| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 781,067 | T→A | 5.6% | Q260L (CAG→CTG) | glyA‑II ← | serine hydroxymethyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 781,067 | 0 | T | A | 5.6% | 215.1 / 2.5 | 72 | Q260L (CAG→CTG) | glyA‑II | serine hydroxymethyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (32/35); new base A (2/2); total (35/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.73e-01 | |||||||||||
CCACGTCGAAACCGCGCTCGATGAACACGCTGGCCATGGCCTGGGCGTTCTTCACGACCTGCTGCTGGTAAGCCTTGAACTCTGGCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAGGCCGCCGCGCGGGCCGCGCAG‑GGTCTTGTGGGTGGTGGTGGTGACCACGTCGGCGAACGGAACAGGGTTCGGGTACACGC > NC_002947/780921‑781214 | ccACGTCGAAACCGCGCTCGATGAACACGCTGGCCATGTCCTGGGCGTTCTTCACGACCTGCTGCTGGTAAGCCTTGAACTCTGGCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTgg > 2:289456/1‑149 (MQ=255)ccACGTCGAAACCGCGCTCGATGAACACGCTGGCCATGGCCTGGGCGTTCTTCACGACCTGCTGCTGGTAAGCCTTGAACTCTGGCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTgg < 4:76380/149‑1 (MQ=255) gTCGAAACCGCGCTCGATGAACACGCTGGCCATGGCCTGGGCGTTCTTCACGACCTGCTGCTGGTAAGCCTTGAACTCTGGCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGgcgc > 6:303061/1‑149 (MQ=255) tCGAAACCGCGCTCGATGAACACGCTGGCCATGGCCTGGGCGTTCTTCACGACCTGCTGCTGGTAAGCCTTGAACTCTGGCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGcc > 3:62096/1‑149 (MQ=255) gAAACCGCGCTCGATGAACACGCTGGCCATGGCCTGGGCGTTCTTCACGACCTGCTGCTTGTAAGCCTTGAACTCTGGCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGccc < 3:70448/148‑1 (MQ=255) gAAACCGCGCTCGATGAACACGCTGGCCATGGCCTGGGCGTTCTTCACGACCTGCTGCTGGTAAGCCTTGAACTCTGGCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATAGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGG‑CGCCCAGGGCGgccc < 8:162492/148‑2 (MQ=255) gAAACCGCGCTCGATGAACACGCTGGCCATGGCCTGGGCGTTCTTCACGACCTGCTGCTGGTAAGCCTTGAACTCTGGCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATAGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGG‑CGCCCAGGGCGgccc > 7:162492/1‑147 (MQ=37) aaCCGCGCTCGATGAACACGCTGGCCATGGCCTGGGCGTTCTTCACGACCTGCTGCTGGTAAGCCTTTAACTCTGGCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTTGGCGCCC‑ggg < 2:173813/149‑1 (MQ=255) aaCCGCGCTCGATGAACACGCTGGCCATGGCCTGGGCGTTCTTCACGACCTGCTGCTGGTAAGCCTTGAACTCTGGCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑ggg < 6:308568/149‑1 (MQ=255) aaCCGCGCTCGATGAACACGCTGGCCATGGCCTGGGCGTTCTTCACGACCTGCTGCTGGTAAGCCTTGAACTCTGGCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑ggg < 3:208137/149‑1 (MQ=255) gcTCGATGAACACGCTGGCCATGGCCTGGGCGTTCTTCACGACCTGCTGCTGGTAAGCCTTGAACTCTGGCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGa < 8:102548/147‑1 (MQ=255) gcTCGATGAACACGCTGGCCATGGCCTGGGCGTTCTTCACGACCTGCTGCTGGTAAGCCTTGAACTCTGGCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGa > 7:102548/1‑147 (MQ=255) cGATGAACACGCTGGCCATGGCCTGGGCGTTCTTCACGACCTGCTGCTGGTAAGCCTTGAACTCTGGCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGAcggcg < 3:17551/149‑1 (MQ=255) aTGAACACGCTGGCCATGGCCTGGGCTTTCTTCACGACCTGCTGCTGGTAAGCCTTGAACTCTGGCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGa < 8:260360/149‑1 (MQ=255) cATGGCCTGGGCGTTCTTCACGACCTGCTGCTGGTAAGCCTTGAACTCTGGCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTtcttct > 7:66356/1‑149 (MQ=255) cATGGCCTGGGCGTTCTTCACGACCTGCTGCTGGTAAGCCTTGAACTCTGGCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTtcttct > 3:362781/1‑149 (MQ=255) gCCTGGGCGTTCTTCACGACCTGCTGCTGGTAAGCCTTGAACTCTGGCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGAt < 8:157556/149‑1 (MQ=255) cTGGGCGTTCTTCACGACCTGCTGCTGGTAAGCCTTGAACTCTGGCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGt < 3:36152/149‑1 (MQ=255) gCGTTCTTCACGACCTGCTGCTGGTAAGCCTTGAACTCTGGCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGc < 6:347328/149‑1 (MQ=255) cttcACGACCTGCTGCTGGTAAGCCTTGAACTCTGGCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCt < 1:123697/98‑1 (MQ=255) cttcACGACCTGCTGCTGGTAAGCCTTGAACTCTGGCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCt > 2:123697/1‑98 (MQ=255) gACCTGCTGCTGGTAAGCCTTGAACTCTGGCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTg < 6:251953/142‑1 (MQ=255) gACCTGCTGCTGGTAAGCCTTGAACTCTGGCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTg > 5:251953/1‑142 (MQ=255) ccTGCTGCTGGTAAGCCTTGAACTCTGGCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGc > 8:219177/1‑148 (MQ=255) ctgctgGTAAGCCTTGAACTCTGGCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGa < 4:163931/149‑1 (MQ=255) ctgGTAAGCCTTGAACTCTGGCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGAt > 2:144881/1‑147 (MQ=255) aaGCCTTGAACTCTGGCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGG‑CGCCCAggg > 3:92642/1‑80 (MQ=255) aaGCCTTGAACTCTGGCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGG‑CGCCCAggg < 4:92642/80‑1 (MQ=255) aGCCTTGAACTCTGGCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAGgccg < 4:283180/148‑1 (MQ=255) ccTTGAACTCTGGCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCAAGCGGGCCGCCCGGGGCGCCC‑GGGAAGCCGGCGGAGGTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGAGTTGGCACGGGCCAGGATCATGccgccg > 6:360286/1‑149 (MQ=255) ttGAACTCTGGCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCa < 1:183351/139‑1 (MQ=255) ttGAACTCTGGCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCa > 2:183351/1‑139 (MQ=255) tGAACTCTGGCTGCAGGGCTTCCTTGAAGAAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCACCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCTGGATCAGGCCTCcgcgc > 7:122114/1‑149 (MQ=255) gAACTCTGGCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAGGCCGCcgcgc < 1:144881/148‑1 (MQ=255) gAACTCTGGCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGA‑‑‑CGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAGGCCGCCGCGCGGGc > 8:254231/1‑149 (MQ=255) tctGGCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCCCGGGCACGTATCAGGCCCCCCCCCGGGcg > 7:236562/1‑148 (MQ=255) gCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGc < 8:109496/109‑1 (MQ=255) gCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGc > 7:109496/1‑109 (MQ=255) gCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAg > 5:7999/1‑130 (MQ=255) gCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAg < 6:7999/130‑1 (MQ=255) cAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAGGCCGCCGCGCGGGCCGCGCAg‑g < 4:62096/148‑1 (MQ=255) cAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGA‑‑‑CGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAGGCCGCCGCGCGGGCCGCGCAG‑GGt < 7:254231/147‑1 (MQ=255) aGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAGGCCGCCGCGCGGGCCGCGCAG‑GGt > 6:370470/1‑149 (MQ=255) cTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAGGCCGCCGCGCGGGCCGCGCAG‑GGTCTtg > 8:290171/1‑149 (MQ=255) ttCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGGGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAGGCCGCCGCGCGGGCCGCGCAG‑GGTCTtgt < 4:362781/149‑1 (MQ=255) ttCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAGGCCGCCGCGCGGGCCGCGCAG‑GGTCTtgt > 3:191238/1‑149 (MQ=255) cTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAGGCCGCCACGCGGGCCGCGCAG‑GGTCTTgtggg > 4:334858/1‑149 (MQ=255) ttGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAgg > 5:42914/1‑117 (MQ=255) ttGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAgg < 6:42914/117‑1 (MQ=255) tGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAGGCCGCCGCGCGGGCCGCGCAG‑GGTCTTgtgggtg > 1:180571/1‑149 (MQ=255) gAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAGGCCGCCGCGCGGGCCGCGCAG‑GGTCTTgtgggtgg > 3:376133/1‑149 (MQ=255) gAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAGGCCGCCGCGCGGGCCGCGCAG‑GGTCTTgtgggtg < 5:303061/148‑1 (MQ=255) aaGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAGGCCGCCGCGCGGGCCGCGCAG‑GGTCTTGTGggtggt > 3:325545/1‑149 (MQ=255) gCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAGGCCGCCGCGCGGGCCGCGCAG‑GGTCTTGTGggtggtgg < 8:66356/149‑1 (MQ=255) cAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAGGCCGCCGCGCGGGCCGCGCAG‑GGTCTTGTGggtggtggt < 7:219177/149‑1 (MQ=255) aGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGCCGGCGGAGGGCAGCTTCTTCTCTATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAGGCCGCCGCGCGGGCCGCGCAG‑GGTCTTGTGggttgtggtg < 5:360286/149‑1 (MQ=25) aGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAGGCCGCCACGCGGGCCGCGCAG‑GGTCTTGTGggtggtggtg < 3:334858/149‑1 (MQ=255) ccTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAGGCCGCCGCGCGGGCCGCGCAG‑GGTCTTGTGGGTGGTGGTGGTGAc > 5:339388/1‑148 (MQ=255) ggCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACCGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAGGCCGCCGCGCGGGCCGCGCAG‑GGTCTTGTGGGTGGTGGTGGTGACCACGt > 6:83766/1‑149 (MQ=255) gCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAGGCCGCCGCGCGGGCCGCGCAG‑GGTCTTGTGGGTGGGGGTGGTGACCACGTc < 8:181317/149‑1 (MQ=255) gCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAGGCCGCCGCGCGGGCCGCGCAG‑GGTCTTGTGGGTGGTGGTGGTGACCACGTCGGCGAACGGaa > 1:146855/1‑147 (MQ=255) tCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAGGCCGCCGCGCGGGCCGCGCAG‑GGTCTtgt > 2:1744/1‑112 (MQ=255) tCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAGGCCGCCGCGCGGGCCGCGCAG‑GGTCTtgt < 1:1744/112‑1 (MQ=255) ccAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCCGGGGAAGACGGCGGAGTTCAGGTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCCGGCCGCCGCGCCGGCCGCGCAG‑GGTCTTGTGGGTGGTGGTGGTGACCACGTCGGCGAAc > 1:196626/1‑141 (MQ=21) ccAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAGGCCGCCGCGCGGGCCGCGCAG‑GGTCTTGTGGGTGGTGGTGGTGACCACGTCGGCGAAc < 2:196626/140‑1 (MQ=255) cAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAGGCCGCCGCGCGGGCCGCGCAG‑GGTCTTGTGGGTGGTGGTGGTGACCACGTCGGCGAAc < 4:48882/139‑1 (MQ=255) cAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAGGCCGCCGCGCGGGCCGCGCAG‑GGTCTTGTGGGTGGTGGTGGTGACCACGTCGGCGAAc > 3:48882/1‑139 (MQ=255) gCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAGGCCGCCGCGCGGGCCGCGCAG‑GGTCTTGTGGGTGGTGGTGGTGACCACGTCGGCGAACGGAACAGGGTTc < 2:146855/149‑1 (MQ=255) gCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGGTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAGGCCGCCGCGCGGGCCGCGCAG‑GGTCTTGTGGGTGGTGGTGGTGACCACGTCGGCGAACGGAACAGGGTTc < 4:297172/149‑1 (MQ=255) gggCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAGGCCGCCGCGCGGGCCGCGCAG‑GGTCTTGTGGGTGGTGGTGGTGACCACGTCGGCGAACGGAACAGGGTTCgg > 7:131420/1‑149 (MQ=255) gccgccCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAGGCCGCCGCGCGGGCCGCGCAGCTGTCTTGTGTGTGGTGGTTGTGACCACGTCGGCGAACGGAACAGGGTTCggg < 1:289456/149‑1 (MQ=25) cgccCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAGGCCGCCGCGCGGGCCGCGCAG‑GGTCTTGTGGGTGGTGGTGGTGACCACGTCGGCGAACGGAACAGGGTTCGGGTa > 3:120315/1‑148 (MQ=255) cTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAGGCCGCCGCGCGGGCCGCGCAG‑GGTCTTGTGGGTGGTGTTGGTGACAAAGTCGGCGAAAGGCACAGGGTTAGGGTACACGc > 6:268424/1‑149 (MQ=25) cTGGGCGACA‑GGGAAGACTGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAGGCCGCCGCGCGGGCCGCGCAG‑GGTCTTGTGGGTGGTGGTGGTGACCACGTCGGCGAACGGAACAGGGTTCGGGTACACGc < 8:122114/149‑1 (MQ=255) | CCACGTCGAAACCGCGCTCGATGAACACGCTGGCCATGGCCTGGGCGTTCTTCACGACCTGCTGCTGGTAAGCCTTGAACTCTGGCTGCAGGGCTTCCTTGAAGCAGATGGCCTTGGCCGCGATGACGTGCTCCAGCGGGCCGCCCTGGGCGCCC‑GGGAAGACGGCGGAGTTCAGCTTCTTCTCGATGTCGGCGTTGGCACGGGCCAGGATCAGGCCGCCGCGCGGGCCGCGCAG‑GGTCTTGTGGGTGGTGGTGGTGACCACGTCGGCGAACGGAACAGGGTTCGGGTACACGC > NC_002947/780921‑781214 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |