| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 462,592 | A→T | 8.3% | intergenic (‑128/+13) | pqqF ← / ← davA | coenzyme PQQ synthesis protein F/5‑aminopentanamidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 462,592 | 0 | A | T | 8.3% | 231.4 / 8.3 | 80 | intergenic (‑128/+13) | pqqF/davA | coenzyme PQQ synthesis protein F/5‑aminopentanamidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/40); new base T (4/3); total (37/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.98e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
TTGGCGGATGGCGTCAGGCATGGGGGCTCCGGTGGCTGCTCTCCATGCTAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAG > NC_002947/462444‑462737 | ttGGCGGATGGCGTCAGGCATGGGGGCTCCGGTGGCTGCTCTCCATGCTAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCa > 3:367600/1‑149 (MQ=255) ggCGGATGGCGTCAGGCATGGGGGCTCCGGTGGCTGCTCTCCATGCTAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCa > 7:8650/1‑147 (MQ=255) gCGGATGGCGTCAGGCATGGGGGCTCCGGTGGCTGCTCTCCATGCTAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAg > 7:350625/1‑149 (MQ=255) gCGGATGGCGTCAGGCATGGGGGCTCCGGTGGCTGCTCTCCATGCTAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAg > 6:149090/1‑149 (MQ=255) gCGTCAGGCATGGGGGCTCCGGTGGCTGCTCTCCATGCTAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTAGGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGccc < 8:205634/148‑1 (MQ=255) tCAGGCATGGGGGCTCCGGTGGCTGCTCTCCATGCTAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCTATGCGGcccattc < 7:97556/149‑5 (MQ=255) aGGCATGGGGGCTCCGGTGGCTGCTCTCCATGCTAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGGCCGCTATGCGGcccattcgc < 5:377816/149‑7 (MQ=255) ggggCTCCGGTGGCTGCTCTCCATGCTAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTa < 6:348625/149‑1 (MQ=255) cGGTGTCTGCTCTCCATGCTTACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGGCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGGATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAg < 5:288631/147‑1 (MQ=255) cGGTGGCTGCTCTCCATGCTAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAg < 8:8650/147‑1 (MQ=255) cGGTGGCTGCTCTCCATGCTAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGt > 3:198236/1‑149 (MQ=255) cGGTGGCTGCTCTCCATGCTAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGt > 2:112985/1‑149 (MQ=255) gTGGCTGCTCTCCATGCTAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTg > 4:184975/1‑148 (MQ=255) tcCATGCTAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTg < 3:139506/147‑1 (MQ=255) tcCATGCTAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTg < 5:548/147‑1 (MQ=255) tcCATGCTAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGgc > 6:268531/1‑149 (MQ=255) ccATGCTAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGgcg > 2:124039/1‑149 (MQ=255) cATGCTAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTgg < 4:367600/146‑1 (MQ=255) cATGCTAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGgcg > 6:390499/1‑148 (MQ=255) gCTAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTc > 5:188519/1‑139 (MQ=255) gCTAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTc < 6:188519/139‑1 (MQ=255) tAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATc > 1:118724/1‑149 (MQ=255) aaCCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑g > 6:309540/1‑149 (MQ=255) aaCCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑g > 2:277891/1‑149 (MQ=255) aaCCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑g > 8:303559/1‑149 (MQ=255) aCCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGc > 3:169235/1‑130 (MQ=255) aCCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGc < 4:169235/130‑1 (MQ=255) aCCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑g < 7:154427/148‑1 (MQ=255) aCCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑g < 3:6947/148‑1 (MQ=255) ccGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGTGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGt < 8:350625/149‑1 (MQ=255) cGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGt > 4:85966/1‑148 (MQ=255) gATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTg < 3:234249/126‑1 (MQ=255) gATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTg > 4:234249/1‑126 (MQ=255) gtttgCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTa < 4:128358/113‑1 (MQ=255) gtttgCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTa > 3:128358/1‑113 (MQ=255) tgCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑ggg > 3:310473/1‑148 (MQ=255) gCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGa > 7:35917/1‑148 (MQ=255) gCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGa > 3:279270/1‑148 (MQ=255) cccGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGcc > 2:280700/1‑149 (MQ=255) cccGCCCTTTTCGCCTGTATGCCGCCGCTATCAAAGCCACCGCAAATCCCGTGGGAGCGCGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGcc < 4:310473/149‑1 (MQ=255) ccGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAATTCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGccc < 1:176136/149‑1 (MQ=255) ccGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGccc > 7:363242/1‑149 (MQ=255) cGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGCCCt < 1:124039/149‑1 (MQ=255) ggCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGCCCTg < 4:134704/149‑1 (MQ=255) cTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGCCCTgcgc < 1:343129/149‑1 (MQ=255) ttttCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGCCCTGCGcc > 3:3151/1‑149 (MQ=255) tCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGCCCTGCGcccc < 3:85966/148‑1 (MQ=255) cgcgGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGCCCTGCGCCCCt < 5:149090/148‑1 (MQ=255) gcgGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGCCCTGCGCCCCTg < 8:35917/148‑1 (MQ=255) gggTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGCCCTGCGCCCCTGcac < 4:279270/149‑1 (MQ=255) gggTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGCCCTGCGCCCCTGcac > 5:389407/1‑149 (MQ=255) tATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGCCCTGCGCCCCTGcaccac > 6:117525/1‑149 (MQ=255) tGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAACCGCCCTGCGCCCCTGCACCAccc > 6:266405/1‑149 (MQ=255) gcgcCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCg > 8:233696/1‑148 (MQ=255) gcCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCt < 6:303753/148‑1 (MQ=255) gcCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCt > 5:303753/1‑148 (MQ=255) gcCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTc < 5:268531/149‑1 (MQ=255) tATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGTGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCt < 4:198236/149‑1 (MQ=255) tATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTAc < 3:42101/77‑1 (MQ=255) tATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTAc > 4:42101/1‑77 (MQ=255) tGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGTGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGaa < 3:304442/114‑1 (MQ=255) tGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGTGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGaa > 4:304442/1‑114 (MQ=255) tGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTc < 2:81602/148‑1 (MQ=255) taaGGCATCGCAAATCCCGTGGGATCGGGCGTGCCCGCGTATTGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCATGTGCATCTCCTTGCGGAAATCTGGTCAGGTA‑‑GGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCg < 1:280700/147‑1 (MQ=255) aaaGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCCCCCGCTCATGCTCGAg > 6:206397/1‑149 (MQ=255) cAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTg > 1:114653/1‑149 (MQ=255) aGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGc < 1:277891/149‑1 (MQ=255) gcAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCcaa < 8:363242/149‑1 (MQ=255) cAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCcaac < 5:117525/149‑1 (MQ=255) tCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACt < 3:184975/149‑1 (MQ=255) ccGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTgg < 2:118724/149‑1 (MQ=255) ggAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTc < 6:389407/149‑1 (MQ=255) gCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCATGTATTCGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCa < 1:112985/149‑1 (MQ=255) gCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATc < 5:390499/149‑1 (MQ=255) gggCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATccc < 4:3151/149‑1 (MQ=255) gTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGctct < 2:371806/123‑1 (MQ=255) gcgAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCAt > 1:261100/1‑149 (MQ=255) caggggCCGCTATGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGc > 7:296911/4‑149 (MQ=255) gggCCGCTATGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGTCCGGCCATg > 7:183566/1‑144 (MQ=255) gggCCGCTATGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGTCCGGCCATg < 8:183566/144‑1 (MQ=255) gggCCGCTATGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAg > 5:307564/1‑149 (MQ=255) gggCCGCTATGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAg > 5:302364/1‑149 (MQ=255) aTAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAg > 2:368488/1‑146 (MQ=255) aTAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAg < 1:368488/146‑1 (MQ=255) | TTGGCGGATGGCGTCAGGCATGGGGGCTCCGGTGGCTGCTCTCCATGCTAACCGATTTGTTTGCAGGCCCGGCCTTTTCGCGGGTATGGCGCCGGTATGAAAGGCAGCGCAAATCCCGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGCATAGCGGCCCCTGTCAGCCTTTACGCAGGTGCAGCTCCTGGCGCAAATC‑GGTCAGGTA‑‑GGGAAACGCCCTGCGCCCCTGCACCACCCGCTCATGCTCGAGCTCTGCCAACAACTGGCACTCATCCCGCCCGGCCATGGCCAGCAAG > NC_002947/462444‑462737 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |