Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,950,783 | T→C | 8.7% | R500R (CGT→CGC) N725S (AAC→AGC) |
ppx → ppk ← |
exopolyphosphatase polyphosphate kinase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,950,783 | 0 | T | C | 8.7% | 192.9 / 6.7 | 69 | R500R (CGT→CGC) N725S (AAC→AGC) | ppx ppk | exopolyphosphatase polyphosphate kinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (30/33); new base C (3/3); total (33/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TGCCAACGGTAGAACTGCACGGCGGGGACAACAGCCTGGATGTAGCCTTCCCTGAAGGTTGGCTGCAGCAGAACCAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGCCGGTCGGGGTGCTGCGCACGTAGCGCCCGTCTGGCTGCAAGGTCCAGGCGTGGGTATTGTCGGTCAGGTAGCCTTCCAGCTCCTT > NC_002947/5950638‑5950931 | tGCCAACGGTAGAACTGCACGGCGGGGACAACAGCCTGGATGTAGCCTTCCCTGAAGGTTGGCTGCAGCAGAACCAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGa < 6:208106/149‑1 (MQ=255) ccAACGGTAGAACTGCACGGCGGGGACAACAGCCTGGATGAAGCCTTCCCTGAAGGTTGGCTGCAGCAGAACCAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGTGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAg < 5:325713/148‑1 (MQ=255) cAACGGTAGAACTGCACGGCGTGGACAACAGCCTGGATGTAGCCTTCCCTGAAGGTTGGCTGCAGCAGAACCAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAACGTACGCTGAGGa < 3:184268/149‑1 (MQ=255) aaCGGTAGAACTGCACGGCGGGGACAACAGCCTGGATGTAGCCTTCCCTGAAGGTTGCCTGCAGCAGAACCAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGAc > 5:266528/1‑149 (MQ=255) gTAGAACTGCACGGCGGGTACAACAGCCTGGATGTAGCCTTCCCTGAAGGTTGGCTGCAGCAGAACCAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCTGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCggg < 6:151194/149‑1 (MQ=255) gTAGAACTGCACGGCGGGGACAACAGCCTGGATGTAGCCTTCCCTGAAGGTTGGCTGCAGCAGAACCAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCggg < 3:59091/149‑1 (MQ=255) aaCTGCACGGCGGGGACAACAGCCTGGATGTAGCCTTCCCTGAAGGTTGGCTGCAGCAGAACCAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGc > 2:52622/1‑149 (MQ=255) cTGCACGGCGGGGACAACAGCCTGGATGTAGCCTTCCCTGAAGGTTGGCTGCAGCAGAACCAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTc < 2:189991/149‑1 (MQ=255) ggACAACAGCCTGGATGTAGCCTTCCCTGAAGGTTGGCTGCAGCAGAACCAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAACGTACGCTGAGGAcga < 7:119091/130‑3 (MQ=255) ggACAACAGCCTGGATGTAGCCTTCCCTGAAGGTTGGCTGCAGCAGAACCAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAACGTACGCTGAGGAcga > 8:119091/1‑128 (MQ=255) aacaGCCTGGATGTAGCCTTCCCTGAAGGTTGGCTGCAGCAGAACCAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCggg < 4:195973/128‑1 (MQ=255) aacaGCCTGGATGTAGCCTTCCCTGAAGGTTGGCTGCAGCAGAACCAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCggg > 3:195973/1‑128 (MQ=255) aacaGCCTGGATGTAGCCTTCCCTGAAGGTTGGCTGCAGCAGAACCAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAgg > 5:116351/1‑149 (MQ=255) aacaGCCTGGATGTAGCCTTCCCTGAAGGTTGGCTGCAGCAGAACCAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAgg < 1:217111/149‑1 (MQ=255) aacaGCCTGGATGTAGCCTTCCCTGAAGGTTGGCTGCAGCAGAACCAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAACGTACGCTGAGGAcgaa < 1:262783/127‑4 (MQ=255) aacaGCCTGGATGTAGCCTTCCCTGAAGGTTGGCTGCAGCAGAACCAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAACGTACGCTGAGGAcgaa > 2:262783/1‑124 (MQ=255) caGCCTGGATGTAGCCTTCCCTGAAGGTTGGCTGCAGCAGAACCAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGt > 8:70868/1‑149 (MQ=255) ccTGGATGTAGCCTTCCCTGAAGGTTGGCTGCAGCAGAACCAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGc < 7:70868/149‑1 (MQ=255) cTGGATGTAGCCTTCCCCGAAGGTTGGCTGCAGCAGAACCAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGcc < 1:352665/149‑1 (MQ=255) tAGCCTTCCCTGAAGGTTGGCTGCAGCAGAACCAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGc < 7:167883/149‑1 (MQ=255) cTTCCCTGAAGGTTGGCTGCAGCAGAACCAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGcc < 5:386405/138‑1 (MQ=255) cTTCCCTGAAGGTTGGCTGCAGCAGAACCAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGcc > 6:386405/1‑138 (MQ=255) cTGAAGGTTGGCTGCAGCAGAACCAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGt > 2:77752/1‑149 (MQ=255) cTGAAGGTTGGCTGCAGCAGAACCAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGt > 7:178060/1‑149 (MQ=255) tGAAGGTTGGCTGCAGCAGAACCAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGtt > 2:56134/1‑149 (MQ=255) aaGGTTGGCTGCAGCAGAACCAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCt < 1:199965/149‑1 (MQ=255) gTTGGCTGCAGCAGAACCAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGt > 2:67513/1‑149 (MQ=255) gCTGCAGCAGAACCAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGcc > 5:150953/1‑149 (MQ=255) gCTGCAGCAGAACCAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGc < 1:52622/148‑1 (MQ=255) cagcagAACCAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGCCGGTc > 5:313455/1‑149 (MQ=255) agcagAACCAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGc < 6:206710/117‑1 (MQ=255) agcagAACCAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGc > 5:206710/1‑117 (MQ=255) gcagAACCAGCTGACCAAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACAGGGTTGCTCAGCCGCTCCAGCAGGTTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGCAGCTCgt > 2:159016/1‑148 (MQ=255) cagAACCAGCTGACGCAGGCGGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGCCGGTCggg < 6:266528/149‑1 (MQ=255) cagAACCAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGCCGGTCggg > 7:44639/1‑149 (MQ=255) cagAACCAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCAGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGCCGGTCggg < 8:325302/149‑1 (MQ=255) gAACCAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGCCGGTCGGGGt > 7:32386/1‑149 (MQ=255) ccAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGCCGGTCGGGGtgct > 7:343883/1‑149 (MQ=255) ccAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGCCGGTCGGGGtgct < 2:114834/149‑1 (MQ=255) aGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGCCGGTCGGGGtgctgc > 1:300535/1‑149 (MQ=255) ccAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGCCGGTCGGGGTGCTGCGCACg > 4:264551/1‑147 (MQ=255) ccAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGCCGGTCGGGGTGCTGCGCACg > 8:227469/1‑147 (MQ=255) cGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGCCGGTCGGGGTGCTGCGCACGTAGCGCCCGTCTgg > 3:251577/1‑149 (MQ=255) cGCCAACGAGGCGGAGGGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGCCGGTCGGGGCGCTACGTGCGCAGCAccccgac < 7:339080/147‑5 (MQ=255) cAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGCCGGTCGGGGTGCTGCGCACGTAGCGCCCGTCTGGCTg > 7:330090/1‑149 (MQ=255) aCGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCTCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGCCGGTCGGGGTGCTGCGCACGTAGCGCCCGTCTGGCTGCa < 5:92799/149‑1 (MQ=255) gAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGCCGGTCGGGGTGCTGCGCACGTAGCGCCCGTCTGGCTGCAAg < 2:300535/149‑1 (MQ=255) gCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGCCGGTCGGGGTGCTGCGCACGTAGCGCCCGTCTGGCTGCAAGGTc < 6:313455/149‑1 (MQ=255) ggAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGCCGGTCGGGGTGCTGCGCACGTAGCGCCCGTCTGGCTGCAAGGTCCa < 1:67513/149‑1 (MQ=255) gctggcCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGCCGGTCGGGGTGCTGCGCACGTAGCGCCCGTCTGGCTGCAAGGTCCAGGCGTg > 5:369176/1‑149 (MQ=255) gctggcCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGAGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTCGTTGCCGGTCGGGGTGCTGCGCACGTAGCGCCCGTCTGGCTGCAAGGTCCAGGCGTg > 1:264454/1‑149 (MQ=255) ctggcCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGaa < 6:118443/75‑1 (MQ=255) ctggcCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGaa > 5:118443/1‑75 (MQ=255) ctggcCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGCCGGTCGGGGTGCTGCGCACGTAGCGCCCGTCTGGCTGCAAGGTCCAGGCGTgg < 8:32386/149‑1 (MQ=255) tggcCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGCCGGTCGGGGTGCTGCGCACGTAGCGCCCGTCTGGCTGCAAGGTCCAGGCGTggg > 7:279588/1‑149 (MQ=255) gTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGCCGGTCGGGGTGCTGCGCACGTAGCGCCCGTCTGGCTGCAAGGTCCAGGCGTGGGTATTGTCg < 8:44639/149‑1 (MQ=255) tCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGCCGGTCGGGGTGCTGCGCACGTAGCGCCCGTCTGGCTGCAAGGTCCAGGCGTGGGTATTGTCgg > 6:79677/1‑149 (MQ=255) ggCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGCCGGTCGGGGTGCTGCGCACGTAGCGCCCGTCTGGCTGCAAGGTc > 4:141063/1‑128 (MQ=255) ggCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGCCGGTCGGGGTGCTGCGCACGTAGCGCCCGTCTGGCTGCAAGGTc < 3:141063/128‑1 (MQ=255) cgCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGCCGGTCGGGGTGCTGCGCACGTAGCGCCCGTCTGGCTGCAAGGTCCAGGCGTGGGTATTGTCGGTc < 3:133635/148‑1 (MQ=255) gCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGCCGGTCGGGGTGCTGCGCACGTAGCGCCCGTCTGGCTGCAAGGTCCAGGCGTGGGTATTGTCGGTCa < 6:116351/149‑1 (MQ=255) cGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCCGGTTGCCGGTCGGGGTGCTGCGCACGTAGCGCCCGTCTGGCTGCAAGGTCCAGGCGTGGGTATTGTCGGTCAGGt < 1:77752/148‑1 (MQ=255) gTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGCCGGTCGGGGTGCTGCGCACGTAGCGCCCGTCTGGCTGCAAGGTCCAGGCGTGGGTATTGTCGGTCAGGTa < 1:56134/148‑1 (MQ=255) tCCTCAACGTACGCTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGCCGGTCGGGGTGCTGCGCACGTAGCGCCCGTCTGGCTGCAAGGTCCAGGCGTGGGTATTGTCGGTCAGGTAGc > 4:74363/1‑149 (MQ=255) cTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGCCGGTCGGGGTGCTGCGCACGTAGCGCCCGTCTGGCTGCAAGGTCCAGGCGTgg < 2:114897/128‑1 (MQ=255) cTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGCCGGTCGGGGTGCTGAGCACGTAGCGCCCGTCTGGCTGCAAGGTCCAGGCGTgg > 1:114897/1‑128 (MQ=255) tCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGCCGGTCGGGGTGCTGCGCACGTAGCGCCCGTCTGGCTGCAAGGTCCAGGCGTGGGTATTGTCg > 1:268676/1‑136 (MQ=255) tCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGCCGGTCGGGGTGCTGCGCACGTAGCGCCCGTCTGGCTGCAAGGTCCAGGCGTGGGTATTGTCg < 2:268676/136‑1 (MQ=255) gTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGCCGGTCGGGGTGCTGCGCACGTAGCGCCCGTCTGGCTGCAAGGTCCAGGCGTGGGTATTGTCGGTCAGGTAGCCTTCCAGc < 8:343883/149‑1 (MQ=255) ttGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGCCGGTCGGGGTGCTGCGCACGTAGCGCCCGTCTGGCTGCAAGGTCCAGGCGTGGGTATTGTCGGTCAGGTAGCCTTCCAGCTCctt < 5:79677/149‑1 (MQ=255) | TGCCAACGGTAGAACTGCACGGCGGGGACAACAGCCTGGATGTAGCCTTCCCTGAAGGTTGGCTGCAGCAGAACCAGCTGACCCAGGCCGACTTCGCCAACGAGGCGGAGTGGCTGGCCCGGGTCGGCTTCGTCCTCAGCGTACGTTGAGGACCGGGTTGCTCAGGCGCTCCAGCAGGGTCGCCTGAACGCTGCGCGGGTTCTGGTTGCCGGTCGGGGTGCTGCGCACGTAGCGCCCGTCTGGCTGCAAGGTCCAGGCGTGGGTATTGTCGGTCAGGTAGCCTTCCAGCTCCTT > NC_002947/5950638‑5950931 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |