Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 628,905 | T→C | 8.1% | A431A (GCA→GCG) | eutB ← | ethanolamine ammonia‑lyase subunit alpha |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 628,905 | 0 | T | C | 8.1% | 138.8 / 2.7 | 49 | A431A (GCA→GCG) | eutB | ethanolamine ammonia‑lyase subunit alpha |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (25/20); new base C (2/2); total (27/22) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.86e-01 |
CCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATGGTCATCCCTATGCAAGCTGTGCCAAGGCCTGGCGGAAGGCCGGCGGCAGGTT‑GTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCAGGGTCTGGCGCGCGTACAACGCGTCATGGAACGAGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCGTCGGAGCCGGGGATGCCCATGATGAAGTTGATGCCGGCCACCCCCAGCAGCGT > NC_002947/628759‑629051 | ccaAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATGGTCATCCCTATGCAAGCTGTGCCAAGGCCTGGCGGAAGGCCGGCGGCAGGTT‑GTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGc < 3:9414/149‑1 (MQ=255) ccaAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATGGTCATCCCTATGCAAGCTGTGCCAAGGCCTGGCGGAAGGCCGGCGGCAGGTT‑GTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGc > 6:50289/1‑149 (MQ=255) aaGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATGGTCATCCCTATGCAAGCTGTGCCAAGGCCTGGCGGAAGGCCGGCGGCAGGTT‑GTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCt > 1:106382/1‑149 (MQ=255) tCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATGGTCATCCCTATGCAAGCTGTGCCAAGGCCTGGCGGAAGGCCGGCGGCAGGTT‑GTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATCCCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTCGAATTcc > 5:287526/1‑149 (MQ=255) gCGTGCGGTGGTCCATGGTCATCCCTATGCAAGCTGTGCCAAGGCCTGGCGGAAGGCCGGCGGCAGGTT‑GTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCt > 6:87090/1‑149 (MQ=255) gTGCGGTGGTCCATGGTCATCCCTATGCAAGCTGTGCCAAGGCCTGGCGGAAGGCCGGCGGCAGGTT‑GTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTc < 5:66326/149‑1 (MQ=255) gtCCATGGTCATCCCTATGCAAGCTGTGCCAAGGCCTGGCGGAAGGCCGGCGGCAGGTT‑GTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCa < 2:106382/148‑1 (MQ=255) ggTCATCCCTATGCAAGCTGTGCCAAGGCCTGGCGGAAGGCCGGCGGCAGGTT‑GTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTCGAATTCCGGCCCgg < 6:211039/130‑1 (MQ=255) ggTCATCCCTATGCAAGCTGTGCCAAGGCCTGGCGGAAGGCCGGCGGCAGGTT‑GTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTCGAATTCCGGCCCgg > 5:211039/1‑130 (MQ=255) tCATCCCTATGCAAGCTGTGCCAAGGCCTGGCGGAAGGCCGGCGGCAGGTT‑GTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCAGGGTCTGgc > 3:109222/1‑149 (MQ=255) tCCCTATGCAAGCTGTGCCAAGGCCTGGCGGAAGGCCGGCGGCAGGTT‑GTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCAGGGTCTGgcgcg < 5:85389/149‑1 (MQ=255) cTATGCAAGCTGTGCCAAGGCCTGGCGGAAGGCCGGCGGCAGGTTGGTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCtt > 1:270006/1‑127 (MQ=255) cTATGCAAGCTGTGCCAAGGCCTGGCGGAAGGCCGGCGGCAGGTT‑GTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCtt < 2:270006/126‑1 (MQ=255) cTATGCAAGCTGTGCCAAGGCCTGGCGGAAGGCCGGCGGCAGGTT‑GTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCAGGGTCTGGCGCGCGt < 1:338423/149‑1 (MQ=255) gCAAGCTGTGCCAAGGCCTGGCGGAAGGCCGGCGGCAGGTT‑GTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCACGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCAGGGTCTGGCGCGCGTACaa > 4:206530/1‑149 (MQ=255) gCAAGCTGTGCCAAGGCCTGGCGGAAGGCCGGCGGCAGGTT‑GTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCACGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCAGGGTCTGGCGCGCGTACaa > 4:201667/1‑149 (MQ=255) cTGTGCCAAGGCCTGGCGGAAGGCCGGCGGCAGGTT‑GTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCAGGGTCTGGCGCGCGTACAACGCGt < 1:231900/149‑1 (MQ=255) cTGTGCCAAGGCCTGGCGGAAGGCCGGCGGCAGGTT‑GTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCACGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCAGGGTCTGGCGCGCGTACAACGCGt < 3:201667/149‑1 (MQ=255) cTGTGCCAAGGCCTGGCGGAAGGCCGGCGGCAGGTT‑GTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCACGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCAGGGTCTGGCGCGCGTACAACGCGt < 3:206530/149‑1 (MQ=255) tgCCAAGGCCTGGCGGAAGGCCGGCGGCAGGTT‑GTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCAGGGTCTGGCGCGCGTACAACGCGTCAt < 7:30510/149‑1 (MQ=255) ccAAGGCCTGGCGGAAGGCCGGCGGCAGGTT‑GTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCAGGGTCTGGCGCGCGTACAACGCGTCATg > 2:116816/1‑148 (MQ=255) gCCGGCGGCAGGTT‑GTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCAGGGTCTGGCGCGCGTACAACGCGTCATGGAACGAGGTGGTCTGGTa < 4:109222/149‑1 (MQ=255) ccGGCGGCAGGTT‑GTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCAGGGTCTGGCGCGCGTACAACGCGTCATGGAACGAGGTGGTCTGGTAg > 2:257352/1‑149 (MQ=255) cggcggCAGGTT‑GTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCAGGGTCTGGCGCGCGTACAACGCGTCATGGAACGAGGTGGTCTGGTAGt < 5:50289/149‑1 (MQ=255) ggcggcAGGTT‑GTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCAGGGTCTGGCGCGCGTACAACGCGTCATGGAACGAGGTGGTCTGGTAGtt < 5:87090/149‑1 (MQ=255) ggcAGGTT‑GTCACCGAAGCGCACCCGGCCGTCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCAGGGTCTGGCGCGCGTACAACGCGTCATGGAACGAg > 5:249244/1‑132 (MQ=255) ggcAGGTT‑GTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCAGGGTCTGGCGCGCGTACAACGCGTCATGGAACGAg < 6:249244/132‑1 (MQ=255) gcAGGTT‑GTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCAGGGTCTGGCGCGCGTACAACGCGTCATGGAACGAGGTGGTCTGGTAGTTGAg > 3:36664/1‑148 (MQ=255) gTT‑GTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTc > 2:66784/1‑66 (MQ=255) gTT‑GTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTc < 1:66784/66‑1 (MQ=255) tt‑GTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCAGGGTCTGGCGCGCGTACAACGCGTCATGGAACGAGGTGGTCTGGTAGTTGa > 6:80534/1‑142 (MQ=255) tt‑GTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCAGGGTCTGGCGCGCGTACAACGCGTCATGGAACGAGGTGGTCTGGTAGTTGa < 5:80534/142‑1 (MQ=255) tt‑GTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCAGGGTCTGGCGCGCGTACAACGCGTCATGGAACGAGGTGGTCTGGTAGTTGAGCatgat < 1:116816/149‑1 (MQ=255) t‑GTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCCCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCAGGGTCTGGCGCGCGTACAACGCGTCATGGAACGAGGTGGTCTGGTAGTTGAGCatgatg > 4:154372/1‑149 (MQ=255) ccGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCAGGGTCTGGCGCGCGTACAACGCGTCATGGAACGAGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATgtcgtc > 1:353535/1‑149 (MQ=255) cgcACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCAGGGTCTGGCGCGCGTACAACGCGTCATGGAACGAGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCGTCGGAGcc > 3:298012/1‑149 (MQ=255) ggCCATCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCAGGGTCTGGCGCGCGTACAACGCGTCATGGAACGAGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCGTCGGAGCCGGGGATg > 8:199393/1‑149 (MQ=255) cATCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCAGGGTCTGGCGCGCGTACAACGCGTCATGGAACGAGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCGTCGGAGCCGGGGATGcc > 2:90978/1‑148 (MQ=255) ggCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCAGGGTCTGGCGCGCGTACAACGCGTCATGGAACGAGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCGTCGGAGCCGGGGATGCCCatga < 1:257352/149‑1 (MQ=255) ccTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCAGGGTCTGGCGCGCGTACAACGCGTCATGGAACGAGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCGGCGGAGCCGGGGATGCCCatgatg < 4:36664/149‑1 (MQ=255) gTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCAGGGTCTGGCGCGCGTACAACGCGTCATGGAACGAGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCGTCGGAGCCGGGGATGCCCATGATGAAGtt > 7:290078/1‑149 (MQ=255) gAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCAGGGTCTGGCGCGCGTACAACGCGTCATGGAACGAGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCGTCGGAGCCGGGGATGCCCATGATGAAGTTGa > 4:303609/1‑149 (MQ=255) gATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCAGGGTCTGGCGCGCGTACAACGCGTCATGGAACGAGGTGGTCTGGTAGTTGAGCatga < 7:197935/110‑1 (MQ=255) gATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCAGGGTCTGGCGCGCGTACAACGCGTCATGGAACGAGGTGGTCTGGTAGTTGAGCatga > 8:197935/1‑110 (MQ=255) aCCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCAGGGTCTGGCGCGCGTACAACGCGTCATGGAACGAGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCGTCGGAGCCGGGGATGCCCATGATGAAGTTGATGCCgg > 3:354840/1‑149 (MQ=255) aCCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCAGGGTCTGGCGCGCGTACAACGCGTCATGGAACGAGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCGTCGGAGCCGGGGATGCCCATGATGAAGTTGATGCCgg > 2:84699/1‑149 (MQ=255) gggCCAGCCATGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCAGGGTCTGGCGCGCGTACAACGCGTCATGGAACGAGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCGTCGGAGCCGGGGATGCCCATGATGAAGTTGATGCCGGCCAcccc > 5:184474/1‑148 (MQ=255) gccaTGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCAGGGTCTGGCGCGCGTACAACGCGTCATGGAACGAGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCGTCGGAGCCGGGGATGCCCATGATTAAGTTGATGCCGGCCACCCCCagcagc < 4:298012/149‑1 (MQ=255) aTGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCAGGGTCTGGCGCGCGTACAACGCGTCATGGAACGAGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCGTCGGAGCCGGGGATGCCCATGATGAAGTTGATGCCGGCCACCCCCAGCAGCGt > 2:117605/1‑148 (MQ=255) | CCAAGGGTTGTCGGGGGTAGGCGTGCGGTGGTCCATGGTCATCCCTATGCAAGCTGTGCCAAGGCCTGGCGGAAGGCCGGCGGCAGGTT‑GTCACCGAAGCGCACCCGGCCATCGGCCTGGGTGAAGATACCGGTGCGGGCCAGCCATGCCTCGAATTCCGGCCCGGGCTTCAGGCCCAGGGTCTGGCGCGCGTACAACGCGTCATGGAACGAGGTGGTCTGGTAGTTGAGCATGATGTCGTCGGAGCCGGGGATGCCCATGATGAAGTTGATGCCGGCCACCCCCAGCAGCGT > NC_002947/628759‑629051 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |