| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,242,531 | T→A | 8.2% | intergenic (‑65/+135) | bfr‑II ← / ← PP_1083 | bacterioferritin/(2Fe‑2S)‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,242,531 | 0 | T | A | 8.2% | 178.0 / 5.4 | 61 | intergenic (‑65/+135) | bfr‑II/PP_1083 | bacterioferritin/(2Fe‑2S)‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/22); new base A (2/3); total (36/25) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.92e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.54e-01 | |||||||||||
GTGCAGGAAGTACTGGTTGATCGCGACCAGCTCGTTTCCGAGGATCTTGTTGAGATGCTGGATGACGCTTACGTCGCCTTTCATGTCGGGTTCCTGCCCTGTAGAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGCTAACTTGTTGAATTGCGGGCATAAAAAAACCGGACACCAGGTCCGGTTCTTGAAATTCTGCGTTCAGGCAGCGGT > NC_002947/1242383‑1242677 | gtgcAGGAAGTACTGGTTGATCGCGACCAGCTCGTTTCCGAGGATCTTGTTGAGATGCTGGATGACGCTTACGTCGCCTTTCATGTCGGGTTCCTGCCCTGTAGAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGgtgtgt < 5:110091/149‑1 (MQ=255) gTACTGGTTGATCGCGACCAGCTCGTTTCCGAGGATCTTGTTGAGATGCTGGATGACGCTTACGTCGCCTTTCATGTCGGGTTCCTGCCCTGTAGAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTaa < 4:194208/149‑1 (MQ=255) cTGGTTGATCGCGACCAGCTCGTTTCCGAGGATCTTGTTGAGATGCTGGATGACGCTTACGTCGCCTTTCATGTCGGGTTCCTGCCCTGTAGAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGt > 8:129350/1‑148 (MQ=255) gTTGATCGCGACCAGCTCGTTTCGGTGGATCTTTTTGAGATTCTGGATGACGCTTACGTCGCCTTTCATGTCGGTTTCCTGCCCTGTAGAATTGTGTCAATCCACTGAATTTTGAGCCCGATACTTAGGTTTGACACACCTAAGtatc < 8:350691/148‑4 (MQ=255) gTTGATCGCGACCAGCTCGTTTCCGAGGATCTTGTTGAGATGCTGGATGACGCTTACGTCGCCTTTCATGTCGGGTTCCTGCCCTGTAGAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCtt < 3:330923/149‑1 (MQ=255) gTTGATCGCGACCAGCTCGTTTCCGAGGATCTTGTTGAGATGCTGGATGACGCTTACGTCGCCTTTCATGTCGGGTTCCTGCCCTGTAGAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCtt < 7:250334/149‑1 (MQ=255) ttGATCGCGACCAGCTCGTTTCCGAGGATCTTGTTGAGATGCTGGATGACGCTTACGTCGCCTTTCATGTCGGGTTCCTGCCCTGTAGAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTTTGACACACCTAAGtatcgg < 7:136559/149‑6 (MQ=255) aTCGCGACCAGCTCGTTTCCGAGGATCTTGTTGAGATGCTGGATGACGCTTACGTCGCCTTTCATGTCGGGTTCCTGCCCTGTAGAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGaa > 6:119826/1‑148 (MQ=255) tCGTTTCCGAGGATCTTGTTGAGATGCTGGATGACGCTTACGTCGCCTTTCATGTCGGGTTCCTGCCCTGTAGAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGaaaa > 8:357621/1‑149 (MQ=255) ccGAGGATCTTGTTGAGATGCTGGATGACGCTTACGTCGCCTTTCATGTCGGGTTCCTGCCCTGTAGAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAACCTTaa > 8:59713/1‑121 (MQ=255) ccGAGGATCTTGTTGAGATGCTGGATGACGCTTACGTCGCCTTTCATGTCGGGTTCCTGCCCTGTAGAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAAt < 7:129350/148‑1 (MQ=255) cGAGGATCTTGTTGAGATGCTGGATGACGCTTACGTCGCCTTTCATGTCGGGTTCCTGCCCTGTAGAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAg > 1:354709/1‑149 (MQ=255) gAGGATCTTGTTGAGATGCTGGATGACGCTTACGTCGCCTTTCATGTCGGGTTCCTGCCCTGTAGAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAg > 4:155004/1‑148 (MQ=255) gttgAGATGCTGGATGACGCTTACGTCGCCTTTCATGTCGGGTTCCTGCCCTGTAGAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAAt > 1:164680/1‑149 (MQ=255) agagaTGCTGGATGACGCTTACGTCTCCTTTCATGTCGGGGTCCTGCCCTCTAGAAGTGTGTCAAACCACAGAAGAATGAGCCCGAAACATAGGTGAGTCAAACCTAAGTTCATGAATACTAAGTGAAAATTAAAAGGAATAAGAATgg > 8:297696/2‑148 (MQ=255) agaTGCTGGATGACGCTTACGTCGCCTTTCATGTCGGGTTCCTGCCCTGTAGAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGttt > 4:74524/1‑149 (MQ=255) gaTTCTTGATGAGGGTTACGTCGCATTTCATGTCGGGTTCATGCCCTGTAGAAGTGTTTCAATACACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTTTTTCAAACCTAAGTTCTTTAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGttt < 7:297696/148‑1 (MQ=255) tGGATGACGCTTACGTCGCCTTTCATGTCGGGTTCCTGCCCTGTAGAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATTCTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAAc > 5:26344/1‑149 (MQ=255) ttACGTCGCCTTTCATGTCGGGTTCCTGCCCTGTAGAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCaa > 8:142559/1‑149 (MQ=255) cGTCGCCTTTCATGTCGGGTTCCTGCCCTGTAGAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGc < 7:357621/149‑1 (MQ=255) gCCTTTCATGTCGGGTTCCTGCCCTGTAGAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGCTaa < 6:26344/148‑1 (MQ=255) ttCATGTCGGGTTCCTGCCCTGTAGAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTaa > 4:283643/1‑94 (MQ=255) ttCATGTCGGGTTCCTGCCCTGTAGAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTaa < 3:283643/94‑1 (MQ=255) aTGTCGGGTTCCTGCCCTGTAGAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGCTAACttgttg < 3:155004/148‑1 (MQ=255) tGTCGGGTTCCTGCCCTGTAGAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGCTAACTTGTTGaa > 1:152391/1‑149 (MQ=255) tCGGGTTCCTGCCCTGTAGAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGCTAACTTGTTGAAtt > 2:286298/1‑149 (MQ=255) gggTTCCTGCCCTGTAGAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGCTAACTTGTTGAATTGc > 8:93143/1‑149 (MQ=255) gTTCCTGCCCTGTAGAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGCTAACTTGTTGAATTGCgg < 7:142559/149‑1 (MQ=255) ttCCTGCCCTGTAGAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGCTAACTTGTTGAATTGCggg < 5:119826/149‑1 (MQ=255) cTGCCCTGTAGAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGCTAACttgtt < 1:245299/136‑1 (MQ=255) cTGCCCTGTAGAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGCTAACttgtt > 2:245299/1‑136 (MQ=255) cccTGTAGAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGc > 7:13599/1‑124 (MQ=255) cccTGTAGAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGc < 8:13599/124‑1 (MQ=255) ccTGTAGAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGCTAACTTGTTGAATTGCg < 3:243912/140‑1 (MQ=255) ccTGTAGAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGCTAACTTGTTGAATTGCg > 4:243912/1‑140 (MQ=255) ccTGTAGAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGCTAACTTGTTGAATTGCGGGCATaaaa < 7:93143/149‑1 (MQ=255) gTAGAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGCTAACTTGTTGAATTGCGGGCATaaaaa > 3:32921/1‑147 (MQ=255) gTAGAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGCTAACTTGTTGAATTGCGGGCATaaaaa < 4:32921/147‑1 (MQ=255) gAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGtt > 1:164787/1‑110 (MQ=255) gAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGtt < 2:164787/110‑1 (MQ=255) gtgtgtCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGCTAACTTGTTGAATTGCGGGCATAAAAAAACCGGa > 5:54998/1‑148 (MQ=255) tgtCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGCTAACTTGTTGAATTGCGGGCATAAAAAAACCGGacctg > 2:64060/1‑146 (MQ=255) tgtCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGCTAACTTGTTGAATTGCGGGCATAAAAAAACCGGacac > 1:358674/1‑148 (MQ=255) gaTCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGCTAACTTGTTGAATTGCGGGCATAAAAAAACCGGACACCAgga > 2:227714/2‑148 (MQ=255) aaTCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGa > 1:280702/1‑82 (MQ=255) aaTCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGa < 2:280702/82‑1 (MQ=255) aTCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGCTAACTTGTTGAATTGCGGGCATAAAAAAACCGGACACCAGGTc > 3:220797/1‑149 (MQ=255) aTCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGCTAACTTGTTGAATTGCGGGCATAAAAAAACCGGACACCAGGTc > 6:349283/1‑149 (MQ=255) aTCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGCTAACTTGTTGAATTGCGGGCATAAAAAAACCGGACACCAGGTc > 1:119610/1‑149 (MQ=255) cACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGCTAACTTGTTGAATTGCGGGCATAAAAAAACCGGACACCAGGTCCg < 3:74524/148‑1 (MQ=255) aCTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGCTAACTTGTTGAATTGCGGGCATAAAAAAACCGGACACCAGGTCCGGt > 3:57540/1‑149 (MQ=255) aCTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGCTAACTTGTTGAATTGCGGGCATAAAAAAACCGGACACCAGGTCCGGt > 7:215634/1‑149 (MQ=255) tGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAAt > 4:137124/1‑65 (MQ=255) tGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAAt < 3:137124/65‑1 (MQ=255) tGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGCTAACTTGTTGAATTGCGGGCATAAAAAAACCGGACACCAGGTCCGGTTc > 5:191033/1‑149 (MQ=255) ttcaagaaCTTAGGTTTGACACACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGCTAACTTGTTGAATTGCGGGCATAAAAAAACCGGACACCAGGTCCGGTTCTTGAAATTCt > 3:343986/8‑149 (MQ=255) gCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGCTAACTTGTTGAATTGCGGGCATAAAAAAACCGGACACCAGGTCCGGTTCTTGAAATTCt < 6:191033/149‑1 (MQ=255) agaaCTTAGGTTTGACACACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGCTAACTTGTTGAATTGCGGGCATAAAAAAACCGGACACCAg > 6:190796/4‑126 (MQ=255) agaaCTTAGGTTTGACACACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGCTAACTTGTTGAATTGCGGGCATAAAAAAACCGGACACCAg < 5:190796/123‑1 (MQ=255) tACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGCTAACTTGTTGAATTGCGGGCATAAAAAAACCGGACACCAGGTCCGGTTCTTGAAATTCCGCGtt > 6:143945/1‑148 (MQ=255) ttAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGt > 7:314171/1‑73 (MQ=255) ttAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGt < 8:314171/73‑1 (MQ=255) gtgtgtCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGGAACGCTAACTTGTTGAATTGCGGGCATAAAAAAACCGGACACCAGGTCCGGTTCTTGAAATTCTGCGTTCAGGCAGc < 2:152391/149‑1 (MQ=255) gtgtgtCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGCTAACTTGTTGAATTGCGGGCATAAAAAAACCGGACACCAGGTCCGGTTCTTGAAATTCTGCGTTCAGGCAg < 8:215634/148‑1 (MQ=255) tgtgtCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGCTAACTTGTTGAATTGCGGGCATAAAAAAACCGGACACCAGGTCCGGTTCTTGAAATTCTGCGTTCAGGCAGc < 2:358674/148‑1 (MQ=255) gtgtCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGCTAACTTGTTGAATTGCGGGCATAAAAAAACCGGACACCAGGTCCGGTTCTTGAAATTCTGCGTTCAGGCAGCgg > 3:162470/1‑149 (MQ=255) gtCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGTACCGCGTTGCAACGCTAACTTGTTGAATTGCGGGCAt > 5:227905/1‑95 (MQ=255) gtCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGTACCGCGTTGCAACGCTAACTTGTTGAATTGCGGGCAt < 6:227905/95‑1 (MQ=255) gtCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGCTAACTTGTTGAATTGCGGGCATAAAAAAACCGGACACCAGGTCCGGTTCTTGAAATTCTGCGTTCAGGCAGCGGt > 3:121462/1‑148 (MQ=255) | GTGCAGGAAGTACTGGTTGATCGCGACCAGCTCGTTTCCGAGGATCTTGTTGAGATGCTGGATGACGCTTACGTCGCCTTTCATGTCGGGTTCCTGCCCTGTAGAAGTGTGTCAATCCACTGAAGTTTGAGCCCGATACTTAGGTGTGTCAAACCTAAGTTCTTGAATACTAAGTGAAAATTAATAGGAATAAGAATGTTTGTGAACCGCGTTGCAACGCTAACTTGTTGAATTGCGGGCATAAAAAAACCGGACACCAGGTCCGGTTCTTGAAATTCTGCGTTCAGGCAGCGGT > NC_002947/1242383‑1242677 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |