Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 728,809 | G→A | 5.8% | G100R (GGG→AGG) | rluD → | 23S rRNA pseudouridine(1911/1915/1917) synthase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 728,809 | 0 | G | A | 5.8% | 208.4 / 2.3 | 69 | G100R (GGG→AGG) | rluD | 23S rRNA pseudouridine(1911/1915/1917) synthase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/31); new base A (2/2); total (36/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.05e-01 |
TCGTGCGCCCTCGAGACCTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAG‑AAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTGATGGTGGTGGCC > NC_002947/728663‑728955 | tCGTGCGCCCTCGAGACCTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAG‑AAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCggg > 6:72728/1‑149 (MQ=255) gTGCGCCCTCGAGACCTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAG‑AAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCt < 5:72728/149‑1 (MQ=255) ccTCGAGACCTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAG‑AAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTtg‑‑t < 7:231866/149‑1 (MQ=255) gagaCCTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAG‑AAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCa < 4:74306/148‑1 (MQ=255) gTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAG‑AAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCcggcg < 4:370854/147‑1 (MQ=255) ttCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAG‑AAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGcc < 1:306680/149‑1 (MQ=255) cATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAG‑AAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAAGAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCg < 1:52265/148‑1 (MQ=255) aTGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCTAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAG‑AAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCgg < 6:349943/148‑1 (MQ=255) aTGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAG‑AAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGTGGCCgg < 2:347415/148‑1 (MQ=255) gCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAG‑AAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCAGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCcggcg > 6:27130/1‑137 (MQ=255) gCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAG‑AAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCAGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCcggcg < 5:27130/137‑1 (MQ=255) ctctCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAG‑AAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTtg‑‑t > 5:142681/1‑126 (MQ=255) ctctCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAG‑AAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTtg‑‑t < 6:142681/126‑1 (MQ=255) tctcAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAG‑AAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAg > 8:18188/1‑149 (MQ=255) gCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAG‑AAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCa > 4:78499/1‑149 (MQ=255) ccTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAG‑AAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGc > 1:327535/1‑149 (MQ=255) tGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAG‑AAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCt > 3:178965/1‑148 (MQ=255) gAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAG‑AAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCaa < 7:13604/149‑1 (MQ=255) gCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAG‑AAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCGGGTGCACAACCAGCCCGGCAGGCttgttgatcac < 8:288536/111‑6 (MQ=25) gCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAG‑AAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCGGGTGCACAACCAGCCCGGCAGGCttgttgatcac > 7:288536/1‑106 (MQ=25) ccGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAG‑AAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAAcgcg > 3:256225/1‑149 (MQ=255) ggAACATGAGGCGCAGGGCGAGTGGATCGCAG‑AAGATATCGAAGTGGATATCGTCTAGGAAGACGACGACTTCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCAGCCGGCGGCCGTGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAAcgcgg < 4:369106/148‑2 (MQ=255) cGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAG‑AAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACgcgc < 4:256225/149‑1 (MQ=255) cGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAG‑AAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACgcgc < 4:363193/149‑1 (MQ=255) gAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACgcgc > 1:231883/1‑149 (MQ=255) aaCAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAG‑AAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGTTCAACATGCGTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCAGCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCgctg < 5:265015/149‑1 (MQ=255) aaCAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAG‑AAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCggg > 3:262267/1‑119 (MQ=255) aaCAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAG‑AAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCggg < 4:262267/119‑1 (MQ=255) gagGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAG‑AAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCcgg > 5:65235/1‑106 (MQ=255) gagGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAG‑AAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCcgg < 6:65235/106‑1 (MQ=255) ggCCCAGGGCGAGTGGATCGCAG‑AAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCAcc < 3:78499/149‑1 (MQ=255) gCCCAGGGCGAGTGGATCGCAG‑AAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCa > 7:323005/1‑149 (MQ=255) ccAGGGCGAGTGGATCGCAG‑AAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCgg > 2:119871/1‑108 (MQ=255) ccAGGGCGAGTGGATCGCAG‑AAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCgg < 1:119871/108‑1 (MQ=255) aGGGCGAGTGGATCGCAG‑AAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCAtgtg > 8:260344/1‑149 (MQ=255) gAGTGGATCGCAG‑AAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGa < 4:178965/149‑1 (MQ=255) cAG‑AAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAAc > 7:340199/1‑149 (MQ=255) tCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCcgcgc > 4:314268/1‑149 (MQ=255) tGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCAtgt < 7:278055/118‑1 (MQ=255) tGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCAtgt > 8:278055/1‑118 (MQ=255) tatCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATc < 4:275166/148‑1 (MQ=255) atCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGAGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGt > 8:257795/1‑149 (MQ=255) gTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCa > 8:131247/1‑149 (MQ=255) cTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCAcc > 5:279307/1‑149 (MQ=255) cTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATCCCAGCGGCACCCTGCACAACGCGCTGCTGCACCAAGTGCCAGACAACCTCAACCTCCAGCGAGCCGGAATCGTGCa > 5:279311/1‑147 (MQ=255) aCGAAGACGCCCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGc > 4:239112/1‑149 (MQ=255) cGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGcc > 5:73516/1‑149 (MQ=255) gAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCt > 3:141831/1‑149 (MQ=255) gAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCt > 3:136249/1‑149 (MQ=255) aGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑TGGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTg > 1:78644/1‑149 (MQ=255) gacCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAAAGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGAc > 2:66682/1‑147 (MQ=255) acCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAg < 7:260344/149‑1 (MQ=255) ccACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGCCA‑TCACGCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACaa < 1:126605/149‑1 (MQ=255) ccACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAg > 5:264681/1‑148 (MQ=255) ccACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGCGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGAGCAAGACATCGTCAACGAGCCGACCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAg > 4:281035/1‑148 (MQ=255) caTCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCTCCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGaca < 7:18188/149‑1 (MQ=255) tCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGAcacc < 2:231883/149‑1 (MQ=255) cTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGAcaccac > 2:168060/1‑149 (MQ=255) gTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCg < 3:239112/148‑1 (MQ=255) tGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGc < 3:281035/149‑1 (MQ=255) aTCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCt > 3:369471/1‑149 (MQ=255) aacaaGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTGAt > 2:204209/1‑149 (MQ=255) caaGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGa < 3:289230/132‑1 (MQ=255) caaGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGa > 4:289230/1‑132 (MQ=255) gCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTg > 2:242177/1‑121 (MQ=255) gCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTg < 1:242177/121‑1 (MQ=255) gCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTGAtggtgg > 2:344192/1‑149 (MQ=255) ccTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTGAtggtggt > 2:92623/1‑149 (MQ=255) ccGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTGAtggtggtgg < 1:344192/147‑1 (MQ=255) ccGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTGATGGTGGTGGcc < 7:131247/149‑1 (MQ=255) | TCGTGCGCCCTCGAGACCTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAG‑AAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTG‑‑T‑GCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTGATGGTGGTGGCC > NC_002947/728663‑728955 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |