| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,707 | G→C | 8.0% | D38E (GAC→GAG) | parA ← | chromosome partition protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,707 | 0 | G | C | 8.0% | 214.0 / 8.8 | 75 | D38E (GAC→GAG) | parA | chromosome partition protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/36); new base C (3/3); total (36/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.16e-01 | |||||||||||
CCGGCAGCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTGCGGCG > NC_002947/1562‑1853 | ccGGCAGCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGGCGTAGACCGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCg < 8:231183/149‑1 (MQ=255) agcaACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATcag > 3:113489/1‑149 (MQ=255) gcaACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCTGATCGACCTCGATccg > 4:33671/1‑146 (MQ=255) caACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCTGATCGACCTCGATccgca < 3:346159/149‑1 (MQ=255) caACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATcagca < 1:296013/149‑1 (MQ=255) aaCTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCTGATCGACCTCGATccgcag < 3:33671/149‑1 (MQ=255) aCTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATcagcag > 5:296183/1‑148 (MQ=255) gAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGacac > 3:303883/1‑149 (MQ=255) gAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGacac > 7:82909/1‑149 (MQ=255) tCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCt > 5:54621/1‑149 (MQ=255) ccGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCtt < 3:71218/149‑1 (MQ=255) cGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTg < 6:296183/149‑1 (MQ=255) cTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGAt < 1:251893/126‑1 (MQ=255) cTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGAt > 2:251893/1‑126 (MQ=255) tCGGAGTTGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATc < 7:358611/126‑1 (MQ=255) cGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGca < 1:64793/149‑1 (MQ=255) gtGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGcagccagc > 7:315906/1‑148 (MQ=255) cATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAgg > 5:228362/1‑149 (MQ=255) ccTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGgcggcg < 1:376064/149‑1 (MQ=255) tGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAggcggc > 7:196856/1‑146 (MQ=255) ccAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTg < 4:303883/149‑1 (MQ=255) cAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGa > 1:112217/1‑149 (MQ=255) tCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTg > 7:190022/1‑144 (MQ=255) tCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTg < 8:190022/144‑1 (MQ=255) cGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAg > 8:335645/1‑149 (MQ=255) cccGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTGCGTGATTGTCCAAACCCCTGCCCAGGGTGCCGTTGCCCTGCGGAACGAGGTCGAACACCTGGACACGACCCTTGG‑ACGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTCATACAGGTGttt > 1:247567/1‑149 (MQ=255) cccGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGtt < 6:228362/148‑1 (MQ=255) cccGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTg > 7:317891/1‑149 (MQ=255) gATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCt > 2:370699/1‑149 (MQ=255) gCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGcc < 1:62455/148‑1 (MQ=255) ccggcGTAGACCGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCCGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGGCGATCAGCAGGACACGACGCTGGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGGCTTGCCcac < 4:130288/145‑1 (MQ=255) ggTCGTAGACCGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCcaca < 3:359954/149‑1 (MQ=255) gTAGACCGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCAcaccac > 2:10443/1‑149 (MQ=255) ccGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCTTGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTc < 2:247567/149‑1 (MQ=255) ccGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTc < 2:112217/149‑1 (MQ=255) ccGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGGCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTc < 4:113489/149‑1 (MQ=255) cGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGt > 7:139011/1‑65 (MQ=255) cGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGCTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGc < 1:270192/135‑1 (MQ=255) cGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGc > 2:270192/1‑134 (MQ=255) cGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGAGGATCGAGGt < 8:139011/65‑1 (MQ=255) gAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTg < 1:370699/149‑1 (MQ=255) aaTGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTgg > 4:37635/1‑149 (MQ=255) aaTGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGCTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTgg < 1:10443/149‑1 (MQ=255) tCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTg > 6:248562/1‑143 (MQ=255) tCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTg < 5:248562/143‑1 (MQ=255) cGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTcgc > 7:249090/1‑148 (MQ=255) gAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGt > 3:247305/1‑120 (MQ=255) gAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGt < 4:247305/120‑1 (MQ=255) gAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTcgcg < 2:34684/148‑1 (MQ=255) gCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGGGTGGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGAt < 8:148508/148‑1 (MQ=255) gTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTg < 4:77776/100‑1 (MQ=255) gTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTg > 3:77776/1‑100 (MQ=255) ttGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGaa < 2:147011/146‑1 (MQ=255) ttGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGaa > 1:147011/1‑146 (MQ=255) tCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGACGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCt > 1:264943/1‑148 (MQ=255) acacCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGcc < 2:130175/110‑1 (MQ=255) acCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGAACAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCa > 6:213651/1‑149 (MQ=255) cGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCAtt > 2:51440/1‑149 (MQ=255) cGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCAtt > 1:78508/1‑149 (MQ=255) gCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCAttg < 8:68334/149‑1 (MQ=255) ccATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGc > 7:162246/1‑148 (MQ=255) cATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGc > 4:114921/1‑147 (MQ=255) cATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGa < 2:78508/149‑1 (MQ=255) aTGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCTAATACCTTAGCCATTGTTGCGa < 5:157178/148‑1 (MQ=255) aTGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGc > 6:157178/1‑146 (MQ=255) ggtggCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAgt < 8:317891/148‑1 (MQ=255) gtggCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGcc < 2:128076/95‑1 (MQ=255) gTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGc < 7:279225/138‑1 (MQ=255) gTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGc > 8:279225/1‑138 (MQ=255) gtgtccTGCTGATCGACCTCGATCCGCAGGGCACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAg > 3:328122/5‑149 (MQ=255) ctgctgATCGACCTCGATCCGCAGGGCACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCAt < 4:328122/148‑1 (MQ=255) tGCTGATCGACCTCGATCCGCAGGGCACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGc > 8:230746/1‑149 (MQ=255) tCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTgc < 8:315906/148‑1 (MQ=255) aGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTgcggcg > 4:366725/1‑149 (MQ=255) aGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTgcggcg < 3:37635/149‑1 (MQ=255) | CCGGCAGCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCT‑CGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGG‑TCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTGCGGCG > NC_002947/1562‑1853 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |