Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,882,916 | A→G | 7.5% | L93P (CTG→CCG) | PP_5156 ← | hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,882,916 | 0 | A | G | 7.5% | 189.3 / 3.8 | 66 | L93P (CTG→CCG) | PP_5156 | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (38/23); new base G (3/2); total (41/25) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
ATGATACTGGTCACCCAGAATCAGTTGCAGGGTGTGCTTGCCCGGGGTCAGGGTAATGCTGGTTTCGGTCTGTGCCTTGCCGAAGTGCAGCACTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCGGGGTTTGGTCACCCGCAGGTTTGAGGCCCATACCCTCGATACCGAACTTGACGGTGAAGGTCTTGTCGACCGTGGCACCATCGGC > NC_002947/5882771‑5883064 | aTGATACTGGTCACCCAGAATCAGTTGCAGGGTGTGCTTGCCCGGGGTCAGGGTAATGCTGGTTTCGGTCTGTGCCTTGCCGAAGTGCAGCACTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCg > 4:107098/1‑149 (MQ=255) tGGTCACCCAGAATCAGTTGCAGGGTGTGCTTGCCCGGGGTCAGGGTAATGCTGGTTTCGGTCTGTGCCTTGCCGAAGTGCAGCACTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTc > 3:199794/1‑149 (MQ=255) tCACCCAGAATCAGTTGCAGGGTGTGCTTGCCCGGGGTCAGGGTAATGCTGGTTTCGGTCTGTGCCTTGCCGAAGTGCAGCACTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGc > 5:140230/1‑149 (MQ=255) aCCCAGAATCAGTTGCAGGGTGTGCTTGCCCGGGGTCAGGGTAATGCTGGTTTCGGTCTGTGCCTTGCCGAAGTGCAGCACTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCa > 1:164474/1‑149 (MQ=255) cccAGAATCAGTTGCAGGGTGTGCTTGCCCGGGGTCAGGGTAATGCTGGTTTCGGTCTGTGCCTTGCCGAAGTGCAGCACTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCAc < 2:63115/149‑1 (MQ=255) cccAGAATCAGTTGCAGGGTGTGCTTGCCCGGGGTCAGGGTAATGCTGGTTTCGGTCTGTGCCTTGCCGAAGTGCAGCACTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCAc > 1:63115/1‑149 (MQ=255) ccAGAATCAGTTGCAGGGTGTGCTTGCCCGGGGTCAGGGTAATGCTGGTTTCGGTCTGTGCCTTGCCGAAGTGCAGCACTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCAcc > 3:141628/1‑149 (MQ=255) tCAGTTGCAGGGTGTGCTTGCCCGGGGTCAGGGTAATGCTGGTTTCGGTCTGTGCCTTGCCGAAGTGCAGCACTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGctct > 1:251348/1‑149 (MQ=255) gTTGCAGGGTGTGCTTGCCCGGGGTCAGGGTAATGCTGGTTTCGGTCTGTGCCTTGCCGAAGTGCAGCACTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGACATGTCAGCCACCGGCTCTTTg > 1:282348/1‑149 (MQ=255) gCAGGGTGTGCTTGCCCGGGGTCAGGGTAATGCTGGTTTCGGTCTGTGCCTTGCCGAAGTGCAGCACTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTc > 4:143098/1‑148 (MQ=255) ggTGTGCTTGCCCGGGGTCAGGGTAATGCTGGTTTCGGTCTGTGCCTTGCCGAAGTGCAGCACTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACAt > 5:33121/1‑149 (MQ=255) tgCTTGCCCGGGGTCAGGGTAATGCTGGTTTCGGTCTGTGCCTTGCCGAAGTGCAGCACTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGACATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATccac < 2:282348/149‑1 (MQ=255) cccGGGGTCAGGGTAATGCTGGTTTCGGTCTGTGCCTTGCCGAAGTGCAGCACTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGt > 4:259674/1‑133 (MQ=255) cccGGGGTCAGGGTAATGCTGGTTTCGGTCTGTGCCTTGCCGAAGTGCAGCACTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGt < 3:259674/133‑1 (MQ=255) ccGGGGTCAGGGTAATGCTGGTTTCGGTCTGTGCCTTGCCGAAGTGCAGCACTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACcag > 7:260339/1‑145 (MQ=255) gggTAATGCTGGTTTCGGTCTGTGCCTTGCCGAAGTGCAGCACTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGc > 4:101769/1‑149 (MQ=255) ggTAATGCTGGTTTCGGTCTGTGCCTTGCCGAAGTGCAGCACTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGcc > 5:107650/1‑149 (MQ=255) tAATGCGGGTTTCGGTCTGGGCCTTGCCGAAGGGCAGCACTTGCGGGCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCATCGGCATGTCACCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCg < 6:107650/149‑1 (MQ=255) tGCTGGTTTCGGTCTGTGCCTTGCCGAAGTGCAGCACTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGgtg > 4:166221/1‑149 (MQ=255) ggttCGGGGTGTGCCTTGCCGAAGTGCAGCCCGTGCGGTCCCTTGGGCAGT‑GGGACGCCGGCCTCTGGGATCAGGCTGGTGGGCGGCGGCAGGTCAGCCCCCGGGGCTTTGTCGACATCCACCCGCAGATGGTGGTGCCCGGGGTGCgg > 6:211495/3‑149 (MQ=255) gTTTCGGTCTGTGCCTTGCCGAAGTGCAGCACTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGc < 6:226087/147‑1 (MQ=255) gTTTCGGTCTGTGCCTTGCCGAAGTGCAGCACTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGc > 5:226087/1‑147 (MQ=255) gTTTCGGTCTGTGCCTTGCCGAAGTGCAGCACTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCgg > 1:102966/1‑149 (MQ=255) ttCGGTCTGTGCCTTGCCGAAGTGCAGCACTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCGGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCgggg > 3:100347/1‑149 (MQ=255) ttCGGTCTGTGCCTTGCCGAAGTGCAGCACTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCGGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCgggg > 3:94958/1‑149 (MQ=255) ttCGGTCTGTGCCTTGCCGAAGTGCAGCACTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCgggg > 8:267438/1‑149 (MQ=255) ggTCTGTGCCTTGCCGAAGTGCAGCACTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCGGGGtt < 6:33121/148‑1 (MQ=255) gTCTGTGCCTTGCCGAACTGCAGCACTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGCTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGAGTGCGGGGTTTg > 2:98113/1‑149 (MQ=255) tCTGTGCCTTGCCGAAGTGCAGCACTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCGGGGTTTgg > 2:253546/1‑149 (MQ=255) ttGCCGAAGTGCAGCACTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCGGGGTTTGGTCACCCg > 4:143942/1‑148 (MQ=255) cGAAGTGCAGCACTTGCGGTCCCTTCGGCAGTAGCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCAc > 1:46023/1‑83 (MQ=255) cGAAGTGCAGCACTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCAc < 2:46023/82‑1 (MQ=255) cGAAGTGCAGCACTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGAc > 4:15129/1‑97 (MQ=255) tGCAGCACTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCGGGGTTTGGTCACCCGCAGGTTTGAg < 3:143098/149‑1 (MQ=255) agcaCTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCGGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCGGGGTTTGGTCACCCGCAGGTTTGAGGcc < 4:94958/149‑1 (MQ=255) agcaCTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCGGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCGGGGTTTGGTCACCCGCAGGTTTGAGGcc < 4:100347/149‑1 (MQ=255) gcaCTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCGGGGTTTGGTCACCCGCAGGTTTGAGGcc > 3:122045/1‑148 (MQ=255) caCTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGGATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCGGGGTTTGGTCACCCGCAGGTTTGAGGCCCa < 4:141628/149‑1 (MQ=255) caCTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCGGGGTTTGGTCACCCGCAGGTTTGAGGCCCa > 5:375162/1‑149 (MQ=255) aCTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCGGGGTTTGGTCACCCGCAGGTTTGAGGCCCAt < 5:346683/149‑1 (MQ=255) cTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCGGGGTTTGGTCACCCGCAGGTTTGAGGCCCATa > 3:184855/1‑149 (MQ=255) gCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTATGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCGGGGTTTGGTCACCCGCAGGTTTGAGGCCCATAccc > 8:39947/1‑149 (MQ=255) cGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCGGGGTTTGGTCACCCGCAGGTTTGAGGCCCATACCCt < 2:251348/149‑1 (MQ=255) tCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTc > 8:109577/1‑75 (MQ=255) tCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTc < 7:109577/75‑1 (MQ=255) tCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACcag > 7:42061/1‑87 (MQ=255) tCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACcag < 8:42061/87‑1 (MQ=255) ccTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCGGGGTTTGGTCACCCGCAGGTTTGAGGCCCATACCCTCGATa < 4:199794/149‑1 (MQ=255) ccTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCGGGGTTTGGTCACCCGCAGGTTCGAGGCCCATACCCTCGATa > 1:17888/1‑149 (MQ=255) ttCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCGGGGTTTGGTCACCCGCAGGTTTGAGGCCCATACCCt > 1:272602/1‑142 (MQ=255) ttCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCGGGGTTTGGTCACCCGCAGGTTTGAGGCCCATACCCt < 2:272602/142‑1 (MQ=255) aGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCGGGGTTTGGTCACCCGCAGGTTTGAGGCCCATACCCTCGATACCGAACtt > 3:341882/1‑149 (MQ=255) t‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCGGGGTTTGGTCACCCGCAGGTTTGAGGCCCATACCCTCGATACCGAACTTGa > 5:176878/1‑149 (MQ=255) gCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCGGGGTTTGGTCACCCGCAGGTTTGAGGCCCATACCCTCGATACCGAACTTGAc > 5:119394/1‑149 (MQ=255) cGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCTGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCGGGGTTTGGTCACCCGCAGGTTTGAGGCCCATACCCTCGATACCGAACTTGACg < 8:260339/149‑1 (MQ=255) cGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCGGGGTTTGGTCACCCGCAGGTTTGAGGCCCATACCCTCGATACCGAACTTGACg < 1:253546/149‑1 (MQ=255) gACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCGGGGTTTGGTCACCCGCAGGTTTGAGGCCCATACCCTCGATACCGAACTTGACgg < 3:101769/149‑1 (MQ=255) cGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCGGGGTTTGGTCACCCGCAGGTTTGAGGCCCATACCCTCGATACCGAACTTGACGGTGAAg < 6:140230/149‑1 (MQ=255) tGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCGGGGTTTGGTCACCCGCAGGTTTGAGGCCCATACCCTCGATACCGAACTTGACGGTGAAGGTCTTGt > 8:176766/1‑149 (MQ=255) gCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCGGGGTTTGGTCACCCGCAGGTTTGAGGCCCATACCCTCGATACCGAACTTGACGGTGAAGGTCTTGTc < 2:102966/148‑1 (MQ=255) cATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCGGGGTTTGGTCACCCGCAGGTTTGAGGCCCATACACTCGATACCGAACTTGACGGTGAAGGTCTTGTCGa > 1:360546/1‑149 (MQ=255) aGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCGGGGTTTGGTCACCCGCAGGTTTGAGGCCCATACCCTCGATACCGAACTTGACGGTGAAGGTCTTGTCGACCGt < 4:122045/149‑1 (MQ=255) gCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCGGGGTTTGGTCACCCGCAGGTTTGAGGCCCATACCCTCGATACCGAACTTGACGGTGAAGGTCTTGTCGACCGTgg < 2:164474/149‑1 (MQ=255) tGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCGGGGTTTGGTCACCCGCAGGTTTGAGGCCCATACCCTCGATACCGAACTTGAc > 7:129175/1‑124 (MQ=255) tGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCGGGGTTTGGTCACCCGCAGGTTTGAGGCCCATACCCTCGATACCGAACTTGAc < 8:129175/124‑1 (MQ=255) cGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCGGGGTTTGGTCACCCGCAGGTTTGAGGCCCATACCCTCGATACCGAACTTGACGGTGAAGGTCTTGTCGACCGTGGCACCAt > 1:223256/1‑149 (MQ=255) aGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCGGGGTTTGGTCACCCGCAGGTTTGAGGCCCATACCCTCGATACCGAACTTGACGGTGAAGGTCTTGTCGACCGTGGCACCATcggc > 1:57112/1‑149 (MQ=255) | ATGATACTGGTCACCCAGAATCAGTTGCAGGGTGTGCTTGCCCGGGGTCAGGGTAATGCTGGTTTCGGTCTGTGCCTTGCCGAAGTGCAGCACTTGCGGTCCCTTCGGCAGT‑GCGACGCCGGCCTCTGGCATCAGGCTGGTCGGCAGCGGCATGTCAGCCACCGGCTCTTTGTCGACATCCACCAGCAGATGGTGGTGCCCGGTGTGCGGGGTTTGGTCACCCGCAGGTTTGAGGCCCATACCCTCGATACCGAACTTGACGGTGAAGGTCTTGTCGACCGTGGCACCATCGGC > NC_002947/5882771‑5883064 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |