| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 853,962 | G→C | 5.4% | E129Q (GAG→CAG) | prmC → | release factor‑(glutamine‑N5) methyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 853,962 | 0 | G | C | 5.4% | 245.4 / 3.5 | 74 | E129Q (GAG→CAG) | prmC | release factor‑(glutamine‑N5) methyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (36/34); new base C (2/2); total (38/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.74e-01 | |||||||||||
GACCTGGAGGTCGCGCCGCATACCCTGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGCCGCGGAGCGTTTCGACC > NC_002947/853815‑854109 | gACCTGGAGGTCGCGCCGCATACCCTGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCagcga < 1:213507/149‑1 (MQ=255)gACCTGGAGGTCGCGCCGCATACCCTGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCagcga < 1:379651/149‑1 (MQ=255)gACCTGGAGGTCGCGCCGCATACCCTGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCagcg < 4:356548/148‑1 (MQ=255) tGGAGGTCGCGCCGCATACCCTGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAgcgc > 3:256279/1‑149 (MQ=255) gAGGTCGCGCCGCATACCCTGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGccc > 8:311211/1‑149 (MQ=255) aGGTCGCGCCGCATACCCTGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTCGCTGGCCAGCGccag < 6:30555/149‑3 (MQ=255) tCGCGCCGCATACCCTGATCCCGTGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGcc < 1:304660/149‑1 (MQ=255) gcgcCGCATACCCTGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCagcgagc > 6:22665/1‑139 (MQ=255) gcgcCGCATACCCTGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCagcgagc < 5:22665/139‑1 (MQ=255) gcgcCGCATACCCTGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTg > 4:105147/1‑149 (MQ=255) gcgcCGCATACCCTGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTg > 4:110514/1‑149 (MQ=255) gcgcCGCATACCCTGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTg > 4:62696/1‑149 (MQ=255) gccgcATACCCTGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTgg > 8:298978/1‑148 (MQ=255) ccgcATACCCTGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTgg > 3:23358/1‑147 (MQ=255) cATACCCTGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGt < 5:159254/149‑1 (MQ=255) cATACCCTGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGt > 5:362362/1‑149 (MQ=255) tACCCTGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGa > 7:120375/1‑149 (MQ=255) ccTGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAg > 7:309743/1‑149 (MQ=255) ccTGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTCGCTGGCCAGCGccaga > 4:143097/1‑131 (MQ=255) ccTGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTCGCTGGCCAGCGccaga < 3:143097/134‑4 (MQ=255) tGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCg > 6:40114/1‑149 (MQ=255) aTCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCg < 8:341378/147‑1 (MQ=255) ccGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCgg > 6:320569/1‑145 (MQ=255) ccGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCgg < 5:320569/145‑1 (MQ=255) ggCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCgg < 5:40114/149‑1 (MQ=255) gATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTaga < 4:23358/149‑1 (MQ=255) ccGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAgagga < 5:51743/148‑1 (MQ=255) gAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGgc > 6:83108/1‑149 (MQ=255) gctgGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGctgctg > 3:18069/1‑149 (MQ=255) gagaCGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGc < 3:200103/149‑1 (MQ=255) agaCGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGcc < 3:62696/149‑1 (MQ=255) aCGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGa < 8:120375/149‑1 (MQ=255) cGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAg < 8:280042/149‑1 (MQ=255) cTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCaa < 5:213215/149‑1 (MQ=255) ttGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGt > 1:106725/1‑118 (MQ=255) ttGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGt < 2:106725/118‑1 (MQ=255) gAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTa > 2:325341/1‑117 (MQ=255) aaCTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCg < 7:74455/148‑1 (MQ=255) cTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCa > 8:347339/1‑149 (MQ=255) cTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCCCAACCGctg > 6:210012/1‑147 (MQ=255) aaCCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGt < 3:213838/91‑1 (MQ=255) aaCCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGt > 4:213838/1‑91 (MQ=255) cccGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCGGtt < 7:311211/149‑1 (MQ=255) ccGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCGGTTg < 5:83108/149‑1 (MQ=255) cGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCGGTTgg < 8:309743/149‑1 (MQ=255) cGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCGGTTgc < 3:105147/149‑2 (MQ=255) cGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCGGTTgc < 3:110514/149‑2 (MQ=255) gCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCGGTTggg > 2:178824/1‑149 (MQ=255) gCTTCGCCCACCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCGGTTggg > 7:217884/1‑149 (MQ=255) cgcccgccAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCCCAACCGCTGGCGGTTgcgct < 5:210012/147‑2 (MQ=255) gcccgccAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCGGTTGGGCCTgg < 4:18069/149‑1 (MQ=255) gcccgccAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCGGTTGGGCCTgg < 6:362362/149‑1 (MQ=255) cccgccAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCGGTTGGGCCTg < 5:282293/147‑1 (MQ=255) cccgccAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCGGTTGGGCCTg < 5:277120/147‑1 (MQ=255) cccgccAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCGGTTGGGCCTg > 6:277120/1‑147 (MQ=255) cccgccAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCGGTTGGGCCTg > 6:282293/1‑147 (MQ=255) aGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCGGTTgg < 5:44928/135‑1 (MQ=255) aGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCGGTTgg > 6:44928/1‑135 (MQ=255) aGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCt > 1:368482/1‑149 (MQ=255) ccTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACg > 7:90900/1‑137 (MQ=255) ccTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACg < 8:90900/137‑1 (MQ=255) ccTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGc < 7:347339/149‑1 (MQ=255) gTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGc < 8:217884/149‑1 (MQ=255) ggTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTg > 1:36420/1‑149 (MQ=255) gTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCgg > 1:225498/1‑110 (MQ=255) gTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCgg < 2:225498/110‑1 (MQ=255) gTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTgg < 1:178824/149‑1 (MQ=255) gTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTgg > 5:253011/1‑149 (MQ=255) tGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGa > 2:63943/1‑147 (MQ=255) tGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGa > 4:119613/1‑147 (MQ=255) aTCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCt > 2:177126/1‑149 (MQ=255) ctctGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTc < 5:109071/137‑1 (MQ=255) ctctGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTc > 6:109071/1‑137 (MQ=255) ctctGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGcc > 6:85062/1‑149 (MQ=255) cgggCGCTCGCTGGCCAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGCcgc > 1:183498/3‑149 (MQ=255) cgcTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGCCGCGGAg > 1:255076/1‑149 (MQ=255) gCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGCCGCGGAGCGttt < 3:175453/149‑1 (MQ=255) gCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGCCGCGGAGCGtt < 1:63943/148‑1 (MQ=255) cAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGCCGCGGAGCGTTTc > 2:192266/1‑148 (MQ=255) agcgagcgCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGCCGCGGAGCGTTTCGa < 7:298978/149‑1 (MQ=255) cgagcgCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGCTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGCAGAGGAGCGTTTCTAca > 2:277360/1‑148 (MQ=255) | GACCTGGAGGTCGCGCCGCATACCCTGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAGGTTCTCGACCTGGGTACCGGTACGGGTGCCATCGCTCTGGCGCTGGCCAGCGAGCGCCCGGCCTGGCAGGTGACAGCGGTTGACCGGGTAGAGGAGGCTGCTGCCCTCGCCGAGCGCAACCGCCAGCGGTTGGGCCTGGCCAACGCTCGGGTACGGCTGAGCCACTGGTTCGACAGCCTGGCCGCGGAGCGTTTCGACC > NC_002947/853815‑854109 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |