| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,194,647 | C→G | 5.6% | P262P (CCC→CCG) ‡ | uxpA → | lipoprotein UxpA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,194,647 | 0 | C | G | 5.6% | 229.3 / 4.1 | 71 | P262P (CCC→CCG) ‡ | uxpA | lipoprotein UxpA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/33); new base G (2/2); total (36/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.73e-01 | |||||||||||
GTATTGCAGTGGTTGGCGTGACCGACCCGTACGCCCAGGATCAGAAAGCCTCACTCAAACAGTGGTACCAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCTGTGGCCCGCACCGGTCGAGGCCACCCAGGCCAGCGGTCGGCGCGTGCCGGTGCTGTTTGCCGGCTGCCGGGGCAGCGGTGCCT > NC_002947/1194499‑1194795 | gTATTGCAGTGGTTGGCGTGACCGACCCGTACGCCCAGGATCAGAAAGCCTCACTCAAACAGTGGTACCAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGcccc < 4:132590/149‑1 (MQ=255) gCAGTGGTTGGCGTGACCGACCCGTACGCCCAGGATCAGAAAGCCTCACTCAAACAGTGGTACCAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCGTGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCt > 1:281142/1‑149 (MQ=255) aGTGGTTGGCGTGACCGACCCGTACGCCCAGGATCAGAAAGCCTCACTCAAACAGTGGTACCAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCtgt < 6:107856/149‑1 (MQ=255) aGTGGTTGGCGTGACCGACCCGTACGCCCAGGATCAGAAAGCCTCACTCAAACAGTGGTACCAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCtgt < 2:6791/149‑1 (MQ=255) gCGTGACCGACCCGTACGCCCAGGATCAGAAAGCCTCACTCAAACAGTGGTACCAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGtggctggc < 2:248668/148‑1 (MQ=255) gCGTGACCGACCCGTACGCCCAGGATCAGAAAGCCTCACTCAAACAGTGGTACCAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTggctggct > 7:224127/1‑149 (MQ=255) gTGACCGACCCGTACGCCCAGGATCAGAAAGCCTCACTCAAACAGTGGTACCAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGa > 1:193534/1‑149 (MQ=255) gaccCGTACGCCCAGGATCAGAAAGCCTCACTCAAACAGTGGTACCAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGt < 2:189129/149‑1 (MQ=255) accCGTACGCCCAGGATCAGAAAGCCTCACTCAAACAGTGGTACCAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTg < 3:344183/149‑1 (MQ=255) cccGTACGCCCAGGATCAGAAAGCCTCACTCAAACAGTGGTACCAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGc < 7:362204/149‑1 (MQ=255) ccGTACGCCCAGGATCAGAAAGCCTCACTCAAACAGTGGTACCAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGcc > 3:160199/1‑149 (MQ=255) cGTACGCCCAGGATCAGAAAGCCTCACTCAAACAGTGGTACCAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCg < 8:224127/149‑1 (MQ=255) gCCCAGGATCAGAAAGCCTCACTCAAACAGTGGTACCAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAAt > 1:56771/1‑149 (MQ=255) ccAGGATCAGAAAGCCTCACTCAAACAGTGGTACCAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGc > 5:220691/1‑140 (MQ=255) ccAGGATCAGAAAGCCTCACTCAAACAGTGGTACCAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGc < 6:220691/140‑1 (MQ=255) ccAGGATCAGAAAGCCTCACTCAAACAGTGGTACCAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATc > 1:282659/1‑148 (MQ=255) ccAGGATCAGAAAGCCTCACTCAAACAGTGGTACCAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACAGGCCGGGGCCCGtgcct < 4:61636/126‑1 (MQ=255) ccAGGATCAGAAAGCCTCACTCAAACAGTGGTACCAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACAGGCCGGGGCCCGtgcct > 3:61636/1‑126 (MQ=255) ccAGGATCAGAAAGCCTCACTCAAACAGTGGTACCAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGCCACAGGCCGGGGCCCGtgcct < 6:77151/126‑1 (MQ=255) ccAGGATCAGAAAGCCTCACTCAAACAGTGGTACCAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGCCACAGGCCGGGGCCCGtgcct > 5:77151/1‑126 (MQ=255) ggATCAGAAAGCCTCACTCAAACAGTGGTACCAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGtggc > 3:106712/1‑122 (MQ=255) ggATCAGAAAGCCTCACTCAAACAGTGGTACCAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGtggc < 4:106712/122‑1 (MQ=255) tCAGAAAGCCTCACTCAAACAGTGGTACCAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGc < 8:79896/112‑1 (MQ=255) tCAGAAAGCCTCACTCAAACAGTGGTACCAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGc > 5:81481/1‑149 (MQ=255) aGAAAGCCTCACTCAAACAGTGGTACCAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCtg < 2:56771/149‑1 (MQ=255) gAAAGCCTCACTCAAACAGTGGTACCAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCtgt > 6:185468/1‑149 (MQ=255) gAAAGCCTCACTCAAACAGTGGTACCAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCtgt > 2:78267/1‑149 (MQ=255) gAAAGCCTCACTCAAACAGTGGTACCAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCtgt > 4:155595/1‑149 (MQ=255) ctcactcaAACAGTGGTACCAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTgcg > 8:342340/1‑149 (MQ=255) ctcaAACAGTGGTACCAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCg < 4:160199/149‑1 (MQ=255) aaaCAGTGGTACCAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTgg > 4:206960/1‑149 (MQ=255) cAGTGGTACCAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCa < 7:318720/149‑1 (MQ=255) gTACCAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGAcc > 6:279776/1‑149 (MQ=255) gTACCAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCACGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGACCGTGGTCAGGAcc > 7:302528/1‑149 (MQ=255) ccAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCt > 3:160665/1‑147 (MQ=255) ccAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCt < 4:160665/147‑1 (MQ=255) ctgTCTGTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGGGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCtgtg < 7:141098/147‑1 (MQ=255) cAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCtgtg < 8:14120/149‑1 (MQ=255) tctGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCTGTGGCCCg > 3:286119/1‑149 (MQ=255) ctgcCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCTGTGGCCCGCAc < 7:170206/148‑1 (MQ=255) ccGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCTGTGGcctcgaccg < 2:282659/147‑8 (MQ=255) gTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCGTGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCTGTGGCCCGCACCGGTCGa < 2:281142/149‑1 (MQ=255) ttCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGa > 7:106538/1‑125 (MQ=255) ttCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGa < 8:106538/125‑1 (MQ=255) ttCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCTGTGGCCCGCACCGGTCGAgg < 7:342340/148‑1 (MQ=255) gAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCTGTGGCCCGCACCGGTCGAGGCCAc > 3:93148/1‑149 (MQ=255) aaGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGATCGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCTGTGGCCCGCACCGGTCGAGGCCACCCAg < 2:193534/149‑1 (MQ=255) gCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCTGTGGCCCGCACCGGTCGAGGCCACCCAGGc > 1:149615/1‑149 (MQ=255) ccGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTc < 7:104345/110‑1 (MQ=255) ccGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTc > 8:104345/1‑110 (MQ=255) ccGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCTGTGGCCCGCACCGGTCGAGGCCACCCAGGc > 1:37585/1‑147 (MQ=255) ccGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCTGTGGCCCGCACCGGTCGAGGCCACCCAGGCCa > 8:84329/1‑149 (MQ=255) cGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCTGTGGCCCGCACCGGTCGAGGCCACCCAGGCCAg > 5:154471/1‑149 (MQ=255) gCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCTGTGGCCCGCACCGGTCGAGGCCACCCAGGCCAGCg < 6:81481/149‑1 (MQ=255) cACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCTGTGGCCCGCACCGGTCGAGGCCACCCAGGCCAGCgg < 1:78267/149‑1 (MQ=255) gAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCtgttgt < 3:286857/91‑1 (MQ=255) gAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCtgttgt > 4:286857/1‑91 (MQ=255) gAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCTGTGGCCCGCACCGGTCGAGGCCACCCAGGCCAGCGGTCg > 4:241613/1‑149 (MQ=255) cTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCTGTGGCCCGCACCGGTCGAGGCCACCCAGGCCAGCGGTCGGCGCGTGcc > 6:106991/1‑149 (MQ=255) tggtggtggCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGCCCTGTGGCCCGCACCGGTCGAGGCCACCCAGGCCAGCGGTCGGCGAGTGCCg > 4:255567/1‑149 (MQ=255) gtggtggCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCTGTGGCCCGCACCGGTCGAGGCCACCCAGGCCAGCGGTCGGCGCGTGCCg < 5:279776/147‑1 (MQ=255) gtggtggCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCTGTGGCCCGCACCGGTCGAGGCCACCCAGGCCAGCGGTCGGCGCGTGCCg < 5:185468/147‑1 (MQ=255) gCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCTGTGGCCCGCACCGGTCGAGGCCACCCAGGCCAGCGGTCGGCGCGTGCCGGTGCTGtt < 3:155595/149‑1 (MQ=255) cATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCTGTGGCCCGCACCGGTCGAGGCCACCCAGGCCAGCGGTCGGCGCGTGCCGGTGCTGTTTg > 7:211364/1‑149 (MQ=255) aTGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCTGTGGCCCGCACCGGTCGAGGCCACCCAGGCCAGCGGTCGGCGCGTGCCGGTGCTGt > 6:250299/1‑145 (MQ=255) aTGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCTGTGGCCCGCACCGGTCGAGGCCACCCAGGCCAGCGGTCGGCGCGTGCCGGTGCTGt < 5:250299/145‑1 (MQ=255) gCCGACGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCTGTGGCCCGCACCGGTCGAGGCCACCCAGGCCAGCGGTCGGCGCGTGCCGGTGCTGTTTGCCgg < 4:2724/149‑1 (MQ=255) ccGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCTGTGGCCCGCACCGGTCGAGGCCACCCAGGCCAGCGGTCGGCGCGTGCCGGTGCTGTTTGCCGGc > 8:287024/1‑149 (MQ=255) ccGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCTGTGGCCCGCACCGGTCGAGGCCACCCAGGCCAGCGGTCGGCGCGTGCCGGTGCTGTTTGCCGGc < 7:287024/149‑1 (MQ=255) gggCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCTGTGGCCCGCACCGGTCGAGGCCACCCAGGCCAGCGGTCGGCGCGTGCCGGTGCTGTTTGCCGGCTGCCGGGGCAGCg > 3:235969/1‑149 (MQ=255) gggCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCTGTGGCCCGCACCGGTCGAGGCCACCCAGGCCAGCGGTCGGCGCGTGCCGGTGCTGTTTGCCGGCTGCCGGGGCAGCg > 5:113072/1‑149 (MQ=255) gCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCTGTGGCCCGCACCGGTCGAGGCCACCCAGGCCAGCGGTCGGCGCGTGCCGGTGCTGTTTGCCGGCTGCCGGGGCAGCGGt < 1:301590/149‑1 (MQ=255) cccGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCTGTGGCCCGCACCGGTCGAGGCCAcc < 4:144892/93‑1 (MQ=255) cccGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCTGTGGCCCGCACCGGTCGAGGCCAcc > 3:144892/1‑93 (MQ=255) ccGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCGAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCTGTGGCCCGCACCGGTCGAGGCCACCCAGGCCAGCGGTCGGCGCGTGCCGGTGCTGTTTGCCGGCTGCCGGGGCAGCGGTGcc > 5:260517/1‑149 (MQ=255) ccGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCTGTGGCCCGCACCGGTCGAGGCCACCCAGGCCAGCGGTCGGCGCGTGCCGGTGCTGTTTGCCGGCTGCCGGGGCAGCGGTGcc > 2:125926/1‑149 (MQ=255) cGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCtg < 3:249105/67‑1 (MQ=255) cGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCtg > 4:249105/1‑67 (MQ=255) cGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCTGTGGCCCGCACCGGTCGAGGCCACCCAGGCCAGCGGTCGGCGCGTGCCGGTGCTGTTTGCCGGCTGCCGGGGCAGCGGTGCCt < 7:84329/149‑1 (MQ=255) cGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCTGTGGCCCGCACCGGTCGAGGCCAACCAGGCCAGCGGTCGGCGCGTGACGGTGCTGTTTGCCGGCTGCCGGGGCAGCGGTGCCt > 3:226594/1‑149 (MQ=255) | GTATTGCAGTGGTTGGCGTGACCGACCCGTACGCCCAGGATCAGAAAGCCTCACTCAAACAGTGGTACCAGTCTCTGCTGCCGGTATTCGAGCAAGCCCGGCACGAGGCTGACCTGGTGGTGGCCATGGCCGATGCAGGCACGGGCCCCGGCCTGTGGCTGGCTGAACGGGTGCCGCAAATCGACGTGCTGTTGTGCGCCCGTGGTCAGGACCTGTGGCCCGCACCGGTCGAGGCCACCCAGGCCAGCGGTCGGCGCGTGCCGGTGCTGTTTGCCGGCTGCCGGGGCAGCGGTGCCT > NC_002947/1194499‑1194795 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |