| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,338,050 | C→G | 11.8% | intergenic (+57/‑227) | PP_4696 → / → PP_mr53 | nitrogen regulation protein NR(I)/CrcZ ncRNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,338,050 | 0 | C | G | 11.8% | 217.5 / 18.3 | 76 | intergenic (+57/‑227) | PP_4696/PP_mr53 | nitrogen regulation protein NR(I)/CrcZ ncRNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (30/37); new base G (3/6); total (33/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.24e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.46e-01 | |||||||||||
ACGCAAGCTCGGCGTAAGCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTACGGTAACGAAATTGCGACATTT > NC_002947/5337903‑5338190 | aCGCAAGCTCGGCGTAAGCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGccgccc > 7:154036/1‑149 (MQ=255)aCGCAAGCTCGGCGTAAGCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGccgccc > 7:29150/1‑149 (MQ=255)aCGCAAGCTCGGCGTAAGCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGccgccc > 7:23609/1‑149 (MQ=255) gCAAGCTCGGCGTAAGCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGccgcccgc < 1:294979/149‑1 (MQ=255) aaGCTCGGCGTAAGCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCcgcgc > 1:40769/1‑149 (MQ=255) gCTCGGCGTAAGCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCgcgg > 5:171614/1‑149 (MQ=255) ggCGTAAGCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCt < 1:366633/149‑1 (MQ=255) cGTAAGCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCg < 8:53031/149‑1 (MQ=255) tAAGCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGc < 2:243117/149‑1 (MQ=255) aaGCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGcc > 6:229790/1‑149 (MQ=255) aGCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGGCCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGGTCt < 7:267765/149‑1 (MQ=255) gCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCt > 3:311299/1‑148 (MQ=255) ccGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGGCCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGGTCTca < 3:36960/149‑1 (MQ=255) ccGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCgcgg > 5:296219/1‑137 (MQ=255) ccGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCgcgg < 6:296219/137‑1 (MQ=255) ccGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTca < 4:209338/149‑1 (MQ=255) cGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGCATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGGCCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGGTCTcac < 1:43360/149‑1 (MQ=39) tcAAGTGCCTGTGGGTACGCCGCCAGCGGCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATATCCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTGGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCgcggc < 2:261166/135‑1 (MQ=255) gCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCCGTGAGCCCGAGCGCCGCCCGCgcggc > 1:261166/1‑136 (MQ=255) gCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCt < 8:29150/149‑1 (MQ=255) ccTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCt < 8:23609/148‑1 (MQ=255) ccTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCt > 4:235533/1‑148 (MQ=255) gtgGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGg‑cg < 8:174090/143‑1 (MQ=255) gtgGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGg‑cg > 7:174090/1‑143 (MQ=255) ggAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACgt < 5:229790/148‑1 (MQ=255) ggAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACgt < 8:154036/148‑1 (MQ=255) aaCGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTAGCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGCCCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCCCAGG‑CGCTGAACGTGTc > 1:268138/1‑149 (MQ=255) aCGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCa < 4:311299/149‑1 (MQ=255) gccgccAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCac > 8:35459/1‑148 (MQ=255) ccgccAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCacga > 1:233021/1‑149 (MQ=255) cgccAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTc > 8:189194/1‑144 (MQ=255) cgccAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTc < 7:189194/144‑1 (MQ=255) cgccAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCacgac < 8:291425/149‑1 (MQ=255) gccAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACGGG‑CGCTGAACGTGTCacgac > 7:362153/1‑148 (MQ=255) cAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCACGACGaa < 2:40769/149‑1 (MQ=255) gcCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCt > 7:63350/1‑112 (MQ=255) gcCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCt < 8:63350/112‑1 (MQ=255) tGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCACGACGAACAccc > 5:45617/1‑147 (MQ=255) gggCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCt > 7:87686/1‑124 (MQ=255) gggCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCt < 8:87686/124‑1 (MQ=255) ggCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAgg > 1:225416/1‑149 (MQ=255) gCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACGGG‑CGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGt < 8:362153/149‑1 (MQ=255) gCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGt < 7:35459/149‑1 (MQ=255) cATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGGCCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGGTCTcac > 6:205684/1‑114 (MQ=38) cATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGGCCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGGTCTcac < 5:205684/114‑1 (MQ=38) cATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGt > 8:71335/1‑148 (MQ=255) aTCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTaa < 6:171614/149‑1 (MQ=255) ccACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAacac < 5:34401/149‑1 (MQ=255) ccACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAacac < 7:1389/149‑1 (MQ=255) ccACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAacac < 3:235533/149‑1 (MQ=255) cACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGATACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGGCCGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAacac < 1:253048/149‑1 (MQ=255) aCGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTaa < 3:26057/144‑1 (MQ=255) aCGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGAGTCACGCCGAACCCCCCAGGTAacaga > 4:26057/1‑146 (MQ=255) aaGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTTAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTAGGCCTAAAATG‑CGCTGAACGTGGCACGCAGAACACCCCAGGGAAAAACTCAACTcc > 2:309710/1‑149 (MQ=255) aaGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTcc > 2:25659/1‑149 (MQ=255) gagCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTGACACCTCACCTCCCg > 8:79716/1‑149 (MQ=255) gagCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAAcacctc < 6:316811/141‑1 (MQ=255) gagCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAAcacctc > 5:316811/1‑141 (MQ=255) gagCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGAGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACACG‑CGCAGAACGTCTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTccc > 6:22922/1‑148 (MQ=255) aaCGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTaaa < 1:148567/149‑1 (MQ=255) aTAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCaa < 3:239552/149‑1 (MQ=255) cgcaccgcacGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTGACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTccgcc < 7:79716/147‑1 (MQ=255) cgcaccgcacGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGt < 6:45617/149‑1 (MQ=255) gcaccgcacGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTa < 2:225416/149‑1 (MQ=255) cgcacGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAg > 6:23544/1‑149 (MQ=255) gcacGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGt < 7:71335/149‑1 (MQ=255) cacGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTc > 1:27279/1‑149 (MQ=255) gcgctaGCCTAGGCGGCGGCGGGGAGCCCGCGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGGGTCACGACGCACCCCCCCGCTAACACCTCACCTCCCGTAAAACTCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGGAACAGTcccc < 8:342674/144‑1 (MQ=37) gccgcAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTcccc < 2:268138/149‑1 (MQ=255) ccgcAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCg < 5:23544/149‑1 (MQ=255) cgcAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTaaa > 8:149750/1‑111 (MQ=255) cgcAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTaaa < 7:149750/111‑1 (MQ=255) cgcAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGa < 2:233021/149‑1 (MQ=255) gCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGGAACACTCCCCGAgctc > 7:342674/1‑146 (MQ=255) gcggcgTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTACgg > 7:31151/1‑148 (MQ=255) aCCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTACGGTAACGAAATTGCGa > 4:202105/1‑148 (MQ=255) cGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTACGGTAACGAAATTGCGACAt > 3:201910/1‑149 (MQ=255) gAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTACGGTAAc < 5:314600/135‑1 (MQ=255) gAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTACGGTAAc > 6:314600/1‑135 (MQ=255) aGCGCAGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGACACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTACGGTAACGAAATTGCTACAttt < 1:309710/149‑1 (MQ=255) | ACGCAAGCTCGGCGTAAGCCGCAAGTGCCTGTGGGAACGCCGCCAGCGCCTGGGCATCCCACGGCGCAAGAGCAACGCTACCAGCGAATAACCCACCTACGCACCGCACGCCGCAGCCTATGCGGCGTCGGTGAGACCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGGCCTCACAGG‑CGCTGAACGTGTCACGACGAACACCCCAGGTAACACCTCACCTCCCGTAAAAATCTGTTACCCAAGCTTTCCGCCGTAACAGTCCCCGAGGCGTACGGTAACGAAATTGCGACATTT > NC_002947/5337903‑5338190 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |