| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,077,520 | T→G | 6.7% | E60A (GAG→GCG) ‡ | PP_5329 ← | phosphate ABC transporter substrate‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,077,520 | 0 | T | G | 6.7% | 251.2 / 4.8 | 82 | E60A (GAG→GCG) ‡ | PP_5329 | phosphate ABC transporter substrate‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (40/36); new base G (3/3); total (43/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.86e-01 | |||||||||||
GCTCGAAGGCTTGCAGCTCGACGTCCTTCATCTTGCGGCTCATCGGGCCGAGGTTGGCGGTGCCTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGTGGTCTTGGTGTAGGTCGGGATCGCAGGATCGACAGCGGCTACCGCGTTGGCGGTTGCAACGCCAGCGGCGGCAAAG > NC_002947/6077374‑6077666 | gCTCGAAGGCTTGCAGCTCGACGTCCTTCATCTTGCGGCTCATCGGGCCGAGGTTGGCGGTGCCTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCg > 5:337582/1‑149 (MQ=255)gCTCGAAGGCTTGCAGCTCGACGTCCTTCATCTTGCGGCTCATCGGGCCGAGGTTGGCGGTGCCTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCg > 4:146440/1‑149 (MQ=255) gAAGGCTTGCAGCTCGACGTCCTTCATCTTGCGGCTCATCGGGCCGAGGTTGGCGGTGCCTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGcc > 2:157028/1‑148 (MQ=255) caacgCTAGCAGCACGACGTCCTTCATCTTGCGGCTCAACGCGCCGAGGTTGGCCGTGCCATCCCACAGCGCAGGTGGAGCCGTAGACGAGCCCGCAGCCTGGAACTGCAAGTTAACGTTCCGATATTCCTTCTTGTAGGCATCTGcc > 4:347780/5‑148 (MQ=255) gCAGCTCGACGTCCTTCATCTTGCGGCTCATCGGGCCGAGGTTGGCGGTGCCTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGt > 3:124644/1‑148 (MQ=255) aGCTCGACGTCCTTCATCTTGCGGCTCATCGGGCCGAGGTTGGCGGTGCCTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCAt > 7:244054/1‑149 (MQ=255) cTCGACGTCCTTCATCTTGCGGCTCATCGGGCCGAGGTTGGCGGTGCCTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCAt > 6:75586/1‑147 (MQ=255) gACGTCCTTCATCTTGCGGCTCATCGGGCCGAGGTTGGCGGTGCCTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGt > 2:336898/1‑149 (MQ=255) ccTTCATCTTGCGGCTCATCGGGCCGAGGTTGGCGGTGCCTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTcgc > 3:81288/1‑148 (MQ=255) cTTCATCTTGCGGCTCATCGGGCCGAGGTTGGCGGTGCCTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTcgcg < 6:337582/148‑1 (MQ=255) cTTCATCTTGCGGCTCATCGGGCCGAGGTTGGCGGTGCCTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTcgc > 6:63598/1‑147 (MQ=255) ttCATCTTGCGGCTCATCGGGCCGAGGTTGGCGGTGCCTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTAGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAg > 5:390144/1‑149 (MQ=255) aTCTTGCGGCTCATCGGGCCGAGGTTGGCGGTGCCTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGgt > 1:8702/1‑149 (MQ=255) cTTGCGGCTCATCGGGCCGAGGTTGGCGGTGCCTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGATGAGCCGGTAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATTAGGTTCGCGAGGgtgt > 5:88779/1‑149 (MQ=255) ttGCGGCTCATCGGGCCGAGGTTGGCGGTGCCTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTc > 4:259082/1‑149 (MQ=255) ttGCGGCTCATCGGGCCGAGGTTGGCGGTGCCTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTc > 5:202871/1‑149 (MQ=255) ggggCTCATCGGGCCGAGGTGGGCGGGGCCTTCGGGCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGgtgt < 8:221460/144‑1 (MQ=255) gCGGCTCATCGGGCCGAGGTTGGCGGTGCCTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTc < 5:75586/147‑1 (MQ=255) gCGGCTCATCGGGCCGAGGTTGGCGGTGCCTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCg < 2:8702/148‑1 (MQ=255) ggCTCATCGGGCCGAGGTTGGCGGTGCCTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGaa < 5:43148/149‑1 (MQ=255) gCTCATCGGGCCGAGGTTGGCGGTGCCTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAAc < 3:347560/149‑1 (MQ=255) tCATCGGGCCGAGGTTGGCGGTGCCTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTGGGCCGAGGCCtacaaga > 5:50962/1‑117 (MQ=255) tCATCGGGCCGAGGTTGGCGGTGCCTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTGGGCCGAGGCCtacaaga < 6:50962/120‑4 (MQ=255) tCATCGGGCCGAGGTTGGCGGTGCCTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAAcc > 7:213701/1‑148 (MQ=255) aTCGGGCCGAGGTTGGCGGTGCCTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAAc > 4:302551/1‑149 (MQ=255) tCGGGCCGAGGTTGGCGGTGCCTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCg < 1:17380/140‑1 (MQ=255) tCGGGCCGAGGTTGGCGGTGCCTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCg > 2:17380/1‑140 (MQ=255) tCGGGCCGAGGTTGGCGGTGCCTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACg > 4:117162/1‑149 (MQ=255) gggCCGAGGTTGGCGGTGCCTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGc < 8:244054/148‑1 (MQ=255) ggCCGAGGTTGGCGGTGCCTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTg < 5:271688/149‑1 (MQ=255) cGAGGTTGGCGGTGCCTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCcac < 4:131159/107‑1 (MQ=255) cGAGGTTGGCGGTGCCTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCcac > 3:131159/1‑107 (MQ=255) gAGGTTGGCGGTGCCTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGga > 4:242487/1‑147 (MQ=255) aGGTTGGCGGTGCCTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGagag < 4:89118/149‑1 (MQ=255) gTTGGCGGTGCCTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGt > 7:67185/1‑149 (MQ=255) gTTGGCGGTGCCTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGt < 3:146440/149‑1 (MQ=255) cGGTGCCTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGccc < 6:112597/149‑1 (MQ=255) gTGCCTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGa < 4:124644/149‑1 (MQ=255) ccTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGaaa < 5:63598/148‑1 (MQ=255) gTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGt > 3:291174/1‑149 (MQ=255) gTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCAGAAACACCAGt > 5:105916/1‑149 (MQ=255) gcgcAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTACTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGTGGTc < 5:226187/149‑1 (MQ=255) cAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGTGGTCTTg < 1:336898/149‑1 (MQ=255) aGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGACTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGAATCGACACACAGAGACATGAGGATCCCGAGGGTGTAGGACCCAACGATGGAGAGCTTGCCCGAAACACAAGTGCTCATgg > 8:110487/1‑149 (MQ=255) ggTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGTGGTCTTGgt < 6:202871/149‑1 (MQ=255) tGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGTGGTCTTGgtgt < 3:302551/149‑1 (MQ=255) ggCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGTGGTCTTGgtg > 8:76946/1‑147 (MQ=255) gcgGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAgg < 4:190866/93‑1 (MQ=255) gcgGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAgg > 3:190866/1‑93 (MQ=255) gcgGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGTGGTCTTGGTGTAGGt < 2:54579/149‑1 (MQ=255) ggTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGTGGTCTTGGTGTAGGTCg < 4:81288/149‑1 (MQ=255) aggagCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGTGGTCTTGGTGTAGGTCGGGATc > 7:86178/1‑149 (MQ=255) gagCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGTGGTCTTGGTGTAGGTCGGGATCg > 1:105757/1‑148 (MQ=255) agCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGTGGTCTTGGTGTAGGTCGGGATCGCa < 7:76946/149‑1 (MQ=255) cgggCATCCTGTATCTGGATGTTTACTTGCGGATTTTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGGGTCGGAACGAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGTGGTCTTGGTGTAGGTCGGGATCGCAgg < 7:110487/147‑1 (MQ=255) ggCAGCCTGGATCTGTATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGTGGTCTTGGTGTAGGTCGGGATCGCAGGAt < 3:347780/149‑1 (MQ=255) aGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGTGGTCTTGGTGTAGGTCGGGATCGCAGGATCGa > 4:103142/1‑149 (MQ=255) gatctggatGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGTGGTCTTGGTGTAGGTCGGGATCGCAGGATCGACAGc < 1:157028/147‑1 (MQ=255) gatctggatGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGTGGTCTTGGTGTAGGTCGGGATCGCAGGATCGACAGc < 3:103142/147‑1 (MQ=255) ggatGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGCGTTTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGTGGACTTGGTGTAGGTCGTGATCGCAGGATCGACAGCTGCTAcc > 8:332115/1‑149 (MQ=255) gatGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGTGGTCTTGGTGTAGGTCGGGATCGCAGGATCGACAGCGGCTACcg > 3:314054/1‑149 (MQ=255) tGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGTGGTCTTGGTGTAGGTCGGGATCGCAGGATCGACAGCGGCTACcgcg > 1:107314/1‑149 (MQ=255) tACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGACCGAAACACCAGTGGTCTTGGTGTAGGTCGGGATCGCAGGATCGACAGCGGCTACCGCGTTgg > 7:131811/1‑149 (MQ=255) aCGTTCGTATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAATCACCAGTGGTCTTGGTGTAGGTCGGGATCGCAGGATCGACAGCGGCTACCGCGTTgg < 8:67185/148‑1 (MQ=255) aCGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGTGGTCTTGGTGTAGGTCGGGATCGCAGGATCGACAGCGGCTACCGCGTTgg < 3:259082/148‑1 (MQ=255) cGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACGGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGCACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGTGGTCTTGGTGTAGGTCGGGATCGCAGGATCGACAGCGGCTACCGCGTTGGCg < 4:358503/149‑1 (MQ=255) ttCGGATATTCCTTCTTTTATGCCTCTGCACAGATAGTCATGAGGTTCGCGAGTTTGTCGGAACCAACTCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGTCGTCTTTGTGTATGTCGGGATCGCATGATCGACAGCGGCTACCTCGTTGGCGGt < 6:88779/149‑1 (MQ=255) ggATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGTGGTCTTGGTGTAGGTCGGGATCGCAGGATCGACAGCGGCTACCGCGTTGGCGGTTg < 3:242487/148‑1 (MQ=255) gATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGTGGTCTTGGTGTAGGTCGGGATCGCAGGATCGACAGCGGCTACCGCGTTGGCGGTTg > 7:72032/1‑147 (MQ=255) gATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGTGGTCTTGGTGTAGGTCGGGATCGCAGGATCGACAGCGGCTACCGCGTTGGCGGTTg < 8:72032/147‑1 (MQ=255) ttcttGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGTGGTCTTGGTGTAGGTCGGGATCGCAGGATCGACAGCGGCTACCGCGTTGGCGGTTGc > 2:302637/1‑140 (MQ=255) ttcttGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGTGGTCTTGGTGTAGGTCGGGATCGCAGGATCGACAGCGGCTACCGCGTTGGCGGTTGc < 1:302637/140‑1 (MQ=255) ttcttGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGTGGTCTTGGTGTAGGTCGGGATCGCAGGATCGACAGCGGCTACCGCGTTGGCGGTTGCAACGCCa > 8:302560/1‑147 (MQ=255) tctgtgGGCCGAGGCCTACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGTGGTCTTgg > 7:29913/3‑89 (MQ=255) tctgtgGGCCGAGGCCTACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGTGGTCTTgg < 8:29913/87‑1 (MQ=255) tctgtgGGCCGAGGCCTACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGTGGTCTTGGTGTAGGTCGGGATCGCAGGATCGACAGCGGCTACCGCGTTGGCGGTTGCAACGCCAgc < 6:341913/145‑1 (MQ=255) tctgtgGGCCGAGGCCTACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGTGGTCTTGGTGTAGGTCGGGATCGCAGGATCGACAGCGGCTACCGCGTTGGCGGTTGCAACGCCAgc > 5:341913/3‑147 (MQ=255) gTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGTGGTCTTGGTGTAGGTCGGGATCGCAGGATCGACAGCGGCTACCGCGTTGGCGGTTGCAACGCCAgcggcg < 3:117162/148‑1 (MQ=255) tAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAAACAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGTGGTCTTGGTGTAGGTCGGGATCGCAGGATCGACAGCGGCTACCGCGTTGGCGGTTGCAACGCCAGcggcgg > 6:295945/1‑148 (MQ=255) gCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGTGGTCTTGGTGTAGGTCGGGATCGCAGGATCGACAGCGGCTACCGCGTTGGCGGTTGCAACGCCAGCGGCGGCa > 1:170279/1‑147 (MQ=255) ccTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGTGGTCTTGGTGTAGGTCGGGATCGCAGGATCGACAGCGGCTACCGCGTTGGCGGTTGCAACGCCAGCGGCGGCAAAg < 2:105757/149‑1 (MQ=255) ccTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGTGGTCTTGGTGTAGGTCGGGATCGCAGGATCGACAGCGGCTACCGCGTTGGCGGTTGCAACGCCAGCGGCGGCAAAg > 2:78967/1‑149 (MQ=255) | GCTCGAAGGCTTGCAGCTCGACGTCCTTCATCTTGCGGCTCATCGGGCCGAGGTTGGCGGTGCCTTCGGTCAGCGCAGGTGGCGCGGTAGAGGAGCCGGCAGCCTGGATCTGGATGTTTACGTTCGGATATTCCTTCTTGTAGGCCTCGGCCCACAGAGTCATGAGGTTCGCGAGGGTGTCGGAACCAACGCTGGAGAGGTTGCCCGAAACACCAGTGGTCTTGGTGTAGGTCGGGATCGCAGGATCGACAGCGGCTACCGCGTTGGCGGTTGCAACGCCAGCGGCGGCAAAG > NC_002947/6077374‑6077666 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |