| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,086,693 | T→G | 11.3% | D119A (GAC→GCC) ‡ | PP_0941 ← | ribosome associated protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,086,693 | 0 | T | G | 11.3% | 209.3 / 14.1 | 77 | D119A (GAC→GCC) ‡ | PP_0941 | ribosome associated protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (36/32); new base G (3/6); total (39/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.10e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTT‑GTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGAGCTGTCCATCTGTTCGAGCAAGGCATGGATGGCATCGAGGTCTTGCACGCGCATGAGCTTGCCGACGAAC > NC_002947/1086553‑1086839 | cgAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTT‑GTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTtcgtcg > 6:310746/1‑149 (MQ=255) gAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTT‑GTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTcgtcgt > 6:107322/1‑149 (MQ=255) aGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTT‑GTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGACCTCGAGCGCTtcgtcaac < 2:134217/149‑4 (MQ=255) cgcgGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTT‑GTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCg > 3:224190/1‑149 (MQ=255) gTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTT‑GTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATc > 4:172371/1‑148 (MQ=255) aCTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTT‑GTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAAc > 8:274149/1‑149 (MQ=255) aCTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTT‑GTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAAc > 2:290447/1‑149 (MQ=255) ttGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTT‑GTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTACTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGACCTCGAGCGCTtcgtcaa > 5:273326/1‑131 (MQ=255) ttGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTT‑GTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTACTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGACCTCGAGCGCTtcgtcaa < 6:273326/133‑3 (MQ=255) cacCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGGTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCa > 1:22596/1‑149 (MQ=255) cTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTT‑GTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGc > 7:65004/1‑148 (MQ=255) ttGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTT‑GTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGa > 5:186879/1‑133 (MQ=255) ttGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTT‑GTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGa < 6:186879/133‑1 (MQ=255) gcgcgGCGGCAGGCGGCTT‑GTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAgcgc > 2:14003/1‑149 (MQ=255) ggcggcAGGCGGCTT‑GTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCa < 2:22596/149‑1 (MQ=255) ggcggcAGGCGGCTT‑GTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCa < 5:18211/149‑1 (MQ=255) ggcggcAGGCGGCTT‑GTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCa < 7:14021/149‑1 (MQ=255) ggcAGGCGGCTT‑GTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTAACGTCGATCAACCGGTCACGCAAGCCCGCCAGGc > 8:239454/1‑149 (MQ=255) gcAGGCGGCTT‑GTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCt > 1:317605/1‑149 (MQ=255) aGGCGGCTT‑GTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCtgt > 5:147635/1‑149 (MQ=255) gcggcTT‑GTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTgg < 3:245821/149‑1 (MQ=255) tt‑GTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATc < 2:338069/114‑1 (MQ=255) tt‑GTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATc > 1:338069/1‑114 (MQ=255) gcCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTa < 2:317605/149‑1 (MQ=255) ctcGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTg < 5:107322/147‑1 (MQ=255) gTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGc < 3:172371/146‑1 (MQ=255) gTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGc < 6:147635/146‑1 (MQ=255) gTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGc < 1:14003/146‑1 (MQ=255) tGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGt > 2:356903/1‑149 (MQ=255) gCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTc > 5:347542/1‑149 (MQ=255) tGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTc > 8:269484/1‑147 (MQ=255) ggCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAg > 2:86983/1‑106 (MQ=255) ggCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGa < 7:274149/147‑1 (MQ=255) ggCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGAGc > 4:81394/1‑149 (MQ=255) gCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGAGCt > 8:135258/1‑149 (MQ=255) cATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGAGCTg > 5:194813/1‑149 (MQ=255) cgcACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGAGCTGTCCAt < 3:260160/149‑1 (MQ=255) agcgagcgTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGAGCTGTCCATCTGTTc < 8:65004/149‑1 (MQ=255) agcgagcgTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGAGCTGTCCATCTGTTc < 7:135258/149‑1 (MQ=255) agcgagcgTAGCTGCTGGCGGTCGGTATCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGAGCTGTCCATCTGTTc > 1:11574/1‑149 (MQ=255) gcgagcgTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGAGCTGTCCATCTGTTCg < 1:290447/149‑1 (MQ=255) gTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGATACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGACCTGGCCATCTGTTCGAGCAAg > 8:171369/1‑149 (MQ=255) tAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGGCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGAGCTGTCCATCTGTTCGAGCAAgg < 5:310746/149‑1 (MQ=255) cgcttgctgGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGAGCTGTCCATCTGTTCGAGCaa < 7:310387/143‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGa > 7:193898/1‑125 (MQ=255) aGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGa < 8:193898/125‑1 (MQ=255) gctgctGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGAGCTGTCCATCTGTTCGAGCAAGGc < 7:269484/148‑1 (MQ=255) gctgGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGaa > 5:290206/1‑97 (MQ=255) gctgGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGaa < 6:290206/97‑1 (MQ=255) ctgGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGAGCTGTCCATCTGTTCGAGCAAGGCatgg < 3:81394/148‑1 (MQ=255) tgGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAACCGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGAGCTGTCCATCTGTTCGAGCAAGGCatggat > 2:258573/1‑149 (MQ=255) gCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGAGCTGTCCATCTGTTCGAGCAAGGCatggatgg > 6:257025/1‑149 (MQ=255) tgtCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTTCCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCGAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGCGCTGTGCATCTGTTCGAGCAAGGCATGGATGGCATCGAgg > 6:125352/1‑149 (MQ=255) tCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGAGCTGTCCATCTGTTCGAGCAAGGCATGGATGGCATCGAGGTc < 2:344127/149‑1 (MQ=255) gggTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGAGCTGTCCATCTGTTCGAGCAAGGCATGGATGGCATCGAGGTCTTg < 2:11574/149‑1 (MQ=255) aCTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTCTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGAGCTGTCCATCTGTTCGAGCAAGGCATGGATGGCATCGAGGTCTTGCAcg > 2:174421/1‑149 (MQ=255) gTTGACGAAGCGCTCGAGGGCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGAGCTGTCCATCTGTTCGAGCAAGGCATGGATGGCATCGAGGTCTTGCACgcgc < 4:126880/148‑1 (MQ=255) tttaCGAAGCTCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACAGTTCACGCCAGCTCTCCAGGCTGTTGAAACGTTCGTTGTACTGGCGATTCGAGCTGTCCATCTGTTCGAGCAAGGCATTGATGGCATCGAGGTCTTGCACGCGCAt < 7:239454/146‑1 (MQ=255) ttGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGAGCTGTCCATCTGTTCGAGCAAGGCATGGATGGCATCGAGGTCTTGCACGCACAt > 4:243817/1‑149 (MQ=255) gACGAAGACCTCGAGCGCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGAGCTGTCCATCTGTTCGAGCAAGGCatggatg < 6:138236/124‑1 (MQ=255) gACGAAGACCTCGAGCGCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGAGCTGTCCATCTGTTCGAGCAAGGCatggatg > 5:138236/1‑124 (MQ=255) gACGAAGACCTCGAGCGCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGAGCTGTCCATCTGTTCGAGCAAGGCATGGATGGCATCGAGGTCTTGCACGCGCAt > 7:219497/1‑147 (MQ=255) aCGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGAGCTGTCCATCTGTTCGAGCAAGGCATGGATGGCATCGAGGTCTTGCACGCGCATGa < 5:257025/148‑1 (MQ=255) aCGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGAGCTGTCCATCTGTTCGAGCAAGGCATGGATGGCATCGAGGTCTTGCACGCGCATGAg > 1:136009/1‑149 (MQ=255) aCGAAGACCTCGAGCGCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGAGCTGTCCATCTGTTCGAGCAAGGCATGGATGGCATCGAGGTCTTGCACGCGCATGAg < 8:219497/149‑1 (MQ=255) gAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGAGCTGTCCATCTGTTCGAGCAAGGCATGGATGGCATCGAGGTCTTGCACGCGCATGAGCt > 6:232046/1‑149 (MQ=255) gAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGAGCTGTCCATCTGTTCGAGCAAGGCATGGATGGCATCGAGGTCTTGCACGCGCATGAGCt < 6:194813/149‑1 (MQ=255) gcTCGAGGTCTTCGTCTTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTAAAGGCTTTGTAAACGTTCGTTGTAATTGAGAGTCGAGCTGTCAATCTGTTCGAGCAAGGCATGCATGGCATAGAGGTCTTAAAAGAACATTAGCTTGcgg > 4:50547/1‑147 (MQ=255) gcTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGAGCTGTCCATCTGTTCGAGCAAGGCATGGATGGCATCGAGGTCTTGCACGCGCATGAGCTTGCcg < 7:1542/149‑1 (MQ=255) tCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGAGCTGTCCATCTGtt > 7:179236/1‑97 (MQ=255) tCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGAGCTGTCCATCTGtt < 8:179236/97‑1 (MQ=255) tCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGAGCTGTCCATCTGTTCGAGCAAGGCATGGATGGCATCGa < 5:184030/121‑1 (MQ=255) tCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGAGCTGTCCATCTGTTCGAGCAAGGCATGGATGGCATCGa > 6:184030/1‑121 (MQ=255) ggTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGAGCTGTCCATCTGTTCGAGCAAGGCATGGATGGCATCGAGGTCTTGCACGCGCATGAGCTTGCCGacgaac < 6:347542/149‑1 (MQ=255) ggTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGAGCTGTCCATCTGTTCGAGCAAGGCATGGATGGCATCGAGGTCTTGCACGCGCATGAGCTTGCCGacgaac > 8:59526/1‑149 (MQ=255) ggTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGAGCTGTCCATCTGTTCGAGCAAGGCATGGATGGCATCGAGGTCTTGCACGCGCATGAGCTTGCCGacgaac < 7:247751/149‑1 (MQ=255) ggTCTGCGTCGTTACCGTCGATCCACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGGGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGAGCTGTCCATCTGTTCGAGCAAGGCATGGATGGCATCGAGGTCTTGCACGCGCATGAGCTTGCCGacgaac < 4:224190/149‑1 (MQ=255) | CGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTT‑GTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGGTACTCGTTGACGAAGCGCTCGAGGTCTTCGTCGTTACCGTCGATCAACCGGTCACGCCAGCGCTCCAGGCTGTGGAAACGTTCGTTGTACTGGCGAGTCGAGCTGTCCATCTGTTCGAGCAAGGCATGGATGGCATCGAGGTCTTGCACGCGCATGAGCTTGCCGACGAAC > NC_002947/1086553‑1086839 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |