Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 6,064,576 | G→C | 6.8% | intergenic (+17/+17) | ubiA → / ← PP_5319 | 4‑hydroxybenzoate octaprenyltransferase/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 6,064,576 | 0 | G | C | 6.8% | 219.8 / 4.0 | 72 | intergenic (+17/+17) | ubiA/PP_5319 | 4‑hydroxybenzoate octaprenyltransferase/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (37/30); new base C (2/3); total (39/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.55e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
CGTGCTTTGCCTGGGAATACTGGTCAACGCGCAAGCTGGACCGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTGCCGTCGTAAGCCCACTGCATCGAACCGTCGTCACGCGT > NC_002947/6064429‑6064721 | cgTGCTTTGCCTGGGAATACTGGTCAACGCGCAAGCTGGACCGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCaga < 2:324538/149‑1 (MQ=255) tttGCCTGGGAATACTGGTCAACGCGCAAGCTGGACCGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGCATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGc > 4:183451/1‑149 (MQ=255) ccTGGGAATACTGGTCAACGCGCAAGCTGGACCGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCTCTGCGGcccc < 7:350825/148‑1 (MQ=255) gAATACTGGTCAACGCGCAAGCTGGACCGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTAt < 1:25976/149‑1 (MQ=255) gAATACTGGTCAACGCGCAAGCTGGACCGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGNAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTAt < 1:31795/149‑1 (MQ=255) aTACTGGTCAACGCGCAAGCTGGACCGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTAtc > 3:174098/1‑148 (MQ=255) aTACTGGTCAACGCGCAAGCTGGACCGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTAtc < 1:305860/148‑1 (MQ=255) tGGTCAACGCGCAAGCTGGACCGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATg > 8:139694/1‑149 (MQ=255) tGGTCAACGCGCAAGCTGGACCGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATg > 2:259496/1‑149 (MQ=255) tGGTCAACGCGCAAGCTGGACCGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATg > 7:202467/1‑149 (MQ=255) aaCGCGCAAGCTGGACCGGGAATCGTGCGTCAACGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTCTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCtt < 7:278922/148‑1 (MQ=255) gcgcAAGCTGGACCGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATg < 2:81277/141‑1 (MQ=255) gcgcAAGCTGGACCGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATg > 1:81277/1‑141 (MQ=255) gCTGGACCGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGt < 5:98598/147‑1 (MQ=255) gCTGGACCGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGt > 6:98598/1‑147 (MQ=255) gACCGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCa < 8:202467/147‑1 (MQ=255) ccGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACg > 1:258411/1‑149 (MQ=255) ggAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCt > 6:32484/1‑149 (MQ=255) ggAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCt > 8:252804/1‑149 (MQ=255) aTCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCTTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCttt < 4:174098/148‑1 (MQ=255) aTCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGCATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTGGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTc < 3:183451/149‑1 (MQ=255) gCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGcc > 2:5774/1‑149 (MQ=255) cTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGcc < 3:77244/148‑1 (MQ=255) cAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGt < 1:259496/147‑1 (MQ=255) aaGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCAc < 7:252804/149‑1 (MQ=255) aGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGc > 1:367254/1‑103 (MQ=255) ggCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCg < 2:258411/149‑1 (MQ=255) gCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCgg > 5:300895/1‑149 (MQ=255) cATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGt > 8:255415/1‑149 (MQ=255) cTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGt > 1:282125/1‑149 (MQ=255) tGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGt > 3:175828/1‑148 (MQ=255) gCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCa > 6:241282/1‑149 (MQ=255) aaCCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAAc > 5:252982/1‑108 (MQ=255) ccACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGc < 8:115518/78‑1 (MQ=255) ccACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGc > 7:115518/1‑78 (MQ=255) cACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCct > 7:70922/1‑149 (MQ=255) tGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGc < 6:292275/106‑1 (MQ=255) tGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGc > 5:292275/1‑106 (MQ=255) ggCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTg < 7:139694/149‑1 (MQ=255) ggggATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTcc > 4:66432/1‑149 (MQ=255) gATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGATCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTtg < 1:5774/149‑1 (MQ=255) cTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTtgatga < 7:255415/149‑1 (MQ=255) cTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTtgatg < 6:300895/148‑1 (MQ=255) tGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTtga > 1:14776/1‑145 (MQ=255) tGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTtga < 2:14776/145‑1 (MQ=255) ggTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAg > 7:297972/1‑149 (MQ=255) gtgtTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAgg < 5:32484/149‑1 (MQ=255) tttATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCcttc > 3:266452/1‑130 (MQ=255) tttATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCcttc < 4:266452/130‑1 (MQ=255) aTCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGtata > 2:52938/1‑147 (MQ=255) gAGTTGTGCTTGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGAAGTCTTTCATGACGTAAACGGTCATGTCAAAGGCCTTCTTGTCCTTGATTAAGGTATAAAGCgg > 2:373788/1‑149 (MQ=255) gTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTc > 6:25071/1‑106 (MQ=255) tgtgCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCtt < 4:175828/148‑1 (MQ=255) gtcttACGCTTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCTCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTGCcgtcg < 3:10104/146‑1 (MQ=255) ggATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTGcc > 5:350311/1‑145 (MQ=255) ggATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTGcc < 6:350311/145‑1 (MQ=255) cgcgTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTGCCGTCGTAAGcc < 8:70922/149‑1 (MQ=255) gTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTGCCGTCGTAAGCCCAc > 7:112229/1‑149 (MQ=255) gTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTGCCGTCGTAAGCCCAc < 5:241282/149‑1 (MQ=255) cgcTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTGCCGTCGTAAGCCCACTGc < 3:66432/148‑1 (MQ=255) agtagtTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTGCCGTCGTAAGCCCACTGCATCGa > 8:260576/1‑148 (MQ=255) gtTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTGCCGTCGTAAGCCCACTGCATCGAACcgt > 8:53116/1‑149 (MQ=255) tttGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTGCCGTCGTAAGCCCa < 4:209254/134‑1 (MQ=255) tttGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTGCCGTCGTAAGCCCa > 3:209254/1‑134 (MQ=255) tttGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTGCCGTCGTAAGCCCACTGCATCGAACcgtc > 4:42620/1‑149 (MQ=255) tttGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTGCCGTCGTAAGCCCACTGCATCGAACcgtc > 3:121770/1‑149 (MQ=255) cggggCCGCTCTGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTGCCGTCGTAAGCCCACTGCATc < 2:366950/138‑1 (MQ=255) cggggCCGCTCTGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTGCCGTCGTAAGCCCACTGCATc > 1:366950/2‑139 (MQ=255) ggggCCGCTCTGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTg < 4:275930/117‑1 (MQ=255) ggggCCGCTCTGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTg > 3:275930/1‑117 (MQ=255) ccGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTGCCGTCGTAAGCCCACTGCATCGAACcg > 6:24458/1‑140 (MQ=255) ccGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTGCCGTCGTAAGCCCACTGCATCGAACcg < 5:24458/140‑1 (MQ=255) gCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTGCCGTCGTAAGCCCACTGCATCGAACCGTCGTCACGCGt > 1:188013/1‑149 (MQ=255) | CGTGCTTTGCCTGGGAATACTGGTCAACGCGCAAGCTGGACCGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTGCCGTCGTAAGCCCACTGCATCGAACCGTCGTCACGCGT > NC_002947/6064429‑6064721 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |