| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 999,625 | C→G | 7.9% | G165A (GGC→GCC) | PP_0861 ← | outer membrane ferric siderophore receptor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 999,625 | 0 | C | G | 7.9% | 231.4 / 8.5 | 76 | G165A (GGC→GCC) | PP_0861 | outer membrane ferric siderophore receptor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/36); new base G (3/3); total (37/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.95e-01 | |||||||||||
GCGACCGGCAACGGTATCGCTGAACTGGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGC‑GCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTCGAAGCCGCGGATGAACGGGCGGTCACC > NC_002947/999480‑999773 | gCGACCGGCAACGGTATCGCTGAACTGGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGC‑GCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGgccgcgccgc > 2:47360/1‑149 (MQ=255)gCGACCGGCAACGGTATCGCTGAACTGGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGC‑GCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGgccgcgccgc < 5:242001/149‑1 (MQ=255)gCGACCGGCAACGGTATCGCTGAACTGGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGC‑GCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGGCCCGCGCGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGgccgcgccgc > 8:291726/1‑149 (MQ=255) cGACCGGCAACGGTATCGCTGAACTGGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGC‑GCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGccgcgccgcg < 1:47360/149‑1 (MQ=255) cGGCAACGGTATCGCTGAACTGGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGC‑GCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCa > 2:98845/1‑149 (MQ=255) gCAACGGTATCGCTGAACTGGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGCGGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCAc > 1:264253/1‑149 (MQ=255) gCAACGGTATCGCTGAACTGGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGC‑GCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCAcc > 7:194672/1‑149 (MQ=255) gCAACGGTATCGCTGAACTGGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGC‑GCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCAcc > 6:69722/1‑149 (MQ=255) ggTATCGCTGAACTGGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGC‑GCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATgg < 2:155850/149‑1 (MQ=255) cGCTGAACTGGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGC‑GCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGGCGCGGccggcg < 1:90522/140‑5 (MQ=255) cGCTGAACTGGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGC‑GCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGGCGCGGccggcg > 2:90522/1‑136 (MQ=255) gCTGAACTGGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGC‑GCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCTGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAg < 2:97516/148‑1 (MQ=255) gCTGAACTGGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGC‑GCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGt > 6:91242/1‑149 (MQ=255) tGAACTGGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGC‑GCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑c > 1:173056/1‑149 (MQ=255) aaCTGGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGC‑GCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑Cgg > 6:240768/1‑149 (MQ=255) tAGTTGCCATCGAAGGTGTAGC‑GCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCtt < 4:90854/149‑1 (MQ=255) gTTGCCATCGAAGGTGTAGC‑GCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTg < 6:71676/148‑1 (MQ=255) gTTGCCATCGAAGGTGTAGC‑GCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTg < 2:264253/148‑1 (MQ=255) ttGCCATCGAAGGTGTAGC‑GCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGc < 4:275987/149‑1 (MQ=255) tCGAAGGTGTAGC‑GCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCACtt > 2:110132/1‑148 (MQ=255) tCGAAGGTGTAGC‑GCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCACTTc < 7:19554/149‑1 (MQ=255) gAAGGTGTAGC‑GCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCACTTCaa < 5:91242/149‑1 (MQ=255) gAAGGTGTAGC‑GCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCGTGGCCCCTTcca > 4:218649/1‑147 (MQ=255) aaGGTGTAGC‑GCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCACTTCAAc < 3:218649/149‑1 (MQ=255) tAGC‑GCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCtt < 6:340084/131‑1 (MQ=255) tAGC‑GCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCtt > 5:340084/1‑131 (MQ=255) cTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATgg < 8:101088/149‑1 (MQ=255) ggTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGc < 5:69722/147‑1 (MQ=255) gTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGaa < 2:173196/149‑1 (MQ=255) gTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGaa < 3:129038/149‑1 (MQ=255) tCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCGCTTCAACAGATTCGATGGCg > 1:290331/1‑146 (MQ=255) tCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGAt > 6:169135/1‑137 (MQ=255) tCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGAt < 5:169135/137‑1 (MQ=255) tCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCg > 8:320159/1‑146 (MQ=255) tCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTc > 6:124675/1‑149 (MQ=255) cGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTcg < 5:240768/149‑1 (MQ=255) gCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTcgc > 4:43238/1‑149 (MQ=255) ccccAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGTCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCgg < 3:43238/147‑1 (MQ=255) ccccAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGt < 1:110132/149‑1 (MQ=255) ccAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGttt > 5:231568/1‑149 (MQ=255) ggTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTggg < 1:65511/149‑1 (MQ=255) gTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGgc > 7:337362/1‑149 (MQ=255) tCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGgc < 1:98845/149‑1 (MQ=255) 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cAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGaa > 5:361436/1‑117 (MQ=255) cccAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCTCTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAg < 2:290331/149‑1 (MQ=255) cccAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCa < 7:291726/148‑1 (MQ=255) cccAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCa < 2:59056/148‑1 (MQ=255) ccAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGTCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCa < 3:84356/147‑1 (MQ=255) ccAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTAGCGGGTATGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAg > 4:84356/1‑148 (MQ=255) gATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTaa < 6:49101/149‑1 (MQ=255) gcgcgcgcTTGCTTACCTGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGAGGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCTTCTTCACCAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGGTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCg < 1:299284/137‑1 (MQ=255) gcgcgcgcATCCTTACCAGGTTGAAGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCCCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTAGGCCACTTCAACAGATTCCATGGCGAAGATTTAGCGGGATTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCg > 2:299284/1‑137 (MQ=255) gcgcTTGCTTACCAGGTTGATGGTACACGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGgc > 1:3684/1‑115 (MQ=255) gcgcTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGgc < 2:3684/114‑1 (MQ=255) 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atcggtggccgCGGCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGc > 3:138701/7‑132 (MQ=255) atcggtggccgCGGCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGc < 4:138701/126‑1 (MQ=255) gtggccgCGGCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTCGAAGCCGCgg < 8:154675/139‑1 (MQ=255) gtggccgCGGCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTCGAAGCCGCgg > 7:154675/3‑141 (MQ=255) gccgcgccgcGGCCACCGATTGCCGTGTT‑CGGCGCCTTTGTCACTTCAACATTTTCGATGGTGAAGATTTCGCGGGTTTGGGTGCCAGTGTCACGCTCTCAGTCCAGGTAAGTATAGCCCTGGGCGTCGAAGCCGCGGATGAAGGGGCg < 6:291902/149‑1 (MQ=255) gccgcgccgcGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTCGAAGCCGCGGATGAACGGGCg < 6:231568/149‑1 (MQ=255) ccgcgccgcgGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTCGAAGCCGCGGATGAACGGGCgg > 7:356042/1‑149 (MQ=255) cgcgccgcgGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTCGAAGCCGCGGATGAACGGGCGGt > 2:351551/1‑149 (MQ=255) cgccgcgGCCACCGATGGCCGAGGT‑CGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGGTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTCGAAGCCGCGGATGAACGGGCGGTCa < 7:320235/149‑1 (MQ=255) ccgcgGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTCGAAGCCGCGGATGAACGGGCGGTCAcc > 5:367173/1‑149 (MQ=255) | GCGACCGGCAACGGTATCGCTGAACTGGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGC‑GCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTAC‑CGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTT‑CGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTCGAAGCCGCGGATGAACGGGCGGTCACC > NC_002947/999480‑999773 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |