| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,003,645 | C→A | 6.6% | G98C (GGC→TGC) | amaB ← | L‑piperidine‑6‑carboxylate dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,003,645 | 0 | C | A | 6.6% | 242.5 / 4.7 | 75 | G98C (GGC→TGC) | amaB | L‑piperidine‑6‑carboxylate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/35); new base A (2/3); total (37/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.83e-01 | |||||||||||
TCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGTTCGCCACGGCGCGGAGCCGGCACACTGCGCCAGGCTTCGAAGGCGCTCTGGGCCT > NC_002947/6003501‑6003791 | tCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTcc < 8:46257/149‑1 (MQ=255)tCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTcc > 2:260005/1‑149 (MQ=255) aCGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTg < 3:166894/149‑1 (MQ=255) aCGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTg > 6:9717/1‑149 (MQ=255) cGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTgg < 4:86935/149‑1 (MQ=255) cGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTgg < 6:242906/149‑1 (MQ=255) cGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTgg > 2:359961/1‑149 (MQ=255) cGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTgg < 2:352558/149‑1 (MQ=255) cGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTgg > 8:28301/1‑149 (MQ=255) ccGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGt > 7:33620/1‑149 (MQ=255) ccGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGt < 6:367165/149‑1 (MQ=255) cGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGAAGGCCTGGGTg < 5:159256/149‑1 (MQ=255) aCCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGAt < 5:9717/149‑1 (MQ=255) aCCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGAAGGCCTGGGTGaa < 4:297701/149‑2 (MQ=255) aCCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGAAGGCCTGGGTGaa < 4:297262/149‑2 (MQ=255) acacAGCGGGTGCCAGGTTTAAAGCATTTGGTGTCACGGGCGATCGGAAGCGATGGTCAGGCCTTACATCTGGCGCGACAGCCCAACGGCGAAGTAGCAGATGTCGATCATTTC‑ATGCACTTCACACAGGCATTCCTTGGTCATCTTg > 8:356233/4‑148 (MQ=255) cccAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGcc < 5:341428/149‑1 (MQ=255) ccAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCg > 5:355272/1‑149 (MQ=255) ccAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCg < 8:33620/149‑1 (MQ=255) tGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTtcgat < 6:355272/149‑1 (MQ=255) tGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTtcgat > 6:235520/1‑149 (MQ=255) aGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCgag < 1:359961/149‑1 (MQ=255) ggTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCTAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCgaga < 1:260005/149‑1 (MQ=255) gTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGAc > 5:304337/1‑149 (MQ=255) aCGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCt > 2:250651/1‑149 (MQ=255) gCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTtcgatcga < 1:137436/139‑1 (MQ=255) gCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTtcgatcga > 2:137436/1‑139 (MQ=255) aTGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCtt > 5:52055/1‑130 (MQ=255) aTGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCtt < 6:52055/130‑1 (MQ=255) gtggCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGt > 4:181096/1‑149 (MQ=255) gtggCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGt > 1:69734/1‑149 (MQ=255) gCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCgg < 5:208773/149‑1 (MQ=255) gCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCg < 6:304337/148‑1 (MQ=255) ccGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGcc > 4:199722/1‑149 (MQ=255) gggCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCtt < 2:345520/149‑1 (MQ=255) ggCGCTCGGAAGCGCGCGCCCGGCCGGACAGCGCGCGCGACAGCCCAACCGCGAAGACGCAGATCTCGATCATTTC‑CAGCACTTCACCCCGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCGtg < 4:304036/149‑1 (MQ=255) gcTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAAAGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTtgtg > 1:13191/1‑148 (MQ=255) gcTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAAAGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTtgtg < 2:13191/148‑1 (MQ=255) tCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCt > 4:6967/1‑148 (MQ=255) aaGCGAGGGCCAGGCCGTACAGCTGGCGCTACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGACTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACgc < 4:235755/149‑1 (MQ=255) gCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCGGTGCACTTCACCCCGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACg > 1:303452/1‑147 (MQ=255) ggTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACtt > 4:18361/1‑149 (MQ=255) gTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTc < 3:181096/149‑1 (MQ=255) aGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGcc < 4:49951/149‑1 (MQ=255) aGGCCGTACAGCTGGCGCGAAAGGACAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGc < 7:356233/148‑1 (MQ=255) ccGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGaa > 3:204433/1‑149 (MQ=255) cAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGgc < 2:69734/149‑1 (MQ=255) cTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCa < 3:6967/149‑1 (MQ=255) gCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGTTc < 6:121526/144‑1 (MQ=255) gCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGTTc > 5:121526/1‑144 (MQ=255) gCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGTTCGCCAc > 8:133875/1‑149 (MQ=255) cAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGTTCGCCACgg > 5:189792/1‑149 (MQ=255) cGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACgca > 5:72726/1‑102 (MQ=255) cGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACgca < 6:72726/102‑1 (MQ=255) gCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGTTCGCCACGgc < 4:202598/137‑1 (MQ=255) gCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGTTCGCCACGgc > 3:202598/1‑137 (MQ=255) aTGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTtcgatc < 2:85247/60‑1 (MQ=255) aTGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGTTCGCCACGGCGCGGAGCCGGCACACt < 1:250651/149‑1 (MQ=255) gTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGTCCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGTTCGCCACGGCGCGGAGcc < 1:119461/139‑1 (MQ=255) gTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGTTCGCCACGGCGCGGAGcc > 2:119461/1‑139 (MQ=255) cGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGTTCGCCACGGCGCGGAGCCGGCACACTgcgc > 5:378574/1‑149 (MQ=255) gATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATGGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGTTCGCCACGGCGCGGAGCCGGCCCACTgcgc > 2:110114/1‑148 (MQ=255) aTTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGTTCGCCACGGCGCGGAGCCGGc < 6:68523/135‑1 (MQ=255) aTTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGTTCGCCACGGCGCGGAGCCGGc > 5:68523/1‑135 (MQ=255) ggcaagatCACCCAGGAAGGCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGTTCGCCACGGCGCGGAGCCGGCACACTGCGCCAGGCTTCg > 5:316602/8‑148 (MQ=255) cACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGTTCGCCACGGCGCGGAGCCGGCACACTGCGCCAGGCTTCGAAgg < 7:133875/149‑1 (MQ=255) cACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGTTCGCCACGGCGCGGAGCCGGCACACTGCGCCAGGCTTCGAAgg < 5:235520/149‑1 (MQ=255) ttCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGTTCGCCACGGCGCGGAGCCGGCACACTGCGCCAGGCTTCGAAGgcgc > 5:140959/1‑149 (MQ=255) ttCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACAAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGTTCGCCACGGCGCGGAGCCGGCACACTGCGCCAGGCTTCGAAGgcgc > 6:104771/1‑149 (MQ=255) ccAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGTCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGTTCGCCACGGCGCGGAGCCGGCACACTGCGCCAGGCTTCGAAGGCGCTCTgg > 4:32437/1‑149 (MQ=255) ccAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGTTCGCCACGGCGCGGAGCCGGCACACTGCGCCAGGCTTCGAAGGCGCTCTgg > 3:16113/1‑149 (MQ=255) ccAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGTTCGCCACGGCGCGGAGCCGGCACACTGCGCCAGGCTTCGAAGGCGCTCTgg > 5:195085/1‑149 (MQ=255) ccAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGTTCGCCACGGCGCGGAGCCGGCACACTGCGCCAGGCTTCGAAGGCGCTCTgg > 7:22908/1‑149 (MQ=255) ggCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGTTCGCCACGGCGCGGAGCCGGCACACTGCGCCAGGCTTCGAAGGCGCTCTGGGcc > 2:102106/1‑149 (MQ=255) gCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGTTCGCCACGGCGCGGAGCCGGCACACTGCGCCAGGCTTCGAAGGCGCTCTGGGCCt < 2:303452/149‑1 (MQ=255) | TCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTC‑CTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGTTCGCCACGGCGCGGAGCCGGCACACTGCGCCAGGCTTCGAAGGCGCTCTGGGCCT > NC_002947/6003501‑6003791 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |