| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,821,897 | T→A | 9.6% | L173Q (CTG→CAG) | metW → | methionine biosynthesis protein MetW |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,821,897 | 0 | T | A | 9.6% | 196.4 / 9.3 | 73 | L173Q (CTG→CAG) | metW | methionine biosynthesis protein MetW |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (36/30); new base A (4/3); total (40/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 | |||||||||||
GCTGGTACCTGGCGACCAAAGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTT‑CTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTCGCGGTCTGACGCCCACCGGAGGAATCGCACCATGC > NC_002947/5821753‑5822044 | gCTGGTACCTGGCGACCAAAGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTT‑CTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCg > 3:273941/1‑149 (MQ=255) gTACCTGGCGACCAAAGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTT‑CTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGt < 4:261824/147‑1 (MQ=255) tACCTGGCGACCAAAGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTT‑CTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCAGGCGGTCGa < 6:221809/149‑1 (MQ=255) ccTGGCGACCAAAGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTT‑CTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGAc < 3:75806/148‑1 (MQ=255) tGGCGACCAAAGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTT‑CTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑c > 8:218438/1‑149 (MQ=255) gCGACCAACGGCCTCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTTGTACAACACGCCGAACATCCACTT‑CTGCACCTTCGCCTACTTCGAACAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑Ctt < 8:194783/149‑1 (MQ=255) gCGACCAAAGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTT‑CTGCACCTTCGCCGACTTCCAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑c < 2:175712/147‑1 (MQ=255) gACCAAAGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTT‑CTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTg > 7:268950/1‑148 (MQ=255) cAAAGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCAGTTACTGCACCTTCCCCGAATTCGAAGAACTTGTGCACCAACGCCGGGCCAAGGTACAAGAACCCCTGGCCGTCGACCA‑CATGccc > 1:302896/1‑147 (MQ=255) aTGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTT‑CTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACgggtg < 7:218438/149‑1 (MQ=255) ggACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTT‑CTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGc > 6:231111/1‑149 (MQ=255) gACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTT‑CTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCt < 8:242419/149‑1 (MQ=255) tGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTT‑CTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGcc > 7:261940/1‑148 (MQ=255) gCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTT‑CTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAAGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCt > 4:238465/1‑148 (MQ=255) aCCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTT‑CTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCAGGCGGTCGa < 4:28112/101‑1 (MQ=255) aCCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTT‑CTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCAGGCGGTCGa > 3:28112/1‑101 (MQ=255) cTGGTACAACACGCCGAACATCCACTT‑CTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATAGCCTAATCTTCTAg < 8:218987/149‑1 (MQ=255) gTACAACACGCCGAACATCCACTT‑CTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAAtcttc > 1:151728/1‑143 (MQ=255) aacaCGCCGAACATCCACTT‑CTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGt > 1:293005/1‑144 (MQ=255) acccGCCGAACATCCACTT‑CTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATc < 8:268950/146‑1 (MQ=255) acacGCCGAACATCCACTT‑CTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGAACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGt > 3:98072/1‑143 (MQ=255) gCCGAACATCCACTT‑CTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCa < 5:231111/149‑1 (MQ=255) ccGAACATCCACTT‑CTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCAt < 3:366401/149‑1 (MQ=255) gAACATCCACTT‑CTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAgg > 8:37745/1‑135 (MQ=255) gAACATCCACTT‑CTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAgg < 7:37745/135‑1 (MQ=255) aTCCACTT‑CTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCt > 6:389094/1‑145 (MQ=255) aTCCACTT‑CTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCt < 5:389094/145‑1 (MQ=255) aTCCACTT‑CTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACcg > 3:179345/1‑149 (MQ=255) aTCCACTT‑CTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAAGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACcg < 3:238465/149‑1 (MQ=255) aCTT‑CTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTa < 8:104620/125‑1 (MQ=255) aCTT‑CTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTa > 7:104620/1‑125 (MQ=255) aCTT‑CTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGt < 3:193285/128‑1 (MQ=255) aCTT‑CTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGt > 4:193285/1‑128 (MQ=255) tt‑CTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTcag > 6:100846/1‑149 (MQ=255) gCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTga < 2:232657/124‑1 (MQ=255) gCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACAAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTga > 1:232657/1‑124 (MQ=255) cACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGTCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGGGTcagca < 2:302896/146‑1 (MQ=255) ccTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCg < 8:96245/149‑1 (MQ=255) cTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGc < 2:215900/74‑1 (MQ=255) cTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCgg < 4:273941/149‑1 (MQ=255) cTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACAAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGc > 1:215900/1‑74 (MQ=255) gCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCt < 2:293005/149‑1 (MQ=255) gACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGc > 5:203092/1‑148 (MQ=255) ttCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGAGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTa < 4:95543/105‑1 (MQ=255) ttCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGAGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTa > 3:95543/1‑105 (MQ=255) gaagaaCTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGc > 2:266518/1‑114 (MQ=255) gaagaaCTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGc < 1:266518/114‑1 (MQ=255) gaagaaCTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCa > 5:1365/1‑149 (MQ=255) gaaCTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCa < 8:261940/149‑1 (MQ=255) aCTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGc < 3:17257/149‑1 (MQ=255) gtgCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTcgc > 1:14061/1‑149 (MQ=255) cACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTCGCGGt > 1:200168/1‑149 (MQ=255) gAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTCGCGGTCt > 5:200958/1‑148 (MQ=255) aaCGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTCGCGGTCTGa > 7:227125/1‑149 (MQ=255) gCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTCGCGGTCTGACGc > 8:207500/1‑149 (MQ=255) gCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGCGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGCTCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTCGCGGTCTGACGc > 5:128962/1‑149 (MQ=255) ggCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTCGCGGTCTGACGCCCAc > 2:309245/1‑149 (MQ=255) aGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTCGCGGTCTGACGCCCACCggag > 2:301161/1‑149 (MQ=255) ggTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCC‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGGCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCAGGGCCTGCAAGAGGATCAGCTCGCGGTCTTACGCCCACCggagg > 5:164416/1‑149 (MQ=255) ggTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTCGCGGTCTGACGCCCACCggag > 7:25677/1‑148 (MQ=255) tggtCGACCGCCAGGCGGTCGAGTACCTTGGCCCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTCGCGGTCTGACGCCCACCggagg > 4:120017/4‑148 (MQ=38) aCTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTCGCGGTCTGACGCCCACCGGAGGAAt > 4:127189/1‑149 (MQ=255) gtCGACCGCCAGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTAACGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCAGGAGCTAGCGGTATGACGCCCACCGGAGGGAtg > 8:241362/2‑148 (MQ=255) cTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTCGCGGTCTGACGCCCACCGGAGGAATc < 4:179345/149‑1 (MQ=255) tCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTc > 2:326892/1‑122 (MQ=255) tCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTc < 1:326892/122‑1 (MQ=255) tCGACCGCCAGGTGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTCGCGGTCTGACGCCCACCGGAGGAATCg > 4:138783/1‑149 (MQ=255) gACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTCGCGGTCTGACGCCCACCGGAGGAATCGCa > 8:258170/1‑149 (MQ=255) gACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTCGCGGTCTGACGCCCACCGGAGGAATCGCa < 2:14061/149‑1 (MQ=255) gACCGCCAGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGGGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTCGCGGTATGACGCCCACCGGAGGAATCGc < 7:241362/148‑1 (MQ=255) ccGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTCGCGGTCTGACGCCCACCGGAGGAATCGCAcc < 6:1365/149‑1 (MQ=255) ccTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTCGCGGTCTGACGCCCACCGGAGGAATCGCACCATg > 4:163985/1‑149 (MQ=255) cTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTCGCGGTCTGACGCCCACCGGGGGAATCGCACCATGc < 6:203092/149‑1 (MQ=255) | GCTGGTACCTGGCGACCAAAGGCCGCATGCCGGTATCGGACTTCATGCCGTATACCTGGTACAACACGCCGAACATCCACTT‑CTGCACCTTCGCCGACTTCGAAGAACTTGTGCACGAACGCCGGGCCAAGGTACTCGACCGCCTGGCGGTCGACCA‑CTTGCACCGCAACGGGTGGGGTGGCCGGCTATGGCCTAATCTTCTAGGTGAGATCGGCATCTACCGCGTCAGCAGTCCGGGCCTGCAAGAGCATCAGCTCGCGGTCTGACGCCCACCGGAGGAATCGCACCATGC > NC_002947/5821753‑5822044 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |