| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,334,338 | G→A | 5.7% | P256P (CCG→CCA) | PP_4695 → | two‑component system sensor histidine kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,334,338 | 0 | G | A | 5.7% | 213.1 / 2.1 | 70 | P256P (CCG→CCA) | PP_4695 | two‑component system sensor histidine kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/31); new base A (2/2); total (37/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.29e-01 | |||||||||||
CCTTGTATGGCGTATTCGGTGGCCCGCACGAGCTGGAAGTCTGGCTGCTGCAGAACCAGACCGCCCTCGCCGCCCTGCACACCCCACTGCAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTGTGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCACCAAC > NC_002947/5334190‑5334485 | ccTTGTATGGCGTATTCGGTGGCCCGCACGAGCTGGAAGTCTGGCTGCTGCAGAACCAGACCGCCCTCGCCGCCCTGCACACCCCACTGCAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCg < 8:18175/149‑1 (MQ=255) gTATGGCGTATTCGGTGGCCCGCACGAGCTGGAAGTCTGGCTGCTGCAGAACCAGACCGCCCTCGCCGCCCTGCACACCCCACTGCAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGcaca > 6:87661/1‑149 (MQ=255) gTATGGCGTATTCGGTGGCCCGCACGAGCTGGAAGTCTGGCTGCTGCAGAACCAGACCGCCCTCGCCGCCCTGCACACCCCACTGCAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGcaca > 6:274879/1‑149 (MQ=255) gCGTATTCGGTGGCCCGCACGAGCTGGAAGTCTGGCTGCTGCAGAACCAGACCGCCCTCGCCGCCCTGCACACCCCACTGCAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTAc > 7:245365/1‑149 (MQ=255) cGTATTCGGTGGCCCGCACGAGCTGGAAGTCTGGCTGCTGCAGAACCAGACCGCCCTCGCCGCCCTGCACACCCCACTGCAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTTGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTAcc < 8:245365/149‑1 (MQ=255) tATTCGGTGGCCCGCACGAGCTGGAAGTCTGGCTGCTGCAGAACCAGACCGCCCTCGCCGCCCTGCACACCCCACTGCAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACca > 3:306625/1‑148 (MQ=255) ttCGGTGGCCCGCACGAGCTGGAAGTCTNGCTGCTGCAGAACCAGACCGCCCTCGCCGCCCTGCACACCCCACTGCAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACAt > 1:216980/1‑149 (MQ=255) ttCGGTGGCCCGCACGAGCTGGAAGTCTGGCTGCTGCAGAACCAGACCGCCCTCGCCGCCCTGCACACCCCACTGCAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACcaca < 7:78444/148‑1 (MQ=255) ggTGGCCCGCACGAGCTGGAAGTCTGGCTGCTGCAGAACCAGACCGCCCTCGCCGCCCTGCACACCCCACTGCAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGc > 6:334163/1‑149 (MQ=255) ggTGGCCCGCACGAGCTGGAAGTCTGGCTGCTGCAGAACCAGACCGCCCTCGCCGCCCTGCACACCCCACTGCAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGc < 1:353560/149‑1 (MQ=255) tgcaccGCACGAGCTGGAAGTATGGCTGCTGCAGAACCATACCGACCTCGCATCCCTGCACACCCCACTGCAGGAAGGAACATGGAGCACCCTTCTGATGGTTTTCGTCGCCTCGGCAATCGTCCTTCCGCACAATTACCACATGTCCt > 4:190808/5‑149 (MQ=255) gCTGGAAGTCTGGCTGCTGCAGAACCAGACCGCCCTCGCCGCCCTGCACACCCCACTGCAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAAcc < 5:274879/149‑1 (MQ=255) gCTGGAAGTCTGGCTGCTGCAGAACCAGACCGCCCTCGCCGCCCTGCACACCCCACTGCAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAAc < 5:252759/148‑1 (MQ=255) cTGGAAGTCTGGCTGCTGCAGAACCAGACCGCCCTCGCCGCCCTGCACACCCCACTGCAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTAc > 6:256549/1‑140 (MQ=255) cTGGAAGTCTGGCTGCTGCAGAACCAGACCGCCCTCGCCGCCCTGCACACCCCACTGCAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTAc < 5:256549/140‑1 (MQ=255) gAAGTCTGGCTGCTGCAGAACCAGACCGCCCTCGCCGCCCTGCACACCCCACTGCAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGTCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCaa > 4:33017/1‑149 (MQ=255) tGGCTGCTGCAGAACCAGACCGCCCTCGCCGCCCTGCACACCCCACTGCAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCcgcg < 3:323449/149‑1 (MQ=255) gctgctGCAGAACCAGACCGCCCTCGCCGCCCTGCACACCCCACTGCAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCcgcg < 5:87661/147‑1 (MQ=255) tgcAGAACCAGACCGCCCTCGCCGCCCTGCACACCCCACTGCAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTg > 5:231925/1‑149 (MQ=255) gcAGAACCAGACCGCCCTCGCCGCCCTGCACACCCCACTGCAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTgg > 3:71042/1‑149 (MQ=255) gcAGAACCAGACCGCCCTCGCCGCCCTGCACACCCCACTGCAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCACAACCCGCGCTCGCTgg > 7:12467/1‑149 (MQ=255) cAGAACCAGACCGCCCTCGCCGCCCTGCACACCCCACTGCAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGt < 5:334163/149‑1 (MQ=255) aGAACCAGACCGCCCTCGCCGCCCTGCACACCCCACTGCAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCgag < 1:295974/125‑1 (MQ=255) aGAACCAGACCGCCCTCGCCGCCCTGCACACCCCACTGCAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCgag > 2:295974/1‑125 (MQ=255) ccAGACCGCCCTCGCCGCCCTGCACACCCCACTGCAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAgcg > 1:244717/1‑149 (MQ=255) ccAGACCGCCCTCGCCGCCCTGCACACCCCACTGCAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAgcg > 4:365384/1‑149 (MQ=255) gACCGCCCTCGCCGCCCTGCACACCCCACTGCAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAgcgc > 5:356191/1‑147 (MQ=255) aCCGCCCTCGCCGCCCTGCACACCCCACTGCAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAg < 5:115137/149‑1 (MQ=255) cGCCCTCGCCGCCCTGCACACCCCACTGCAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCt > 3:99913/1‑149 (MQ=255) gccTCGCCGCCCTGCACACCCCACTGCATGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTgg < 8:135887/148‑1 (MQ=255) ccTCGCCGCCCTGCACACCCCACTGCAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTggg > 8:18499/1‑149 (MQ=255) gccgccCTGCACACCCCACTGCAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGTCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGc < 3:33017/147‑1 (MQ=255) ccgccCTGCACACCCCACTGCAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTg > 1:331062/1‑149 (MQ=255) cccTGCACACCCCACTGCAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAgc > 3:181424/1‑131 (MQ=255) cccTGCACACCCCACTGCAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAgc < 4:181424/131‑1 (MQ=255) tGCACACCCCACTGCAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTg > 3:219151/1‑149 (MQ=255) acacCCCACTGCAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTc < 4:306625/149‑1 (MQ=255) cAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCctgctgctg < 6:231925/147‑1 (MQ=255) cAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTTCtga < 8:12467/148‑1 (MQ=255) ggAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCtgatga < 4:99913/149‑1 (MQ=255) gAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGCACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAg > 5:214343/1‑149 (MQ=255) aGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGcc > 6:136646/1‑149 (MQ=255) cccATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTtg < 4:219151/149‑1 (MQ=255) ccATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTtgc < 5:389879/149‑1 (MQ=255) ccATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTtgc < 2:331062/149‑1 (MQ=255) ccATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTtgc > 7:332923/1‑149 (MQ=255) ccATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTtgc > 6:389879/1‑149 (MQ=255) ccATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTCTTCATGCTGCTGATGAGCCAtgc > 8:297850/1‑149 (MQ=255) cATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGc > 1:33322/1‑123 (MQ=255) cATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGc < 2:33322/123‑1 (MQ=255) cATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCctg > 8:351952/1‑131 (MQ=255) cATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCctg < 7:351952/131‑1 (MQ=255) ccTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTgg > 2:84998/1‑149 (MQ=255) ctgctgGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTg < 4:71042/147‑1 (MQ=255) ctgctgGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGc < 2:244717/148‑1 (MQ=255) ctgctgGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCt < 7:18499/149‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) ccTCGGCCATCGTCATGCCACACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTGTGGGCCGGCCTgcgc < 6:109734/149‑1 (MQ=255) ccTCGGCCATCGTCATGCCACACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCGGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTGTGGGCCGGCCTgcgc < 6:104358/149‑1 (MQ=255) tCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTGTGGGCCGGCCTGCGCCTGGgcgc > 7:48228/1‑148 (MQ=255) cGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTGTGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCa < 7:6/149‑1 (MQ=255) tCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTGTGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAg > 6:337737/1‑148 (MQ=255) aTGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTGTGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCAc > 2:289858/1‑149 (MQ=255) aTGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTGTGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCAc < 6:356191/149‑1 (MQ=255) tGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACATCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTGTGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCAc > 1:247191/1‑148 (MQ=255) cGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTGTGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCACCAAc < 3:365384/149‑1 (MQ=255) | CCTTGTATGGCGTATTCGGTGGCCCGCACGAGCTGGAAGTCTGGCTGCTGCAGAACCAGACCGCCCTCGCCGCCCTGCACACCCCACTGCAGGAAGGCCCATGGCGCACCCTGCTGCTGGTGTTCTTCGCCTCGGCCATCGTCATGCCGCACATGTACCACATGGCCTTTACCGAGAACCTCAACCCGCGCTCGCTGGTCAGCGCCAGCTGGGGCCTGCCGCTGTTCCTGCTGCTGATGAGCCTTGCCGTGCCGCTGGTGCTGTGGGCCGGCCTGCGCCTGGGCGCCAGCACCAAC > NC_002947/5334190‑5334485 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |