| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,458,119 | A→T | 10.0% | intergenic (+19/+21) | PP_1276 → / ← algA | hypothetical protein/mannose‑6‑phosphate isomerase/mannose‑1‑phosphate guanylyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,458,119 | 0 | A | T | 10.0% | 211.9 / 10.6 | 79 | intergenic (+19/+21) | PP_1276/algA | hypothetical protein/mannose‑6‑phosphate isomerase/mannose‑1‑phosphate guanylyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/33); new base T (3/5); total (40/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.76e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.48e-01 | |||||||||||
TCGAAATGACTGCCACAAGCATCAGGGCTGAATCCTTCGAATTTGAAGGGGAGGATGATTTGCAGCGACCTTTCAGGGTGGTGGGTGGCCCATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATCCTCGCCCAGGTAGCTCCCGGACTGCACCTCGATGATC > NC_002947/1457973‑1458263 | tCGAAATGACTGCCACAAGCATCAGGGCTGAATCCTTCGAATTTGAAGGGGAGGATGATTTGCAGCGACCTTTCAGGGTGGTGGGTGGCCCATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGc > 3:303234/1‑149 (MQ=255)tCGAAATGACTGCCACAAGCATCAGGGCTGAATCCTTCGAATTTGAAGGGGAGGATGATTTGCAGCGACCTTTCAGGGTGGTGGGTGGCCCATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGc > 2:103668/1‑149 (MQ=255)tCGAAATGACTGCCACAAGCATCAGGGCTGAATCCTTCGAATTTGAAGGGGAGGATGATATGCAGCGACCTTTCAGGGTGGTGGGTGGCCCATACGACATCTACGTCATAGCCACGAGC‑GTTGAATAAGCAGGATCGCCCCAGGTCAGc > 3:114216/1‑149 (MQ=255) ccACAAGCATCAGGGCTGAATCCTTCGAATTTGAAGGGGAGGATGATTTGCAGCGACCTTTCAGGGTGGTGGGTGGCCCATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGa < 3:344150/147‑1 (MQ=255) ccACAAGCATCAGGGCTGAATCCTTCGAATTTGAAGGGGAGGATGATTTGCAGCGACCTTTCAGGGTGGTGGGTGGCCCATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAg > 7:169133/1‑148 (MQ=255) ccACAAGCATCAGGGCTGAATCCTTCGAATTTGAAGGGGAGGAGGATTTGCAGCGACCTTTCAGGGTGGTGGGTGGCCCATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGGCTGACCAGGGGCGa < 4:303707/147‑1 (MQ=255) cacaAGCATCAGGGCTGAATCCTTCGAATTTGAAGGGGAGGATGATTTGCAGCGACCTTTCAGGGTGGTGGGTGGCCCATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGt > 2:82508/1‑148 (MQ=255) cacaAGCATAAGGGCTCAATCATTCGAATTTGAAGGGGAGGATGATTTGCAGCGAACTAACAGGGTGGTGGGTGGACCATTAGACATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCGGGTAAGCCCAGCGGCTAga > 5:109568/1‑147 (MQ=255) 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8:169133/149‑1 (MQ=255) tGAATCCTTCGAATTTGAAGGGGAGGATGATTTGCAGCGACCTTTCAGGGTGGTGGGTGGCCCATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTgcgc > 2:165451/1‑148 (MQ=255) aaTCCTTCGAATTTGAAGGGGAGGATGATTTGCAGCGACCTTTCAGGGTGGTGGGTGGCCCATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGa < 6:137129/148‑1 (MQ=255) aTCCTTCGAATTTGAAGGGGAGGATGATTTGCAGCGACCTTTCAGGGTGGTGGGTGGCCCATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATg < 1:165451/149‑1 (MQ=255) cTTCGAATTTGAAGGGGAGGATGATTTGCAGCGACCTTTCAGGGTGGTGGGTGGCCCATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGt < 1:82508/148‑1 (MQ=255) ttCGAATTTGAAGGGGAGGATGATTTGCAGCGACCTTTCAGGGTGGTGGGTGGCCCATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGt < 7:308251/147‑1 (MQ=255) ttCGAATTTGAAGGGGAGGATGATTTGCAGCGACCTTTCAGGGTGGTGGGTGGCCCATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCt > 5:100953/1‑149 (MQ=255) ttCGAATTTGAAGGGGAGGATGATTTGCAGCGACCTTTCAGGGTGGTGGGTGGCCCATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCACTGGTCAGACCAGTGGAGAGTAAGCATT‑TACTTCGCGATGGTc > 8:308251/1‑148 (MQ=255) gAATTTGAAGGGGAGGATGATTTGCAGCGACCTTTCAGGGTGGTGGGTGGCCCATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCa < 3:252263/149‑1 (MQ=255) aaTTTGAAGGGGAGGATGATTTGCAGCGACCTTTCAGGGTGGTGGGTGGCCCATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCAc > 2:80928/1‑149 (MQ=255) aaGGGGAGGATGATTTGCAGCGACCTTTCAGGGTGGTGGGTGGCCCATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCCGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGaaa < 1:46097/148‑1 (MQ=255) gaggaTGATTTGCAGCGACCTTTCAGGGTGGTGGGTGGCCCATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTAAGGCCAGGGGCGAGTCAGAATT‑TACTGCGCTATGGTCTTCACCGAAAcgccgc > 7:242651/1‑149 (MQ=255) gatgatTTGCAGCGACCTTTCAGGGTGGTGGGTGGCCCATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCt > 8:69333/1‑149 (MQ=255) gatgatTTGCAGCGACCTTTCAGGGTGGTGGGTGGCCCATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCt < 3:95330/149‑1 (MQ=255) atgatTTGCAGCGACCTTTCAGGGTGGTGGGTGGCCCATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAAcgc > 8:330446/1‑142 (MQ=255) atgatTTGCAGCGACCTTTCAGGGTGGTGGGTGGCCCATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAAcgc < 7:330446/142‑1 (MQ=255) tttGCAGCGACCTTTCAGGGTGGTGGGTGGCCCATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATg > 5:33673/1‑149 (MQ=255) tGCAGCGACCTTTCAGGGTGGTGGGTGGCCCATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATgg < 6:100953/148‑1 (MQ=255) cAGCGACCTTTCAGGGTGGTGGGTGGCCCATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATggggg > 5:218779/1‑149 (MQ=255) cAGCGACCTTTCAGGGTGGTGGGTGGCCCATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATgggg < 6:218779/148‑1 (MQ=255) aGGGTGGTGGGTGGCCCATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGcc > 1:65627/1‑149 (MQ=255) gggTGGTGGGTGGCCCATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGccc < 7:233629/149‑1 (MQ=255) gtgggtggtggCCCATTCGAAATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAATCATGCTCCCCCCTGGTCACGCCAGGGGGGTGGCATCATTCTACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGccc < 1:103668/142‑1 (MQ=255) ggtgggtgGCCCATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATa > 6:133118/1‑148 (MQ=255) gtgggtggCCCATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATaca < 5:133118/149‑1 (MQ=255) cccATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAAcgcc < 6:212598/109‑1 (MQ=255) cccATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAAcgcc > 5:212598/1‑109 (MQ=255) ccATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCg > 7:358030/1‑148 (MQ=255) ccATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGCCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCCATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCg > 3:309810/1‑148 (MQ=255) cATCCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCg > 5:190834/1‑147 (MQ=255) aTTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGCGGTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGTTGGCCGTGCGCCCATACACATCCTCg > 1:215786/1‑147 (MQ=255) aTTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGCGGTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCg > 1:28134/1‑147 (MQ=255) cATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATacac > 2:24975/1‑133 (MQ=255) cATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATacac < 1:24975/133‑1 (MQ=255) atACGTCATAGCTCAGAGC‑GTTTATTAAGCAGGCGCGCCCCTGGTTAGCCCAGGGTCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACTCCTGGCTCGATGGGGGTGGACGGGCTCCCATACACATCCTCGAAGCTCTCGAt < 6:109568/147‑1 (MQ=255) tACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATg < 1:184046/79‑1 (MQ=255) tACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATg > 2:184046/1‑79 (MQ=255) aCGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATac < 5:385254/126‑1 (MQ=255) aCGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATac > 6:385254/1‑126 (MQ=255) aCGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGt > 3:237401/1‑148 (MQ=255) tCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATc < 2:215786/149‑1 (MQ=255) tCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATc > 2:57660/1‑149 (MQ=255) ccGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATCCTCGCCCa < 4:303234/149‑1 (MQ=255) ccGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATCCTCGCCCa < 1:80928/149‑1 (MQ=255) cc‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATCCTCGCCCAGGTa < 2:28134/148‑1 (MQ=255) ttGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATCCTCGCCCAGGTAGCt > 2:252829/1‑149 (MQ=255) ttGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATCCTCGCCCAGGTAGCt > 8:177721/1‑149 (MQ=255) aaTAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCCAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCATCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATCCTCGCCCAGGTAGTTccc > 3:259725/1‑149 (MQ=255) aaGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGaaa < 7:53738/67‑1 (MQ=255) aaGCAGGCTCGCCCATGGTCAGCCCAGGGACGAGTCAGCATT‑TACTGCGAGATGGTCTACACCGaaa > 8:53738/1‑67 (MQ=255) gCAGGCTCGCCCCAGGTCAGCCCACGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATCCTCGCCCAGGTAGCTCCCGGACt > 6:316688/1‑149 (MQ=255) aGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATCCTCGCCCAGGTAGCTCCCGGACTGc < 5:316688/149‑1 (MQ=255) cTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATCCTCGCCCAGGTAGCTCCCGGACTGCAcc < 4:237401/149‑1 (MQ=255) tCGCCCCTGGGCTGACCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATggggg < 8:122564/77‑1 (MQ=38) tCGCCCCTGGGCTGACCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATggggg > 7:122564/1‑77 (MQ=38) tCGCCCCTGGGCTGACCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATg < 7:222586/115‑1 (MQ=255) tCGCCCCTGGGCTGACCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATg > 8:222586/1‑115 (MQ=255) gCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATCCTCGCCCAGGTAGCTCCCGGACTGCACCTCg < 2:65627/149‑1 (MQ=255) gCCCCTGGGCTGACCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATCCTCGCCCAGGTAGCTCCCg < 7:135568/137‑1 (MQ=255) ccccTGGTCTGGCCAGGGGCGAGTGAGCTTA‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGATACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATCCTGGCCCAGGTAGCTCCCGGAGTGCACCTCga < 4:114216/149‑1 (MQ=255) ccccTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATCCTCGCCCAGGTAGCTCCCGGACTGCACCTCga < 6:33673/149‑1 (MQ=255) cccTGGGCTGACCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATCCTCGCCCAGGTAGCTCCCGGACTGCACCTCgat > 5:182958/1‑149 (MQ=255) ccTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATCCTCGCCCAg < 4:331835/124‑1 (MQ=255) ccTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATCCTCGCCCAGGTAGCTCCCGGACTGCACCTCgatg < 7:177721/149‑1 (MQ=255) ccTGCTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACCCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATCCTCGCCCAg > 3:331835/1‑124 (MQ=255) gTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATCCTCGCCCAGGTAGCTCCCGGACTGCACCTCGATGAtc < 7:69333/148‑1 (MQ=255) | TCGAAATGACTGCCACAAGCATCAGGGCTGAATCCTTCGAATTTGAAGGGGAGGATGATTTGCAGCGACCTTTCAGGGTGGTGGGTGGCCCATTCGACATCTACGTCATAGCCCCGAGC‑GTTGAATAAGCAGGCTCGCCCCTGGTCAGCCCAGGGGCGAGTCAGCATT‑TACTGCGCGATGGTCTTCACCGAAACGCCGCGCTCGATGGGGGTGGACGTGCGCCCATACACATCCTCGAAGCGCTCGATGTCATCCTCGCCCAGGTAGCTCCCGGACTGCACCTCGATGATC > NC_002947/1457973‑1458263 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |