Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 563,007 | T→G | 5.7% | P30P (CCT→CCG) ‡ | rpoA → | DNA‑directed RNA polymerase subunit alpha |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 563,007 | 0 | T | G | 5.7% | 222.6 / 4.1 | 70 | P30P (CCT→CCG) ‡ | rpoA | DNA‑directed RNA polymerase subunit alpha |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (31/35); new base G (2/2); total (33/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.69e-01 |
AACGAAAACCTGATTGTCGAGCTCTACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCGAGATCGATGGCGTACTCCATGAGTACTCCGCGATCGAAGGTGTTCAGGAAGACGTAATT > NC_002947/562860‑563154 | aaCGAAAACCTGATTGTCGAGCTCTACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCct < 1:275073/148‑1 (MQ=255) aCGAAAACCTGATTGTCGAGCTCTACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCctct > 1:288515/1‑149 (MQ=255) aaaaCCTGATTGTCGAGCTCTACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGa < 6:203492/149‑1 (MQ=255) aaCCTGATTGTCGAGCTCTACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGAGGCTCGAGc < 7:86147/149‑1 (MQ=255) cTGATTGTCGAGCTCTACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTg < 6:359257/149‑1 (MQ=255) cTGATTGGCGAGCTCTACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGATCCTGACTCCCCGCCACAT‑TGATCTGCAGGAAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTg < 7:295977/149‑1 (MQ=255) aTTGTCGAGCTCTACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGAGGCTCGAGCGtaatt < 7:289014/149‑5 (MQ=255) ttGTCGAGCTCTACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGttt < 6:101634/149‑1 (MQ=255) tCGAGCTCTACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACAG‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTCGTTTCgg > 6:86700/1‑149 (MQ=255) gAGCTCTACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGc < 5:266003/148‑1 (MQ=255) tctACTCCAAGTAAGGTCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCTGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTg < 1:123147/136‑1 (MQ=255) tctACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATAc > 3:232876/1‑149 (MQ=255) tctACTACAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACAT‑TGATGTTCAGGTAGTCAGTCCGACAAGCGCCAAAATTACGATAGAGCCTCTCGAGCGTg > 2:123147/1‑136 (MQ=255) cTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTg < 5:387292/149‑1 (MQ=255) ccAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTggg > 3:243046/1‑149 (MQ=255) cAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGtt < 6:202687/132‑1 (MQ=255) cAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGtt > 5:202687/1‑132 (MQ=255) gCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCt > 7:101821/1‑136 (MQ=255) gCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCt < 8:101821/136‑1 (MQ=255) tAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTgcg > 2:333536/1‑149 (MQ=255) gTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCa > 2:50960/1‑118 (MQ=255) gTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCa < 1:50960/118‑1 (MQ=255) cATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCa < 2:142135/141‑1 (MQ=255) cATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCa > 1:142135/1‑141 (MQ=255) cATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGGTCCTGACTCCCCGACACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCTCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCtgtt < 8:153405/148‑1 (MQ=255) aTCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACATGTGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCtctc > 1:78877/1‑98 (MQ=255) aTCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCtctc < 2:78877/97‑1 (MQ=255) aTCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCtgttgt > 6:42261/1‑149 (MQ=255) tGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGtcctc > 6:178064/1‑148 (MQ=255) cAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCtgttg > 7:257405/1‑141 (MQ=255) cAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCtgttg < 8:257405/141‑1 (MQ=255) cAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCAt < 2:158959/149‑1 (MQ=255) aGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATg < 5:365998/149‑1 (MQ=255) tttCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCt < 4:232876/149‑1 (MQ=255) ggTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCt > 5:35981/1‑149 (MQ=255) aaTGAGTTCCTGACTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGc < 2:288515/149‑1 (MQ=255) ccTGACTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTc > 2:378572/1‑148 (MQ=255) cTGACTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTc > 6:126757/1‑147 (MQ=255) cTGACTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTc > 2:278407/1‑147 (MQ=255) cTGACTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGa < 6:35981/149‑1 (MQ=255) gACTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAgg > 2:300956/1‑149 (MQ=255) aCTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGc < 1:300956/149‑1 (MQ=255) tCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGcc > 1:278330/1‑148 (MQ=255) tCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGcc > 7:180426/1‑148 (MQ=255) cccGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAgg > 6:205978/1‑144 (MQ=255) cccGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAgg < 5:205978/144‑1 (MQ=255) cccGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGcc > 3:370249/1‑146 (MQ=255) cccGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCga < 2:59201/148‑1 (MQ=255) ccGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTg > 5:916/1‑68 (MQ=255) ccGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTg < 6:916/68‑1 (MQ=255) ccGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCgaga < 4:370249/149‑1 (MQ=255) agCCAGAT‑TGATGTGCAGGTTGTCAGTCCGACCGGGTCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGATTCGGCCTTACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGGTGTCCTGCATGCCTGGGTGTGCAGTAGTCGAGGCCGAGAt < 5:222323/148‑1 (MQ=255) ccACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCGAGATCg < 1:378572/149‑1 (MQ=255) cacaT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCGAGATCGa < 8:180426/149‑1 (MQ=255) aT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCGAGATCGATgg > 8:222013/1‑149 (MQ=255) t‑tGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTg < 5:231095/89‑1 (MQ=255) t‑tGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTg > 6:231095/1‑89 (MQ=255) tgCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCGAGATCGATGGCGTACt < 4:243046/148‑1 (MQ=255) 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aCGCTCGAGAGGCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCGAGATCGATGGCGTACTCCATGAGTACTCCGCGATCGAAGGTGTTCAgg > 2:175829/1‑148 (MQ=255) tCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCAGACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCGAGATCGATGGCGTACTCCATGAGTACTCCGCGATCGAAGGTGTTCAGGAAGAc > 3:216491/1‑149 (MQ=255) gAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCGAGATCGATGGCGTACTCCATGAGTACTCCGCGAt < 3:233710/128‑1 (MQ=255) gAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCGAGATCGATGGCGTACTCCATGAGTACTCCGCGAt > 4:233710/1‑128 (MQ=255) gCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCGAGATCGATGGCGTACTCCATGAGTACTCCGCGATCGAAGGTGTTCAGGAAGACGTaa < 2:121165/149‑1 (MQ=255) tctcGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCGAGATCGATGGCGTACTCCATGAGTACTCCGCGATCGAAGGTGTTCAGGAAGACGTAAtt > 3:2565/1‑148 (MQ=255) | AACGAAAACCTGATTGTCGAGCTCTACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAGGTGCATCCATGCAGATTTCGGTAAATGAGTTCCTGACTCCCCGCCACAT‑TGATGTGCAGGTAGTCAGTCCGACCCGCGCCAAAATTACGCTCGAGCCTCTCGAGCGTGGTTTCGGCCATACCCTGGGCAACGCGCTGCGCCGCATCCTGTTGTCCTCCATGCCTGGCTGTGCAGTAGTCGAGGCCGAGATCGATGGCGTACTCCATGAGTACTCCGCGATCGAAGGTGTTCAGGAAGACGTAATT > NC_002947/562860‑563154 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |