| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 964,478 | T→A | 6.1% | L95* (TTG→TAG) ‡ | phnE → | phosphonate ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 964,478 | 0 | T | A | 6.1% | 242.3 / 5.1 | 82 | L95* (TTG→TAG) ‡ | phnE | phosphonate ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (37/39); new base A (3/2); total (40/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.75e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.56e-01 | |||||||||||
GCAGATTGCCAGCTTCACCAGCGCCTTCTGGCCGCCGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGATTTTCCTGCGTAGCGTGCCGGAAATCGTCTGGGCGTTGCTGTTCGTGCGC > NC_002947/964332‑964626 | gcagATTGCCAGCTTCACCAGCGCCTTCTGGCCGCCGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGc > 1:177241/1‑149 (MQ=255)gcagATTGCCAGCTTCACCAGCGCCTTCTGGCCGCCGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGc > 6:240993/1‑149 (MQ=255) cagATTGCCAGCTTCACCAGCGCCTTCTGGCCGCCGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCt < 8:94932/149‑1 (MQ=255) cagATTGCCAGCTTCACCAGCGCCTTCTGGCCGCCGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCt > 6:304915/1‑149 (MQ=255) gATTGCCAGCTTCACCAGCGCCTTCTGGCCGCCGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTgg < 5:103871/149‑1 (MQ=255) ccAGCTTCACCAGCGCCTTCTGGCCGCCGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCCAGCAAGCCAGc < 8:30918/149‑1 (MQ=255) aGCTTCACCAGCGCCTTCTGGCCGCCGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCCAGCAAGCCAGCCg < 5:91017/149‑1 (MQ=255) cTTCACCAGCGCCTTCTGGCCGCCGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTg > 8:180376/1‑149 (MQ=255) cTTCACCAGCGCCTTCTGGCCGCCGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCAGGCCCTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCAGGCTTGCTGGCCAGCCGTg > 7:263808/1‑149 (MQ=255) cACCAGCGCCTTCTGGCCGCCGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCt > 3:121403/1‑149 (MQ=255) ccAGCGCCTTCTGGCCGCCGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGcc < 6:320785/141‑1 (MQ=255) ccAGCGCCTTCTGGCCGCCGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGcc > 5:320785/1‑141 (MQ=255) cAGCGCCTTCTGGCCGCCGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTg < 7:205228/133‑1 (MQ=255) cAGCGCCTTCTGGCCGCCGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTg > 8:205228/1‑133 (MQ=255) cAGCGCCTTCTGGCCGCCGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGt > 7:3553/1‑149 (MQ=255) aGCGCCTTCTGGCCGCCGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTc < 4:316310/149‑1 (MQ=255) gcgcCTTCTGGCCGCCGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGc < 7:232049/129‑1 (MQ=255) gcgcCTTCTGGCCGCCGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGc > 8:232049/1‑129 (MQ=255) ttCTGGCCGCCGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACACTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCg > 5:295235/1‑149 (MQ=255) gccgccGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGtg < 6:345097/146‑1 (MQ=255) cgGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCa > 2:82404/1‑149 (MQ=255) atgatgCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACgcggc > 2:249864/1‑149 (MQ=255) atgCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGACGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTACTTCACGcggcgg < 7:100235/148‑1 (MQ=255) atgCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGcggcgg < 7:160631/148‑1 (MQ=255) ccGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCggcgggcg < 5:304915/148‑1 (MQ=255) cGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGcgggcggg < 1:82404/149‑1 (MQ=255) gATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCgggcgggc < 8:3553/149‑1 (MQ=255) aTTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGcgggcggg > 8:135078/1‑147 (MQ=255) aTTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGcgggcggg < 7:135078/147‑1 (MQ=255) aTTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGcgggcc < 1:249864/149‑1 (MQ=255) ttttCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGcgggccg < 4:121403/149‑1 (MQ=255) tgctgTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCAGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTcg > 6:242649/1‑149 (MQ=255) tGAAGCGACCTTGCAGACCCAGGCCGTGCCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTg < 7:74771/148‑1 (MQ=255) gAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGtt > 1:232491/1‑149 (MQ=255) aaGCTAGCTTGCTGACGCTGGCCTTGGCTTCTGCCGTCATGGCGCTGTCGTTGTTTTTGGCGATCCCGGCTTGCTTGCTGGCCAGCCGTGGCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGTCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTg < 2:357786/149‑1 (MQ=255) aGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTgc > 1:337518/1‑149 (MQ=255) aCCTTGCAGACTCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGa > 3:144064/1‑138 (MQ=255) aCCTTGCAGACACTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGa < 4:144064/138‑1 (MQ=255) cTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGc < 7:180376/149‑1 (MQ=255) cTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGc > 7:64541/1‑149 (MQ=255) cTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGc < 2:177241/149‑1 (MQ=255) ttGCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGcc > 4:89621/1‑149 (MQ=255) gCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCg < 8:64541/148‑1 (MQ=255) aGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACgcggc > 7:26023/1‑107 (MQ=255) aGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACgcggc < 8:26023/107‑1 (MQ=255) ccTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTg > 7:21721/1‑149 (MQ=255) ccTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTg > 4:67444/1‑149 (MQ=255) ccTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTg > 7:16133/1‑149 (MQ=255) ccTGGCCGTGGCGACTGCCGGCAAGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGTCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGGTGCGCCTGCCGGTGCGTg > 7:272400/1‑149 (MQ=255) tGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTggg > 5:272888/1‑149 (MQ=255) ggCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGc < 5:240993/149‑1 (MQ=255) ccGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTGGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGTCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTa < 6:295235/149‑1 (MQ=255) gTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACt < 3:347516/149‑1 (MQ=255) ggCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGa < 6:272888/149‑1 (MQ=255) gACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGAttt > 2:118034/1‑149 (MQ=255) cTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGATTTTc > 2:192827/1‑149 (MQ=255) tGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGtgctg > 3:89945/1‑69 (MQ=255) tGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGtgctg < 4:89945/69‑1 (MQ=255) ggCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGAGTGGGCTACTGATTTTCCTGCGTAGc < 1:5792/148‑1 (MQ=255) ggtGGGGTTGTGGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCGGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGGGGGCGGGGCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGATTTTCCTGCGTAGCGTGc < 8:263808/147‑1 (MQ=255) cTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGATTTTCCTGCGTAGCGTGcc < 3:89621/149‑1 (MQ=255) ggCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGATTTTCCTGCGTAGCGTGCCgg < 5:242649/149‑1 (MQ=255) ggCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGATTTTCCTGCGTAGCGTGCCg > 1:266941/1‑148 (MQ=255) ggCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGATTTTCCTGCGTAGCGTGCCg < 2:266941/148‑1 (MQ=255) gCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGATTTTCCTGCGTAGCGTGCCgg > 3:294146/1‑148 (MQ=255) ttgttgGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGATTTTCCTGCGTAGCGTGCCGGAAATCGt < 1:192827/149‑1 (MQ=255) ttgGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCCCGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGATTTTCCTGCGTAGCGTGCCGGAAATCGTCTg < 2:232491/149‑1 (MQ=255) gATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGTCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGATTTTCCTGCGTAGCGTGGAGGAAATCGTCTGGGCGt > 2:31191/1‑149 (MQ=255) aTCCAGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCTGGCGGGCCTGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGATTTTGCAGCGTAGCTTGCCGGAAATCGTCTGGGCGtt < 1:31191/149‑1 (MQ=255) tCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGATTTTCCTGCGTAGCGTGCCGGAAATCGTCTGGGCGTTg > 3:202473/1‑149 (MQ=255) gcacGGCTGGCCAGCAAGCCAGCCGGGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGATTTTCCTGCGTAGCGTGCCGGAAATCGTCTGGGCGTTg > 3:368414/4‑149 (MQ=255) cccGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGATTTTCCTGCGTAGCGTGCCGGAAATCGTCTGGGCGTTg < 2:337518/148‑1 (MQ=255) cacGGCTGGCCAGCAAGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGATTTTCCTGCGTAGCGTGCCGGAAATCGTCTGGGCGTTGc > 7:211630/3‑149 (MQ=255) ccGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGATTTTCCTGCGTAGCGTGc < 3:229469/127‑1 (MQ=255) ccGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGATTTTCCTGCGTAGCGTGc > 4:229469/1‑127 (MQ=255) ccGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGATTTTCCTGCGTAGCGTGCCGGAAATCGTCTGGGCGTTGCt > 3:291812/1‑149 (MQ=255) acGGCTGGCCAGCAAGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCAAGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGATTTTACTGCGTAGCGTGCCGGAAATCGTCTGGGCGTTGCt > 6:39789/2‑149 (MQ=255) cGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGtt < 5:33499/82‑1 (MQ=255) cGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGtt > 6:33499/1‑82 (MQ=255) cGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGATTTTCCTGCGTAGCGTGCCGGAAATCGTCTGGGCGTTGCTg > 6:147501/1‑149 (MQ=255) ctggctTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGATTTTCCTGCGTAGCGTGCCGGAAATCGTCTGGGCGNTGCTGTTc < 8:21721/149‑1 (MQ=255) ctggctTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGGGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGATTTTCCTGCGTAGCGTGCCGGAAATCGTCTGGGCGTTGCTGTTc < 8:16133/149‑1 (MQ=255) tGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGATTTTCCTGCGTAGCGTGCCGGAAATCGTCTGGGCGTTGCTGTTCGTgcgc > 5:109849/1‑149 (MQ=255) | GCAGATTGCCAGCTTCACCAGCGCCTTCTGGCCGCCGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGACTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGATTTTCCTGCGTAGCGTGCCGGAAATCGTCTGGGCGTTGCTGTTCGTGCGC > NC_002947/964332‑964626 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |