| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 670,785 | C→T | 9.2% | Q743* (CAG→TAG) ‡ | pbpC → | peptidoglycan glycosyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 670,785 | 0 | C | T | 9.2% | 213.2 / 9.4 | 76 | Q743* (CAG→TAG) ‡ | pbpC | peptidoglycan glycosyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (28/41); new base T (3/4); total (31/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CAGGCGCCGGCCAGTGCACCACCGCTGTCGATCGTCGGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACAG > NC_002947/670638‑670927 | cAGGCGCCGGCCAGTGCACCACCGCTGTCGATCGTCGGTGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCa < 3:238248/149‑1 (MQ=255) gcCGGCCAGTGCACCACCGCTGTCGATCGTCGGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGt > 4:132916/1‑149 (MQ=255) gcCGGCCAGTGCACCACCGCTGTCGATCGTCGGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGt < 5:355370/149‑1 (MQ=255) ccGGCCAGTGCACCACCGCTGTCGATCGTCGGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGtt < 1:356306/149‑1 (MQ=255) ggCCAGTGCACCACCGCTGTCGATCGTCGGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTgg < 3:236129/149‑1 (MQ=255) ggCCAGTGCACCACCGCTGTCGATCGTCGGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTgg < 7:46359/149‑1 (MQ=255) ccAGTGCACCACCGCTGTCGATCGTCGGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGt < 5:146157/149‑1 (MQ=255) ccAGTGCACCACCGCTGTCGATCGTCGGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGt < 7:258801/149‑1 (MQ=255) tGCACCACCGCTGTCGATCGTCGGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCCCAACGGCTGGCCGTTgaggaacc < 4:266214/149‑8 (MQ=255) accaccGCTGTCGATCGTCGGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAAcc > 3:350609/1‑148 (MQ=255) caccGCTGTCGATCGTCGGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAg < 7:147921/149‑1 (MQ=255) caccGCTGTCGATCGTCGGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCCCAACGGCTGGCCGTTgagg < 1:167303/140‑4 (MQ=255) caccGCTGTCGATCGTCGGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCCCAACGGCTGGCCGTTgagg > 2:167303/1‑137 (MQ=255) cGCTGTCGATCGTCGGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAgggg > 4:326577/1‑149 (MQ=255) tGTCGATCGTCGGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAg > 2:236764/1‑149 (MQ=255) gtcgGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCtt > 4:143122/1‑149 (MQ=255) gtcgGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCtt > 7:120940/1‑149 (MQ=255) gtcgGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCtt < 8:315671/149‑1 (MQ=255) gtcgGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCt < 2:174627/148‑1 (MQ=255) tcgGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGa > 7:339491/1‑142 (MQ=255) tcgGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGa < 8:339491/142‑1 (MQ=255) gTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTtgct < 3:114165/149‑1 (MQ=255) cgcCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCCGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTtgctgc < 5:88420/148‑1 (MQ=255) ccAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGttt < 7:293632/149‑1 (MQ=255) ccAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGttt < 6:246537/149‑1 (MQ=255) aGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGc < 6:50704/149‑1 (MQ=255) aGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGc < 8:79245/149‑1 (MQ=255) aGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGc < 1:236764/149‑1 (MQ=255) gCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCGGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCca < 8:294489/149‑1 (MQ=255) cGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCTTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCcac < 2:268361/149‑1 (MQ=255) gACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCTGGCCGTTga > 3:89004/1‑105 (MQ=255) gACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCTGGCCGTTga < 4:89004/106‑2 (MQ=255) aCAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAg < 7:292043/149‑1 (MQ=255) cAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAgg > 8:85828/1‑149 (MQ=255) cgccgcCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCggg > 8:279193/1‑147 (MQ=255) cgccgcCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCgg < 3:326577/146‑1 (MQ=255) cccGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCGGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGcc > 2:70158/1‑148 (MQ=255) accaGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTg > 2:75287/1‑88 (MQ=255) accaGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTg < 1:75287/88‑1 (MQ=255) accaGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAg > 5:33516/1‑149 (MQ=255) ccaGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAgc < 6:136157/149‑1 (MQ=255) cTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTg < 3:132916/149‑1 (MQ=255) tGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCa < 4:307306/93‑1 (MQ=255) gCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACg < 3:143122/149‑1 (MQ=255) ccGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCt < 7:81227/97‑1 (MQ=255) ccGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCt > 8:81227/1‑97 (MQ=255) cAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCgg > 4:363820/1‑149 (MQ=255) aaTTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCGGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGt < 1:70158/149‑1 (MQ=255) gCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAg < 8:297202/148‑1 (MQ=255) cAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGCACGAAAGCGGTCAGAc > 6:164936/1‑149 (MQ=255) gTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGgc > 2:132150/1‑149 (MQ=255) aTCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCTTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGgcgc > 6:271594/1‑149 (MQ=255) cTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCgg > 7:176043/1‑149 (MQ=255) gCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGt > 1:86285/1‑149 (MQ=255) ccTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCgg < 3:363820/146‑1 (MQ=255) ccTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTg < 7:279193/149‑1 (MQ=255) ccTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTg > 8:175030/1‑149 (MQ=255) gtggtggACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCa < 2:86285/148‑1 (MQ=255) gACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGt < 5:271594/149‑1 (MQ=255) cgcTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTa < 6:33516/149‑1 (MQ=255) gcTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAg < 8:120940/149‑1 (MQ=255) gtTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCg > 6:85067/1‑80 (MQ=255) gtTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCg < 5:85067/80‑1 (MQ=255) gtTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCa > 6:275328/1‑129 (MQ=255) gtTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCa < 5:275328/129‑1 (MQ=255) gtTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTc < 7:85828/148‑1 (MQ=255) tcacccAACGGCTGGCCGTTGAGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGt < 3:235439/119‑1 (MQ=255) tcacccAACGGCTGGCCGTTGAGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGt > 4:235439/6‑124 (MQ=255) cTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTcgacga > 8:63408/1‑149 (MQ=255) tCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTcgacga > 4:100025/1‑148 (MQ=255) aaCGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAgc > 1:306612/1‑81 (MQ=255) aaCGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAgc < 2:306612/81‑1 (MQ=255) aaCGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCa < 3:138386/127‑1 (MQ=255) aaCGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCa > 4:138386/1‑127 (MQ=255) aaCGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACAg > 6:4648/1‑149 (MQ=255) aaCGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCCCGGGTGGAGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACAg > 5:33897/1‑149 (MQ=255) | CAGGCGCCGGCCAGTGCACCACCGCTGTCGATCGTCGGCGTGCGCCCAGGCGACAATCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACAG > NC_002947/670638‑670927 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |