Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,235,310 | C→G | 6.6% | S215W (TCG→TGG) | fecA → | outer membrane ferric citrate porin |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,235,310 | 0 | C | G | 6.6% | 246.6 / 6.6 | 76 | S215W (TCG→TGG) | fecA | outer membrane ferric citrate porin |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (30/41); new base G (2/3); total (32/44) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.14e-01 |
ACGCCCCCGACAACAACGGTACCGGCAGCCATGACCTGGCGCTGAACTTCGGCATCCGCGGCCTCAACCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTGCGCTACGGCCCGCAGAACGTCGGCGGCATCGTCAACTTCGTCACCCGGGCGATCCCTGAACAGGCCACGTTCAAGGCCGCCAT > NC_002947/5235163‑5235457 | aCGCCCCCGACAACAACGGTACCGGCAGCCATGACCTGGCGCTGAACTTCGGCATCCGCGGCCTCAACCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCg < 5:247602/149‑1 (MQ=255) aCGCCCCCGACAACAACGGTACCGGCAGCCATGACCTGGCGCTGAACTTCGGCATCCGCGGCCTCAACCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCg < 7:226160/149‑1 (MQ=255) gCCCCCGACAACAACGGTACCGGCAGCCATGACCTGGCGCTGAACTTCGGCATCCGCGGCCTCAACCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCt < 7:278389/149‑1 (MQ=255) ccGACAACAACGGTACCGGCAGCCATGACCTGGCGCTGAACTTCGGCATCCGCGGCCTCAACCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGcc < 7:145199/149‑1 (MQ=255) ccGACAACAACGGTACCGGCAGCCATGACCTGGCGCTGAACTTCGGCATCCGCGGCCTCAACCCGCGCCTGGCATCGCGCGCGACCGTGCGGATTGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCGACAGCTGCGGCTGGcc < 3:263852/149‑1 (MQ=255) cGACAACAACGGTACCGGCAGCCATGACCTGGCGCTGAACTTCGGCATCCGCGGCCTCAACCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCGACAGCTGCGGCTGGccg < 7:201600/149‑2 (MQ=255) cGACAACAACGGTACCGGCAGCCATGACCTGGCGCTGAACTTCGGCATCCGCGGCCTCAACCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGccc < 8:154266/149‑1 (MQ=255) gACAACAACGGTACCGGCAGCCATGACCTGGCGCTGAACTTCGGCATCCGCGGCCTCAACCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGcccc > 3:290974/1‑149 (MQ=255) aacaacGGTACCGGCAGCCATGACCTGGCGCTGAACTTCGGCATCCGCGGCCTCAACCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCGACAGCTGCGGCTGGccgtacg < 7:154681/149‑6 (MQ=255) aacGGTACCGGCAGCCATGACCTGGCGCTGAACTTCGGCATCCGCGGCCTCAACCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAg < 1:16355/149‑1 (MQ=255) acGGTACCGGCAGCCATGACCTGGCGCTGAACTTCGGCATCCGCGGCCTCAACCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGc < 6:306176/149‑1 (MQ=255) tACCGGCAGCCATGACCTGGCGCTGAACTTCGGCATCCGCGGCCTCAACCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATg‑g < 5:62874/149‑1 (MQ=255) tACCGGCAGCCATGACCTGGCGCTGAACTTCGGCATCCGCGGCCTCAACCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATg‑g < 4:290974/149‑1 (MQ=255) aGCCATGACCTGGCGCTGAACTTCGGCATCCGCGGCCTCAACCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACAt < 2:153742/149‑1 (MQ=255) aTGACCTGGCGCTGAACTTCGGCATCCGCGGCCTCAACCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGAc > 2:83540/1‑149 (MQ=255) tGGCGCTGAACTTCGGCATCCGCGGCCTCAACCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCa > 2:3455/1‑146 (MQ=255) tGGCGCTGAACTTCGGCATCCGCGGCCTCAACCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCa < 1:3455/146‑1 (MQ=255) gcgcTGAACTTCGGCATCCGCGGCCTCAACCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGCAATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTAAGCATG‑GGACACATCGAAGCAGTGGa > 6:264578/1‑149 (MQ=255) gcTGAACTTCGGCATCCGCGGCCTCAACCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACg < 4:32706/149‑1 (MQ=255) gAACTTCGGCATCCGCGGCCTCAACCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAg > 1:315668/1‑149 (MQ=255) aaCTTCGGCATCCGCGGCCTCAACCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCaa > 4:45971/1‑128 (MQ=255) aaCTTCGGCATCCGCGGCCTCAACCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCaa < 3:45971/128‑1 (MQ=255) aaCTTCGGCATCCGCGGCCTCAACCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGt < 8:274338/149‑1 (MQ=255) aaCTTCGGCATCCGCGGCCTCAACCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGt < 6:194222/149‑1 (MQ=255) cTTCGGCATCCGCGGCCTCAACCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTgc > 4:316450/1‑149 (MQ=255) cTTCGGCATCCGCGGCCTCAACCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTgc > 4:311255/1‑149 (MQ=255) ttCGGCATCCGCGGCCTCAACCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGACGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTgcg > 4:286422/1‑149 (MQ=255) ggCATCCGCGGCCTCAACCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCgg > 3:188403/1‑149 (MQ=255) cATCCGCGGCCTCAACCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTg < 2:222041/149‑1 (MQ=255) cATCCGCGGCCTCAACCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTg > 2:244275/1‑149 (MQ=255) aTCCGCGGCCTCAACCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTgg < 1:331917/149‑1 (MQ=255) aTCCGCGGCCTCAACCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTgg < 2:315668/149‑1 (MQ=255) aTCCGCGGCCTCAACCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTCAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTgg < 5:264578/149‑1 (MQ=255) cgcgGCCTCAACCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTggcgg < 3:44015/149‑1 (MQ=255) gCCTCAACCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGcgcg < 8:48751/149‑1 (MQ=255) gCCTCAACCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGcgcg > 8:311670/1‑149 (MQ=255) aaCCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTgcg > 6:48911/1‑149 (MQ=255) aaCCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTg < 2:209109/147‑1 (MQ=255) aaCCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTg < 7:201010/147‑1 (MQ=255) aCCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATGCGGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTgcg < 1:83540/149‑1 (MQ=255) acgcgCCTGGCATCGCGCTCGACAGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTGCGCTa < 6:1301/148‑1 (MQ=255) ccTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTggc < 4:49794/130‑1 (MQ=255) ccTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTggc > 3:49794/1‑130 (MQ=255) gcgcTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTGCGCTACGGCCCGCAGAAc < 2:80416/148‑1 (MQ=255) tGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTGCGCTACGGCCCGCAGaa < 7:63371/136‑1 (MQ=255) tGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTGCGCTACGGCCCGCAGaa > 8:63371/1‑136 (MQ=255) tGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTGCGCTACGGCCCGCAGAACGTCGGCGGCATCGt > 2:297761/1‑148 (MQ=255) tGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTGCGCTACGGCCCGCAGAACGTCGGCGGCATCGt > 7:190335/1‑148 (MQ=255) atggatggCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTGCGCTACGGCCCGCAGAACGTCGGCGGCATCGTCaa > 7:313845/1‑149 (MQ=255) atggCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTGCGCTACGGCCCGCAGAACGTCGGCGGCCTCGTCCACTTc > 7:322272/1‑149 (MQ=255) atggCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTGCGCTACGGCCCGCAGAACGTCGGCGGCATCGTCAACTTc < 3:286422/149‑1 (MQ=255) cATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTgc < 8:49204/107‑1 (MQ=255) cATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTgc > 7:49204/1‑107 (MQ=255) aTCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTGCGCTACGGCCCGCAGAACGTCGGCGGCATCGTCAACTTCGTCAc < 1:297761/149‑1 (MQ=255) ggTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTGCGCTACGGCCCGCAGAACGTCGGCGGCATCGTCAACTTCGTCACCCggg < 1:244275/149‑1 (MQ=255) gCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTGCGCTACGGCCCGCAGAACGTCggcggc < 4:149814/124‑1 (MQ=255) gCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTGCGCTACGGACCGCAGAACGTCggcggc > 3:149814/1‑124 (MQ=255) cgcgCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTGCGCTACGGCCCGCAGAACGTCGGCGGCATCGTCAACTTCGTCACCCGGGCGATCCCt < 8:190335/148‑1 (MQ=255) gcCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTGCGCTACGGCCCGCAGAACGTCGGCGGCATCGTCAACTTCGTCACCCGGGCGATCCCTGaa > 1:199906/1‑148 (MQ=255) cGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTGCGCTACGGCCCGCAGAACGTCGGCGGCATCGTCAACTTCGTCACCCGGGCGATCCCTGAACAg < 2:199906/149‑1 (MQ=255) gTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTGCGCTACGGCCCGCAGAACGTCGGCGGCATc < 3:73827/115‑1 (MQ=255) gTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTGCGCTACGGCCCGCAGAACGTCGGCGGCATc > 4:73827/1‑115 (MQ=255) gTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTGCGCTACGGCCCGCAGAACGTCGGCGGCATCGTCAACTTCGTCACCCGGGCGATCCCTGAACAgg > 6:186746/1‑149 (MQ=255) gggCCAGCGACAGCTGCGGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTGCGCTACGGCCCGCAGAACGTCGGCGGCATCGTCAACTTCGTCACCCGGGCGATCCCTGAACAGGCCa > 4:173046/2‑149 (MQ=255) ggCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTGCGCTACGGCCCGCAGAACGTCGGCGGCATCGTCAACTTCGTCACCCGGGCGATCCCTGAACAGGCCAc < 8:286901/149‑1 (MQ=255) ccAGCCGCAGCTGTGGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTGCGCTACGGCCCGCAGAACGTCGGCGGCATc > 7:324977/1‑109 (MQ=255) ccAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTGCGCTACGGCCCGCAGAACGTCGGCGGCATc < 8:324977/109‑1 (MQ=255) ccAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTGCGCTACGGCCCGCAGAACGTCGGCGGCATCGTCAACTTCGTCACCCGGGCGATCCCTGAACAGGCCACGt > 2:346300/1‑149 (MQ=255) ccAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTGCGCTACGGCCCGCAGAACGTCGGCGGCATCGTCAACTTCGTCACCCGGGCGATCCCTGAACAGGCCACGt > 2:33942/1‑149 (MQ=255) aGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTGCGCTACGGCCCGCAGAACGTCGGCGGCATCGTCAACTTCGTCACCCGGGCGATCCCTGAACAGGCCACGTTc < 4:188403/149‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTGCGCTACGGCCCGCAGAACGTCGGCGGCATCGTCAACTTCGTCACCCGGGCGATCCCTGAACAGGCCACGTTCaa < 5:48911/149‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTGCGCTACGGCCCGCAGAACGTCGGCGGCATCGTCAACTTCGTCACCCGGGCGATCCCTGAACAGGCCACGTTCaa < 7:311670/149‑1 (MQ=255) cAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTGCGCTACGGCCCGCAGAACGTCGGCGGCATCGTCAACTTCGTCACCCGGGCGATCCCTGAACAGGCCACGTTCAAGgc > 7:77133/1‑149 (MQ=255) cTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTGCGCTACGGCCCGCAGAACGTCGGCGGCATCGTCAACTTCGTCACCCGGGCGATCCCTGAACAGGCCACGTTCAAGgccgc > 5:242761/1‑149 (MQ=255) gTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTGCGCTACGGCCCGCAGAACGTCGGCGGCATCGTCAACTTCGTCACCCGGGCGATCCCTGAACAGGCCACGTTCAAGGCCGCCa > 2:60674/1‑149 (MQ=255) tCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTGCGCTACGGCCCGCAGAACGTCGGCGGCATCGTCAACTTCGTCACCCGGGCGATCCCTGAACAGGCCACGTTCAAGGCCGCCAt > 6:281568/1‑149 (MQ=255) | ACGCCCCCGACAACAACGGTACCGGCAGCCATGACCTGGCGCTGAACTTCGGCATCCGCGGCCTCAACCCGCGCCTGGCATCGCGCTCGACCGTGCTGATGGATGGCATCCCGGTGCCCTTCGCGCCGTACGGCCAGCCGCAGCTGTCGCTGGCCCCGCTGAGCATG‑GGCAACATGGACGCAGTGGACGTAGTGCGCGGTGGCGGCGCGGTGCGCTACGGCCCGCAGAACGTCGGCGGCATCGTCAACTTCGTCACCCGGGCGATCCCTGAACAGGCCACGTTCAAGGCCGCCAT > NC_002947/5235163‑5235457 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |