Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 490,670 | T→G | 6.4% | D584A (GAC→GCC) | lptD ← | LPS‑assembly protein LptD |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 490,670 | 0 | T | G | 6.4% | 238.5 / 3.1 | 74 | D584A (GAC→GCC) | lptD | LPS‑assembly protein LptD |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (37/32); new base G (3/2); total (40/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
AACGAGGTGTTGCGGTCGAAATACAGGCCGCTGTCGACGCTGAAAATCGGGATATCGCGGTTCAGGTTGCTTTTGTAGTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGCAGGCTGATGGAAGGGGCGACGTTCAGGCGGGTACCGTTGGCACGCGCTACACCGAAGATGTTTTCATCCAGTCGCCGAC > NC_002947/490526‑490817 | aacGAGGTGTTGCGGTCGAAATACAGGCCGCTGTCGACGCTGAAAATCGGGATATCGCGGTTCAGGTTGCTTTTGTAGTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAg < 2:268894/149‑1 (MQ=255) cGAGGTGTTGCGGTCGAAATACAGGCCGCTGTCGACGCTGAAAATCGGGATATCGCGGTTCAGGTTGCTTTTGTAGTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGt > 6:261202/1‑149 (MQ=255) aaGGTGTTGCGGTCGAAATACAGGCCGCTGTCGACGCTGAAAATCGGGATATCGCGGTTCAGGTTGCTTTTGTAGTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTc < 4:52007/148‑1 (MQ=255) gtgtTGCGGTCGAAATACAGGCCGCTGTCGACGCTGAAAATCGGGATATCGCGGTTCAGGTTGCTTTTGTAGTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGt > 5:160428/1‑148 (MQ=255) gtTGCGGTCGAAATACAGGCCGCTGTCGACGCTGAAAATCGGGATATCGCGGTTCAGGTTGCTTTTGTAGTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAAt > 5:243803/1‑149 (MQ=255) ttGCGGTCGAAATACAGGCCGCTGTCGACGCTGAAAATCGGGATATCGCGGTTCAGGTTGCTTTTGTAGTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAAt < 6:167466/148‑1 (MQ=255) gCGGTCGAAATACAGGCCGCTGTCGACGCTGAAAATCGGGATATCGCGGTTCAGGTTGCTTTTGTAGTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATgg < 6:243803/148‑1 (MQ=255) cGGTCGAAATACAGGCCGCTGTCGACGCTGAAAATCGGGATATCGCGGTTCAGGTTGCTTTTGTAGTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCaa > 5:242308/1‑136 (MQ=255) cGGTCGAAATACAGGCCGCTGTCGACGCTGAAAATCGGGATATCGCGGTTCAGGTTGCTTTTGTAGTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCaa < 6:242308/136‑1 (MQ=255) cGGTCGAAATACAGGCCGCTGTCGACGCTGAAAATCGGGATATCGCGGTTCAGGTTGCTTTTGTAGTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGt < 1:167887/149‑1 (MQ=255) gTCGAAATACAGGCCGCTGTCGACGCTGAAAATCGGGATATCGCGGTTCAGGTTGCTTTTGTAGTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGta > 8:251289/1‑148 (MQ=255) tCGAAATACAGGCCGCTGTCGACGCTGAAAATCGGGATATCGCGGTTCAGGTTGCTTTTGTAGTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGt < 1:231018/146‑1 (MQ=255) tCGAAATACAGGCCGCTGTCGACGCTGAAAATCGGGATATCGCGGTTCAGGTTGCTTTTGTAGTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGt > 2:231018/1‑146 (MQ=255) gAAATACAGGCCGCTGTCGACGCTGAAAATCGGGATATCGCGGTTCAGGTTGCTTTTGTAGTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATAc < 6:160428/148‑1 (MQ=255) aTACAGGCCGCTGTCGACGCTGAAAATCGGGATATCGCGGTTCAGGTTGCTTTTGTAGTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATg > 7:293885/1‑148 (MQ=255) aTACAGGCCGCTGTCGACGCTGAAAATCGGGATATCGCGGTTCAGGTTGCTTTTGTAGTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTAGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTTCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATg > 2:337215/1‑148 (MQ=255) aGGCCGCTGTCGACGCTGAAAATCGGGATATCGCGGTTCAGGTTGCTTTTGTAGTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAg > 8:195998/1‑125 (MQ=255) aGGCCGCTGTCGACGCTGAAAATCGGGATATCGCGGTTCAGGTTGCTTTTGTAGTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAg < 7:195998/125‑1 (MQ=255) gCCGCTGTCGACGCTGAAAATCGGGATATCGCGGTTCAGGTTGCTTTTGTAGTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATGCATGTACtt > 5:303513/1‑147 (MQ=255) cGCTGTCGACGCTGAAAATCGGGATATCGCGGTTCAGGTTGCTTTTGTAGTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGc > 4:302263/1‑149 (MQ=255) aaaaTCGGGATATCGCGGTTCAGGTTGCTTTTGTAGTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATg < 2:52810/147‑1 (MQ=255) aaaaTCGGGATATCGCGGTTCAGGTTGCTTTTGTAGTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTa < 8:293885/149‑1 (MQ=255) tCGGGATATCGCGGTTCAGGTTGCTTTTGTAGTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCg < 4:271064/149‑1 (MQ=255) gggATATCGCGGTTCAGGTTGCTTTTGTAGTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGt < 3:223192/148‑1 (MQ=255) ggATATCGCGGTTCAGGTTGCTTTTGTAGTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATGCATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAg < 6:303513/149‑1 (MQ=255) tatCGCGGTTCAGGTTGCTTTTGTAGTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTg < 1:337215/149‑1 (MQ=255) gTTCAGGTTGCTTTTGTAGTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCa > 4:178259/1‑149 (MQ=255) ttCAGGTTGCTTTTGTAGTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCAt > 2:111268/1‑149 (MQ=255) cAGGTTGCTTTTGTAGTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATc < 5:261202/148‑1 (MQ=255) gTTGCTTTTGTAGTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCgg > 1:47590/1‑147 (MQ=255) ttGCTTTTGTAGTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGCAg > 5:109893/1‑149 (MQ=255) ttttGTAGTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGt > 6:140670/1‑84 (MQ=255) ttttGTAGTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGt < 5:140670/84‑1 (MQ=255) ttttGTAGTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGCAGGCt > 1:41152/1‑148 (MQ=255) tGTAGTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGCAGGCTGAt < 1:111268/148‑1 (MQ=255) tGTAGTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGCAGGCTGAt < 2:47590/148‑1 (MQ=255) gTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGCAGGCTGATGGaa < 6:109893/148‑1 (MQ=255) gTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCAGCCTGCCGATGGag < 3:220743/148‑2 (MQ=255) tCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGCAGGCTGATGGAAgg > 3:44114/1‑149 (MQ=255) gCCGAACACGTCCAGTGTGTCTTCGTTCGCTCCTGCAATGTCTCCCTTGCCCCTGCTATCCAGGTGAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGTTGTAGCCGTTGCTGGGCTCCATCGGCAGGCTGATGGAAggg < 2:347199/148‑1 (MQ=255) gCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGCAGGCTGATGGAAgggg < 7:251289/149‑1 (MQ=255) gTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGt < 1:198078/96‑1 (MQ=255) gTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGt > 2:198078/1‑96 (MQ=255) gTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGCAGGCTGATGGAAGGGGCGACGtt > 5:3494/1‑147 (MQ=255) tCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATACAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCAATCGGCAGGCTGATGGAAGTGGCGACGTTCAg > 8:183933/1‑149 (MQ=255) tgtCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGCAGGCTGATGGAAGGGGCGACGTTCAGGCGGGTa < 3:302263/149‑1 (MQ=255) tCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGCAGGCTGATGGAAGGGGCGACGTTCAGGCGGGTAcc > 8:219227/1‑149 (MQ=255) cGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGCAGGCTGAt > 5:329970/1‑118 (MQ=255) cGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGCAGGCTGAt < 6:329970/118‑1 (MQ=255) cGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGCAGGCTGATGGAAGGGGCGACGTTCAGGCGGGTACCGTTg > 4:376343/1‑149 (MQ=255) ttCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGCAGGCTGATGGAAGGGGCGACGTTCAGGCGGGTACCGTTgg > 5:95466/1‑148 (MQ=255) ttCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGCAGGCTGATGGAAGGGGCGACGTTCAGGCGGGTACCGTTgg > 5:89966/1‑148 (MQ=255) cgcgCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTT‑CTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGCAGGCTGATGGAAGGGGCg < 1:132592/123‑1 (MQ=255) cgcgCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTT‑CTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGCAGGCTGATGGAAGGGGCg > 2:132592/1‑123 (MQ=255) gcgcCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGCAGGCTGATGGAAGGGGCGACGTTCAGGCGGGTACCGTTGGCAcg > 8:41898/1‑149 (MQ=255) cgcCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGCAGGCTGATGGAAGGGGCGACGTTCAGGCGGGTACCGTTGGCAcgc < 3:178259/149‑1 (MQ=255) attacgaccttgacctggaTAGCAAGGGCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGCAGGCTGATCGAAGGGGCGACGTACAGGCGGGTACCGTTGGCACGCGCTACAcc > 1:42839/8‑149 (MQ=255) tCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGCAGGCTGATGGAAGGGGCGACGTTCAGGCGGGTACCGTTGGCACGCGCTACACCg > 6:127891/1‑147 (MQ=255) gcccttgcccttGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGCAGGCTGATGGAAGGGGCGACGTTCAGGCGGGTACCGTTg > 5:208167/1‑130 (MQ=255) gcccttgcccttGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGCAGGCTGATGGAAGGGGCGACGTTCAGGCGGGTACCGTTg < 6:208167/130‑1 (MQ=255) gaccttgacctggaTAGCAAGGGCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGCAGGCTGATGGAAGGGGCGACGTTCAGGCGGGTACCGTTGGCACGCGCTACACCg > 2:165591/3‑145 (MQ=255) cccttgcccttgCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGCAGGCTGATGGAAGGGGCGACGTTCAGGCGGGTACCGTTGGCACGCGCTACACCGAAGAt > 4:149688/1‑149 (MQ=255) ccttgacctggaTAGCAAGGGCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGc > 5:349746/1‑89 (MQ=37) ccttgacctggaTAGCAAGGGCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGc < 6:349746/89‑1 (MQ=37) ttgcccttgcTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGCAGGCTGATGGAAGGGGCGACGTTCAGGCGGGTACCGTTGGCACGCGCTACACCGAAGATGtt > 2:355270/1‑149 (MQ=255) gcccttgcTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGCAGGCTGATGGAAGGGGCGACGTTCAGGCGGGTACCGTTGGCACGCGCTACACCGAAGATGttt > 3:162762/1‑148 (MQ=255) cccttgcTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGCAGGCTGATGGAAGGGGCGACGTTCAGGCGGGTACCGTTGGCACGCGCTACACCGAAGATGTTTTc < 4:44114/149‑1 (MQ=255) ccttgcTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGCAGGCTGATGGAAGGGGCGACGTTCAGGCGGGTACCGTTGGCACGCGCTACACCGAAGATGttttaa > 6:279242/1‑147 (MQ=255) cttgcTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGCAGGCTGATGGAAGGGGCGACGTTCAGGCGGGTACCGTTGGCACGCGCTACACCGAAGATGTTTTCAt < 3:376343/149‑1 (MQ=255) tCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGCAGGCTGATGGAAGGGGCGACGTTCAGGCGGGTACCGTTGGCACGCGCTACACCGAAGATGTTTTCATCCAGTCg > 7:270095/1‑149 (MQ=255) gcaaGGGCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGCAGGCTGATGGAAGGGGCGACGTTCAGGCGGGTACCGTTGGCACGCGCTACACCGAAGATGTTTTCATCCAGTCg < 1:165591/146‑1 (MQ=255) ccAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGCAGGCTGATGGAAGGGGCGACGTTCAGGCGGGTACCGTTGGCACGCGCTACACCGAAGATGTTTTCATCCAGTCGc > 8:194966/1‑149 (MQ=255) ggTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGCAGGCTGATGGAAGGGGCGACGTTCAGGCGGGTACCGTTGGCACGCGCTACACCGAAGATGTTTTCATCCAGTCGCCGa < 6:3494/149‑1 (MQ=255) gTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGCAGGCTGATGGAAGGGGCGACGTTCAGGCGGGTACCGTTGGCACGCGCTACACCGAAGATGTTTTCATCCAGTCGCCGac > 2:102928/1‑149 (MQ=255) | AACGAGGTGTTGCGGTCGAAATACAGGCCGCTGTCGACGCTGAAAATCGGGATATCGCGGTTCAGGTTGCTTTTGTAGTCGCCGAACACGTCCAGTGTGTCTGCGTTCGCGCCTGCAATGTCGCCCTTGCCCTTGCTATCCAGGTCAAGGTCGTAATGGGTATACATGTACTTCAGCTTCGGCGTGATGTAGCCGTAGCTGGCCTCCATCGGCAGGCTGATGGAAGGGGCGACGTTCAGGCGGGTACCGTTGGCACGCGCTACACCGAAGATGTTTTCATCCAGTCGCCGAC > NC_002947/490526‑490817 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |