| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,437,042 | C→T | 5.4% | G8S (GGC→AGC) | PP_1257 ← | 1‑pyrroline‑4‑hydroxy‑2‑carboxylate deaminase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,437,042 | 0 | C | T | 5.4% | 224.9 / 2.2 | 74 | G8S (GGC→AGC) | PP_1257 | 1‑pyrroline‑4‑hydroxy‑2‑carboxylate deaminase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/36); new base T (2/2); total (36/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.39e-01 | |||||||||||
GTCAGCAGCGGCCAGTCACCCATCGAGCCGCAGTACACCACCGCGCTCATGCCGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCAGTCGGGAAAAGACCGGGGTCAGATGCCCCAGGCGAAAGGGTCTTGTTCGTCGATCAGCAGGGTGCTGTCGGCGGTCATGTAGGCGCGGCCGGTGATGAAC > NC_002947/1436897‑1437187 | gTCAGCAGCGGCCAGTCACCCATCGAGCCGCAGTACACCACCGCGCTCATGCCGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGt > 2:241051/1‑149 (MQ=255) tCAGCAGCGGCCAGTCACCCATCGAGCCGCAGTACACCACCGCGCTCATGCCGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCTCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCg < 3:337971/146‑1 (MQ=255) tCAGCAGCGGCCAGTCACCCATCGAGCCGCAGTACACCACCGCGCTCATGCCGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGt > 7:47945/1‑148 (MQ=255) tCAGCAGCGGCCAGTCACCCATCGAGCCGCAGTACACCACCGCGCTCATGCCGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGt > 8:341874/1‑148 (MQ=255) tCAGCAGCGGCCAGTCACCCATCGAGCCGCAGTACACCACCGCGCTCATGCCGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGt > 7:186065/1‑148 (MQ=255) cagcGGCCAGTCACCCATCGAGCCGCAGTACACCACCGCGCTCATGCCGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTg > 1:75023/1‑145 (MQ=255) ggCCAGTCACCCATCGAGCCGCAGTACACCACCGCGCTCATGCCGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGAtgtt < 8:186065/149‑1 (MQ=255) gCCAGTCACCCATCGAGCCGCAGTACACCACCGCGCTCATGCCGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGAtgttg < 2:332537/149‑1 (MQ=255) gCCAGTCACCCATCGAGCCGCAGTACACCACCGCGCTCATGCCGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGAtgttg < 3:320977/149‑1 (MQ=255) gCCAGTCACCCATCGAGCCGCAGTACACCACCGCGCTCATGCCGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGAtgttg < 7:38177/149‑1 (MQ=255) ccAGTCACCCATCGAGCCGCAGTACACCACCGCGCTCATGCCGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGAtgttgt < 7:341874/149‑1 (MQ=255) aGTCACCCATCGAGCCGCAGTACACCACCGCGCTCATGCCGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGGTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGtca > 6:13016/1‑149 (MQ=255) aGTCACCCATCGAGCCGCAGTACACCACCGCGCTCATGCCGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGtca > 8:225443/1‑149 (MQ=255) aCCCATCGAGCCGCAGTACACCACCGCGCTCATGCCGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGTCGGTGAAGATGTTGtcattca < 1:136953/149‑1 (MQ=255) ccATCGAGCCGCAGTACACCACCGCGCTCATGCCGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTcattcatt < 7:272030/149‑1 (MQ=255) tCGAGCCGCAGTACACCACCGCGCTCATGCCGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCAttgtt > 5:161525/1‑149 (MQ=255) aGCCGCAGTACACCACCGCGCTCATGCCGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTc < 2:75023/149‑1 (MQ=255) gCCGCAGTACACCACCGCGCTCATGCCGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCAttgttg < 5:63518/146‑1 (MQ=255) gCCGCAGTACACCACCGCGCTCATGCCGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCAttgttg > 6:63518/1‑146 (MQ=255) gCCGCAGTACACCACCGCGCTCATGCCGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCa > 6:25904/1‑149 (MQ=255) gCCGCAGTACACCACCGCGCTCATGCCGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCa > 2:310436/1‑149 (MQ=255) caccGCGCTCATGCCGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTgg > 4:151463/1‑144 (MQ=255) caccGCGCTCATGCCGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTgg < 3:151463/144‑1 (MQ=255) caccGCGCTCATGCCGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCa < 5:234188/146‑1 (MQ=255) caccGCGCTCATGCCGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCa > 6:234188/1‑146 (MQ=255) caccGCGCTCATGCCGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAg > 3:1670/1‑149 (MQ=255) ccGCGCTCATGCCGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCTGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGAtgtt < 8:241479/118‑1 (MQ=255) ccGCGCTCATGCCGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGAtgtt > 7:241479/1‑118 (MQ=255) ccGCGCTCATGCCGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGtcattca < 3:1678/126‑1 (MQ=255) ccGCGCTCATGCCGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGtcattca > 4:1678/1‑126 (MQ=255) gcgcTCATGCCGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCa < 8:47945/149‑1 (MQ=255) cgcTCATGCCGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCAg < 1:321035/149‑1 (MQ=255) aTGCCGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCAGTCgg < 1:241051/148‑1 (MQ=255) cGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCTGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCAGTCggg > 7:331089/1‑145 (MQ=255) cGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCTGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCAGTCggg > 7:107677/1‑145 (MQ=255) cGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCTGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCAGTCggg < 8:107677/145‑1 (MQ=255) cGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCTGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCAGTCggg < 8:331089/145‑1 (MQ=255) cGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCAGTCGGGaa > 8:212108/1‑147 (MQ=255) tCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCa > 7:102024/1‑125 (MQ=255) tCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTACGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCa < 8:102024/125‑1 (MQ=255) cccTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCAGTCGGGAAAAGACCGGGGTCAGATGCCCCa < 6:161525/149‑1 (MQ=255) cTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCaaa > 7:171118/1‑112 (MQ=255) cTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCaaa < 8:171118/112‑1 (MQ=255) cgcACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCAGTCGGGAAAAGACCGGGGTCAGATGCCCCAGGCGaa < 7:212108/149‑1 (MQ=255) gcACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCAGTCGGGAAAAGACCGGGGTCAGATGCCCCAGGCGa > 7:211356/1‑147 (MQ=255) cACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCAGTCGGGAAAAGACCGGGGTCAGATGCCCCAGGCGAAAg < 4:1670/149‑1 (MQ=255) aCCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGtca < 1:331990/81‑1 (MQ=255) aCCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGtca > 2:331990/1‑81 (MQ=255) gggCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGTCAAAGTTCAGTCGGGAAAAGACCGGGGTCAGATGCCCCAGGCGAAAGGGTCt > 7:171198/1‑149 (MQ=255) ggCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCAGTCGGGAAAAGACCGGGGTCAGATGCCCCAGGCGAAAGGGTCtt < 5:25904/149‑1 (MQ=255) gCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCAGTCGGGAAAAGACCGGGGTCAGATGCCCCAGGCGAAAGGGTCTTg < 8:211356/149‑1 (MQ=255) cGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCAGTCGGGAAAAGACCGGGGTCAGATGCCCCAGGCGAAAGGGTCTTGt < 2:277195/149‑1 (MQ=255) cGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCAGTCGGGAAAAGACCGGGGTCAGATGCCCCAGGCGAAAGGGTCTTGt < 3:203001/149‑1 (MQ=255) gAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCTCTCCTGGCATAGTTCAGTGGGGATAAGACCGGGGTCAGATGCCCCAGGCGAATGGGTCTTGTtcgt < 5:384380/149‑1 (MQ=255) gAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCAGTCGGGAAAAGACCGGGGTCAGATGCCCCAGGCGAAAGGGTCTTGTtcgt > 5:72848/1‑149 (MQ=255) aGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGCTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCAGTCGGGAAAAGACCGGGGTCAGATGCCCCAGGCGAAAGGGTCTTGTtcgtcg < 1:310436/149‑1 (MQ=255) tCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCAGTCGGGAAAAGACCGGGGTCAGATGCCCCAGGCGAAAGGGTCTTGTTCGTCGAt < 7:225443/149‑1 (MQ=255) cGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCAGTCGGGAAAAGACCGGGGTCAGATGCCCCAGGCGAAAGGGTCTTGTTCGTCGAt > 2:97147/1‑147 (MQ=255) gTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCAGTCGGGAAAAGACCGGGGTCAGATGCCCCAGGCGAAAGGGTCTTGTTCGTCGATcagc < 1:97147/149‑1 (MQ=255) tCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCAGTCGGGAAAAGACCGGGGTCAGATGCCCCAGGCGAAAGGGTCTTGTTCGTCGATCAGCAGGGTGCt > 2:15662/1‑149 (MQ=255) ggTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCAGTCGGGAAAAGACCGGGGTCAGATGCCCCAGGCGAAAGGGTCTTGTtcgtc < 2:375264/129‑1 (MQ=255) ggTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCAGTCGGGAAAAGACCGGGGTCAGATGCCCCAGGCGAAAGGGTCTTGTtcgtc > 1:375264/1‑129 (MQ=255) ggTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCAGTCGGGAAAAGACCGGGGTCAGATGCCCCAGGCGAAAGGGTCTTGTTCGTCGATCAGCAGGGTGCTGTcgg > 5:84511/1‑149 (MQ=255) aCGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGCTGTCATTCATTGTTGTCACTCATGGCAAAGTTCAGTCGGGAAAAGACCGGGGTCAGATGCCCCAGGCGAAAGGGTCTTGTTCGTCGATCAGCAGGGTGCTGTCGGCGGt > 8:258227/1‑148 (MQ=255) tcaGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCAGTCgg > 3:304687/1‑69 (MQ=255) tcaGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCAGTCgg < 4:304687/69‑1 (MQ=255) tcaGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCAGTCGGGAAAAGACCGGGGTCAGATGCCCCAGGCGAAAGGGTCTTGTTCGTCGATCAGCAGGGTGCTGTCGGCGGTCATGTAGgcg > 8:300406/1‑149 (MQ=255) tcaGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCAGTCGGGAAAAGACCGGGGTCAGATGCCCCAGGCGAAAGGGTCTTGTTCGTCGATCAGCAGGGTGCTGTCGGCGGTCATGTAGgcg > 1:308453/1‑149 (MQ=255) caGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCAGTCGGGAAAAGACCGGGGTCAGATGCCCCAGGCGAAAGGGTCTTGTtcgtc < 3:61089/114‑1 (MQ=255) caGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCAGTCGGGAAAAGACCGGGGTCAGATGCCCCAGGCGAAAGGGTCTTGTtcgtc > 4:61089/1‑114 (MQ=255) caTGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCAGTCGGGAAAAGACCGGGGTCAGATGCCCCAGGCGAAAGGGTCTTGTTCGTCGATCAGCAGGGTGCTGTCGGCGGTCATGTAGGCGCGGCCGGtga < 4:126844/149‑1 (MQ=255) aTGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCAGTCGGGAAAAGACCGGGGTCAGATGCCCCAGGCGAAAGGGTCTTGTTCGTCGATCAGCAGGGTGCTGTCGGCGGTCATGTAGGCGCGGCCGGtg > 2:224987/1‑147 (MQ=255) aTGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCAGTCGGGAAAAGACCGGGGTCAGATGCCCCAGGCGAAAGGGTCTTGTTCGTCGATCAGCAGGGTGCTGTCGGCGGTCATGTAGGCGCGGCCGGtg < 1:224987/147‑1 (MQ=255) tGCCGTTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCAGTCGGGAAAAGACCGGGGTCAGATGCCCCAGGCGAAAGGGTCTTGTTCGTCGATCAGCAGGGTGCTGTCGGCGGTCATGTAGGCGCGGCCGGTGATGAAc > 3:328419/1‑149 (MQ=255) | GTCAGCAGCGGCCAGTCACCCATCGAGCCGCAGTACACCACCGCGCTCATGCCGGCCTCGATCAGCTCGCGGCCCTTGCGCACCAGGGCGTCGAAGTCCGGTTTGCGCTCGGCGGTGCACGGGGTCATCAGGGCAGGCATGGTGCCGGTGAAGATGTTGTCATTCATTGTTGTCACTCCTGGCAAAGTTCAGTCGGGAAAAGACCGGGGTCAGATGCCCCAGGCGAAAGGGTCTTGTTCGTCGATCAGCAGGGTGCTGTCGGCGGTCATGTAGGCGCGGCCGGTGATGAAC > NC_002947/1436897‑1437187 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |