| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,561,514 | T→C | 9.2% | N193D (AAC→GAC) ‡ | pctA ← | methyl‑accepting chemotaxis protein PctA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,561,514 | 0 | T | C | 9.2% | 207.6 / 10.3 | 76 | N193D (AAC→GAC) ‡ | pctA | methyl‑accepting chemotaxis protein PctA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/35); new base C (3/4); total (37/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.15e-01 | |||||||||||
GGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCTTGTTGGTGGTCATGT > NC_002947/1561366‑1561660 | gggCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGtt < 7:352365/149‑1 (MQ=255) gCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGa < 8:357719/149‑1 (MQ=255) cTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGAc < 3:257985/149‑1 (MQ=255) aaGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGAcc < 8:230278/147‑1 (MQ=255) gTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCAACGACCAgggc < 3:21641/149‑3 (MQ=255) gTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCAGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCGGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCAACGACCAgggc < 4:368851/149‑3 (MQ=255) gTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCAGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCAACGACCAgggc < 4:362918/149‑3 (MQ=255) tCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAg < 3:53244/149‑1 (MQ=255) agcagGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGc < 1:256176/149‑1 (MQ=255) gCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGAAGGAACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCATGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTAt > 1:308307/1‑149 (MQ=255) cGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATcc < 1:86443/149‑1 (MQ=255) gggTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATcc > 5:14701/1‑148 (MQ=255) ccATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCAAGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGCAAgcc > 4:160218/1‑132 (MQ=255) cATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATgccgcc > 2:123079/1‑148 (MQ=255) cATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGccgccg < 6:14701/149‑1 (MQ=255) tttGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGtt > 3:259917/1‑148 (MQ=255) aCTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGc > 1:359704/1‑147 (MQ=255) cTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAg > 3:168859/1‑149 (MQ=255) cGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACGAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTtg > 8:86422/1‑149 (MQ=255) cGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGtt < 4:168859/148‑1 (MQ=255) gCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTg < 4:259917/147‑1 (MQ=255) tCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGAGAGTTGATGATCTGCACCAgg > 4:122351/1‑149 (MQ=255) gTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCg > 3:21053/1‑149 (MQ=255) tttCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCCCCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGt > 2:352398/1‑149 (MQ=255) tttCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAg < 1:138537/123‑1 (MQ=255) tttCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAg > 2:138537/1‑123 (MQ=255) tttCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGt > 3:253865/1‑149 (MQ=255) tttCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATCATCTGCACCAGGCCGt > 4:96141/1‑149 (MQ=255) cGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAggg < 2:308307/149‑1 (MQ=255) tgcGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTc > 7:175650/1‑149 (MQ=255) gcGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTcg > 3:371348/1‑149 (MQ=255) gggAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTcgcc > 7:351658/1‑149 (MQ=255) gAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTcgccgc > 1:106306/1‑149 (MQ=255) gAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTcgccgc > 4:223283/1‑149 (MQ=255) aGGTCCG‑ACTGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGAc < 5:131963/149‑1 (MQ=255) g‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGc > 6:267166/1‑148 (MQ=255) gCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACg < 7:86422/149‑1 (MQ=255) gCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACg < 1:352398/149‑1 (MQ=255) cGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGc < 8:240844/143‑1 (MQ=255) cGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGc > 7:240844/1‑143 (MQ=255) cGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACgc > 7:139548/1‑149 (MQ=255) gACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGc > 5:42123/1‑142 (MQ=255) gACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGc < 6:42123/142‑1 (MQ=255) cATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGctgctg < 4:253865/148‑1 (MQ=255) aTGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGctgctg > 3:155086/1‑147 (MQ=255) ccAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGGGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGAcc < 2:243838/149‑1 (MQ=255) aTCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGc > 2:301967/1‑149 (MQ=255) ccTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACgctgct < 4:291794/136‑1 (MQ=255) ccTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACgctgct > 3:291794/1‑136 (MQ=255) cTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGa < 8:139548/149‑1 (MQ=255) aTCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCtt > 4:307511/1‑141 (MQ=255) aTCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCtt < 3:307511/141‑1 (MQ=255) tCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGa < 8:351658/148‑1 (MQ=255) tCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGAt > 4:344657/1‑149 (MQ=255) cGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGc < 3:344657/149‑1 (MQ=255) gggTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGcc < 2:106306/149‑1 (MQ=255) cACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGa < 2:359704/149‑1 (MQ=255) aCCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGAc < 8:175650/149‑1 (MQ=255) ccAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGAc > 2:32620/1‑148 (MQ=255) ggATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATc < 5:275192/149‑1 (MQ=255) ggATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATc < 3:223283/149‑1 (MQ=255) tGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCttgttg > 5:27483/1‑149 (MQ=255) cttccTGGTCAACGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCttgttg > 3:312049/4‑149 (MQ=255) cttccTGGTCAACGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCttgttg < 2:348970/146‑1 (MQ=255) cttccTGGTCAACGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCttgttg > 1:348970/4‑149 (MQ=255) ttccTGGTCAACGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCTTGTtgg > 5:108437/3‑149 (MQ=255) gCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCtt < 3:96141/144‑1 (MQ=255) gCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGGCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCtt < 6:383628/144‑1 (MQ=255) cccTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCTTGTtggt < 7:195811/149‑1 (MQ=255) ccTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGGTGACCATCTTGTtggtg > 7:79084/1‑149 (MQ=255) cTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCTTGTtggtgg < 4:21053/149‑1 (MQ=255) cTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCTTGTtggtgg > 2:281224/1‑149 (MQ=255) gTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCTTGTTggtggt < 3:122351/147‑1 (MQ=255) gTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAg > 2:54038/1‑117 (MQ=255) gTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAg < 1:54038/117‑1 (MQ=255) gTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCTTGTTGGTGGTCATGt > 8:164118/1‑149 (MQ=255) gTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCTTGTTGGTGGTCATGt < 4:371348/149‑1 (MQ=255) | GGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCG‑ACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCTTGTTGGTGGTCATGT > NC_002947/1561366‑1561660 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |