| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 672,892 | T→A | 9.2% | I210F (ATC→TTC) | PP_0574 ← | LuxR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 672,892 | 0 | T | A | 9.2% | 180.5 / 8.2 | 65 | I210F (ATC→TTC) | PP_0574 | LuxR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (30/29); new base A (4/2); total (34/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.93e-01 | |||||||||||
TCGTGAACCGCTGGTGCACGGGTGACGAGCTGGG‑GGTCAGCGCCAGAGCCAGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCGGTGGGTGCCTTGGCCACGGGCTTT > NC_002947/672751‑673033 | tCGTGAACCGCTGGTGCACGGGTGACGAGCTGGG‑GGTCAGCGCCAGAGCCAGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTaa > 8:348866/1‑149 (MQ=255) cGTGAACCGCTGGTGCACGGGTGACGAGCTGGG‑GGTCAGCGCCAGAGCCAGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAAt > 2:64802/1‑149 (MQ=255) gTGAACCGCTGGTGCACGGGTGACGAGCTGGG‑GGTCAGCGCCAGAGCCAGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAAt < 2:293185/148‑1 (MQ=255) aCCGCTTGTGCACGGGTGACGTTCTGGG‑TGTCAGCGCCAGAGCCAGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGAGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTCACTGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGt < 6:154657/148‑1 (MQ=255) aCCGCTGGTGCACGGGTGACGAGCTGGG‑GGTCAGCGCCAGAGCCAGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTc > 6:135291/1‑149 (MQ=255) ccGCTGGTGCACGGGTGACGAGCTGGG‑GGTCAGCGCCAGAGCCAGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTct < 7:330889/149‑1 (MQ=255) cGCTGGTGCACGGGTGACGAGCTGGGAGGTCAGCGCCAGAGCCAGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGt > 1:3666/1‑147 (MQ=255) cGCTGGTGCACGGGTGACGAGCTGGG‑GGTCAGCGCCAGAGCCAGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGt < 2:3666/146‑1 (MQ=255) cTGGTGCACGGGTGACGAGCTGGG‑GGTCAGCGCCAGAGCCAGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTcttgc < 4:331687/149‑1 (MQ=255) tGCACGGGTGACGAGCTGGG‑GGTCAGCGCCAGAGCCAGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTcttgccctt > 3:54546/1‑149 (MQ=255) tGCACGGGTGACGAGCTGGG‑GGTCAGCGCCAGAGCCAGCTGGGTGCGGTTGTCCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTcttgccctt < 4:211916/149‑1 (MQ=255) gggTGACGAGCTGGG‑GGTCAGCGCCAGAGCCAGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTa > 1:134466/1‑149 (MQ=255) aCGAGCTGGG‑GGTCAGCGCCAGAGCCAGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAgg > 4:162411/1‑149 (MQ=255) cAGAGCCAGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGc > 5:326937/1‑149 (MQ=255) gCCAGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTgg < 3:162411/149‑1 (MQ=255) ccAGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGga < 7:348866/149‑1 (MQ=255) aGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGgaga < 7:174933/149‑1 (MQ=255) cTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTAc > 5:270902/1‑117 (MQ=255) cTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTAc < 6:270902/117‑1 (MQ=255) gggtcGGGTGTGCATATGCGGGAACCGCAATACCTGAGACACAAAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAg < 8:309456/143‑1 (MQ=255) ggTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTtctc > 6:266781/1‑148 (MQ=255) gCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACgct > 8:108838/1‑149 (MQ=255) atatGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACgctgc > 6:232310/1‑149 (MQ=255) tatGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACgctgct < 4:54546/149‑1 (MQ=255) tatGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGGGGAGACAGTTTCTAGACCgctgct > 4:15409/1‑149 (MQ=255) cGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGc < 7:108838/148‑1 (MQ=255) gTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGtt > 4:122505/1‑130 (MQ=255) gTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGtt < 3:122505/130‑1 (MQ=255) gTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAg < 3:99521/149‑1 (MQ=255) tCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGAGTGGAGACAGTTTCTAGAACGCTGCTGGCAGc > 8:153684/1‑149 (MQ=255) aaaCGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGGGTCGATCTGGTAATTGTTCTTGCCATTGCCTACAAGGCGCGCCACTTCAAGCTGGCGTGGAGACATTTTCTCGAACGATCCTgg > 1:108887/1‑145 (MQ=255) aaaCGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCtc < 1:183474/149‑1 (MQ=255) aaTACCTGATACAGATAGAGCTTCTCGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCTTG‑‑CGATCTGGTAATTTTTCTTTCCATTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCATCTTGCGTGGTGTCAGTTTCTCGAACGCTGCTTGCAGCtagctttc < 8:189461/149‑1 (MQ=255) aaTACCTGAGACACATAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGga > 3:139231/1‑114 (MQ=255) aaTACCTGAGACACATAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGga < 4:139231/114‑1 (MQ=255) cTGAGACACATAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTcgctttcgcttt < 5:266781/149‑1 (MQ=255) acacATAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTtcttct < 5:232310/149‑1 (MQ=255) acaTAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTg > 7:47324/1‑148 (MQ=255) acaTAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGc < 2:134466/149‑1 (MQ=255) aTAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTATTTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCtcgctttcg < 5:192390/136‑1 (MQ=255) aTAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCtcgctttcg > 6:192390/1‑136 (MQ=255) aTAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCAt > 5:366284/1‑149 (MQ=255) agagCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCa > 2:211010/1‑149 (MQ=255) cTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTgg > 6:296195/1‑149 (MQ=255) tgtTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCgg > 5:382439/1‑149 (MQ=255) ttttCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCggtg > 7:174120/1‑149 (MQ=255) ttCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGc > 3:183531/1‑129 (MQ=255) ttCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGc < 4:183531/129‑1 (MQ=255) ttCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCggtgg < 8:174120/148‑1 (MQ=255) cGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGATTCTCGAACGCTGCTGGCAGCtcgctttc < 3:224386/115‑1 (MQ=255) cGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGATTCTCGAACGCTGCTGGCAGCtcgctttc > 4:224386/1‑115 (MQ=255) ggTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCGGTGGGTGc < 2:108887/149‑1 (MQ=255) tAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCATTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCGGTGGGTGCCt > 2:202386/1‑149 (MQ=255) caattaccAGATCGCCTG‑‑CGAACTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCggtgg > 3:323948/7‑143 (MQ=255) caattaccAGATCGCCTG‑‑CGAACTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCggtgg < 4:323948/137‑1 (MQ=255) caattaccAGATCGCCTG‑‑CGAACTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCGGTGGGTGCCt > 1:184071/7‑149 (MQ=255) attaccAGATCGCCTG‑‑CGAACTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCGGTGGGTGCCTTg > 6:26770/5‑149 (MQ=255) attaccAGATCGCCTG‑‑CGAACTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCGGTGGGTGCCTTg > 6:108857/5‑149 (MQ=255) tGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCGGTGGGTGCCTTgg > 5:154911/1‑149 (MQ=255) gCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCGGTGGGTGCCTTGGc > 6:70734/1‑149 (MQ=255) cccAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCGGTGGGTGCCTTGGc < 6:154911/148‑1 (MQ=255) cccAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCGGTGGGTGCCTTGGc < 5:70734/148‑1 (MQ=255) ccAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCGGTGGGTGCCTTGGCCa > 6:36999/1‑149 (MQ=255) gCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCGGTGGGTGCCTTGGCCACGGGCt < 5:36999/148‑1 (MQ=255) cctg‑‑CGAACTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCGGTGGGTGCCTTGGCCACGGGCttt < 5:26770/146‑1 (MQ=255) | TCGTGAACCGCTGGTGCACGGGTGACGAGCTGGG‑GGTCAGCGCCAGAGCCAGCTGGGTGCGGTTGTGCATATGCGTCAAACGCAATACCTGAGACACATAGAGCTTCACGGTGTTTTCGGTAATGCCCAGTTCGCAGG‑‑CGATCTGGTAATTGGTCTTGCCCTTGCCTACCAGGCGCGCCACTTCCAGCTGGCGTGGAGACAGTTTCTCGAACGCTGCTGGCAGCTCGCTTTCGCTTTCTTCTGCATCACTGGCACGCCGGTGGGTGCCTTGGCCACGGGCTTT > NC_002947/672751‑673033 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |