| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,034,086 | G→A | 6.7% | E41E (GAG→GAA) | PP_0892 → | phospholipase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,034,086 | 0 | G | A | 6.7% | 221.8 / 5.1 | 74 | E41E (GAG→GAA) | PP_0892 | phospholipase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (38/31); new base A (2/3); total (40/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.56e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.52e-01 | |||||||||||
CTGATCTTCACTGCGCGCTGACATGGCGGGGCCGG‑TCTTCCCCTGGCGGGATGGCAATCAGTTCGAACTGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGCCCGGCGTGGCGTGCGGGTGCGGTGCCTGTTCGATGACTACGGTTCATTGGCCTTCAACAGCGCGTTGCGTCAGCGCCTGCTGGACG > NC_002947/1033942‑1034234 | cTGATCTTCACTGCGCGCTGACATGGCGGGGCCGG‑TCTTCCCCTGGCGGGATGGCAATCAGTTCGAACTGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCTATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGt < 5:105871/149‑1 (MQ=255)cTGATCTTCACTGCGCGCTGACATGGCGGGGCCGG‑TCTTCCCCTGGCGGGATGGCAATCAGTTCGAACTGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGt < 5:340815/149‑1 (MQ=255)cTGATCTTCACTGCGCGCTGACATGGCGGGGCCGG‑TCTTCCCCTGGCGGGATGGCAATCAGTTCGAACTGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTCAACCTGGAACtc < 7:356001/148‑2 (MQ=255) aTCTTCACTGCGCGCTGACATGGCGGGGCCGG‑TCTTCCCCTGGCGGGATGGCAATCAGTTCGAACTGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTAcc > 7:53486/1‑149 (MQ=255) ttCACTGCGCGCTGACATGGCGGGGCCGG‑TCTTCCCCTGGCGGGATGGCAATCAGTTCGAACTGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTgg > 2:205407/1‑149 (MQ=255) cACTGCGCGCTGACATGGCGGGGCCGG‑TCTTCCCCTGGCGGGATGGCAATCAGTTCGAACTGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTAcc < 8:1967/144‑1 (MQ=255) aCTGCGCGCTGACATGGCGGGGCCGG‑TCTTCCCCTGGCGGGATGGCAATCAGTTCGAACTGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTc < 2:16427/148‑1 (MQ=255) tGCGCGCTGACATGGCGGGGCCGGTTCTTCCCCTGGCGGGATGGCAATCAGTTCGAACTGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTc > 7:237522/1‑147 (MQ=255) tGCGCGCTGACATGGCGGGGCCGG‑TCTTCCCCTGGCGGGATGGCAATCAGTTCGAACTGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAg > 2:41226/1‑149 (MQ=255) cgcgcTGACATGGCGGGGCCGG‑TCTTCCCCTGGCGGGATGGCAATCAGTTCGAACTGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGc < 1:205407/149‑1 (MQ=255) gcgcTGACATGGCGGGGCCGG‑TCTTCCCCTGGCGGGATGGCAATCAGTTCGAACTGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTCAACCTGGAACtc > 7:48204/1‑133 (MQ=255) gcgcTGACATGGCGGGGCCGG‑TCTTCCCCTGGCGGGATGGCAATCAGTTCGAACTGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTCAACCTGGAACtc < 8:48204/134‑2 (MQ=255) cTGACATGGCGGGGCCGG‑TCTTCCCCTGGCGGGATGGCAATCAGTTCGAACTGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGt < 1:85371/149‑1 (MQ=255) aCATGGCGGGGCCGG‑TCTTCCCCTGGCGGGATGGCAATCAGTTCGAACTGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGcc > 6:99212/1‑149 (MQ=255) tGGCGGGGCCGG‑TCTTCCCCTGGCGGGATGGCAATCAGTTCGAACTGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCtgt < 5:298489/149‑1 (MQ=255) ggCGGGGCCGG‑TCTTCCCCTGGCGGGATGGCAATCAGTTCGAACTGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCtgtg > 2:292476/1‑149 (MQ=255) gCGGGGCCGG‑TCTTCCCCTGGCGGGATGGCAATCAGTTCGAACTGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCtgtg < 1:41226/148‑1 (MQ=255) gCCGG‑TCTTCCCCTGGCGGGATGGCAATCAGTTCGAACTGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTAcc > 6:367524/1‑122 (MQ=255) g‑TCTTCCCCTGGCGGGATGGCAATCAGTTCGAACTGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCggt > 3:315177/1‑149 (MQ=255) g‑TCTTCCCCTGGCGGGATGGCAATCAGTTCGAACTGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCggt < 5:99212/149‑1 (MQ=255) ttCTTCCCCTTGCGGGATGGCAATCAGTTCGAACTGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATTCGTGCCGAGTTCCATGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCggt < 6:161402/148‑1 (MQ=255) ttCCCCTGGCGGGATGGCAATCAGTTCGAACTGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCggtggt > 6:276866/1‑149 (MQ=255) ccccTGGCGGGATGGCAATCAGTTCGAACTGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTc < 1:292476/148‑1 (MQ=255) cccTGGCGGGATGGCAATCAGTTCGAACTGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGa > 1:244411/1‑149 (MQ=255) ccTGGCGGGATGGCAATCAGTTCGAACTGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTc > 3:268117/1‑116 (MQ=255) ccTGGCGGGATGGCAATCAGTTCGAACTGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTc < 4:268117/116‑1 (MQ=255) ccTGGCGGGATGGCAATCAGTTCGAACTGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGAGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGAc > 4:304161/1‑149 (MQ=255) tGGCAATCAGTTCGAACTGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACGTGGTCGATGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGc < 7:324104/149‑1 (MQ=255) cAATCAGTTCGAACTGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAgg < 4:143865/149‑1 (MQ=255) aaTCAGTTCGAACTGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGa > 8:227093/1‑134 (MQ=255) aaTCAGTTCGAACTGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGa < 7:227093/134‑1 (MQ=255) aaTCAGTTCGAACTGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGc > 1:213583/1‑149 (MQ=255) gAACTGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGCCCggc < 8:53486/148‑1 (MQ=255) gAACTGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCAGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGATGCCGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGACCggct > 8:346298/1‑148 (MQ=255) cTGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTAGAgg < 4:255300/94‑1 (MQ=255) cTGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTAGAgg > 3:255300/1‑94 (MQ=255) cTGCTTATCGACGGCCATGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGCCCggcgtgg > 2:178264/1‑149 (MQ=255) tGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGCCCggcgtggc > 3:9048/1‑149 (MQ=255) cTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGCCCggcgtggc < 5:276866/147‑1 (MQ=255) tCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGCCCGGCGTGGCgtgcgg > 4:326044/1‑149 (MQ=255) aCGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGCCCGGCGTGGCgtgcgggtg < 3:326044/149‑1 (MQ=255) ggCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGCGCAGGCTGCCCGGCGTGGCgtgcgggtgcg > 4:204245/1‑149 (MQ=255) cccTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGCCCGGCGTGGCGTGCGggtgcggt < 8:237522/149‑1 (MQ=255) gCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGCCCGGCGTGGCGTGCGGGTGCGGTGCCt > 5:71577/1‑149 (MQ=255) ttCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGCCCGGCGTGGCGTGCGGGTGCGGTGCCTGtt < 2:244411/149‑1 (MQ=255) ttCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGCCCGGCGTGGCGTGCGGGTGCGGTGCCTGtt > 4:346971/1‑149 (MQ=255) tCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGCCCGGCGTGGCGTGCGGGTGCGGTGCCTGTTCg < 5:141136/146‑1 (MQ=255) gcgcATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGCCCGGCGTGGCGTGCGGGTGCGGTGCCTGTTCGATGAc > 3:372307/1‑148 (MQ=255) tCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACACTCTGGAGCAGGCTGCCCg > 5:63644/1‑106 (MQ=255) cTGGCTATAATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTTGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGGTCCTATTCGTGTGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTTCCCGGCGTGTCGTGCGGGTGCTGTGACTGTTCGATGACTACGGTTCAtt < 8:222853/149‑1 (MQ=255) cTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGCCCGGCGTGGCGTGCGGGTGCGGTGCCTGTTCGATGACTACGGTTCAtt > 5:368208/1‑149 (MQ=255) cTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGCCCGGCGTGGCGTGCGGGTGCGGTGCCTGTTCGATGACTACGGTTCAt < 6:71577/148‑1 (MQ=255) gCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGCCCGGCGTGGCGTGCGggtgcggt < 2:28381/121‑1 (MQ=255) gCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGCCCGGCGTGGCGTGCGggtgcggt > 1:28381/1‑121 (MQ=255) gCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGCCCGGCGTGGCGTGCGGGTGCGGTGCCTGTTCGATGACTACGGTTCATTg < 4:315177/147‑1 (MQ=255) gATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGCCCGGCGTGGCGTGCGGGTGCGGTGCCTGTTCGATGACTACGGTTCATTGGCCt > 4:321694/1‑149 (MQ=255) cATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGCCCGGCGTGGCGTGCGGGTGCGGTGCCTGTTCGATGACTACGGTTCATTGGCCTTc > 6:186309/1‑148 (MQ=255) gCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGCCCGGCGTGGCgtgcgggt > 4:73707/1‑108 (MQ=255) gCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGCCCGGCGTGGCgtgcgggt < 3:73707/108‑1 (MQ=255) cGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGCCCGGCGTGGCGTGCGGGTGCGGTGCCTGTTCGATGACTACGGTTCATTGGCCTTCAACa < 1:178264/148‑1 (MQ=255) gCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGCCCGGCGTGGCGTGCGGGTGCGGTGCCTGTTCGATGACTACGGTTCATTGGCCTTCAACAgcgc > 2:305412/1‑149 (MQ=255) cGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGCCCGGCGTGGCGTGCGGGTGCGGTGCCTGTTCGATGACTACGGTTCATTGGCCTTCAACAGCGCGt > 6:142302/1‑149 (MQ=255) aGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGCCCGGCGTGGCGTGCGGGTGCGGTGCCTGTTCGATGACTACGGTTCATTGGCCTTCAACAGCGCGTTg > 2:36025/1‑149 (MQ=255) tctCCAGGTCTACCTGGAACTGTACCTGGTCGAGGCCTGTGCCTGTGCCGAGGCGGTTGTCGACGCGCTGGATGAGGCTGCCCGGCGTGGCGTGCGTGTGCGGTGCCTGTTCGATGACTACGGTTCATTGGCCTTCaa < 5:335083/136‑1 (MQ=255) gctCCAGGTAAACCTGGAACTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGCCCGGCGTGGCGTGAGGGTGCGGTGACTGTTCGATGACTACGGTTCATTGGCCATCaa > 6:335083/3‑138 (MQ=255) ccAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGCCCGGCGTGGCGTGCGGGTGCGGTGCCTGTTCGATGACTACGGTTCATTGGCCTTCAACAGCGCGTTGCGt < 7:346298/148‑1 (MQ=255) ggTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGCCCGGCGTGGCGTGCGGGTGCGGTGCCTGTTCGATGACTACGGTTCATTGGCCTTCAACAGCGCGTTGCGTCAgc < 5:142302/149‑1 (MQ=255) gTTGACCTGGAGCTGTACCTGTTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGCCCGGCGTGGAGTGAGGGTGCGGTGCCTGTTCGATGACTAAGGTTCATTGGCATTCAACAGCGCGTTGCGTCAgcg > 2:324842/1‑149 (MQ=255) gACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGCCCGGCGTGGCGTGCGGGTGCGGTGCCTGtt > 7:363147/1‑101 (MQ=255) gACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGCCCGGCGTGGCGTGCGGGTGCGGTGCCTGtt < 8:363147/101‑1 (MQ=255) ccTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCTAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGCCCGGCGTGGCGTGCGGGTGCGGTGCCTGTTCGATGACTACGGTTCATTGGCCTTCAACAGCGCGTTGCGTCAGCGCctgc > 2:297694/1‑149 (MQ=255) cTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGCCCGGCGTGGCGTGCGGGTGCGGTGCCTGTTCGATGACTACGGTTCATTGGCCTTCAACAGCGCGTTGCGTCAGCGCctgct > 2:48050/1‑149 (MQ=255) tGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGCCCGGCGTGGCGTGCGGGTGCGGTGCCTGTTCGATGACTACGGTTCATTGGCCTTCAACAGCGCGTTGCGTCAGCGCctgctg > 1:183195/1‑149 (MQ=255) aGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGCCCGGCGTGGCGTGCGGGTGCGGTGCCTGTTCGATGACTACGGTTCATTGGCCTTCAACAGCGCGTTGCGTCAGCGCCTGCTGGAc > 8:181308/1‑149 (MQ=255) gCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGCCCGGCGTGGCGTGCGGGTGCGGTGCCTGTTCGATGACTACGGTTCATTGGCCTTCAACAGCGCGTTGCGTCAGCGCCTGCTGGACg > 6:87771/1‑149 (MQ=255) | CTGATCTTCACTGCGCGCTGACATGGCGGGGCCGG‑TCTTCCCCTGGCGGGATGGCAATCAGTTCGAACTGCTTATCGACGGCCCTGCGTTCTTTCCGCGCATGCTCCTGGCGATCATGCGTGCCGAGTTCCAGGTTGACCTGGAGCTGTACCTGGTCGAGGCCGGTGCCTGTGCCGAGGCGGTGGTCGACGCGCTGGAGCAGGCTGCCCGGCGTGGCGTGCGGGTGCGGTGCCTGTTCGATGACTACGGTTCATTGGCCTTCAACAGCGCGTTGCGTCAGCGCCTGCTGGACG > NC_002947/1033942‑1034234 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |