| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,561,410 | G→A | 5.2% | T227T (ACC→ACT) | pctA ← | methyl‑accepting chemotaxis protein PctA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,561,410 | 0 | G | A | 5.2% | 237.4 / 2.0 | 78 | T227T (ACC→ACT) | pctA | methyl‑accepting chemotaxis protein PctA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/38); new base A (2/2); total (37/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.42e-01 | |||||||||||
GCGATCACCGCAGAGGTGCGGAAGGTGCTGAGCATCGAGAAGGCCTTGTCCTTGTCCACCGACAGGCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTG > NC_002947/1561264‑1561557 | gCGATCACCGCAGAGGTGCGGAAGGTGCTGAGCATCGAGAAGGCCTTGTCCTTGTCCACCGACAGGCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGt < 1:111913/149‑1 (MQ=255) cGATCACCGCAGAGGTGCGGAAGGTGCTGAGCATCGAGAAGGCCTTGTCCTTGTCCACCGACAGGCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGt < 5:285493/148‑1 (MQ=255) gATCACCGCAGAGGTGCGGAAGGTGCTGAGCATCGAGAAGGCCTTGTCCTTGTCCACCGACAGGCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGt > 5:50939/1‑147 (MQ=255) gATCACCGCAGAGGTGCGGAAGGTGCTGAGCATCGAGAAGGCCTTGTCCTTGTCCACCGACAGGCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGt > 7:357719/1‑147 (MQ=255) cACCGCAGAGGTGCGGAAGGTGCTGAGCATCGAGAAGGCCTTGTCCTTGTCCACCGACAGGCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCt > 7:243092/1‑149 (MQ=255) cGCAGAGGTGCGGAAGGTGCTGAGCATCGAGAAGGCCTTGTCCTTGTCCACCGACAGGCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGc < 7:164878/149‑1 (MQ=255) agGTGCGGAAGGTGCTGAGCATCGAGAAGGCCTTGTCCTTGTCCACCGACAGGCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGt > 7:30394/1‑148 (MQ=255) gAAGGTGCTGAGCATCGAGAAGGCCTTGTCCTTGTCCACCGACAGGCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCg > 4:257985/1‑149 (MQ=255) gTGCTGAGCATCGAGAAGGCCTTGTCCTTGTCCACCGACAGGCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCgt < 4:320650/149‑1 (MQ=255) tGCTGAGCATCGAGAAGGCCTTGTCCTTGTCCACCGACAGGCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCgtg < 8:30394/149‑1 (MQ=255) tGCTGAGCATCGAGAAGGCCTTGTCCTTGTCCACCGACAGGCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCgtg < 5:316819/149‑1 (MQ=255) gCTGAGCATCGAGAAGGCCTTGTCCTTGTCCACCGACAGGCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGGCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCgtgt < 8:155211/149‑1 (MQ=255) cTGAGCATCGAGAAGGCCTTGTCCTTGTCCACCGACAGGCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCgtgt < 8:243092/148‑1 (MQ=255) cTGAGCATCGAGAAGGCCTTGTCCTTGTCCACCGACAGGCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGtgtg < 5:149351/149‑1 (MQ=255) gAGCATCGAGAAGGCCTTGTCCTTGTCCACCGACAGGCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCg > 5:154950/1‑118 (MQ=255) gAGCATCGAGAAGGCCTTGTCCTTGTCCACCGACAGGCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCg < 6:154950/118‑1 (MQ=255) gAGCATCGAGAAGGCCTTGTCCTTGTCCACCGACAGGCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGtgct > 7:230278/1‑149 (MQ=255) aGCATCGAGAAGGCCTTGTCCTTGTCCACCGACAGGCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGtgctg < 6:50939/149‑1 (MQ=255) aTCGAGAAGGCCTTGTCCTTGTCCACCGACAGGCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGc < 4:153682/138‑1 (MQ=255) aTCGAGAAGGCCTTGTCCTTGTCCACCGACAGGCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGc > 3:153682/1‑138 (MQ=255) aTCGAGAAGGCCTTGTCCTTGTCCACCGACAGGCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCgg > 2:86443/1‑149 (MQ=255) aTCGAGAAGGCCTTGTCCTTGTCCACCGACAGACCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCgg > 1:289469/1‑149 (MQ=255) aTCGAGAAGGCCTTGTCCTTGTCCACCGACAGACCGATGTACCAGTTCGCCGACGACAGGCCGGTAATAGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGACATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGAGTGTGCTGCgg > 1:294240/1‑149 (MQ=255) aaGACCTTGTCCTTGTCCACCGACAGGCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCgg < 2:82234/143‑1 (MQ=255) aaGACCTTGTCCTTGTCCACCGACAGGCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCgg > 1:82234/1‑143 (MQ=255) ggCCTTGTCCTTGTCCACCGACAGGCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGt < 4:54671/149‑1 (MQ=255) cttgtccttgtcCACCGACAGGCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGt < 1:321376/105‑1 (MQ=255) cttgtccttgtcCACCGACAGGCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGt > 2:321376/1‑105 (MQ=255) cttgtccttgtcCACCGACAGGCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCAGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTcc > 3:362918/1‑148 (MQ=255) cttgtccttgtcCACCGACAGGCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCAGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTcc > 3:368851/1‑148 (MQ=255) ttgtccttgtccACCGACAGGCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑a > 1:328379/1‑149 (MQ=255) tccttgtccACCGACAGGCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACa < 4:188722/148‑1 (MQ=255) cACCGACAGGCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTcc > 3:318135/1‑136 (MQ=255) cACCGACAGGCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTcc < 4:318135/136‑1 (MQ=255) aCCGACAGGCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCAt < 5:173445/149‑1 (MQ=255) aCCGACAGGCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCAt > 6:275192/1‑149 (MQ=255) gCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTGCG‑Ac < 3:372143/130‑1 (MQ=255) gCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑Ac > 4:372143/1‑130 (MQ=255) gCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGAc > 4:21641/1‑144 (MQ=255) ccGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATc < 1:187464/149‑1 (MQ=255) cGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATcc < 4:215413/149‑1 (MQ=255) cGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATcc < 2:328379/149‑1 (MQ=255) cgTTCGCCGAGGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAATGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCTGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCtgg < 2:294240/148‑1 (MQ=255) aGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCggg < 2:289469/149‑1 (MQ=255) aGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCggg > 1:243838/1‑149 (MQ=255) gTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGt > 4:53244/1‑149 (MQ=255) ttCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGTCCAGATCCTTATCCGGGTg > 7:205994/1‑149 (MQ=255) cGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGTCCAGATCCTTATCCGGGTGc < 8:205994/148‑1 (MQ=255) cGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCAc > 2:256176/1‑147 (MQ=255) ggCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGAt < 7:11037/149‑1 (MQ=255) aGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTc < 6:374670/114‑1 (MQ=255) aGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTc > 5:374670/1‑114 (MQ=255) aGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCtt > 8:352365/1‑149 (MQ=255) gCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTg < 3:237159/148‑1 (MQ=255) gCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTg > 4:237159/1‑148 (MQ=255) gTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTg > 5:383628/1‑149 (MQ=255) gggCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGtt < 7:352365/149‑1 (MQ=255) ggCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGAc < 6:286403/106‑1 (MQ=255) ggCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGAc > 5:286403/1‑106 (MQ=255) gCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGa < 8:357719/149‑1 (MQ=255) cTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGAc < 3:257985/149‑1 (MQ=255) gAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAgg < 4:217752/127‑1 (MQ=255) gAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAgg > 3:217752/1‑127 (MQ=255) aaGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGAcc < 8:230278/147‑1 (MQ=255) gTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCAACGACCAgggc < 3:21641/149‑3 (MQ=255) gTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCAGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCGGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCAACGACCAgggc < 4:368851/149‑3 (MQ=255) gTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCAGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCAACGACCAgggc < 4:362918/149‑3 (MQ=255) tCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAg < 3:53244/149‑1 (MQ=255) agcagGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGc < 1:256176/149‑1 (MQ=255) gCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGAAGGAACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCATGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTAt > 1:308307/1‑149 (MQ=255) cGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATcc < 1:86443/149‑1 (MQ=255) gggTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATcc > 5:14701/1‑148 (MQ=255) ccATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCAAGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGCAAgcc > 4:160218/1‑132 (MQ=255) cATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATgccgcc > 2:123079/1‑148 (MQ=255) cATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGccgccg < 6:14701/149‑1 (MQ=255) tttGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGtt > 3:259917/1‑148 (MQ=255) aCTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGc > 1:359704/1‑147 (MQ=255) cTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAg > 3:168859/1‑149 (MQ=255) cGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACGAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTtg > 8:86422/1‑149 (MQ=255) cGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGtt < 4:168859/148‑1 (MQ=255) | GCGATCACCGCAGAGGTGCGGAAGGTGCTGAGCATCGAGAAGGCCTTGTCCTTGTCCACCGACAGGCCGATGTACCAGTTCGCCGACGGCAGGCCGGTAATCGGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTG > NC_002947/1561264‑1561557 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |