| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,076,738 | G→C | 5.3% | Q39H (CAG→CAC) | mreC → | cell shape‑determining protein MreC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,076,738 | 0 | G | C | 5.3% | 241.7 / 3.9 | 75 | Q39H (CAG→CAC) | mreC | cell shape‑determining protein MreC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (31/40); new base C (2/2); total (33/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.34e-01 | |||||||||||
CCCTTCGCTGGGCGTTCGCCTGCTCGTTCTGGTGGTGATGTCGGTCGCGTTGATGGTTGTCGACGCGCGCTTCGACGTGCTCAAACCCGTGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCGAAGCCCTGCTGCTGCAGGGGCGCCTGCAGAAGCTGGCGGCCCTGACCGAGCAGAACGTGCGGCTGCGCGAGT > NC_002947/1076591‑1076886 | cccTTCGCTGGGCGTTCGCCTGCTCGTTCTGGTGGTGATGTCGGTCGCGTTGATGGTTGTCGACGCGCGCTTCGACGTGCTCAAACCCGTGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGc < 2:173346/149‑1 (MQ=255) ccTTCGCTGGGCGTTCGCCTGCTCGTTCTGGTGGTGATGTCGGTCGCGTTGATGGTTGTCGACGCGCGCTTCGACGTGCTCAAACCCGTGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCg < 8:258274/149‑1 (MQ=255) cTTCGCTGGGCGTTCGCCTGCTCGTTCTGGTGGTGATGTCGGTCGCGTTGATGGTTGTCGACGCGCGCTTCGACGTGCTCAAACCCGTGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGt < 7:355275/149‑1 (MQ=255) cTTCGCTGGGCGTTCGCCTGCTCGTGCTGGTGGTGATGTCGGTCGCGTTGAGGGTTGTCGACGCGCGCTTCGACGTGCTCAAACCCGTGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGt < 6:301242/149‑1 (MQ=255) gCTGGGCGTTCGCCTGCTCGTTCTGGTGGTGATGTCGGTCGCGTTGATGGTTGTCGACGCGCGCTTCGACGTGCTCAAACCCGTGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCt < 1:231707/149‑1 (MQ=255) gggCGTTCGCCTGCTCGTTCTGGTGGTGATGTCGGTCGCGTTGATGGTTGTCGACGCGCGCTTCGACGTGCTCAAACCCGTGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGc < 4:276536/149‑1 (MQ=255) ggCGTTCGCCTGCTCGTTCTGGTGGTGATGTCGGTCGCGTTGATGGTTGTCGACGCGCGCTTCGACGTGCTCAAACCCGTGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGc > 2:309209/1‑148 (MQ=255) cGTTCGCCTGCTCGTTCTGGTGGTGATGTCGGTCGCGTTGATGGTTGTCGACGCGCGCTTCGACGTGCTCAAACCCGTGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAg < 1:1370/149‑1 (MQ=255) ttCGCCTGCTCGTTCTGGTGGTGATGTCGGTCGCGTTGATGGTTGTCGACGCGCGCTTCGACGTGCTCAAACCCGTGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGgt < 6:340724/149‑1 (MQ=255) cGCCTGCTCGTTCTGGTGGTGATGTCGGTCGCGTTGATGGTTGTCGACGCGCGCTTCGACGTGCTCAAACCCGTGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGgtg < 8:250377/148‑1 (MQ=255) gCCTGCTCGTTCTGGTGGTGATGTCGGTCGCGTTGATGGTTGTCGACGCGCGCTTCGACGTGCTCAAACCCGTGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACTGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGgtgt < 7:159312/148‑1 (MQ=255) cTGCTCGTTCTGGTGGTGATGTCGGTCGCGTTGATGGTTGTCGACGCGCGCTTCGACGTGCTCAAACCCGTGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTggc > 1:372776/1‑149 (MQ=255) gCTCGTTCTGGTGGTGATGTCGGTCGCGTTGATGGTTGTCGACGCGAGCTTCGACGTGCTCAAACCCGTGCGCAGCCAGATGGGCATGGTGCTGATGGAGTAGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGcc > 8:193150/1‑133 (MQ=255) gCTCGTTCTGGTGGGGATGTCGGGCGCGTTGATGGTTGTCGACGCGCGCTTCGTCGTGCTCAAACCCGTGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTAGTACTTGATCACCTATTTGCCACAGCGTGcc < 7:193150/133‑1 (MQ=255) cTCGTTCTGGTGGTGATGTCGGTCGCGTTGATGGTTGTCGACGCGCGCTTCGACGTGCTCAAACCCGTGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTggccg < 4:186884/148‑1 (MQ=255) gtggtgATGTCGGTCGCGTTGATGGTTGTCGACGCGCGCTTCGACGTGCTCAAACCCGTGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCgg < 5:297422/149‑1 (MQ=255) gtggtgATGTCGGTCGCGTTGATGGTTGTCGACGCGCGCTTCGACGTGCTCAAACCCGTGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCg < 4:359277/148‑1 (MQ=255) tggtgATGTCGGTCGCGTTGATGGTTGTCGACGCGCGCTTCGACGTGCTCAAACCCGTGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCgg > 6:43757/1‑148 (MQ=255) ggTTGTCGACGCGCGCTTCGACGTGCTCAAACCCGTGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGcc > 5:26724/1‑148 (MQ=255) tGTCGACGCGCGCTTCGACGTGCTCAAACCCGTGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑Gaa > 2:2552/1‑148 (MQ=255) tCGAAGCGTGCTTCGAAGTGCTCAAAACCGTCCGCACCCAGATTGGCCTGGTGCTGATGTTGTCGGTCTGGATCACCGATTTGCCACAGATTTCCTGGCAAGGTGTGTCCGGCCAGTTCGGTAGGCGCAGCTAGGTGATTGCC‑‑‑Gaaaa < 8:152330/148‑1 (MQ=255) aCGCGCGCTTCGACGTGCTCAAACCCGTGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACgag < 3:198976/149‑1 (MQ=255) gcgcgcTTCGACGTGCTCAAACCCGTGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACgagga < 8:13609/149‑3 (MQ=255) gcTTCGACGTGCTCAAACCCGTGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTc < 5:361008/149‑1 (MQ=255) cTTCGACGTGCTCAAACCCGTGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCa < 8:205796/149‑1 (MQ=255) cGACGTGCTCAAACCCGTGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCaa < 3:104021/147‑1 (MQ=255) gACGTGCTCAAACCCGTGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGAc > 3:118474/1‑149 (MQ=255) aCGTGCTCAAACCCGTGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGAcc > 3:58949/1‑149 (MQ=255) gTGCTCAAACCCGTGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCg > 3:163642/1‑148 (MQ=255) gTGCTCAAACCCGTGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAATCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCg > 1:268713/1‑148 (MQ=255) cTCAAACCCGTGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCGAAg < 2:268713/148‑1 (MQ=255) cTCAAACCCGTGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCGAAGc > 4:8731/1‑149 (MQ=255) tCAAACCCGTGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAg > 8:330105/1‑81 (MQ=255) tCAAACCCGTGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAg < 7:330105/81‑1 (MQ=255) aaaCCCGTGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCGAAGCCct > 2:168943/1‑149 (MQ=255) aaaCCCGTGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACACCTTGCCAGGCacgc > 7:69243/1‑77 (MQ=255) aaaCCCGTGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACACCTTGCCAGGCacgc < 8:69243/80‑4 (MQ=255) ccGTGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCGAAGCCctgctg > 5:17307/1‑149 (MQ=255) tGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCGAAGCCctgctgctg < 3:8731/149‑1 (MQ=255) gcgcAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTc > 1:8675/1‑127 (MQ=255) gcgcAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTc < 2:8675/127‑1 (MQ=255) gcAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCGAAGCCCTGCTGCTGCAg < 1:309209/149‑1 (MQ=255) aGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCGAAGCCCTGCTGCTGCAgg < 3:95094/148‑1 (MQ=255) aGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCGAAGCCCTGCTGCTGCAgg > 4:95094/1‑148 (MQ=255) gCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCGAAGCCCTGCTGCTGCAgggg < 2:372776/149‑1 (MQ=255) aGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCGAAGCCCTGCTGCTGCAGGGgcgc > 1:148566/1‑149 (MQ=255) tGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCGAAGCCCTGCTGCTGCAGGGGCGCCTg < 5:43757/149‑1 (MQ=255) ggggCCTGGTGCGGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGGGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCGAAGCCCTGCTGCTGCAGGGGCGCCTg < 5:214886/148‑1 (MQ=255) gggCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCGAAGccc > 7:9051/1‑128 (MQ=255) gggCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCGAAGccc < 8:9051/128‑1 (MQ=255) ccTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCGAAGCCCTGCTGCTGCAGGGGCGCCTGCAGa < 3:314681/149‑1 (MQ=255) tGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCGaa > 1:48163/1‑119 (MQ=255) tGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCGaa < 2:48163/119‑1 (MQ=255) tGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAg > 1:23021/1‑101 (MQ=255) tGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAg < 2:23021/101‑1 (MQ=255) tGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCGAAGCCCTGCTGCTGCAGGGGCGCCTGCAGAAGCTGGCGGcc > 6:291228/1‑149 (MQ=255) ggAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCGAAGCCCTGCTGCTGCAGGGGCGCCTGCAGAAGCTGGCGGcc < 4:58949/148‑1 (MQ=255) tACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGCCCGAAGCCCTGCTGCTGCAGGGGCGCCTGCAGAAGCTGGCGGCCCTGAcc > 4:369659/1‑147 (MQ=255) gATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCGAAGCCCTGCTGCTGCAGGGGCGCCTGCAGAAGCTGGCGGCCCTGACCGAGCAg > 6:361174/1‑148 (MQ=255) tCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCGAAGCCCTGCTGCTGCAGGGGCGCCTGCAGAAGCTggcgg > 4:334002/1‑132 (MQ=255) tCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCGAAGCCCTGCTGCTGCAGGGGCGCCTGCAGAAGCTggcgg < 3:334002/132‑1 (MQ=255) tCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCGAAGCCCTGCTGCTGCAGGGGCGCCTGCAGAAGCTGGCGGCCCTGACCGAGCAGAAc < 2:127903/149‑1 (MQ=255) tCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCGAAGCCCAGCTTCTGCAGGCGCCCCTGCAgca < 3:166328/124‑3 (MQ=255) tCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCGAAGCCCAGCTTCTGCAGGCGCCCCTGCAgca > 4:166328/1‑122 (MQ=255) aCCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCCGGAGAAAACGAGAAGCTCAAGACCGAAGCCCTGATGCTGCAGGGGCGCCTGCAGAAGATGGCGGCCCTGACCGAGCAGaa > 1:307756/1‑149 (MQ=255) aCCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCGAAGCCCTGCTGCTGCAGGGGCGCCTGCAGAAGCTGGCGGCCCt > 7:279552/1‑134 (MQ=255) aCCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCGAAGCCCTGCTGCTGCAGGGGCGCCTGCAGAAGCTGGCGGCCCt < 8:279552/134‑1 (MQ=255) ccGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCGAAGCCCTGCTGCTGCAGGGGCGCCTGCAGAAGCTGGCGGCCCTGACCGAGCAGAACGTg > 3:188276/1‑149 (MQ=255) gATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCGAAGCCCTGCTGCTGCAGGGGCGCCTGCAGAAGCTGGCGGCCCTGACCGAGCAGAACGTGCg > 5:323489/1‑149 (MQ=255) tttGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCGAAGCCCTGCTGCTGCAGGGGCGCCTGCAGAAGCTGGCGGCCCTGACCGAGCAGAACGTGCGGc > 5:196126/1‑149 (MQ=255) cggCCACACCTTGCCAGGCACGCTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCGAAGCCCTGCTGCTGCAg > 7:45931/3‑102 (MQ=38) cggCCACACCTTGCCAGGCACGCTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCGAAGCCCTGCTGCTGCAg < 8:45931/100‑1 (MQ=38) ccACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCGAAGCCCTGCAGCAGCAgg < 1:286648/100‑1 (MQ=255) acaGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCGAAGCCCTGCTGCTGCAGGGGCGCCTGCAGAAGCTGGCGGCCCTGACCGAGCAGAACGTGCGGCTgcgc > 6:196072/1‑148 (MQ=255) aGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCGAAGCCCTGCTGCTGCAGGGGCGCCTGCAGAAGCTGGCGGCCCTGACCGAGCAGAACGTGCGGCTGCGCGAg < 1:2552/149‑1 (MQ=255) gCGGGCCTGGCAAGGTTTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAATCTCAAGACCGAAGCCCCGCTGCTGCAGGGGCGCCTGCAGAAGCTGGCGGCCCTGACCGAGCAGAACGTGCGGCTGCGCGAGt < 7:56726/149‑1 (MQ=255) | CCCTTCGCTGGGCGTTCGCCTGCTCGTTCTGGTGGTGATGTCGGTCGCGTTGATGGTTGTCGACGCGCGCTTCGACGTGCTCAAACCCGTGCGCAGCCAGATGGGCCTGGTGCTGATGGAGTCGTACTGGATCACCGATTTGCCACAGCGTGCCTGGCAAGGTGTGGCCGGCCAGTTCGGTAGCCGCACCGAGCTGATTGCC‑‑‑GAAAACGAGAAGCTCAAGACCGAAGCCCTGCTGCTGCAGGGGCGCCTGCAGAAGCTGGCGGCCCTGACCGAGCAGAACGTGCGGCTGCGCGAGT > NC_002947/1076591‑1076886 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |