggCCAGTTCGGCAGAGTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAg < 4:132993/149‑1 (MQ=255) cAGTTCGGCAGAGTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTg > 8:23253/1‑149 (MQ=255) cGGCAGAGTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCg < 7:110696/148‑1 (MQ=255) cGGCAGAGTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCg < 4:161006/148‑1 (MQ=255) ggCAGCGTCGCCG‑CTGGGCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGCCGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGAt < 8:205286/149‑1 (MQ=255) ggCAGAGTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGAt > 3:33697/1‑149 (MQ=255) ggCAGAGTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGAt > 3:55366/1‑149 (MQ=255) agagTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTa > 6:338052/1‑149 (MQ=255) agagTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTa < 7:23253/149‑1 (MQ=255) gagTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTAc < 7:8380/149‑1 (MQ=255) gagTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTAc < 5:132409/149‑1 (MQ=255) tCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCa < 4:55366/149‑1 (MQ=255) tCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCa > 6:310869/1‑149 (MQ=255) gccg‑cTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCAt < 4:57889/148‑1 (MQ=255) aCTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGcggcgg < 4:77230/148‑1 (MQ=255) tCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATc > 5:93565/1‑149 (MQ=255) aGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGc < 7:29418/149‑1 (MQ=255) aGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGc < 2:84795/149‑1 (MQ=255) gcggcggcgCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGcggcgg > 8:91607/1‑133 (MQ=255) gcggcggcgCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGcggcgg < 7:91607/133‑1 (MQ=255) gcggcggcgCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAg > 3:273444/1‑149 (MQ=255) cggcgCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCtt < 4:348363/149‑1 (MQ=255) gcgcgcAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTgg > 6:139874/1‑149 (MQ=255) gcAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCttt > 7:340360/1‑149 (MQ=255) aaGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCTTTCGAg < 4:273444/149‑1 (MQ=255) aGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCTTTCGAgg < 5:127654/149‑1 (MQ=255) gcgcGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCTTTCGAGGt > 2:280096/1‑149 (MQ=255) tCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCtt < 6:9645/127‑1 (MQ=255) tCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCtt > 5:9645/1‑127 (MQ=255) tCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCTTTCGAGGTTCTCCAGCAc > 6:214032/1‑149 (MQ=255) ctgAGCATGACCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCTTTCg > 6:184610/3‑135 (MQ=255) ctgAGCATGACCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCTTTCg < 5:184610/133‑1 (MQ=255) ctgAGCATGACCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCTTTCGAGGTTCTCCAGCAc < 5:302706/147‑1 (MQ=255) ctgAGCATGACCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCTTTCGAGGTTCTCCAGCAc > 6:302706/3‑149 (MQ=255) gAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCTTTCGAGGTTCTCCAGCACCt > 7:359126/1‑149 (MQ=255) gCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCTTTCGAGGTTCTCCAGCACCTTg < 5:139874/149‑1 (MQ=255) cATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCTTTCGAGGTTCTCCAGCACCTTgg < 6:6645/149‑1 (MQ=255) aTGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCTTTCGAGGTTCTCCAGCACCTTgg < 8:359126/148‑1 (MQ=255) tGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCTTTCGAGGGTCTCCAGCACCTTGGTg < 4:33697/149‑1 (MQ=255) | TTGGCGCAGCAGACTGGCCAGCAAGTCCGGCTGGCCCAGCCACACCGGGCACTGCGGTGCCTGGCGGGCCAGTTCGGCAGAGTCGCCG‑CTGGTCAGCACTTCCAGTTCTGGCGCGGCGGCGCGCAAAAGCGCGGCGTATCGAGCATGGTCATGCTCAGCGATCAGTACGCGCATGGTCAGACGGGGTCGTTGCGGCGCAGCAGCTCTTCGGGCAGGTGCTCGATGTACTCATCTTCCAGCGGCGGCATCTGCAGGTGGTAGCCTTGGCTTTCGAGGTTCTCCAGCACCTTGGTG > NC_002947/5208535‑5208828 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |