| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,403,591 | T→C | 7.8% | intergenic (‑57/+24) | PP_1227 ← / ← PP_1228 | membrane protein/methyl‑accepting chemotaxis transducer |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,403,591 | 0 | T | C | 7.8% | 171.3 / 5.1 | 65 | intergenic (‑57/+24) | PP_1227/PP_1228 | membrane protein/methyl‑accepting chemotaxis transducer |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (27/32); new base C (3/2); total (30/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.59e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.59e-02 | |||||||||||
AACAGGGTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGG > NC_002947/1403452‑1403736 | aaCAGGGTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCCCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGaa < 5:326239/149‑1 (MQ=255) aCAGGGTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAag < 2:202700/149‑1 (MQ=255) cAGGGTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAaga < 7:205685/149‑1 (MQ=255) aGGGTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAagag < 7:80805/149‑1 (MQ=255) ggTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGc > 2:287975/1‑149 (MQ=255) tGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATACGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGccc < 3:14116/149‑1 (MQ=255) tGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGGTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGccc < 2:239832/149‑1 (MQ=255) gcggcgATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGTATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCTGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCTCGTGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCt < 4:323081/148‑1 (MQ=255) ggcgATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGAc < 6:248136/149‑1 (MQ=255) gATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGcc > 4:161583/1‑141 (MQ=255) gATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGcc < 3:161583/141‑1 (MQ=255) aGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGa > 4:319551/1‑149 (MQ=255) tGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGAcgc > 5:325210/1‑149 (MQ=255) cccTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGGGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTc < 5:181352/149‑1 (MQ=255) cTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAgg > 6:178779/1‑119 (MQ=255) cTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAgg < 5:178779/119‑1 (MQ=255) ttGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGcc > 1:37018/1‑120 (MQ=255) ttGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGcc < 2:37018/120‑1 (MQ=255) ttGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCAt > 1:34971/1‑149 (MQ=255) tgcGCTGGTGATGTCCAATAACGTGCATCGGGTTGCATAAGCCAAAAGTTGTCCTCAACAAAAACGCTGGTGCGGGGCCTGTCAGGGCCGCTTCGCGGGCG‑GGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCa < 2:267604/146‑1 (MQ=25) ggCTGGTGTTGTCGATGAAAGTGGATCGGGTTGGATTTGGAATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGTTGCCTGTCTGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCGTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAgc < 2:34971/147‑1 (MQ=255) tGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCA‑CGCCCGCGAAGAGGCCCTGACa < 2:96247/118‑1 (MQ=255) tGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCA‑CGCCCGCGAAGAGGCCCTGACa > 1:96247/1‑118 (MQ=255) tGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCctgct > 4:367515/1‑149 (MQ=255) gTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCctgctgctg > 1:286777/1‑149 (MQ=255) aagaaAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTg > 1:219760/1‑149 (MQ=255) tggtccGGGTTGGATAAGGCATAATTTGTGCTCATGAATAACGATGGTGCGGGGCCTGCCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGcc < 3:68599/144‑1 (MQ=38) gATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCg < 2:219760/148‑1 (MQ=255) gggTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCa < 3:319551/149‑1 (MQ=255) ggTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAg > 4:43909/1‑149 (MQ=255) gTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAgg > 2:240465/1‑149 (MQ=255) ttGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTg < 7:320446/133‑1 (MQ=255) ttGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTg > 8:320446/1‑133 (MQ=255) ttAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTgg < 1:240465/149‑1 (MQ=255) ggCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCt < 3:367515/148‑1 (MQ=255) gCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTg < 5:222821/148‑1 (MQ=255) gCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTAGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCGGACAGGCTAGACGCGAAACGGCTCCCTCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGGTCAGGGCGTGGCtt > 6:222821/1‑147 (MQ=255) cATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGAt < 3:43909/149‑1 (MQ=255) aGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGt > 7:74350/1‑149 (MQ=255) ttGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCATCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCg < 3:168087/146‑1 (MQ=255) ttGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTAACGGCCTATTAGCGGGCG‑TGCCCGCGAATAGGGCCTGACACCGAAGACACCAAACAGCAACAACAGCCCCTGCTGCAGGTTGGACAGCCCGATCAAGGGATCGCTGaaacg > 4:168087/1‑142 (MQ=255) cTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGAt < 8:74350/148‑1 (MQ=255) cTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGACCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGAt > 1:270362/1‑148 (MQ=255) tCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGAtt > 7:176435/1‑148 (MQ=255) tCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGAtt > 7:91613/1‑148 (MQ=255) aaCGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGa > 4:301248/1‑128 (MQ=255) aaCGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGa < 3:301248/128‑1 (MQ=255) aCGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGAc < 4:201532/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGAc > 3:201532/1‑68 (MQ=255) aCGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCt < 6:325210/148‑1 (MQ=255) tgcggtgcCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCccagc > 4:307086/1‑148 (MQ=255) tctagcCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGACGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCccagc > 1:215392/5‑147 (MQ=255) gcCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCAt < 7:111815/129‑1 (MQ=255) gcCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCAt > 8:111815/1‑129 (MQ=255) ccTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGAtt < 3:307086/149‑1 (MQ=255) gTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGtt > 2:21055/1‑84 (MQ=255) gTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGtt < 1:21055/84‑1 (MQ=255) tCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCt < 1:287975/147‑1 (MQ=255) tctTCGCGGGCG‑TGCCGGCGAAGAGGCCCTGACAGGGTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCAGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGGCGATTCATCGCCCTGCCCAGCCACTGATTCTGTCTCGtgtc > 5:193527/1‑149 (MQ=255) tctTCGCGGGCA‑CGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCtt > 2:314678/1‑95 (MQ=255) tctTCGCGGGCA‑CGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCtt < 1:314678/95‑1 (MQ=255) ctTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGtctc > 4:342355/1‑148 (MQ=255) ttCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCTGTTCAGGGCTTGGCTGAt < 6:358922/100‑1 (MQ=255) ttCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGAt > 5:358922/1‑100 (MQ=255) gCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCgg < 8:91613/149‑1 (MQ=255) | AACAGGGTGGCGGCGATCGAGGTGCGTAAAAGCCCTTGTTCGCTGGTGATGTCGAAGAAAGTGGATCGGGTTGGATTAGGCATAAGTTGTGCTCAAGAATAACGATGGTGCGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCG‑TGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGG > NC_002947/1403452‑1403736 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |