Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,453,974 | C→G | 5.8% | A203G (GCC→GGC) | PP_1272 → | multidrug MFS transporter membrane fusion protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,453,974 | 0 | C | G | 5.8% | 225.2 / 3.1 | 69 | A203G (GCC→GGC) | PP_1272 | multidrug MFS transporter membrane fusion protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/31); new base G (2/2); total (36/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.92e-01 |
CTTGCCGAGCAGGGCGCGGGTACCGTGCAGAACGCCCAGCAGGCGCGCAGCGCTGTCGATCAAGCCCGTGCTCGCCTGGCCAACGCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTACACCCGCATCACAGCGCCGGTGGACGGTATGGTCGGCGAACGCGCCCTGCGCGTGGGGGCCTACGTCAACCCGGGCGCTCGC > NC_002947/1453826‑1454116 | cTTGCCGAGCAGGGCGCGGGTACCGTGCAGAACGCCCAGCAGGCGCGCAGCGCTGTCGATCAAGCCCGTGCTCGCCTGGCCAACGCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAgcgc < 5:63414/149‑1 (MQ=255) tGCCGAGCAGGGCGCGGGTACCGTGCAGAACGCCCAGCAGGCGCGCAGCGCTGTCGATCAAGCCCGTGCTCGCCTGGCCAACGCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGcc > 7:88952/1‑148 (MQ=255) ccGAGCAGGGCGCGGTTACCGTGCAGGACGCCCAGCAGGCGCGCAGCGCTGTCGATCAAGCCCGTGCTCGCCTGGCCAACGCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑At > 1:5541/1‑149 (MQ=255) ccGAGCAGGGCGCGGGTACCGTGCAGAACGCCCAGCAGGCGCGCAGCGCTGTCGATCAAGCCCGTGCTCGCCTGGCCAACGCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑At < 1:282984/149‑1 (MQ=255) gAGCAGGGCGCGGGTACCGTGCAGAACGCCCAGCAGGCGCGCAGCGCTGTCGATCAAGCCCGTGCTCGCCTGGCCAACGCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑a < 3:26869/146‑1 (MQ=255) gAGCAGGGCGCGGGTACCGTGCAGAACGCCCAGCAGGCGCGCAGCGCTGTCGATCAAGCCCGTGCTCGCCTGGCCAACGCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑a > 4:26869/1‑146 (MQ=255) aGGGCGCGGGTACCGTGCAGAACGCCCAGCAGGCGCGCAGCGCTGTCGATCAAGCCCGTGCTCGCCTGGCCAACGCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAg > 4:215633/1‑149 (MQ=255) gcgcGGGTACCGTGCAGAACGCCCAGCAGGCGCGCAGCGCTGTCGATCAAGCCCGTGCTCGCCTGGCCAACGCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTc < 8:280950/149‑1 (MQ=255) gcgGGTACCGTGCAGAACGCCCAGCAGGCGCGCAGCGCTGTCGATCAAGCCCGTGCTCGCCTGGCCAACGCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGACCATCGGCG‑CTGGCCacttgag < 5:40597/149‑7 (MQ=255) gggTACCGTGCAGAACGCCCAGCAGGCGCGCAGCGCTGTCGATCAAGCCCGTGCTCGCCTGGCCAACGCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCATCGGCG‑CTGGCCactt < 1:351320/144‑4 (MQ=255) gggTACCGTGCAGAACGCCCAGCAGGCGCGCAGCGCTGTCGATCAAGCCCGTGCTCGCCTGGCCAACGCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCATCGGCG‑CTGGCCactt > 2:351320/1‑141 (MQ=255) tGCAGAACACCCAGCAGGCGCGCAGCGCTGTCGATCAAGCCCGTGCTCGCCTGGCCAACGCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCg > 8:137367/1‑147 (MQ=255) gCAGAACGCCCAGCAGGCGCGCAGCGCTGTCGATCAAGCCCGTGCTCGCCTGGCCAACGCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCt > 5:273539/1‑135 (MQ=255) gCAGAACGCCCAGCAGGCGCGCAGCGCTGTCGATCAAGCCCGTGCTCGCCTGGCCAACGCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCt < 6:273539/135‑1 (MQ=255) cAGAACGCCCAGCAGGCGCGCAGCGCTGTCGATCAAGCCCGTGCTCGCCTGGCCAACGCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGc < 4:76923/149‑1 (MQ=255) gAACGCCCAGCAGGCGCGCAGCGCTGTCGATCAAGCCCGTGCTCGCCTGGCCAACGCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAg > 5:30406/1‑149 (MQ=255) cccAGCAGGCGCGCAGCGCTGTCGATCAAGCCCGTGCTCGCCTGGCCAACGCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTg < 6:297236/149‑1 (MQ=255) gcagGCGCGCAGCGCTGTCGATCAAGCCCGTGCTCGCCTGGCCAACGCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTg < 2:365846/145‑1 (MQ=255) gcagGCGCGCAGCGCTGTCGATCAAGCCCGTGCTCGCCTGGCCAACGCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTg > 1:365846/1‑145 (MQ=255) cagGAGCGCAGCGCTGTCGATCAAGCCCGTGCTCGCCTGGCCAACGCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGaa > 6:42096/1‑147 (MQ=255) agGCGCGCAGCGCTGTCGATCAAGCCCGTGCTCGCCTGGCCAACGCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAg < 6:359258/149‑1 (MQ=255) ggCGCGCAGCGCTGTCGATCAAGCCCGTGCTCGCCTGGCCAACGCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAgg < 8:77706/149‑1 (MQ=255) cgcgcAGCGCTGTCGATCAAGCCCGTGCTCGCCTGGCCAACGCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGcc > 1:55426/1‑149 (MQ=255) gcgcAGCGCTGTCGATCAAGCCCGTGCTCGCCTGGCCAACGCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGccc < 6:275400/149‑1 (MQ=255) cTGTCGATCAAGCCCGTGCTCGCCTGGCCAACGCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGAt < 7:63788/149‑1 (MQ=255) gATCAAGCCCGTGCTCGCCTGGCCAACGCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTc > 4:232051/1‑149 (MQ=255) cAAGCCCGTGCTCGCCTGGCCAACGCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGAt < 3:4318/141‑1 (MQ=255) cAAGCCCGTGCTCGCCTGGCCAACGCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGAt > 4:4318/1‑141 (MQ=255) aGCCCGTGCTCGCCTGGCCAACGCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTaca > 7:45033/1‑149 (MQ=255) cGTGCTCGCCTGGCCAACGCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTACACCCg < 2:82691/149‑1 (MQ=255) tGCTCGCCTGGCCAACGCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTACACCCGCa < 8:88952/149‑1 (MQ=255) gCCTGGCCAACGCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTACACCCGCATca < 7:273112/147‑1 (MQ=255) gCCTGGCCAACGCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTCTCCTACACCCGCATcaca < 1:361180/149‑1 (MQ=255) aaCGCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTACACCCGCATCACAGCGCCGGt < 5:42096/149‑1 (MQ=255) aaCGCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTACACCCGCATCACAGCGCCGGt > 8:285219/1‑149 (MQ=255) aaCGCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCAAGCTCGATCTGTCATACACCCGCATACCAGCGCCGGt > 3:235633/1‑149 (MQ=255) gCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTACACCCGCATCACAGCGCCGGTGGa < 7:285219/149‑1 (MQ=255) tCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCaa > 6:390147/1‑78 (MQ=255) aaGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGTCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTACACCCGCATCACAGCGCCGGTGGACgg > 2:237754/1‑148 (MQ=255) aaGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTACACCCGCATCACAGCGCCGGTGGACgg > 1:26658/1‑148 (MQ=255) cgGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTACACCCGCATCACAGCGCCGGTGGACGGTATGGTCgg < 3:232051/149‑1 (MQ=255) ggcggcGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCGAATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTACACCCGCATCACAGCGCCGGTGGACGGTATGGTCGGCGaa > 1:284579/1‑149 (MQ=255) ggcggcGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑TTGGCCAGCTGAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAATCGGCCCATCTCGATCTGTCCTACACCCGCATCACAGCGCCGGTTGACGGTATGGTCGGCGAAc < 8:152413/149‑1 (MQ=255) gcggcgCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTACACCCGCATCACAGCGCCGGTGGACGGTATGGTCGGCGAAcg > 2:58203/1‑149 (MQ=255) cAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTACACCCGCATCACAGCGCCGGt > 7:282599/1‑120 (MQ=255) cAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTACACCCGCATCACAGCGCCGGt < 8:282599/120‑1 (MQ=255) gCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGaa < 5:327374/73‑1 (MQ=255) gCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGaa > 6:327374/1‑73 (MQ=255) gTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTACACCCGCATCACAGCGCCGGTGGACGGTATGGTCGGCGAACGCGCCCTGCGCGTggg < 2:55426/149‑1 (MQ=255) gACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTACACCCGCATCACAGCGCCGGTGGACGGTATGGTCGGCGAACGCGCCCTGCGCGTGGGGGc > 5:268214/1‑149 (MQ=255) aTCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTACACCCGCATCACAGCGCCGGTGGACGGTATGGTCGGCGAACGCGCCCTGCGCGTGGGGGCCTa > 6:218010/1‑149 (MQ=255) tCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTACACCCGCATCACAGCGCCGGTGGACGGTATGGTCGGCGAACGCGCCCTGCGCGTGGGGGCCTAc > 8:36824/1‑149 (MQ=255) ccTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTACACCCGCATCACAGCGCCGGTGGACGGTATGGTc > 7:175003/1‑118 (MQ=255) ccTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTACACCCGCATCACAGCGCCGGTGGACGGTATGGTc < 8:175003/118‑1 (MQ=255) tCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTACACCCGCATCACAGCGCCGGTGGACGGTATGGTCGGCGAACGCGCCCTGCGCGTGGGGGCCTACGt > 1:99670/1‑148 (MQ=255) tCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTACACCCGCATCACAGCGCCGGTGGACGGTATGGTCGGCGAACGCGCCCTGCGCGTGGGGGCCTACGt > 3:140255/1‑148 (MQ=255) ggCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTACACCCGCATCACAGCGCCGGTGGACGGTATGGTCGGCGAACGCGCCCTGCGCGTGGGGGCCTACGTCAAcc > 4:88467/1‑149 (MQ=255) ggCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTACACCCGCATCACAGCGCCGGTGGACGGTATGGTCGGCGAACGCGCCCTGCGCGTGGGGGCCTACGTCAAcc > 4:1711/1‑149 (MQ=255) tCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTACACCCGCATCACAGCGCCGGTGGACGGTATGGTCGGCGAACGCGCCCTGCGCGTGGGGGCCTACGTCAACCCgg > 5:109815/1‑149 (MQ=255) gagctGGCCATCGGCG‑CTGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTACACCCGCATCACAGCGCCGGTGGACGGTATGGTCGGCGAACGCGCCCTGCGCGTGGGGGCCTACGTCAACCCggg > 1:221274/5‑149 (MQ=255) aaGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTACACCCGCATCACAGCGCCGGTGGACGGTATGGTCGGCGAACGCGCCCTGCGCGTGGGGGCCTACGTCAACCCggg < 7:180179/148‑1 (MQ=255) aaGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTACACCCGCATCACAGCGCCGGTGGACGGTATGGTCGGCGAACGCGCCCTGCGCGTGGGGGCCTACGTCAACCCgg < 1:206517/147‑1 (MQ=255) aaGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTACACCCGCATCACAGCGCCGGTGGACGGTATGGTCGGCGAACGCGCCCTGCGCGTGGGGGCCTACGTCAACCCgg < 4:140255/147‑1 (MQ=255) aaGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTACACCCGCATCACAGCGCCGGTGGACGGTATGGTCGGCGAACGCGCCCTGCGCGTGGGGGCCTACGTCAACCCGGgc > 2:89236/1‑149 (MQ=255) aaGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTACACCCGCATCACAGCGCCGGTGGACGGTATGGTCGGCGAACGCGCCCTGCGCGTGGGGGCCTACGTCAACCCGGgc < 2:284579/149‑1 (MQ=255) tGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTACACCCGCATCACAGCGCCGGTGGACGGTATGGTCGGCGAACGCGCCCTGCGCGTGGGGGCCTACGTCAACCCGGgcgc > 4:87198/1‑148 (MQ=255) tGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTACACCCGCATCACAGCGCCGGTGGACGGTATGGTCGGCGAACGCGCCCTGCGCGTGGGGGCCTACGTCAACCCGGgcgc < 3:87198/148‑1 (MQ=255) tGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTACACCCGCATCACAGCGCCGGTGGACGGTATGGTCGGCGAACGCGCCCTGCGCGTGGGGGCCTACGTCAACCCGGGCGCt > 8:189815/1‑149 (MQ=255) gCCAGCGCCG‑ATGGTCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTACACCCGCATCACAGCGCCGGTGGACGGTATGGTCGGCGAACGCGCCCTGCGCGTGGGGGCCTACGTCAACCCGGGCGCTCg < 1:237754/149‑1 (MQ=255) gCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTACACCCGCATCACAGCGCCGGTGGACGGTATGGTCGGCGAACGCGCCCTGCGCGTGGGGGCCTACGTCCACCCGGGCGCTCg > 8:64214/1‑149 (MQ=255) ccAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTACACCCGCATCACAGCGCCGGTGGACGGTATGGTCGGCGAACGCGCCCTGCGCGTGGGGGCCTACGTCAACCCGGGCGCTCGc < 2:308132/149‑1 (MQ=255) | CTTGCCGAGCAGGGCGCGGGTACCGTGCAGAACGCCCAGCAGGCGCGCAGCGCTGTCGATCAAGCCCGTGCTCGCCTGGCCAACGCTCAAGCTGCGCGGGTGGCGGCGCGCAAGCAGGTGGACATCCTCACGGCTCAAGTGGCCAGCGCCG‑ATGGCCAGCTCAAGCGTGCCGAAGCAGGCCTGGAAAAGGCCCAGCTCGATCTGTCCTACACCCGCATCACAGCGCCGGTGGACGGTATGGTCGGCGAACGCGCCCTGCGCGTGGGGGCCTACGTCAACCCGGGCGCTCGC > NC_002947/1453826‑1454116 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |